Ll_transcript_311101

• Id Trinity: TRINITY_DN47150_c4_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_311101
• Sequence: CTGCACGAGCCTCGTTGGAAAGTAAACGTGAAAACTGAAAAATCAAATAATACTTCAAAAAAATAAAAAATAAAAAATAAAAAAGAAAAGTAAAAAGGTG TGCGTGTGTACCCATCGATTAATTGATTAATAAAATTTTGATGTGGGATCTAGAATCCTTTGTTACAGTCGAGAGAGAAGGATTCTTCTTCTATCTAGGG TTCCTGAATCCGATTCTTACTCTGAAAATTTTCAATGCGATTGTGAGATTCAACTACCAATTATTTCGATTCGATGGAGGAATCTTACACTGGCCTCCCC AGTAGCCATTTACTCGGTTCAGTTCCTGCTGTGATAGCTGAAGAAAATAATGTCACAAGACATGAAGGAATGAATGTGAATGTAGTTCCGGATGCAAATA TGGAAATATTCCCTCCCAACAATGGCGGAGGCGGAGGAGGTAGAGGACGCGGTGGAGGCGGAGGAGGTTATCAAACTCTTGGAAGTCCAACTCCTGGTAT GTTATATCAACGTTTTCATGCTTCATGTTGAGATGGTTTTTGTAATTTTCTGATCTTTGTTTTTTCGTTTTAATAATTTTCTTGATATTTTTGTATCCCA CAGCTATTTCCTGATGACAATTAGTATACACTTTATAAGGAATTGATGAGTTGTGCAGAGAAGATTTTTACTTGTTTAGTTTTAGCTATGTTAGAAATTG CAAACTTAATTAGAGCTTCCAAGCAGATTCTTTCCCTCTTTACATGATAATCTTTGCAAATGTGTTATTATATCTGCCACGCAGGAAACTGCCGCCTTCT AATTAAGTTCTCGTCTTGCCTTTTATGCTTTGGCCTCGGTTGAATCTACCACTGGCCATCATCTAATTAAGTTTTCATATTGTTTTTTTGTTTTTTGGGG TGAAAGTTCTCATATTTATTTTGTCCTGAACTATCCTCTAACCTTAGAATCAAAATAACATTATATAGTTCTTTAATCACTTTGATATGTTTCTACTTCA ATCTCATATATACTCATTAGTTGTTTGCGTACTCCTTCCGATTATGATTGGTGAGAACTTCCTCCTCTTTTCCCCTTTTTCCAGTTTTTCAAGTCTTATT TTATTAAATGATGTCCACTGCATTAAATGTAGAAATACTTCATGAGTGGCATTTACACTCTACTAGTGTTTTGTACAAATCAATATAATGCCATATGCAA ACACCCAAAAAATTTCTAATTATGGCACTATTTAATTAAGAATTGCATATCTTAGTTGAAATGGTTCCAGCAGTTAACCAAATTATCTTCTGGTTTTTAA CTGATCTTCGGTTGCTTCTATCAGAGTAGAGAGCACCTGCTATTTGTATTTTCATTGTCATTTGCTGCTAGAATATGCCATTTATTAATCTCTGGTTTAT TCATCCTTGTAGACACTTATGAACAACAGCCAACAAGCAGCTGGAGAGGAGTCTTTAGTGTCTCATCTTACACACAGTATTTCAATATAGATACAGATGA TGTCGTAACCAGATTATTAAGTTCCTTGAATCCAGTTGGTGGAGACTTTTTCAGCAAGATAGATGCTAACCCTGATTTGTATGTTGTACACTTATGCTTA CTTACCTTTGTGCTGTTATACATCAAAACAGAGATACTGATTTGGATTACATGTCAATATAGAGCCTTGCTTCCTCCTATATCCTCCTAACACTGAATAA AAACAATTAATAAATGAAAAGGTAAATACAGCATCGTTTTGGAAAAATAAATAGCATTCGAAATTCTCTCTAGTATTTGAGGTTTTTAGGAGTGTGAATT TGGAGGATTTAGAATTATTCATCGAAATATGGTTACATGGAATAAAAATTTAATTGAAATGAACTCTTACAATAACCTTTATACAGAAACACCTCTTGTT TACTTCTCGCCCCCTCCATCTTTTTTATAGATATCTAAGTCAAGGTATGGAAGACATTTGCTGAATTTGTTCCATATTTTCAGGATCCTGCCCCAAAGCA TAATTATGCATATCAAACGAGTATTGAATACTAATAGTGTGATTCTTTTCTGTTATTATAGATATGGGCTTATATGGATCTCAACAACATTGGTTTTTGT GCTTGCATCACTTGGAAATCTTGCAACATACCTGATGCGAAAACATGCAGATAGTAGTACTGCTTGGAGCTTTGATGTTAGCTATGTGAATATGGCTGCA TGCTCTATCTATGGCTATGCGATAGTGGTCCCATTGGCATACTATTTCTTCCTTCAGTATATGGGTTCAAATGCTAGCCTTATAAGGTTTTGGTGCATGT GGGGATATTCTCTCACCATTTTCATCATCTCCTCTGTAAGTTTCTGCTTTGTCCAATGTGGTAAACTATGTAATTATCATACTAAAAATAATAATACATA CATTTATTTTCATGTTAAAGTGTTAAACTACATGCGTTGTGGGGAATGTGGGTCTGAAGGGGGAAATTGGCAGGGAGGGAAACTTCTAACAAGTTAGGCA CTCCTCCATCACAGGTGGAAGAGCCTTTGGGTTCAAACTTATATGCAGTACCACTATAGAGCCAAGGCTCAGGTGGTAATAAGATTGTGAAGCAGGAACC GAGGTCTAATGAGTTTTGTTTTACGTTTATCATTTATATTCCACTTACAAGCTGAAACTTTATCTGGTTTATAGGAAATTACATTAGCTTGCTAATTATG CTGTATTGAAAATAATCTTTTTATTATTAAGATAATTTTTGTATTAGCTTTCATGTTACCATCTATCTAATTCATATATATTTCTTGGGAAACTTTCAGT TTCTGTTGATGATTCCATTTGAGTTTCTTCGGTGGACTATAATAATCGCTACTGGTGCTTCCTCAGCTAGCTTTGTTGCCCTAAACCTGAGGTCTTACAT TGAAGGCAATGATCTATCAGTGGCTATAGTTGCTGCATTTTTATTGCAAATAGCTTTGGCAGTCTTCATCAAGGTTTGGTTCTTCGTGTAGCAGAATGCA TTGCAGTACAAATAAGACCCAATCGCTATCAGCCTTAGCTAAACCTTAAGATGAAAGTGGAATTATGTGTAGCAACGGTTGGTTTGTGTTTTTTTGGCTT TTCTATAATGGAATAGATAGTTAAAGAGAGAGTGGTGCGATTGGTAGTGCTTTTTCTGTATCAGCTTTGCTTTTTTGGTCAAGAGCCTTCTGGCAGACCA ACATTTTGTAAGGAGAACAATCGTTGATGTAGCATTTGTCTCTTGAGTGTTTGAGCTTCTTTGCATGTTTGCGTAAATATACTACGTCCATGAATTTTGT ATTTTTTGTACTTTTTTTTAAAAGAAAATCCAAGCAGCTGTCTCATGATATGTTATGATCTTGCATGTAGTTATCCCTAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150219;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_311101

FPKM

• PAB: 1.4
• PNAB: 0.5
• PS1: 0.5
• PS2: 0.7
• PS3: 0.5
• PW1: 0.8
• PW2: 1
• PW3: 0.5

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_311101

• Blastp: Protein YIPF1 homolog from Dictyostelium with 33.7% of identity
• Blastx: Protein YIPF1 homolog from Dictyostelium with 33.7% of identity
• Eggnog: Yip1 domain family(ENOG4110TJR)
• Kegg: Link to kegg annotations (DDB_G0281587)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019460613.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;