| Id Trinity | TRINITY_DN47136_c0_g2_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_310272 |
| Sequence | CACAACAAACACTGTGTCACTGTAAACTTTACCTTCACCTCCAAACCCAATTTAGATACTATACCTAAAAAAACAATACCAAAATGGGTGACAAAAACAA ACCCTCAAGCTCCAAAACAAACACACAAAATGCAAAAACAAGCATGTATAGTAAGACATTATCAAACATTGGAAACCTAATAAAGCTTCTCCCAACAGGC ACTGTTTTCCTCTTCCAATTCCTCAACCCTGTCCTAACCAACAATGGACACTGCACCACTCTCAACAAGTATTTAAGTGGCGCTTTTCTCTTCTTCTGTG GCTTCAACTGTGCATTTTCTTCCTTCACCGATAGCTACACCGGTTCCGACGGCCAGCGCCACTATGGCATCGTAACCACCAAGGGACTATACCCTTCTCC GGCGGCTGACGGTGTTAACTTGTCGGTGTATAAGCTTAGGGTTGGGGACTTTGCGCATGCTTTTCTTTCGGTGGTTGTGTTTGCTGTGTTAGGGTTGCTT GATACTGATAGTGTGCAGTGTTTTTACCCGGAGTTTGAAACTGGTCAGAAGCTTTTGCTGCAGGTGGCGCCGCCAGTTATTGGTGTGGTGGCTAGTACGG TTTTCATGGTGTTTCCCAGTAATCGCCATGGGATTGGGTACCCTACCAGTGCTGATTCTAATGATACTTCTCAGAAGTCCAATGCATAGAATGTCTAGGG GCAAAGATAATCTCTATGATAAACGGTATCTCATTCCAAATTCAGAACTAATCAAAATATTACATTTTATTTTTAAGATTTCTTTTATTCATATGATAAT ATGTGATTGTTTAGTTCTAGCAATTATTTGTTCTATTGTGATTGTGGTCTTGTGTCAACTCTGTATAAGGTTGATATTATATTGATCCAACCATTTGCAT AATAAATACTAGCAATATAAATAAGTTTTGTTTATTTTTGCCATATTTTTATGTTTCCATCATTATTATTTGTATTATGATCGTAGATTTAAATCCTGGA AATAATATTACGTAAGAAAGGGGTTAGATTAATATAGTAGTCTTATTAGATCCTCCTATATGATAAATGGTTAAAGACAATATTAATTTTTTAAGAATGA TATTTGTTTTGGAAACACTTGAACTCAAATGGATTATTTCCTTATAGAACTTATATCTTTTGATTAACGAAAAAAATCTCTAATTTTGATTCTTTGAAAC TCCTAATTCCCATTACCACCATACTAGAAATTTCGTCACCGTTACTATCTACCATCTCCATGATTGTCCTTAGTAGAATGGGTAGTTTAATTTGGTCTGG CCACGAAGTGAAACATGTTTTGTTAATAACAATTTTAATGTTGCGTGCTACTTAATAATTTTCATAGTTGATGAAAAAGTACATAGTGAATTGTTGGACA AGTGACTCTTCCTAATAGAATTTCCATTTCTTCATAATTTATACTATATTCACCCTATAGGCTTAAATCCCAGATTTCTTCCTTCTTAATTCTTATACAA CATATTTTATTGCCTTTAACATCTTAGATTAATTATTATAGCTACTTGTGTAGTTGAATTTCTCTGACCAATAATTTATACAGAAACTATAAGAAAGAAG TCAAGAATTCTTATTTATAGCACAATAAAACAAAGGAGGGAGAAGTGAATCTATATTAATTTCACAAAAAAGAAGTATCAAACTCTGCTATGTCCCACAA TATATGTAGAGAAAGAAAGAACTAAACAAAAGGATATTGCTAAGAGTTTAGATAATATTCCTCTTATTGATTTGCTAAAAAAATATAATATTACTCTTAT TGATAAAAAAAATTAATATATCAAATTAACCGTGACATATGTAATCGTGTATCATTGATTTTTATACGCATTAACCGTAAAAAACACTTACTTATCATCT GATTTAATATTTGTACACATTCTTTTTTAGGATTATTATCACATTCTTTAGTCACCTTAACATGTTATGTAATTAATGAATAGTTAAAATATTGAATAAA GTAATAACACGGCTTTAATTTAATAATAGTAAAACGACAATATTTGTCCTAAATTAACAAAGGAAGGGTATCTAGTTGCCTAAATTACATCCTTGTTGTG GAAGAATGGAGGTAGGCACTTCCTAAAAATTAGGCTGATATTTCTGGAAAAAACAGTCCACGGACATTAGAGTTTCATATTATAAGTTTTGTGGACCAAC ATGGAAATGATAGCTTATTAGTGGGACACTTATCACCTAATATTAGGCAATGTTTTTTTATATTAACTATAAAAGTTAATAGGTTAGTATTTTATAGGTA ATTGTGAGTGGGATTTGAACCTGGATTTCCTTATGATTTTATTCCTGAAGTTTTTCTACACTTATTATGTGATCATTTTATTACTCCTTAGTAGACTTAA AGTTATTGGAGATGATCAATTTATTTTAAGAGTAAGTCTAAAAAGACTTATTCATCATTTTAGTCATCAGTTCATTGGAAATTCAATTGTTTAGATTTAC CACTAATTCAAATCATTGAATATCTAGAATTGATGATTAAGATAAAGAGTAAGTCTTTTAAACTTACTCT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_150073; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_310272
| Blastp | Protein DMP2 from Arabidopsis with 56.74% of identity |
|---|---|
| Blastx | Protein DMP2 from Arabidopsis with 56.74% of identity |
| Eggnog | Protein of unknown function (DUF679)(ENOG410YF1H) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT3G21550) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419568.1) |
| Pfam | Protein of unknown function (DUF679) (PF05078.11) |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |