Ll_transcript_371992

• Id Trinity: TRINITY_DN47020_c1_g1_i7
• Name Transcript: Ll_transcript_371992
• Sequence: CAACGACGTCGTCTTCAAGCGGCGACAATGAAGCATCGAAGATAAAGAAACAGTGTTTGGGTTGGATAGAATGGTTCAGAGGTTGGTTTTGTCTCATATA CGAAATGCTGTTTCAAAGAATCATGGCCAGCCACTTGCATAACCCTATGCCTCTACCTCCAATCAATGACCTTACCTGCATTGTTACTGGATCCACCAGT GGTATAGGCCTCGAAATTGCAAGGCAATTGGCACAAGCAGGGGCTCATGTTGTTATGGCAGTGAGGAATACAAAGGCGGCTCAGGAGTTGATCCAGAAAT GGTCGGTGGACTCTGCTGGGTTGGGTATTGCTCTTAATGTAGAGGTGATGGGTGTTGATCTTCTCTCATTGGATTCTGTAGCAAGGTTTGCTGAAGCATG GAATGCACGATCAGCACCATTGCATGTTCTCATTAATAATGCTGGAATTTTTTCCATTGGAGAGCCACAGAAATTTTCAAAAGATGGTTATGAAGAACAC TTGCAAGTGAACCATCTTGCTCCTGCTTTGCTTTCAGTACTTCTGTTGCCATCCCTTATTAGGGGTTCTCCGAGTCGAATTGTTAATGTGAATTCCATTA TGCATCATGTCGGCTTTGTTGACGCTGAAGACATGAATATCACATCTGGAAAAAGGAAATTTTCTAGTCTGATGGGGTATTCAAACAGCAAGCTGGCACA GGTTATGTTCAGTAGTGTCCTTAATAAGCGACTCCCTGCTGAATCTGGCATCAATGTATTGTGTGTGTCACCTGGAATTGTCCAAACTAATGTTGTAAGT CTTTTGAAGAATTTGAACTTCTGTTTCTAAAAGGGACATATATGGCTGTAATAAATCTGTGAGAAACTGAATGTAATTTCTGCTAATGGGGCAGCATCGT ATCTAATTAGTACGATTATTTTGCTATAAGGCAATAGAGAACCTTGGGAAGTTATCTTTAGTATTGTAATTTTCTTACACCCCTTGCTCATGTCTCTGTC TGTGAGCCTTGCTGAGAAAAAACAATAGATGTGGTAGGGGTAGATTGTATTAAGTGGAACACACTTTTATACCATAAGTAGTGCAACATTACCATACATT TTTAAAGGTTCCATGAAACTGAATTTTGTCTTCCAAGTTGAAATTATGCGGTGATACTGGATTTAGAATTTACAAGTCAGACTAGCCCAAGGTATCATGC CTTAAGTAGGTCAATCCTTGAAGTGAAAATTACAGCATCCAAGTGCAGTCTAAAAGTAATGTGATTAACTATTCCTTTAATGGATACTTAGGTCCGTTAA TGTCTGTTTCAAATATTTGTAATGTGATTAACTATTGTCTAGGGTAGCTGTTAACTAAATTTTTTAACAATACCCATAATAATTATTTGCACTAGATAAT TTGCAAACCGTACTCGGATGATTTGTTTAAGATTATCTTTCTATTGTTGAGTTGAGGTTTGATTAATCAGAAGTCTTGGGAGGCATATTTGCTTTGTCTT GTATGACTAGTGTTTATTTTGAAATGCATGTTACAAAGTAGAAAAATAAACGATGTTAAATTAATCAGTTCTTTGAGAGAATAATATAGTGTCGACTGGG TTGAAGAGTTATCTAATAAAAATAAAGCTTGGTTATATTAAACTGAGGGATATCATTGTATATGATTAGATAACTCTGAGGCTAAATGGTAAATTATGTT AACCATGATATGCTGTGTCTACATGTTTAAAAGGATACGGTGCTAGGCTGGTAAGGACATAATTTATTTTTCATTTTGGAGGATTCAGAATCCTGTTTGG ATCCTGTAGGAGTTAACTGCTACAATTTCCGTACTTAATAGTGTCGCTAATGAAATAGTCATGGTTTGCGGTTTAAAATAGTTGATTGTGGAGTAAGACT TGCTAAGTTCTTTGTTGTATAACAGGGCGTCTATTGTCACAGATTCCTTTTTTATCTGCATTGTTTCATAAGCTTACTCCTTTTTTGTACTTTCAATTTT ATATAATGCAGGCAAGGGATCTTCCAAAAATTGTTCAATCGACATATCGTTTGGTACCTTACTTCATCTTTAATGCTCAAGAAGGTCTGTTTTATCACTT TTTCATGATAGAAATACTTACCGTCTTTAGTTTTTAAGTTCTATCGTGGTCATTGCCTGTTTTAGATTTGTGATGTGGCTCATGTGCTCTCGTCCTTTTG GATCTAACATTTTGGTGCACTTAAAATTACTTCATTTCATATAGTAAAATATGAATTTCAGTCTTGGCAATATGAGGGCTTCTTGGATTGGGATTCTCAA AAAAGTGATTCTCCAAAAACTTTTCCAGAAGATTTTTTTTGTGAATTCACTCTTTGGAGCTTTTCCGGCAGACTTGCAAGGAAAAACCTAAACAAACTGG TCTTAAAACATGTTTCAATGTTAGTTCAATTGGCCAACCACCCTAAGTAATTATGCAAACAAAAGTAATTGGGTGCTGAAAGTTTTCAGGACTGACTATG AAGATAACATGACTAATGCTGCAATACAGGTTCCAGGAGTACTCTTTTTGCTGCCACTGATCCTCAAATATCAGAGTATTGTGAATTGTTGAAAGCAGAT GAGTGGCCTGTTTGCGCCTTTATTTCTCAAGAGTGTCGTCCAGCGAATCCATCAGAAGAAGCGCATAACATTCAAACAGCATATGAAGTATGGGAGAAGA CATTAGAGATGACTGGTCTTCCTTCTGATGCCTTGGAGAAGCTCCTAGAGGGAGAAAATGTTAAATGTCGGTACGGACATGAACAACAGTAATCTAATTT CAATGATGACAGTAAAACACATGAGTAGCTGTAGTATCCCATCCATTCTCCCCCTTACTGATTTCTAAGGGCATTTACATTATTTATAACTAAGTAACAA CCATCTTACTCCTAATTTGTCGGAGAAGAGCTTCTTTTTTTCCAACAAGATTGATAATGGCTATAACTTTGGTACTATCACATTTTTAGGGGATGTTTTC AGATCCAAAATTTAAGTGTATATCCATTTTGACTATAGAAACATTTGGGTTGGTACATAAATTCCTAAACTTGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_149018;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_371992

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.5
• PS2: 0.6
• PS3: 0.5
• PW1: 0.3
• PW2: 0.7
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_371992

• Blastp: Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic from Pisum with 38.14% of identity
• Blastx: Dehydrogenase/reductase SDR family member on chromosome X from Homo with 37.44% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019458836.1)
• Pfam: short chain dehydrogenase (PF00106.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;