Id Trinity | TRINITY_DN47159_c0_g2_i4 |
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Name Transcript | Ll_transcript_309043 |
Sequence | ATGGCTTTGTAGTAGGAAACAAATGAGCAGCCATGGAACTCATGCTACCTATCTTAATTTCATGCATCTACTCCATCTATATATCTCTTTATATGTCATA ATAATGACTCTTCAAATCTACCCTTCACACTCTGTTTTATTCCTTTTTCTTTCTCTGTGGGGTCACTCCTCTTCATTTACGCCATCTTTTCTTTATTTCT TTTTCTCTTAACTTTGAAAGAGTGTTATTTCTATGCCAATGCACCTAACGTTACTCCATCCTGACAGCCAGGAAATGAGCTGAATCAGTTTAATTTATTG GTTTAACTTGAAACTTAACTCGAGTCTGATATGAATTATTTTTTTAATTTTAGTTTATATCGGTTAAAGTTCGTGAATTGTTCGGTTTAGTTCGAATTGG TTAATTTAATAAGTTCTTTATTTTGTTTTTAAATAAATAGGCACGTGGTTATATATACATATATGAATAAAATTAAAAGCATGTCATAGTTTTAAGTTGG GCCGAAAGATGGGGATAACAAATTTGCAGCCCAAAATATAGGAATATTTAAAGAATATAATATATGAAAAAATGGAAGCAGAGTAGAGAGTGAGAGATGA GATCTGTTGGTTGAAGAAAGTAGTTTATTTGATTATTATGAGATAGAAATATATAGATCTGTGTTGTGTGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAGTGAGAG TGAGATAAAGAAGAGCAAGGTGGAAATGGAGTACAGGAAAATGAAAGACGAGGAGGATGAAGATAGGAGCGTGGGCGTTGAAGATAACATCGATAAATCA TTTTTGATTTCAGTCCCAGATAACAGCAATTTAGTGGGAGAAACCAAACTTGAAACCCACAGGACCCAAGTACAGTGGAAGCGCAAGTCAGTGGTTACGC TTTCATTGACTATTCTGACTAGTTCCCAAGCCATTCTAATTGTTTGGTCCAAGAGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACTGCTAACTTTTTGGT CGAGACTTTAAAATGTGCTATATCCCTCTTGGCCTTGGCAAGATTATGGAACAAACATGGTGTCACCGACGACAACAGGTTGACTACAACATTAAATGAA GTTATAGTGTATCCTATTCCAGCAGTGCTTTACCTCATAAAAAATTTGCTCCAGTATTACATCTTTGCATATGTAGATGCTCCAGGGTATCAAATATTAA AGAACTTCAATATTATCAGTACAGGAGTCCTATACAGAATTATACTTAAGAAAAGGTTAAGTGAGATTCAGTGGGCTGCTTTTATTCTACTCACTGCTGG GTGCACCACAGCTCAGTTGAATTCGAAGTAAGACTAATCCAAGCCTGAATCTTGGCCATTATTTGTGTTAGTATATTGACCTTATTATGTATCATACATA AATATAGTGTGGATTGAAGTATTGCCACTGTAATATAGATTCCAATAAAAAAATCGTACATGTCATGTGTCAAGAAGCGAGTCAAATACTTTAAAGAAAT TGAAAGCATGAGAAAAACATGACTCAACTCATCTAATATTTAATTATAGTAATTGAGAGAGGAAATAAAATCATAGTTAATCAAATTCAGAACATAGTTA AAAATAAATTAATATAGCGTTGCTAACTAAATCAAGGTTTCATCTTCCCCTTGGTACTCGTCTCAAATCCTTGTGATACACTGCTCTCAAATTCTCTCTC TTGCAGCACTAGTTTCCTCAAATTGTGTTGTGGCGCACTTCTGTTTATAACTGAAGCATATTGTAGGTTTCAATTCAAAACAAATCTGGCATCTCGTTTT GCCGGCTCCACTTATGTTTCTCCCTACAATTTTTCTTGATACCAAATTTATACGGCTGCATCTTGGTGTGATAATATAAACAAATATAGTCATTATAATT ATCATTAAGCTTCACATGTGACATGTGACCTATTTGAGTTTGACCCCATATCAAGTATACAAATTTAAACCTGCACTTTATCATAAAAGATTAATAAGTC ATCCATTTATATCAGTGCCAGACCTGCATTGATAGGTCTGGGGACACATGCCCCCACTGATTTTGAAAAGAAAAAAATTAGAAATATATATCCATTTTTG TTCTTGTTTTAACAATTTCAAGAAACTTGTCCACATTGCATGTTAGAGTGAAAGAACAAACAGTTTCAAATATATTTTTATGTGCATTTATAATCTTTGT CTCCACATCCTGATACTGTATTTATAATGATATTATGAATCTGAAGATATGTTGTATACGAAGTGATAACCTAATACCCATAATTATACCTATATTAGTA AAATACTGATGTAGTACAACTTGCATATGCCTCGTCCCTCAATTTTGGACGGCTAATCTATAAGGTTCCTACAACAGTAAGGATCCTGATAGTCTAACAA TTACAGTTCCCACAAAGGTTAAGGCTCTGTATGGACTGTGGTACTAGATAAAATCAATACCTTTGATCTATTTGCATATTTGTAGCAATACTGTTGATCT GTTTATGTATTTGTAGTAATACCATCGGTCTGTTTATGTACTTGTAGCTTATGAGCCTCACTGGGCTATTTCTGTTGATTTTTATGTTAGGTTTTTTTAT TTCAGAGATCAATATTCGTCCTTTTATCTTTTTGCACTCTGAAGTTGCTTGGTAGGTGGTAGCTTGGTAGCTAACATTTTTATGGTTGCCTTGGGAGGAT TTATTATTCTCCTTTTCTGTATGCCCCTTCTATCTTCTAACAGATTCTTTTGTTATCACAGAAAAATACTGTGCAAGTTCATATTTATTGATAATCATGT GCTAAATTACCTTAATATTTAATTTGTTTTTTCAGTTCTGATCATGTTCTTCAAACTCCCTTTCAAGGTTGGGTTATGGCAATTGTCATGGCACTCTTGA GTGGTTTTGCAGGGGTATATACAGAGGCTATTATTAAAAAGCGTCCTTCACGAGACATTAATGTTCAGAACTTTTGGTTGTATATCTTCGGCATGGGCTT CAATGCTGTTGCAATACTAGTTCAAGATTTTGATGCAGTGATGAACAAGGGATTCTTCCATGGATATTCATTTGTTACTGTTCTCATGATTTTCAATCAC GCACTCAGTGGGATTGCTGTATCAATGGTAATGAAGTATGCTGACAATATTGTGAAGGTGTATTCTACTTCGGTGGCAATGATTCTTACAGCAATTGTTT CGGTGTTCCTTTTTGGCTTCCATCTCTCCCTTGCCTTCTTCCTTGGCACAATCGTTGTCTCTGTTGCAATTTATCTGCACTCTGCTGGGAAGATCCAAAG ATAGCTATGACTGCCTACTAGTTTTATTTTTTATTTTTATTGTTGTTTAGCAATTTATTTCTTTTGAAACTGTTAATTCAATATCTTTAGTGAATACTTT GAAATCTTTCTCAGTAAATATATCTCTATATGGATCAAAGCAATCTATGTATAAGGCTTTGTTTACATTTTCACTGCTGCTAGCCTGCTACAAATATGTG ATTTGCAAGTTTCACTATAAACTATTGTGGTGAGTTTGAATGGGATAATTGACCCTTCTCCCACCGGGGAATTTTGAATTTCCAGCAAGAAAAGATTAGT AAATTGAGCGTTGTGATTAATTTAATCTCTGGACCTTTACAAAATTGAAGTTCTTTTGGGTAATATCAGTGTGATCATCCAAATCTGAGTAACTGCATAA GTAGGG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_150304; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_309043
Blastp | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 90.07% of identity |
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Blastx | CMP-sialic acid transporter 4 from Arabidopsis with 69.19% of identity |
Eggnog | membrane(COG0697) |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460204.1) |
Pfam | Nucleotide-sugar transporter (PF04142.14) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |