Id Trinity | TRINITY_DN47019_c0_g1_i9 |
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Name Transcript | Ll_transcript_372364 |
Sequence | CATAGGAACACAAGAAGAGAAGAGAAAATAGGGTTTATTTGCTTTACTCATTTCTAAAATCATCTATTTTCAATTCCTCTTCTTCATTTCCTCTTTCTAT TCCTAGCTTATCCCAACTTCACCTTCAAACCCTAGCTTCATACCCATCACCCATTTCTACTCAATTTCACCATAATGCTGCTCCAATTTCACTTCAAGTG CATGTGTTGTTTCTGAGAGAAGAGGGAAGATATGGAAGGGGGTAACCATGGGGTTCTGTTATCTTGTGCAATTTGTGGGTCCCTTTTCACTGTTCTAGGG TTTGCTTCCTTCTTCTTACTTTGGGCTGTTAATTGGAGGCCCTGGAGGATTTATAGTTGGATCTTTGCTCGGAAATGGCCAAATATCTTGCAAGGTCCTC AACTCCATTTGCTCTGTGATTTCCTGAATCTTTCCGCATGGGTTGTTGTTATTTCTCCAGTTCTGGTGCTTATCATTTGGGGGTCCTGGTTAATTGTAAT ATTGGGTCGAGACCTGATTGGTTTGGCTGTTATAATGGCTGGCACTGCTCTTGTATTGGCATTTTATTCGATTATGCTTTGGTGGAGAACGCAATGGCAA AGCTCAAGAGCTGTTGCCATTCTGCTTCTTCTTGCTGTTGCTCTACTCTGTGCATATGAACTTTGTGCGGTGTATGTTACAACTGGTTCACGGGCATCTG ACCGCTATTCTCCTTCTGGTTTCTTTTTCGGAGTCTCAGCAATTGCTTTAGCAATCAACATGCTATTTATTTGCAGGATGGTATTTAATGGGAGTGGCTT AGATGTGGATGAATATGTACGTAGGGCGTACAAATTTGCTTATTCTGATTGTGTTGAATTGGGTCCTGTGGCATGTTTACCTGCACCACCAGACCCAAAT 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CAAAAGGTCAGCTTTTCCATTGCATTGATGATTCAACCCGAGTCTGGTCCTGTTTGCCTTTTGGGCACTGAGTTTCAGAAAAAGGTTTGCTGGGAAATTC TCGTGGCGGGTTCTGAGCAAGGTATCGAGGCTGGACAAGTTGGGCTTAGATTGATTACTAAGGGTGATAGGCAAACAACGGTTGCAAGGGAATGGAGTAT TAGTGCAACAAGCATTGCGGATGGAAGGTTTGGCATTTTTCTTTATATCCTAGTTATGCTTGGATTTTTAAATTTTATGTACTAATGTTTCTGAGTTCTC TTGTTATTCATGTTTTACCTGTTGTTGCAGGTTGTTCTCAAATGCGTTTTTGAAGTTTTCCTAGTTTAACATCCTGTTATTATAATTTCATTCAGAAGCA TTTCATAATTATTTGGTTTCAGTCTTTCTTATTGCTTTTGCAGTTCTTTTCGCCAAAGGTTATGTTTCATGATTTCACCAATAACTCAAAATTCAAAACT TAAAAGTGTTCAATATCTCTGCCAGCTTTATTGAGATGCACAAGATAACTAGTTTTACCTGAAGACTGTCAGCACCTACTTTTGTTCTTAATTGCTTAAT TTGGATTATTCTGTGTAGATGATGCTGTTTTAATGGTGGTAAATTATTGTTTTACTTTTTGACATTTCTGCTTGAATAATTCCGTGCAGGTGGCATATTG TGACAATGACAGTTGATGCTGATTTAGGTGAAGCAATATGTTATTTAGATGGTGGGTTTGATGGCTACCAGAATGGTCTGCCCTTGTGTGTGGGTAGTAG CATTTGGGAACAAGGGACGGAAATCTGGGTTGGTGTTAGACCTCCAACAGATATTGATGCATTTGGGAGGTCAGATAGTGAGGGAGTTGAATCTAAGATG CATATTATGGATGCTTTTCTCTGGGGAAGGTGCTTAACTGAAGATGAGATTTCTGGTCTATATACCTCAATCGCTTCGGCTGACTTCGGTGCACTTGATT TCCCTGAAGATAATAATTGGCAATGGGCTGATTCACCCTCTAGGGTTGAAGGTTGGGACAGTGATACTGCTGATGTAGATTTATATGACAGAGATGACGT AGATTGGGATGGACAATATTCTAGTGGGAGGAAAAGAAGGTCAGAACGTGATGGTGTGGTGGTGGATGTGGATTCCTTTTCCAGGAAATATAGAAAACCT AGAATAGAAACACAGGAAGAGATTAATCAACGGATGCTATCAGTAGAATTGGCCATCAAAGAAGCTCTTTTTGCTAGAGGAGAGCCACAGTTTACTGATC AGGAATTTCCTCCAAATAATCAATCGTTGTTTGTGGACCCTGAAAACCCCCCAGCAAAGTTACAGGTCGTTTCTGAGTGGCTGAGACCAGGTGAAATTGT GAGACAGAACCATCTAGACTGTGATCCATGCTTATTTTCAGGAGCACCGAATCCTTCAGATGTTTGCCAGGTTTCATGTTTTTCTTTTAACATGCAAGAA TTTGACAATAAAAGCTTGCTTATTGTATATATATATGTATATATATATATGTGTTCTGATGTTATGTACTTATATGTGTTTCTAAATTGGTCTTAATAAT TGTTCTGTGCATTGAATAGGGTCGGTTAGGTGATTGTTGGTTCTTGAGCGCTGTTGCTGTTCTGACAGAGTTTTCACGTATATCTGAAGTAATCATCACT CCAGGATATAATGAGGAGGGAATATACACTGTTCGTTTTTGTGTTCAGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_149014; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_372364
Blastp | Calpain-type cysteine protease DEK1 from Arabidopsis with 75.37% of identity |
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Blastx | Calpain-type cysteine protease DEK1 from Arabidopsis with 75.37% of identity |
Eggnog | Calpain-like cysteine peptidase(ENOG410XP0B) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G55350) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019461690.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |