Ll_transcript_311589

• Id Trinity: TRINITY_DN47152_c2_g6_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_311589
• Sequence: GCCTAATCAATGAGGTGGTTTTTCTAATCACATTATAGAAGGTAGACTTAGTTATGCATTATAGCTTAGCTCTTCAACAAATTTAATGTAACTGGTTTAG CAGTTAGTAGCAATGTTTGCTAGATGGTTGATCATTTATGCACCTTCACTCCTTTTCCTGGCTTTTCTACCGTAAAGATTTGCTTGTGTCGTATGCTTGT TTTTCTGATAATTTGTATATTCAAGGACCAGCTATAATATATTCCGTGATACTACCTGCTTACGAAGTGTCTATCCGGGGTGTCTCTGGTACATGGTTTA CTAGTTTCCTACTGGTGTCATGTTTAAATTTTCTGTACATTTTTGATAAACTCTTGTGGTGATACTCCCCCTATCTCTCCCCTTGTCTATGACTCTATAT TCAATCATAGTCTTTGGACGTTCACATTAGCTTATTATCATTCTTGAGTAGTGGACCGTAGTTTCAAATTGTTATATTGTAATGTGGATCCTTTCCCCCC AAAAAGATCTTAAGTATTGACTTAAGAATATCAATATGTTTCTTTTTTCCCACATTGTTTTTGCTTGTCCTTAAGCACCTAGAATAACCACTGATGTGCA AAAGGTTTTGATCTATTTGATCTTCCAAGTGATGTTAGTACACTTGGTTGATGTTCTCTGCTCATGGTGGTGAAACTGCTATATCTTTTCTCCGGGGTGG AATTCATATCTTTTCTAGTTCAAATTTTGCGTCAATGGAGAACTATTAGATTAATGTTGGATATGTAATTGTTGCCCCTACATTTTCTTCAACAAACTAT CTATTCAGTTTCGGTATGGTATGGCTCTAGTGAGGATCATACTATATTGAAAATAATTAGGGTTTTTCTTCCAGTTTGATAAGGGTTAAATTGTAATATC TAATAGTTGTATACCAACACATTCTGTTAGAGTTGGTAGACATGTAGAGTAAACCACTCAACTTGATCCATTGTTGTAACTTTCTCTTTTGTAAACTTTT TTATTCTCTCAATAAATCTCTGTCTCGAAACTCTTTCAATTCATAGAGTTTCCTGCAATTCATTTTCTTCGAGCTCTTTCTTGAATTCCTAGAAAAACCA TATCAAATTCCTGTCCTCCCCTATTTTTCTCATGCAGAAACAACAAAAAAAGGATAGAAATCCCTAATACCTCACTCACTCCTCTTTCCTTCTCCATTCA CGCAGCAGATTATCCTTCCTCCTCTTCAGCGACAGGTTTCTTTTTGGCATGGGAGTTGTCCGTCTCATTTTGATAATGCCTCTTGGTGGTGGTTTGTGGT GGTTCATCGGTGGAACCACCTATTATTATGGTGGTTCTAAAAAAGTAGGCATGGCTTACAATATTAGCAAATAGATAGGGATTCGGGTGTTCAATGCTTG GCACCGATGGAATGTCAAAAAGTGTCGCCATGATTAAGGAGTAGGGAATGTTGTGAGTGTAAACATCCTCAAATAGAAGAGTCATTGTATCCAGGAGGTG ATGAAAAAGGCCATCGGTCGAGGATGGCCATGGGGTCAAGGCTCAAAACCGACGAAGACAAGGGGTTTCAAGATAAAAAGGATATTTTATGTGAAAGTTG TATCGGGATTGACTTTCTTGGTGGATTCATGAGCACATTTGAGGAATATGAGATTGGGTTTGAGTAGATTGAATCCTGAAGATTCCTGATTTCTAAAGAA AGAGAAAAGGGAAATGAGAATTACCATGTGCCTGTCTTAGTCCTTCCATATGTATTTTAATATATCATACTATGATATATGTATATGTTTATCTCGTGTA TTTAATTGGATTGTACTACTTTTTTAATTTTAAATATAATGGTATCTTGAGAAAAA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150243;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_311589

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.1
• PS3: 0.2
• PW1: 0.6
• PW2: 1.1
• PW3: 0.9

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_311589

• Blastp: -
• Blastx: Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16 from Arabidopsis with 62% of identity
• Eggnog: NA(ENOG410XS10)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G04920)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_016189784.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;