Id Trinity | TRINITY_DN47052_c1_g1_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_372453 |
Sequence | CCAGGGTGTATGTCTTTTCTTCTCATTCCACATTTAATTTCACGTATTTTGTTCATTATCATTCTCTCTTTTTTATATTGATGGAATTTTTTAGCTACTT GTTGGTGTATTTTTATTTTTTTAGACTATTTACCCAGATCCATATTTGGTCCTTACAAAACTCAAACGTGGGTTAAAATAATAGTACTTTTTCAATAGAT ATTTAGGGATTCGTCGGTTCCTGTTAATGTTTATTCTGTGCAGCACATTTTTTTTTTCTATGAATGTGTGTTTACACTTTTAATTTTGATTTGTTTCAAA AGTTTCAATCTGCTATTTGACATTGTTTATTGTTTACTATTAATAAGAATAAATTTATGTGAATCAGTTATTGTTACAATTTTTAGAATGAGATGATATC AAGTAAACATGCTTATAAGAGTGGTTGCTTGTCAAATTTGTGCTTATTATTTTTATAATCAGGTTTTCAATTTTTTTTTTGTCTCTGCATAAATTGTCAG CATTGAATGGATTTCTCAGTGGTTGTTCTATTTATATTTAGGAACTGCATGGGGTGCTTTGTTCTAGTTGTTACTTTTACTTTGCTTGGTCTTAATTTAT GATCATTGACAATTTTTAATGTTCAAGTTACAAGGCTACAGTGTTGACCAATGTTTCACATTTTCAGATTCCACATTTGAGGCCTGCAGAATACAAGAGA TCTAGACTGTCAAGAAACCGGAGGACTGTGAATCGCGCATATGGCGGAGTTTTGTCTGGAGGTGCTGTCAGAGAAAGGATTATTCGTGCCTTCCTGGTTG AAGAGCAGAAGATTGTCAAAAAGGTCTTGAAGATCCAAAAGGCAAAGGAAAAGCAAGCTTCAAAAGCCTGAGTTTGGGGGAAAGAGATAAAAGATCTTTT TCGAGAAATTTTAGGTTTGGTTGATCCTAGTAAATCATGAAGCTTATTATTAGAGCTGTTCAGATGTTAATTTTGTGCTCTTATTTGGTGAACTCTTTCC GGTACAATTCTTAACTTTGTCGACAATTCCATTATGATACAGTTTTGATGCATTTCTTTTCTTGATGGATTATTGGCTTCAAGTCATATGTTTTTTGCAA TCTTCAACTTTATCTACTATATACACATTGGTTGCATAGACCCAGAACGATTCTGTTCTAAGCTAATTTTATCTGATTTCCGTATCAGTTTTTGGGCTGA ACAATATAGTGAAAAGAATGGAACCATATTTCTAAAAAGTGACACTTTATATGTCATGTAACTTGCTTACATTGATTAGTGATCTCTTTACTCTTCTAAG TGTAAAAGTTTTTGCCATTATTTATAATTTTGAACCTCTTTTTGGAAATTCATAGTACTTCTGGGCATAGTTGTAAATACCACGCCAGTTAGTTTAATTG GGAAACTGGTGAATCGTTCCCATATTTATGTTTGGACATACAATTACTTTATGTTGGCCAAACTGGGTTGTATATGAAAAAAAATCCTATTTTTCCCAAA GAACAATTTGAATAATTGAAAAATATATTGTAAATAGTATTTATCTCATAAATTTATTATGAGTGTAATATCTATCTATTGACAGTATAGATGTATATAT ACAGTCATTGTATCATTCATTTGGATTATTTCTTTTATAAAGAGTTAATGGTGATAAAAAATGAATGGTGTATCAGACCGTGACAATATAGAAAACTTAT ACTATTAATGTATATATTTGTTTCTCTTATAATATATAACATAACCAATACTTTTAATTGTAAATCAATATAATAACCGCTGGTACACAATTAATAACAT TATTATTAAGGTCTACGTTCATTTCCATAACTTTTCTGTCTTTCCCGTTTTCCTCATTTATTTCAAACTCCACTTTTCTACATTATTACAGTCCCCAATC AGAGGAAATTAGTGTCCATCAATTTCAAATTTTCAATAATCTAATGTCAGATGAATTTTTTTTCTAATTTTGATTTGGGTCTACTCAAAGTGGAAAGAGA TAATTTTTTAAAAAGAAATCCATTTGAGATTATGGAAAATGAAATGGAGATATTGTTCTAATTTTCTACGTTTTAGAATTAACTATTTCAATTTACAATA AATATCATATGGCGCTTCAATTGTATTTAAGTTCTTTTTAAAATTTGTTTGAATTTGGGATTGTTTTTATTAGTTCACCTCTCCCATTATCTGCAACTTG TCACCAATTAATAATTAAAGTCATATAGTTTATTAAAGGTGAAGTTAGTAAAATATTAAACTAGCGATGAAGACCGAGGATAGACAAGGAGTCACAAAAG TGATAGTAACATATACCAATCAAGTCAAACCACACTCACTCAAGCATTTTTTCACACACTTTGTATGCAACTATGACAAGTATAGGGTCATGACAACGGA TGAGGATCCTCTGTCCCGTATTCCTATCCCAAACCCTGTCCCGCCCAATGATTGATTGTCATGTCATTTAAAATTCCAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_149338; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_372453
Blastp | - |
---|---|
Blastx | 60S ribosomal protein L34 from Pisum with 97.62% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428122.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |