| Id Trinity | TRINITY_DN47159_c0_g2_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_309051 |
| Sequence | CAGATAACAGCAATTTAGTGGGAGAAACCAAACTTGAAACCCACAGGACCCAAGTACAGTGGAAGCGCAAGTCAGTGGTTACGCTTTCATTGACTATTCT GACTAGTTCCCAAGCCATTCTAATTGTTTGGTCCAAGAGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACTGCTAACTTTTTGGTCGAGACTTTAAAATGT GCTATATCCCTCTTGGCCTTGGCAAGATTATGGAACAAACATGGTGTCACCGACGACAACAGGTCATCTCTCTCCCTCTCAATTCAATGATAATAATAAC GACTCGCAACACTGAAATAGCTCACCACTATATTGTTTCTTACACTAGATTCAATTAACTGTCCATTGCATTTGCCAAAAAAGAAGAACAAAAAACATGG ATGGCTAATTCATACAGGAATATGCTATCCGTTTACGTTATCACAGCTCCATTACCATTATTTCATATTTCAAAAGCTAAATGCAAATTCTGTTGAATGA TGTGAGAACCGATCTGAGCATTAAAACTCCTGAGGCTAGAACCTATATCTTCAGTAGTGTTTTCAGCAGGCCAGTGTTTCCACCTTACTTTTTCTGCTGG CGCTGTTCAAATATTTGCAACTTCATCTTCTTATTCAAGCTATATCTTTTCCCTTGTTGATATACTATGAATTTAAACAACTTAACATATTTTATGCCCT TAACATAGGTTGACTACAACATTAAATGAAGTTATAGTGTATCCTATTCCAGCAGTGCTTTACCTCATAAAAAATTTGCTCCAGTATTACATCTTTGCAT ATGTAGATGCTCCAGGGTATCAAATATTAAAGAACTTCAATATTATCAGTACAGGAGTCCTATACAGAATTATACTTAAGAAAAGGTTAAGTGAGATTCA GTGGGCTGCTTTTATTCTACTCACTGCTGGGTGCACCACAGCTCAGTTGAATTCGAAGTAAGACTAATCCAAGCCTGAATCTTGGCCATTATTTGTGTTA GTATATTGACCTTATTATGTATCATACATAAATATAGTGTGGATTGAAGTATTGCCACTGTAATATAGATTCCAATAAAAAAATCGTACATGTCATGTGT CAAGAAGCGAGTCAAATACTTTAAAGAAATTGAAAGCATGAGAAAAACATGACTCAACTCATCTAATATTTAATTATAGTAATTGAGAGAGGAAATAAAA TCATAGTTAATCAAATTCAGAACATAGTTAAAAATAAATTAATATAGCGTTGCTAACTAAATCAAGGTTTCATCTTCCCCTTGGTACTCGTCTCAAATCC TTGTGATACACTGCTCTCAAATTCTCTCTCTTGCAGCACTAGTTTCCTCAAATTGTGTTGTGGCGCACTTCTGTTTATAACTGAAGCATATTGTAGGTTT CAATTCAAAACAAATCTGGCATCTCGTTTTGCCGGCTCCACTTATGTTTCTCCCTACAATTTTTCTTGATACCAAATTTATACGGCTGCATCTTGGTGTG ATAATATAAACAAATATAGTCATTATAATTATCATTAAGCTTCACATGTGACATGTGACCTATTTGAGTTTGACCCCATATCAAGTATACAAATTTAAAC CTGCACTTTATCATAAAAGATTAATAAGTCATCCATTTATATCAGTGCCAGACCTGCATTGATAGGTCTGGGGACACATGCCCCCACTGATTTTGAAAAG AAAAAAATTAGAAATATATATCCATTTTTGTTCTTGTTTTAACAATTTCAAGAAACTTGTCCACATTGCATGTTAGAGTGAAAGAACAAACAGTTTCAAA TATATTTTTATGTGCATTTATAATCTTTGTCTCCACATCCTGATACTGTATTTATAATGATATTATGAATCTGAAGATATGTTGTATACGAAGTGATAAC CTAATACCCATAATTATACCTATATTAGTAAAATACTGATGTAGTACAACTTGCATATGCCTCGTCCCTCAATTTTGGACGGCTAATCTATAAGGTTCCT ACAACAGTAAGGATCCTGATAGTCTAACAATTACAGTTCCCACAAAGGTTAAGGCTCTGTATGGACTGTGGTACTAGATAAAATCAATACCTTTGATCTA TTTGCATATTTGTAGCAATACTGTTGATCTGTTTATGTATTTGTAGTAATACCATCGGTCTGTTTATGTACTTGTAGCTTATGAGCCTCACTGGGCTATT TCTGTTGATTTTTATGTTAGGTTTTTTTATTTCAGAGATCAATATTCGTCCTTTTATCTTTTTGCACTCTGAAGTTGCTTGGTAGGTGGTAGCTTGGTAG CTAACATTTTTATGGTTGCCTTGGGAGGATTTATTATTCTCCTTTTCTGTATGCCCCTTCTATCTTCTAACAGATTCTTTTGTTATCACAGAAAAATACT GTGCAAGTTCATATTTATTGATAATCATGTGCTAAATTACCTTAATATTTAATTTGTTTTTTCAGTTCTGATCATGTTCTTCAAACTCCCTTTCAAGGTT GGGTTATGGCAATTGTGAGTTGTCAACATTTGTGGTTCTCTCACATTGGAAATATAAAGTAGTGTAGTCTAAAGTTATGGCTTGAAAATGATCATGAGCT TTTCCTTTTCAGGTCATGGCACTCTTGAGTGGTTTTGCAGGGGTATATACAGAGGCTATTATTAAAAAGCGTCCTTCACGAGACATTAATGTTCAGAACT TTTGGTTGTATATCTTCGGCATGGGCTTCAATGCTGTTGCAATACTAGTTCAAGATTTTGATGCAGTGATGAACAAGGGATTCTTCCATGGATATTCATT TGTTACTGTTCTCATGATTTTCAATCACGCACTCAGGTAACATACGTAGATAGAATTTCATGAATGCTGGGAGTTTTCCCTCTTCATTTCTTCATATGTC TTTGCTTCTGTCTATGTTTCTATCATTATCTCTATCAAAGTTTCACAACATAGAAAGACATGGGAACACTCTGACCAAGTGAATAAAAGCAAACCTCCCA TTATTTTATTATCTGGAATTTTGACTTTTTGTATTGTGAATTAATATTTGTTTTCGTGGTTGGTTCATTTTTTAGTGGGATTGCTGTATCAATGGTAATG AAGTATGCTGACAATATTGTGAAGGTAAGCGTGAGTTTATGATTGTGTAGTAGGATGCTTCCAGTTCCACCACTTAATATTTACACGGATGTGGAATTTG ACACTTCCATAACTAAGAGTTGGGATTACTTATTGTTAAGAGTGTAATGCATTAAGCATGTGTGTAATGTATTCTTGGCAACTATCCTCTACTGCTGATC AATTTATAAAAGAAAAAAGGCTTTGAAATTTGTGACTAACTTCCTAATTTACATAGGTGTATTCTACTTCGGTGGCAATGATTCTTACAGCAATTGTTTC GGTGTTCCTTTTTGGCTTCCATCTCTCCCTTGCCTTCTTCCTTGGCACAATGTAAGCTGCTGTTTATTATATCATGAATGTACTTCACATCTTCTATTGT TGTATTTTTCTTCCTTTTTTTACTATCC BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_150304; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_309051
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 91.89% of identity |
| Eggnog | membrane(COG0697) |
| Kegg | Link to kegg annotations (4343687) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460204.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |