Id Trinity | TRINITY_DN47069_c1_g1_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_371320 |
Sequence | ATTTTAAGTATTTATGTGTTGTTCAATCTCAACTATTGAGATAAAGACTTGATTATTGTTGTTTATTTCAAGTATTTATACATTGTTCGATCCATGTGGC CAACCTCACCTATTGAGATAAAGGCTTGATCGTTGTCGTCTATTTTAAGTCGGTATTGATGTTTGCCTTAGGGTTAACTTTAGATGGAAAATTGCATTAA TTCTAATCTGGTGTTTTCTAAAGTACTTAGTTCCTCCACCTTAACATTTTCGATCCAAGTTAATGTAGATGACGAACATTGACTCGAAATGAAGGGACTA AAGTACAGTTTATCAAATTAATGGTGTAAGCAATAACTTTAGAGGAGCCAAATCTACATGAATCATATCAGCCAAGACTACTTTTTCGATAAGAGAGGTG ATACCGGTTTATCGTAATCATCGAATCTTTTTTGAAGATTAGAAAAAACGCATATGCTTCTTTTTAAGTAGTCACGCAACCTTTTAATTTTGAGCATCCT TGTATAATTGTTGTTCAAGATTTGTTCTTCTCACTAGATATGTCACATATGTATATACTATATAGTTTACTTTGTTATTTCGGAATTTGAATAAATGATG ATATATTTATTCATGGAGATGTTGTAATACTTCGGTAATTTGTGTATCGGTGTTCTTAGAGGACAGAAGACAAGGGCAAGGAATTCGGGTCGTACGTTAA ATCTGGGAAATTAAGATGGTTTGTGAGGGAAACTGGTATTATCATTTCTATGCTGACAAATATGCTTTCGGTTGTCAAGTTTATGAAATTGCTAGACAAG TATATATTTCTTTCGGTCTCATGGTTTGCAGGATCAGCTGAAAGCAGACGCGGAACAATTCTATTCCTTCACGGAGCACCAACGCAATCTTTTAGCTACC GAGTTGTTATGTCTCAGTTGGGAGATGCGGGTTTCCACTGCTTTGCACCTGACTGGATAGGATTTGGTTTCAGCGACAAACCACAGCCCGGATATGGTTT TAACTACACAGAAAAGGAGTTTCATGATGCGTTGGATAATCTGCTTGATGTGTTACGGGTCGAATCTCCCCTATTTCTAGTTGTTCAGGGGTTTCTTGTA GGTTCATATGGACTAACTTGGGCCCTGAAGAACTCAAGCAAGATATCGAAGCTAGCAATATTGAACAGTCCACTAACAGATTCGTCCGTCGTTCCTGGAC TTTTTCAGAAGCTAAGGTTTGGTTGCTATATTACCAATGAATTGTTGCCGAATTTATAGTTTCCTTGTTGTATCTCTTGATTTTATTAATCTCAAGGCGT TATACAAGCACCATGTTCGCTTCCAACAAAGATTTTAACCGACCATTTTCTAGAACATGAGTCCTCCTGTTACTGAATATTCCCTCGAGGCCTCAACTAA AGAATGCTCTCGTTCGTGTTGCGTTGAAATGACTATAAATCCTTAAACGGTGTTAGTTGAGTGTGGAACATGAATCCTCTGTCGCATTCGTATATAGACC TATCAACTTGGTCACACTATTAATCATATATTCTCTTAATGGCATGAGCAAAAACACTTCATCCATCCTGAAAATGTGATTTCTTCATTTCCGATGTATC GTATAAGCACAAACTTGATAGTGTCTGCATCGGATTTTGATGGCATCACCAACGGAAGCTTGATAGTTTAAGCAAATATACCATGTTTCGAAATTTTAAA AGAATGTTCCGTGACATTGTTTTCGCTATGACGTTTTGAAATTGAAGGTGTGTGGCCAGTAATTATGCTCTACATGTTACTACACAACTTAATTTAATCC TTCTTTGTCTTTTGGTTTATCTTAGCTGTTTGATCTTGATCATTGTATTATATTGACACTATTCGTTAATTTTCTCTCCTTTTCAGAATTCCTCTATTTG GCGAGTTTACATGTCAGAATGCGATCGAAGCTGAGCGGTTTATTGAAGCAGGTAGCCCGTATGTATCCAAAAGTGTATTTCGTAATTGTCTGGTAATTTT ATGAACTGTAGTTGTAACCTGCAACTTATACCGTCACTTTCACTGCATTAAGTTCTATTATAGCTTTGCAATTTCGATTAAGGTAAACAATTTAATTAGC TTAGGTGAATAAATTGTCCAGTTTCGGCCATTGCGTCAAAATCTCCCGTAGCCATTGTCGTTCTCAGTCTCACCATCTCATTGGAAATTTTCATGTCAAA GCATTAAAACATGATTAGACATGAGACAATACCTTCTCAAATTATAACTTTTTTGTGTTGGCTCTAATATAGCACATTATTTTGCAGTTATGTCTTGAAA AATGAAAAGGCGGATGTGTATCGACTACCGTATTTATCAAGTAGTGGACCGGGATTTG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_149524; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_371320
Blastp | Haloalkane dehalogenase from Xanthobacter with 32.88% of identity |
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Blastx | Haloalkane dehalogenase from Xanthobacter with 32.65% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019454482.1) |
Pfam | Serine aminopeptidase, S33 (PF12146.7) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |