Id Trinity | TRINITY_DN47145_c5_g1_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_309012 |
Sequence | AGTTGTGGATTGCAATTTAAACAATGTGTGCCTTTACTTATATATATATATATATATATAGTTAACTGCTACTAGGTACGGTAGTCTGGTACGTGGTTCA CTTGGGTATAAAGTTTGTTATGATGGACCCGGTATGTGGGGCGCAATATAATGATATAGGGTAAATGAGAGAATTATGTAACTATGATATTTTGTATGAT CTTGGTGTGAGGAATTTGAGTTAATGCAGACATGCTTTGTGCTTTGAGTTATAGCACTTCACTTGATTTCAAGCAGCTGATTTAATAAATGAATTATTGG CTTGGGCTCAAAACTCTTTCGAACTTATCTATCTCTTTCATGAGAATTGTGATTCATTTCAGCCAATGATAGTGCTCTTATGCCTTTTGTTTTAAAGGAT AGTGCTCTTGTGCCTTTTGTTTTAAATTCATGTTTGTCTTGTTATGTGGTGATTTTCTGAATCCTGAGCCAAATAGGTGTTTGGGCATTTGACCTATTTG TACTTTGTAGCCAGAGATACTGGCATTCATGTTGAGTAAAGAGATTTAAAATATACGGAACATTTAAGATGGTTGTGTTAAGATAGAGGATCTCCCAGCT TTCTAATTTGTATACTCTGCAGCTTTGCTTAAATTTACTAGTATCACTTGTCGTTAAAACGATAGAAAGACCAAAATTTATAAGAGAATCAAGGCAATTC AGGTATTTTTATGATGTGTCCCTGAAATTACTTTCTTCGAGGTTACCTAGGAATTATCAAGCAGGTGGCTGGGAATCTCTTCTGTGACTGGTGCTCGCTT TTCTCCCATTAATTTTCCTTTGATAGACACAAAGAATGAAGAGGTATTCATTATACAATACAGTTCAGTTAAAAAATTTTGAATAACTAAAGAAGTTTCT TTTTTCTTGGCCATTACAATATTGGCTCGAAGAAAATATATGAGATTGTAACCTGTCTCCAAAATTTTCTTACACAAGTAGAAGTGGCAAAGAGATTGAC AAGCAGACTAATAATAGTTGAACATGTTTTTATAACTTGCATTTATTAGTCTCTTCACTATACTGCTCTCTGTCAGCAGTTTAAAAATGCTGTAAATTAC CAGCTTATAATGCTTGGATCCGTCTGTTCACAACATTCCTTGAGCTTCTTGCACTACAGATAGGACTTCAGCAAATATTGAAAATTTTATTGATTTTTAT TAGCCAAATAGTTCCCCTTCTAACTCTTGCATACTGTCTTTCTGTGGAACCAGCACACTTTTTTGATGGATTTCCCTCTTTTCTTTAAATGTTTTAATTT GTAATATACTAGGTTGTTAATTGCAATACCCTTGTATTATATAACATATAGCAACAAAAATGAAGCTTTTTCCCACTATATGGGACTGGCTATATAAATA TAATACCAACAATGCAAAATTTTGCTAGGAGAACTCATCAGTTTTTGCATCTGCTTTTGTTATGTAGATGTGATGGACATCTATTATTAGTGATGATGAA AAGATATAAGTTTTCATTTTTATCTGCTCCTGATCTCAATTGTGGTTTTTGGCTGCTCTAGGAATTAAGGATGGGGGAAGTCCAGCTTGGTTCACATACT TTGCGTTCTCATGGATATACAGTTGCAAGAACGCACAAGCATGATTGGCTCATACTCTTTCTTCTTGTGGTTATTGATATCATCCTATACATTATCCATC CTTTCTATCGCTTTGTGGGGAAGGATATGATGACAGATCTGAGATATCCCCTGAAAAGTAACACAGTTCCTTTTTGGGCCGTTCCTATATATGCAGTTTT ATTGCCTATGCTGATCTTTCTTGTTGTCTATATCCGAAGGAGAGATATCTACGATCTTCATCATAGCATACTGGGTCTATTGTTCTCTGTTTTAGTAACG GCAGTAATTACTGATTCTATAAAAAATGCAGTAGGGCGACCTCGACCAGACTTCTTCTGGAGATGTTTCCCAGATGGAAAGGATGTTTATGATACTTTGG GTGATGTTGCATGTCATGGTGACAAGAGTGTAATAAAGGAAGGACATAAAAGTTTCCCAAGCGGCCATACTGCATGGTCATTTGCTGGTCTGGGGTTTTT AACATTGTATTTATCTGGGAAAATAAAAGCATTTGATAGCAAAGGCCATGTTGCAAAACTTTGCATTGTTTTTCTACCACTCCTTTTTGCATCACTTGTT GGGATTTCAAGAGTTGATGATTACTGGCATCACTGGCAGGACGTGTTTGCTGGAGGTCTTTTAGGTCGGTCCATCTTTAGTACCGTAATTAGTTGTACTC GTTAACTAGGCGTTGTGTGTTACCAAAATACGGGGAAAAAAGAACTTACCTTACCGCTGTCGTTGGTTCTTGACTTGTCTGACTATGTAAGAATTCTTAT TTTAGGGCTTGTCATGGCTACGATATGCTATTTGCAGTTTTTCCCTCCTCCTTATCATTCTGAAGGTATGCTTCAGTTCGTATTATATTAGATAATTTAT CGTATAAGAATTTATTGTTTATATGGCTGTGTATGTGCATTGGCTGGTTGTGTTTGTTAGTGTTAACCCATGTGTTTCACGTATGCTTGATGATACATCT TTCCCTTTCGGAATAGCGAGTTTAGACTCTAGAGGATTTAAACCAACCACATAAGTAAGTGTGAGTTATCAGTATAAAGAATTTTGTCGGCATTGTTAGA TATTCATTGAAGGTAAGCCTTGGCACAACAATAAGGTCGATGCCTTGTGTCTTATAGGTCGTTAGCCTGCTTACGGGGATTAGTCTACACGCATCTATCT TTTCCAGACCCCGCCAAGTGGGAGTCTCATTTATCAGGCACCTTGTTGTTAGCTATTTTGTCGGGGTTTACGGGGGGATTAGTCTACGCATATCTAGCTT TTATTCCTAGTAAACATTAATTTTGAAATCTAATCTATTTCCCTTCAACATTTACCGAGCTTATAAATTCGATTTTGTTATGAAATATGCTTCCGACCAC CTTAATCTCTAGACGTGTTATTTTTCTCTGCAGGCTGGGGACCGTATGCTTATTTTCGGACGCTAGAACAATTACGAGGTATGACACAAGCTCCTAATGC TCAAACCCAGTTATCAGAGGCTCGGGTTGAGAACCAGGGTGAACAACGTCACCATGGTTGTATGGGGTTAGGCTTATCACGGGAGAACAATGGTTCAGCT TTGGACGAAATTGAAACCGGGAGAAGATAAGTTTTTTTGTACATCTCATGATCTTGCTCTCAGATAGTGTTCTTATCCTAGGATCTTATTACTGTCTTTC AAAACATGTTTGTAAGAATTAGATTTGTGAGTGTTCCAAGTTTGAATTGATTATAGATTTTCAAGAATTAGCTAAGGTATTTCTACAGCATTTGATGGTT TTAGTAATACAAGGTTTGTTTTGAACATTTGTATTTTTGTAACTATCAGGAATTAGTTACTGAACAATGTTTTTTTTTCATAGTTTGAACAAATTTTAAT CTAAAGTTGTTGCAAAAAGCACTTATCTATTGTGATATGAGGAACTATAGTCATTGCTAGCTGTGCTGTTTAAGTAGTAAGAATGATTGTTGCCACTTTG GACATTCTATGAATCCTAAATTTCATGCTTTTGATTATTTTTCATTAAAAATGCAAGGTATGAAGTTTTCTTGGGATGACAATGGGTACCCGGATCCGTG AGTACCTGCAATGGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_150180; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_309012
Blastp | Putative lipid phosphate phosphatase 3, chloroplastic from Arabidopsis with 81.28% of identity |
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Blastx | Putative lipid phosphate phosphatase 3, chloroplastic from Arabidopsis with 68.87% of identity |
Eggnog | PHOsphatase(COG0671) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT3G02600) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019419191.1) |
Pfam | PAP2 superfamily (PF01569.20) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |