Id Trinity | TRINITY_DN46975_c0_g1_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_313951 |
Sequence | TTGAGACTATACAGAACCATAAGGACAAACTAAACCTCATTCATTACAACCACACACTTAGTTTTCTTGTAAGTGTTGCTTGCTCCTTAGCAACCTCTTA CTTTTACTGTCATATTGTTAACTATCTTCTAATGAGTAACACTCTCCTATTATTGTTTATTCTTTATTTCTCTGTCTTGTTTTATGATGCTTATGCTCTT ATATCTGATGGGGTGATTCTGTTGTCACTCTTGAAACACTGGACCTTTGTTCCTCATGTCATAAACTCCACATGGAATGCATCTGATTCCATTCCATGTT CATGGGTAGGAGTCAAATGTGACCATGCTCATAATGTGCTCTCAATTGACCTCAATGATCATGGCATTATTGGTCAACTTGGACCACAGATTGGACAATT GCATCACTTGCATACCCTTGTGTTGTCAAGTAATAGTTTCTCAGGTAACATACCTTCTGAGTTAAGCAATTGTAGTTTGCTTCAGTATTTAGATCTTTCT TATAACAGCTTTAGTGGACAAATACCTGGTAGCTTGAAAAAGTTGCAAACTTTAAGGTATATTAGCTTGGCCTCAAATCTAATGAGTGGTGGAATTCCAG ATTCCTTGTTTCAAATTCCTCACTTAAAAGAAGTGAGCCTTCAGAGAAACCAGCTTAATGGTTCTATCCCAGCTAATATTGGCAACATGACTGAACTGTT AAAGTTGTCTCTATATGGTAATCAGTTTTCAGGGAACATTCCTTCATCCATTGGTAATTGCTCTAAATTAGAGGCTTTGTTTTTGAATGACAACAGGTTG AATGGTAACCTTCCTGAGAGTCTTCAGAATCTGGAAAATCTTGCTTATTTGATGGTCAGAAATAATAGTCTTGGAGGTACCATCCCACTTGGTTCTGGAA GCTGTAAAAGATTGTTTATTTTGGATCTCTCACTCAATGCATTTAGTGGAAGCATTCCCTCTGGCTTGGGAAATTGTAGTGCTTTAGCAGAATTTGCTGC TCAGAACAACAACTTAGTTGGCAGTGTCCCGTCATCCTTAGGCTTGCTACATAAGCTTTTAATTCTTCGCCTTTCTGAGAACCATTTATCGGGGAAAATA TCTCCAGAAATTGGCAACTGCAGATCTTTGAAGAAATTACATTTATTTTCCAACCAACTGGAGGGAGAAATTCCTGATAAATTGGGAATGCTAAGTGAGC TAGAGGACCTTCAACTGTCTTTCAACCGCTTCACGGGTGAAATCCCAGTCAGCATTTGGAGGATTGAAAGTCTTAGGAGCATCTTGGTCCAAAACAATAG CCTTTTTGGGGAACTACCTTTGGAGATGACAAAGCTCAAGCATCTAAAAAATATCTCATTGTTTGACAACCGGTTCTCCGGAGTCATACCTCAAGGCTTG GGCATCAATAGCAGTTTGGTTAAGTTGGACATCACAAATAATAAGTTCACTGGTAATATCCCTCCTAATCTTTGCTTCGGAAAACAATTACTTGTGATGA ACATGGGGCTTAATCAACTTCAGGGGTGCATACCTTCTGATGTAGGAAGATGTGCAACTCTAAGGAGGTTGATTCTCAATGAGAATAATTTGACTGGGTT TCTTCCTGATTTTGAAAGTAACTTAAACCTCCGATACATCGACGTAAGCAAGAACAACATCAGTGGAGCAATTCCGTCAAATTTGAAAAATTGTGAAAAT CTCACTGAAATTAATATGTCGGCGAACAGGTTTAGTGGGGTCATACCATCGGAGCTTGGAAAACTTGTGAAACTTGTTGTTTTGGATCTTTCACACAACA ACTTGGAAGGTCCTGTGCCACCCCAGCTCTCAAATTGCACCAAAATGGACCATTTTGATGTGGGATTCAACTTCCTAAATGGTACATTTCCATCAAGTTT GAGGACCTGGACGAGGATATCAACAATAATTTTACGAGAGAATCATTTTACAGGAGGTATCCCGGCCGTTTTATCAGAATTTAGCATGCTTCGCGAGTTA CAACTTGGTGGTAATTTGTTCGGAGGCGAAATTCCACTATCAATGGGAACATTGCAAAATCTGTTCTATGGGTTGAATCTGAGTGCTAATGGATTGACAG ATGAGATTCCTTTGGAAATTCGGAAGCTAAGAGAGTTGCAAAGTCTAGATTTATCCTTAAACAATTTGACAGGAAGCATAGATGTTCTTGGTGATCTTGT TTCATTAATTGAAGTCAATATCTCATACAATTTCTTCAATGGTACTCTACCAAAAAATCTGATCAAGTTTTTGAGTTCCTCGCCATCATCCTTTATGGGT AATCCTCACCTGTGTGTTAGTTGTCCACCTTCTCAGGGCTTGAGTTGCACTAAAAATAGTTATTTGAAGGCATGTGTCGACAAGCCAATAGATCACACTG GCATCAGTAAATTTGTAATTGTGATGATAGAAGTTGGATCCTCAGTTTTTGTTTCCGCTATCCTGATAGCACTTGTTCGCAGCTATATGCGAAGAACAGT GAAGCCAGATGATTGTACAGATGACTTGTGGTTAGAGAATCGACAATTACCTCTTGCTTTACTAATGAAGGCGACGAATGATCTAGATGATTCATATGTT ATTGGTAGAGGTGCCCATGGAATTGTTTATAAAGCCAAAATTGATTCACATAAAACTCTAGCTGTAAAGAAGATTGTATTTGGAAGCAACCAGGAGAAGC ACTTAAGTACCCTGTGCAAAGAAATTAAAGCCCTTACATATAAGCATAAAAATTTGGTCACTTGTAGGGGCTACTATATTGGAAAGGACTACGGTTTAAT CTTATCTGATTACATGGAAAATGGAAGCCTTCATGATATTTTGCATGAAAAAGATCCCCCACCACCCTTAAGTTGGAATGTCCGGTTTAATATAGCGGTC GGAATTGCACAAGGACTAGCATATCTACACTATGATTGTATCCCACACATAGTGCATCGAGACATCAAACCAAAGAATATACTTCTTGATGCTAGTATGG AGCCTGTTATAGCTGATTTCGGTACTGCCATGTTCAGGAACCCTAGTGAGTATTCTGGTAGTCGTCCTCAATGTAGGCAAAATCTTTCAACATGCATTGC TGGTACTGCTGGCTATATTGCACCGGAGAATGCATATGCAACACTGCCGGGCAGAAAGTCTGATGTATATAGCTACGGGGTAGTTCTGCTTGAGCTATTA ACCAGAAAGAAAGTATTATTAATTTTGTTCACGGAGAAGAAGGAACAGGAGATCCATTTAGTTAGTTGGGTTAGATCTGTCTGGTTGACAACGGGCAAAG TTGAGAAGGTCGTTGATCCAGACCTTGCAAGCGCATTTCTCAATTCAGTTGTAGCAAGCCAAGTCAGTGGTGTTCTTATGTTGGCATTAAGATGTACAGA AAGGGATCCAAGGAAGAGACCAACAATGGAAGAAGTTGTTCACTTCTATCATAGAGGCAAGTTCACAAGGAGGTGGGGTGATGAGGTTTATGGTACAGAA GTTGTAGCTGATGTAGCACCACAACCATATAGCTCTCTTGATATTTTAACTTGTGTTCCAGTTGTCAGTACTACGTCAGTTTCTCCTATTCCGGGAGGCT ACAATCTCCGTGGAGAATGTAGTACGGCTGCACCGTTGAGACAGATAGAAGTTACATTGGATGTGAAGAGTGAACCTGAAGATTCTAATGATTTCGCCCG ATGGTGTGATGCTAGTCAATTTCATCAGGGAAACTCATGGGATGATTCGAAATCCATGTCTAAACCAAAAACTGGTGTTGATGCACTTGTAGCACAACAA CCATGTAGCTCTCTTGATCTTTTCACACATGTTTCAGTTGTAAGTATTGACTCAGTTCCTAATACTCAGGGAAACTACCTTCTACATGGAGAATGTAGTA AGGCTGCACAGTTAGAACAGAAGGTACATTCCAATGATTTCAGGTGGTGGGAGGATGCTAATCAATTTGGTCTAGGAGTCTATGACTGGGATGATTGGAA ACTCATGTCTACACCTACAACTTATATTGATGGACTTGTAATTGAAGTAATGGGCAATGGTAAGGTAGATGCTACACAAGTAGTGGTTGTGGCTCTAATT GTTCCTAAAATAACATACACTTGGCCTTCTTTGATCCTCCTTCCATCTGTAATTGGTCCATTAGTTACTGAGACTTTCAATTGGTTTTTTGTCTCTAGTT GGCATAAGTATATGCAACAGCAGAAATCCTTGAAATCACTGCCCAGATCATACTTTATAACACCAACCAAGGCCACTCTTGAACTAAGTGAAAGTGAGTA ACTATGGGAAGAATCCCAAAGTCCTTATAAAGCCAATATCTTTCAGTGGTTCAAAGCTTATGCAGAGTGACAACAGAGCAGAAGCATCATAGGAGAATGC AAAGAAACAAAAGCACTTACAAGTGAGTGATTGGAATTGAGATAGATTAGTTAAGAGAGGAGAAAATCTGGTATATTTTGTGCTTCTTATATAAGGTGAG TGTTAAACATATTACTGTACAATTGCAGGGGTTTTATTGTGCAAAATGTTTCCTTTTTTGGATTCATATTATGTCATTTATAAAAAAATAAAAATAAAAT GATTAATTTCTTTTTTGGATTAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_148721; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_313951
Blastp | Receptor-like protein kinase from Ipomoea with 50.18% of identity |
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Blastx | Receptor-like protein kinase from Ipomoea with 50.41% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (109187519) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019455870.1) |
Pfam | Leucine rich repeat N-terminal domain (PF08263.11) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |