Id Trinity | TRINITY_DN47159_c0_g2_i17 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_309074 |
Sequence | ATGGCTTTGTAGTAGGAAACAAATGAGCAGCCATGGAACTCATGCTACCTATCTTAATTTCATGCATCTACTCCATCTATATATCTCTTTATATGTCATA ATAATGACTCTTCAAATCTACCCTTCACACTCTGTTTTATTCCTTTTTCTTTCTCTGTGGGGTCACTCCTCTTCATTTACGCCATCTTTTCTTTATTTCT TTTTCTCTTAACTTTGAAAGAGTGTTATTTCTATGCCAATGCACCTAACGTTACTCCATCCTGACAGCCAGGAAATGAGCTGAATCAGTTTAATTTATTG GTTTAACTTGAAACTTAACTCGAGTCTGATATGAATTATTTTTTTAATTTTAGTTTATATCGGTTAAAGTTCGTGAATTGTTCGGTTTAGTTCGAATTGG TTAATTTAATAAGTTCTTTATTTTGTTTTTAAATAAATAGGCACGTGGTTATATATACATATATGAATAAAATTAAAAGCATGTCATAGTTTTAAGTTGG GCCGAAAGATGGGGATAACAAATTTGCAGCCCAAAATATAGGAATATTTAAAGAATATAATATATGAAAAAATGGAAGCAGAGTAGAGAGTGAGAGATGA GATCTGTTGGTTGAAGAAAGTAGTTTATTTGATTATTATGAGATAGAAATATATAGATCTGTGTTGTGTGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAG TGAGATAAAGAAGAGCAAGGTGGAAATGGAGTACAGGAAAATGAAAGACGAGGAGGATGAAGATAGGAGCGTGGGCGTTGAAGATAACATCGATAAATCA TTTTTGATTTCAGGTTTGATCTCTCTCTACTATCTATCTTCTCTTCTGTTTACTCATTCCATTCAATTTCACCTATTTATCTCTACACAGTCCCAGATAA CAGCAATTTAGTGGGAGAAACCAAACTTGAAACCCACAGGACCCAAGTACAGTGGAAGCGCAAGTCAGTGGTTACGCTTTCATTGACTATTCTGACTAGT TCCCAAGCCATTCTAATTGTTTGGTCCAAGAGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACTGCTAACTTTTTGGTCGAGACTTTAAAATGTGCTATAT CCCTCTTGGCCTTGGCAAGATTATGGAACAAACATGGTGTCACCGACGACAACAGGTTGACTACAACATTAAATGAAGTTATAGTGTATCCTATTCCAGC AGTGCTTTACCTCATAAAAAATTTGCTCCAGTATTACATCTTTGCATATGTAGATGCTCCAGGGTATCAAATATTAAAGAACTTCAATATTATCAGTACA GGAGTCCTATACAGAATTATACTTAAGAAAAGGTTAAGTGAGATTCAGTGGGCTGCTTTTATTCTACTCACTGCTGGGTGCACCACAGCTCAGTTGAATT CGAAGTAAGACTAATCCAAGCCTGAATCTTGGCCATTATTTGTGTTAGTATATTGACCTTATTATGTATCATACATAAATATAGTGTGGATTGAAGTATT GCCACTGTAATATAGATTCCAATAAAAAAATCGTACATGTCATGTGTCAAGAAGCGAGTCAAATACTTTAAAGAAATTGAAAGCATGAGAAAAACATGAC TCAACTCATCTAATATTTAATTATAGTAATTGAGAGAGGAAATAAAATCATAGTTAATCAAATTCAGAACATAGTTAAAAATAAATTAATATAGCGTTGC TAACTAAATCAAGGTTTCATCTTCCCCTTGGTACTCGTCTCAAATCCTTGTGATACACTGCTCTCAAATTCTCTCTCTTGCAGCACTAGTTTCCTCAAAT TGTGTTGTGGCGCACTTCTGTTTATAACTGAAGCATATTGTAGGTTTCAATTCAAAACAAATCTGGCATCTCGTTTTGCCGGCTCCACTTATGTTTCTCC CTACAATTTTTCTTGATACCAAATTTATACGGCTGCATCTTGGTGTGATAATATAAACAAATATAGTCATTATAATTATCATTAAGCTTCACATGTGACA TGTGACCTATTTGAGTTTGACCCCATATCAAGTATACAAATTTAAACCTGCACTTTATCATAAAAGATTAATAAGTCATCCATTTATATCAGTGCCAGAC CTGCATTGATAGGTCTGGGGACACATGCCCCCACTGATTTTGAAAAGAAAAAAATTAGAAATATATATCCATTTTTGTTCTTGTTTTAACAATTTCAAGA AACTTGTCCACATTGCATGTTAGAGTGAAAGAACAAACAGTTTCAAATATATTTTTATGTGCATTTATAATCTTTGTCTCCACATCCTGATACTGTATTT ATAATGATATTATGAATCTGAAGATATGTTGTATACGAAGTGATAACCTAATACCCATAATTATACCTATATTAGTAAAATACTGATGTAGTACAACTTG CATATGCCTCGTCCCTCAATTTTGGACGGCTAATCTATAAGGTTCCTACAACAGTAAGGATCCTGATAGTCTAACAATTACAGTTCCCACAAAGGTTAAG GCTCTGTATGGACTGTGGTACTAGATAAAATCAATACCTTTGATCTATTTGCATATTTGTAGCAATACTGTTGATCTGTTTATGTATTTGTAGTAATACC ATCGGTCTGTTTATGTACTTGTAGCTTATGAGCCTCACTGGGCTATTTCTGTTGATTTTTATGTTAGGTTTTTTTATTTCAGAGATCAATATTCGTCCTT TTATCTTTTTGCACTCTGAAGTTGCTTGGTAGGTGGTAGCTTGGTAGCTAACATTTTTATGGTTGCCTTGGGAGGATTTATTATTCTCCTTTTCTGTATG CCCCTTCTATCTTCTAACAGATTCTTTTGTTATCACAGAAAAATACTGTGCAAGTTCATATTTATTGATAATCATGTGCTAAATTACCTTAATATTTAAT TTGTTTTTTCAGTTCTGATCATGTTCTTCAAACTCCCTTTCAAGGTTGGGTTATGGCAATTGTCATGGCACTCTTGAGTGGTTTTGCAGGGGTATATACA GAGGCTATTATTAAAAAGCGTCCTTCACGAGACATTAATGTTCAGAACTTTTGGTTGTATATCTTCGGCATGGGCTTCAATGCTGTTGCAATACTAGTTC AAGATTTTGATGCAGTGATGAACAAGGGATTCTTCCATGGATATTCATTTGTTACTGTTCTCATGATTTTCAATCACGCACTCAGTGGGATTGCTGTATC AATGGTAATGAAGTATGCTGACAATATTGTGAAGGTGTATTCTACTTCGGTGGCAATGATTCTTACAGCAATTGTTTCGGTGTTCCTTTTTGGCTTCCAT CTCTCCCTTGCCTTCTTCCTTGGCACAATCGTTGTCTCTGTTGCAATTTATCTGCACTCTGCTGGGAAGATCCAAAGATAGCTATGACTGCCTACTAGTT TTATTTTTTATTTTTATTGTTGTTTAGCAATTTATTTCTTTTGAAACTGTTAATTCAATATCTTTAGTGAATACTTTGAAATCTTTCTCAGTAAATATAT CTCTATATGGATCAAAGCAATCTATGTATAAGGCTTTGTTTACATTTTCACTGCTGCTAGCCTGCTACAAATATGTGATTTGCAAGTTTCACTATAAACT ATTGTGGTGAGTTTGAATGGGATAATTGACCCTTCTCCCACCGGGGAATTTTGAATTTCCAGCAAGAAAAGATTAGTAAATTGAGCGTTGTGATTAATTT AATCTCTGGACCTTTACAAAATTGAAGTTCTTTTGGGTAATATCAGTGTGATCATCCAAATCTGAGTAACTGCATAAGTAGGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_150304; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_309074
Blastp | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 90.07% of identity |
---|---|
Blastx | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 90.32% of identity |
Eggnog | membrane(COG0697) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460204.1) |
Pfam | Nucleotide-sugar transporter (PF04142.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |