| Id Trinity | TRINITY_DN47011_c2_g1_i4 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_372765 |
| Sequence | AAGATGATATTTTTACCACCCCAGACTGGAGTTACCATGGGTGGACATCTTCTGTCCCACAAATGTGTGCCACTTCCTGTGCCACCATTTCTGATTGGCC AGAAAAATAATAAATTATTATTTTTTTAACATTAATATATTTTTATTGGCGTAATCATAAGTTTCATGTTCTTTCCTTATTCACTCTCTCTATTCTTTTA TCAAACCAACCAAACAAACAAAACAATCCAAAAACCTTATTTTCTATGTCTTTATTTATGTCTCTGTTTTTATTTGTTGTTTTCAGTATATCATCTTAGT TTGTTGAAAATAGGGTTCAGAATATGAGCATTGTTCCCAAAGAAACAATTGAAGTTATTGCACAGAGTATTGGGATCAATAATTTCTCTCCTGATGTTGC TCTTGCTCTTGCTCCTGATGTCGAATATCGAATTCGAGAGATTATGCAGGAGGCAATCAAATGCATGCACCATTCTAAGAGAACCACATTGACAGCAGAT GATGTTGATGGTGCATTGAACATGAGGAATGTTGAACCAATATATGGATTTACATCTGGTGGTCCTTTACGGTTCAAAAGAGCTGCCGGGCACAGGGATT TGTTTTACATTGATGACAAGGATGTAGACTTGAAAGATGTTATTGAAGCTTCTTTGCCAAAAGCACCCCTTGCCACTGCAATTACTTGCCACTGGCTTGC CATTGAAGGTGTACAACCTGCTATTCCAGAAAATGCTCCCGTAGCAGTAATTTCAGCCCCTGCTGACGTAAAAAAGGAAGAACAGAAGAATGATAACCTT CCAGTTGACATAAAATTACCTGTTAAGCATGTACTATCCAGGGAGCTTCAGCTGTATTTTGATAAAGTGACTGAGCTAGCTTTGAGTGCGTCTGATTCGG TTCTCTTTAAAGAAGCGTTAGTAAGTTTGGCCACCGATTCAGGACTTCATCCATTAGTTCCTTATTTCACGTGCTTTATCGCTGATGAGGTTTCTCGTGG TTTGAATAATTTTCCTCTTCTATTTGCCTTAATGCGAGTTGTTAATAGCCTCCTGCAGAACCCTCATATTCATATTGAACCTTATGTAAGTTCACTTCTT GTTTGGTTTGGTATACTTGTTGATATTCTTGCTGACATAATCATGATCTTTGTTTAAGAAAATTAGTATTATTAATATTTAAATTAATTTTATGTTGGTT CACGTGGCGTGGTGTGGCAACTAATAAGGGTTTAAATTAATGTTATGTTTAAGCAAATTACTATACTTGTTAATATTTAAATTAACGTTAAAGCAAATTA GCACACAGCATTTGGGCATGGCGTGGCAACTAGAAAGGGTTGGAACTTTGGATGATAACTCGGTTCACATGAACGAATTAATACGGAGCTGTCTCTCATC TCTTTTTCTTTCCATTTTTCCGAGCTTTTCAGCTACACCAGTTGATGCCATCTGTTGTGACCTGCCTCGTTGCTAAAAGGTTGGGTAGTAGATTGGCGGA TGACCATTGGGAACTTAGAGATTTTACAGCTAACCTTGTTGCCTCAATATGCAAAAGGTGAGATATCCTCTGTCTATTCTGTTATATGTTGTGCATCCAA GGGAATGTAACAACTTTCGGTGGATAGTTTCTCTCGTACGCCATCTATTTTGTTGTAGTTGTTGCAGATTTTCTATATTTCGTTCTTTGATCCAATAGTA GCAAAGCCATGGAATCATATATTTGTTGAGTTTAGCCTTTGAAAGGCACACTTCAATGATTTCTTTTTCTGAATTTGTATCACTAAAGCTTATGCATTTT GTTGAGATCTCAAACAACTTCTAGCACAGTCATTGGCTTTGAAGAAGTTGAACTTGGTACATTCTGCCGATTCCTTAAATTTTAAACCAGAAAATATGGT TTTGCTTAATGACTAAAGGCATCTAGCTTGGTTCAGAATATTCTGTGGTTTGTTTGTGAGGCACTTGCAGATTTCATTGCGAATTTTGTCTTGCGATAAA TGTGTTATGCAGGTTTGGACAAGTTTATAGTAATCTACAGTCCCGGTTGACGAAAACATTGCTGAATGCATTCTTGGATCCCAAGAAGGCAATGACACAG CACTATGGTGCAATTCAAGGGTTAGCAGCACTCGGACCCAATGTGGTATGCACCTATCCTTACTCTTGGCAGCTAAGGAATCAGTTAAAACCCAAACATT GGAAAAATATTTTGGAAGACAAAAATGAATAAATGAGTGCATCAAATTTATTGTGTTGGAAATTAACCTTGTTATGTGTATTGTAGAACGCTGTTTGCAT GGGATCAGAATAGCCCATTAAAAATTGTAATTGATTAGTCTAATCTTTAAGGTTTCAAATTCAAAAAAATTATGCCCGGCGATATACTTTTGTTAATTCG TATTAAAACTTCTGAATGTACTGACTATATATGCTCCATGTGAAGAAAATGTTATTTAAGTAGAAGCTCGATATTATGTAGTATATTGACACCTTGGTTG AAGTCACAGTTTTGGGAAAAAGAATGGTGCTTGATGCTTGATGCTGCTTTATATACAATATTAAGCATGTAACATATTTTTTTTTTGACAAATCTTGACG ATAAAACTGTATAAGAGGGAACTTTAAGGATGAGATTGTCTAATTTTAAAAAAGCCATGCATACATGTGATATATCTCTTATAAATACCTGATCTGACTC GAGTCTGTTCTTTTTATGCATATCCTTAATCCGAAAGTAGGTTCGCCTTCTTTTGCTGCCAAATCTTGAACCATATATGCGACTTCTTGAACCAGAGATG CTTCTCGAGAAGCAGAAAAATGAGATGAAAAGGCAGGAAGCTTGGCGTGTTTATGGAGCCTTGCTGGTAAGATTTACTATCAAATACAGACTCTTGGTAG TAAAAAAATGTACGTTCTTTCATGACTAAAAAGCATTAGCATCAATATAATCTAGCTGTCCATGTAGCCGACCCCACCTAGCAGGATAAAGGTTCGGTCG TTATTGTATCAGTATAATGATCTGGTTGGTCTGATGATTGTATGTGTTATTCAGCGTGCTGCGGGTCAGTGTATATATGATCGACTGAAGTTGTTCCACA ATTTTCCATCTCCTCTTCCTCATGCTTTCTGGAAGACCAATGCAAGAATTCTTACTTCAACTTATAAGCGCAAGGCAAGCCTTGAACGATTGGAAGAACG ACCACCTTTGAAGAAAACAACTACCGATGGCGATGGCGATGTCGTTATGACAAATTCTGAACCAGTAGAGGAGGCAGGGACTCGAGCTTCTGCAGTTGAT CCCGCTTCATCATCTTCCGAGCAGACGAAAAGCGAAACTACTTTAGATGGCACAGTTAGAGGTAACAGGGATGATACTCTGGCGATGAAGACATCGGCCG CACTTGCCCAGGTTTGGAAGGACGAGCTGGACTCTGGACGTATCCTAGTCTCACTGTTTGAGTTGTTCGGTGAAGGCATTCTTTCCTTCATTCCTGCTCC TGAGATGTACATGTTCTTGTAACTTTCCGAAGGCGTATTAGAATTGTCTGTGGAAAGAAGATCATGGATCATCCATTGATGCTAATTTCGAGAACAAACT GACATTGTTCCTTGGTGTAATATAATATAAGCTTAGAAGTTTATTTCTGGTGATTGAATATTTGGCTCCACAGAATCTTGATGCTTTAGGTTTTGAATGA TGACACTCAATGTTTGCATACCATGATAAATTCCTTGTTGAAGCTTAATAGAAAATTCAAATATCCAAAATACTCATATGGGTATGTTAACTTGTTATTA GAGGCGTTGGTCTAGTGATATAAGTTTTACTGAAAAAAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_148982; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_372765
| Blastp | Transcription initiation factor TFIID subunit 6 from Arabidopsis with 76.83% of identity |
|---|---|
| Blastx | Transcription initiation factor TFIID subunit 6 from Arabidopsis with 76.83% of identity |
| Eggnog | Transcription initiation factor TFIID(COG5095) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G04950) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452094.1) |
| Pfam | TATA box binding protein associated factor (TAF) (PF02969.16) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |