Id Trinity | TRINITY_DN46972_c2_g1_i5 |
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Name Transcript | Ll_transcript_313376 |
Sequence | CTTCCAATGCAGGATATCAACGGTTTAAGGTCCTCCACGATCTCAGATATCAACCTTTAGTTATAAAGACACCGTATGGCTGCCATTCATGCACGATTGT CACGTTTTCACCGTTAGATATAAAATAATCAAACGGCTACGAGTTGTGCATTAGAACAGCAGAACATGCGCAGCGGAACATTCAACTACTGAAGAGAGAG AAAGAAAGTTGAGTTGGAGAAGAAGCAAGATGAAGCAAAGTGGAGGAATGGGAAATGGGTCGCAGGAAAGGAACCAACTTGTTCGAGCTAGTCATGGTTC AGATAATGGGGTTGTTTTTTTTATGACTTATATGTACAATGTTATTTTTTTATTTTTATATTGGCTTCTGATTTTGGTCTTGGAATTTTGTTTTTATTCT TGAAATGGAGTTGGGGATGCAATTTTTAGTTTATTATCATACATGAGTGCCTTGTTTTTTCATCCTTAGGTTGCTGTTCTTCTTGGGTCCTATCCTTAGT TTATTATCTATTTGACTGATTCGTTTCTGTTGATAGTTTGAATCTGATGTTTCTCTTTAGGGTGAGTTCATGAATTGAATTAGTTGCTTTAGTTTATTTT TTACTTACTTTTTACTTTTTTACAATTTAATGTTTTGAGAATTCCAGTTCATTAGTTTTGTGTGGATTTGGCATGTCATTTTCATTTATTATCTTGTCAG AGATTGATCTGTGTAGATTTTATATTTTCTTGTATAGTTCTATTTCTAACTTGTATAATCCCTATACAGTCTAATAAACCCTTGAAGAATCTGAATGGTC AAGTTTGTGAAGTATGTGGTGATACTGTTGGATTTACCACCACTGGTGATGTGTTTGTTGATTGTCAAGAGTGTGGCTTCCCACTTTGCCATAATTGCTA TGAATATGAGCTGAAAAATGGGAACCAATCTTGCCCCAAGTGCAAGACTAGATACAAGAGTCACAAAGTGATTCCTCAATTGGGGGGAGATGATCAGGAC GATGATGTTGATAATCCAGAGAATGAGGCCAGTTATGGACAAGGAAATACTAAGACAGGGCTGCAGTGGGAAGAAGAAGCTGACCTATCTTCGTCTTCCG GACATGATTCTCAACAACCAAAATCCCATCTCACAAATGGGCAGCTGGTAATGTACTGAACTTATTTTTGCGACTCTTAACTTGGGAAAACTGATGAGTT TTACAGCAAAAATGGGTCAACTTAGTTATCAACTTAATTGGTCAAAACCTTGCTTTGACTCAGTTGCATTTACACAAACATGAGTGAACTTTGAAAATTA TGAAACTTTTGAAGATCTTGCTCTCCTTTTTCCTTCTTGACATTGTGATTTGCCTGCAATAGTCATGTTGCTTGATTAGACATTTAATATTAATGTGACA TTAGTTGTTTCAAAGTTTGTTATGCATTTTGGTTATGGATGTTAACATAGCATTGTTTTCATGGACACTAACATTTATAATGTTGGCTAACTTAACAAGT TTATGATTCAAGTGTACCCACTCTCCAAAAGTTTACTTAAATAGCCTTGTGAGTTTCACAACTTTGCTCGTCGCTTGTCAAATGTTGTCAGTGTTCTTTA ATCTTTATCTGTGATGTAAAATTGGGATCTCTTGTTTAAACTTTAAAATAAGTGAACTTTAGATTATGTAAACAAGTGATTATAGTTTATAGGTTCTGGT GTAAAGAAGAAAGCTAAACTCAAAATGTCAAAATTTGAGATTCTAATTAAATTTGGTTAAACCCAAACAGTCAATTTTCTTCTCAAAATTATCAGAAATC TGATTATTCTGGGGTTCTGAACTTCTGATTATTGTAAATATCTTATATGTGATATTTTCAATAAAAAAATGATTTTTATAAAGACATAATCCCAAATGGG CTCTTGATCAAACATAAAAAATGTCCAGATGAACTTCTTTTTCATTTTTAATTGTCTGTAATCAGTACTACATATGTTCTACAGGTAAGAGTATATGCTA CATAAGTTACTTGTAGGCTTTGTTGACAACCAATTGACAAATAGTTCCGTGTTCATACTGGTGGGATTATTTAGTTTGCAAGAATATTAACTAATAATTA GTGCTTTATATGGTCAGATGTCTGGTAAGATTGCATGTGCTACTCATAAAAATCAATCTCTGCGAGCCACATGTATTCCTTTGGGTCCATCTGGAAGGGT TCACTCACTTCCTTATATTGATCCAAAGCAACCAGGTATGTAGTTTACTTGATGCCATTGTTGCATATCACCTACTATGGATATTATTGATTCTCAATTC AATATATCCTTATTATTGTAGTTCTAGCAAGAGTTGTTTACCCATCAACAGACTAAACATTCTTATTTTCATTTCCTTAAATATTGAAATAATGGATGGA AGTCTTTTTTTATTTATCAGAAGCTCCTAGTATTGTTTTATGGAATACCTACACTTAAACTAATTAAAAATAAATTTTCGAAGATTCTTTTTCAATGTCC GAACTCTTAAGTAATGAATGATTGAGAGTGTAATATTAAAATTTTACACTTGGTATATAGGCTTTATGGTATTGAATATTTCCTTTTCTATACCCAGTCT TATTTTCCTGAAATCTACTTCATCGAAAGAGCTCCTTAAGTCAATTTATCATTGTTGTCTGTTGTTCTCATAAACTTGAATAAAATGATTATCTTGATTC TCCAGATAATTTACTGGGGTTTGAACTTCATTGAAATTGGCATAATCCAGGTCTTGAGAGTGATGAGGAGATCAGAAGAGTGCCGGAGATAGGAGGTGAA TTTGCTGGAACATCAGCCGCTCGCCCAGACACTGGTTCAACCATGGCTCCTGAAAGTGTTCATGGTACAAGAGAGGGTCAGAGGAAGAGAGGGAGAAACC CAGCTGACAAAGAAAGCAAGCGATTAAAGAGGCTACTGAGGAACAGAGTTTCAGCTCAGCAAGCAAGGGAGAGAAAAAAGGCTTACTTGAATGATTTAGA AACTAAAGTCAAAGACTTGGAGAAGAAGAATTCCGAGCTCAAAGAGAGACTATCTACTTTGCAGAATGAGAATCAAATGCTAAGACAGATACTGAAAAAC ACAACAGCTACCAGGAGAGGGAGCAATAGTGGTGCCAATGCTGAATGAACTTGATGAGAAATATGGATTACCAGATAAAGTTATAGGTATTGTAGATGTA GAGTGTGAAAGTGAGAGAGGAGAGTAAACTAGCGAGAAAGGGAAAAGTAATAGTGAAAAATTAGTTTTGATAATTCTTTAATGGTGTTTGGTTGTAATAT TATGCAGTGCTTTATCCTAGGATATTGTGATGTGTGTAATATATATGCACTTTCCGTGTAAAGATTTATAGACGGTCACTATGTTATACACTATTCATTT GGATTAGTTTTTTTGAAGAGTTAATGATTATTAAATATGAATGCTGGATGATACAGTGTCAGTGTATAAAACTCTTTTTTTTCTCTTGTGATTTGATGTG AATTTATTCATTGTTTT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_148691; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_313376
Blastp | Transcription factor HY5 from Arabidopsis with 79.12% of identity |
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Blastx | Transcription factor HY5 from Arabidopsis with 69.17% of identity |
Eggnog | Transcription factor(ENOG4111CH5) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G11260) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019437116.1) |
Pfam | bZIP transcription factor (PF00170.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |