Ll_transcript_309049

• Id Trinity: TRINITY_DN47159_c0_g2_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_309049
• Sequence: CAGATAACAGCAATTTAGTGGGAGAAACCAAACTTGAAACCCACAGGACCCAAGTACAGTGGAAGCGCAAGTCAGTGGTTACGCTTTCATTGACTATTCT GACTAGTTCCCAAGCCATTCTAATTGTTTGGTCCAAGAGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACTGCTAACTTTTTGGTCGAGACTTTAAAATGT GCTATATCCCTCTTGGCCTTGGCAAGATTATGGAACAAACATGGTGTCACCGACGACAACAGGTCATCTCTCTCCCTCTCAATTCAATGATAATAATAAC GACTCGCAACACTGAAATAGCTCACCACTATATTGTTTCTTACACTAGATTCAATTAACTGTCCATTGCATTTGCCAAAAAAGAAGAACAAAAAACATGG ATGGCTAATTCATACAGGAATATGCTATCCGTTTACGTTATCACAGCTCCATTACCATTATTTCATATTTCAAAAGCTAAATGCAAATTCTGTTGAATGA TGTGAGAACCGATCTGAGCATTAAAACTCCTGAGGCTAGAACCTATATCTTCAGTAGTGTTTTCAGCAGGCCAGTGTTTCCACCTTACTTTTTCTGCTGG CGCTGTTCAAATATTTGCAACTTCATCTTCTTATTCAAGCTATATCTTTTCCCTTGTTGATATACTATGAATTTAAACAACTTAACATATTTTATGCCCT TAACATAGGTTGACTACAACATTAAATGAAGTTATAGTGTATCCTATTCCAGCAGTGCTTTACCTCATAAAAAATTTGCTCCAGTATTACATCTTTGCAT ATGTAGATGCTCCAGGGTATCAAATATTAAAGAACTTCAATATTATCAGTACAGGAGTCCTATACAGAATTATACTTAAGAAAAGGTTAAGTGAGATTCA GTGGGCTGCTTTTATTCTACTCACTGCTGGGTGCACCACAGCTCAGTTGAATTCGAAGTAAGACTAATCCAAGCCTGAATCTTGGCCATTATTTGTGTTA GTATATTGACCTTATTATGTATCATACATAAATATAGTGTGGATTGAAGTATTGCCACTGTAATATAGATTCCAATAAAAAAATCGTACATGTCATGTGT CAAGAAGCGAGTCAAATACTTTAAAGAAATTGAAAGCATGAGAAAAACATGACTCAACTCATCTAATATTTAATTATAGTAATTGAGAGAGGAAATAAAA TCATAGTTAATCAAATTCAGAACATAGTTAAAAATAAATTAATATAGCGTTGCTAACTAAATCAAGGTTTCATCTTCCCCTTGGTACTCGTCTCAAATCC TTGTGATACACTGCTCTCAAATTCTCTCTCTTGCAGCACTAGTTTCCTCAAATTGTGTTGTGGCGCACTTCTGTTTATAACTGAAGCATATTGTAGGTTT CAATTCAAAACAAATCTGGCATCTCGTTTTGCCGGCTCCACTTATGTTTCTCCCTACAATTTTTCTTGATACCAAATTTATACGGCTGCATCTTGGTGTG ATAATATAAACAAATATAGTCATTATAATTATCATTAAGCTTCACATGTGACATGTGACCTATTTGAGTTTGACCCCATATCAAGTATACAAATTTAAAC CTGCACTTTATCATAAAAGATTAATAAGTCATCCATTTATATCAGTGCCAGACCTGCATTGATAGGTCTGGGGACACATGCCCCCACTGATTTTGAAAAG AAAAAAATTAGAAATATATATCCATTTTTGTTCTTGTTTTAACAATTTCAAGAAACTTGTCCACATTGCATGTTAGAGTGAAAGAACAAACAGTTTCAAA TATATTTTTATGTGCATTTATAATCTTTGTCTCCACATCCTGATACTGTATTTATAATGATATTATGAATCTGAAGATATGTTGTATACGAAGTGATAAC CTAATACCCATAATTATACCTATATTAGTAAAATACTGATGTAGTACAACTTGCATATGCCTCGTCCCTCAATTTTGGACGGCTAATCTATAAGGTTCCT ACAACAGTAAGGATCCTGATAGTCTAACAATTACAGTTCCCACAAAGGTTAAGGCTCTGTATGGACTGTGGTACTAGATAAAATCAATACCTTTGATCTA TTTGCATATTTGTAGCAATACTGTTGATCTGTTTATGTATTTGTAGTAATACCATCGGTCTGTTTATGTACTTGTAGCTTATGAGCCTCACTGGGCTATT TCTGTTGATTTTTATGTTAGGTTTTTTTATTTCAGAGATCAATATTCGTCCTTTTATCTTTTTGCACTCTGAAGTTGCTTGGTAGGTGGTAGCTTGGTAG CTAACATTTTTATGGTTGCCTTGGGAGGATTTATTATTCTCCTTTTCTGTATGCCCCTTCTATCTTCTAACAGATTCTTTTGTTATCACAGAAAAATACT GTGCAAGTTCATATTTATTGATAATCATGTGCTAAATTACCTTAATATTTAATTTGTTTTTTCAGTTCTGATCATGTTCTTCAAACTCCCTTTCAAGGTT GGGTTATGGCAATTGTGAGTTGTCAACATTTGTGGTTCTCTCACATTGGAAATATAAAGTAGTGTAGTCTAAAGTTATGGCTTGAAAATGATCATGAGCT TTTCCTTTTCAGGTCATGGCACTCTTGAGTGGTTTTGCAGGGGTATATACAGAGGCTATTATTAAAAAGCGTCCTTCACGAGACATTAATGTTCAGAACT TTTGGTTGTATATCTTCGGCATGGGCTTCAATGCTGTTGCAATACTAGTTCAAGATTTTGATGCAGTGATGAACAAGGGATTCTTCCATGGATATTCATT TGTTACTGTTCTCATGATTTTCAATCACGCACTCAGTGGGATTGCTGTATCAATGGTAATGAAGTATGCTGACAATATTGTGAAGGTGTATTCTACTTCG GTGGCAATGATTCTTACAGCAATTGTTTCGGTGTTCCTTTTTGGCTTCCATCTCTCCCTTGCCTTCTTCCTTGGCACAATCGTTGTCTCTGTTGCAATTT ATCTGCACTCTGCTGGGAAGATCCAAAGATAGCTATGACTGCCTACTAGTTTTATTTTTTATTTTTATTGTTGTTTAGCAATTTATTTCTTTTGAAACTG TTAATTCAATATCTTTAGTGAATACTTTGAAATCTTTCTCAGTAAATATATCTCTATATGGATCAAAGCAATCTATGTATAAGGCTTTGTTTACATTTTC ACTGCTGCTAGCCTGCTACAAATATGTGATTTGCAAGTTTCACTATAAACTATTGTGGTGAGTTTGAATGGGATAATTGACCCTTCTCCCACCGGGGAAT TTTGAATTTCCAGCAAGAAAAGATTAGTAAATTGAGCGTTGTGATTAATTTAATCTCTGGACCTTTACAAAATTGAAGTTCTTTTGGGTAATATCAGTGT GATCATCCAAATCTGAGTAACTGCATAAGTAGGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150304;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_309049

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.1
• PS1: 0
• PS2: 0.2
• PS3: 0.2
• PW1: 0.4
• PW2: 0.2
• PW3: 0.2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_309049

• Blastp: CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 89.78% of identity
• Blastx: CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 89.86% of identity
• Eggnog: membrane(COG0697)
• Kegg: Link to kegg annotations (4343687)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019460205.1)
• Pfam: Nucleotide-sugar transporter (PF04142.14)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;