Id Trinity | TRINITY_DN47159_c0_g2_i8 |
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Name Transcript | Ll_transcript_309052 |
Sequence | CAGATAACAGCAATTTAGTGGGAGAAACCAAACTTGAAACCCACAGGACCCAAGTACAGTGGAAGCGCAAGTCAGTGGTTACGCTTTCATTGACTATTCT GACTAGTTCCCAAGCCATTCTAATTGTTTGGTCCAAGAGAGCTGGCAAGTATGAGTACAGTGTCACTACTGCTAACTTTTTGGTCGAGACTTTAAAATGT GCTATATCCCTCTTGGCCTTGGCAAGATTATGGAACAAACATGGTGTCACCGACGACAACAGGTCATCTCTCTCCCTCTCAATTCAATGATAATAATAAC GACTCGCAACACTGAAATAGCTCACCACTATATTGTTTCTTACACTAGATTCAATTAACTGTCCATTGCATTTGCCAAAAAAGAAGAACAAAAAACATGG ATGGCTAATTCATACAGGAATATGCTATCCGTTTACGTTATCACAGCTCCATTACCATTATTTCATATTTCAAAAGCTAAATGCAAATTCTGTTGAATGA TGTGAGAACCGATCTGAGCATTAAAACTCCTGAGGCTAGAACCTATATCTTCAGTAGTGTTTTCAGCAGGCCAGTGTTTCCACCTTACTTTTTCTGCTGG CGCTGTTCAAATATTTGCAACTTCATCTTCTTATTCAAGCTATATCTTTTCCCTTGTTGATATACTATGAATTTAAACAACTTAACATATTTTATGCCCT TAACATAGGTTGACTACAACATTAAATGAAGTTATAGTGTATCCTATTCCAGCAGTGCTTTACCTCATAAAAAATTTGCTCCAGTATTACATCTTTGCAT ATGTAGATGCTCCAGGGTATCAAATATTAAAGAACTTCAATATTATCAGTACAGGAGTCCTATACAGAATTATACTTAAGAAAAGGTTAAGTGAGATTCA GTGGGCTGCTTTTATTCTACTCACTGCTGGGTGCACCACAGCTCAGTTGAATTCGAAGTAAGACTAATCCAAGCCTGAATCTTGGCCATTATTTGTGTTA GTATATTGACCTTATTATGTATCATACATAAATATAGTGTGGATTGAAGTATTGCCACTGTAATATAGATTCCAATAAAAAAATCGTACATGTCATGTGT CAAGAAGCGAGTCAAATACTTTAAAGAAATTGAAAGCATGAGAAAAACATGACTCAACTCATCTAATATTTAATTATAGTAATTGAGAGAGGAAATAAAA TCATAGTTAATCAAATTCAGAACATAGTTAAAAATAAATTAATATAGCGTTGCTAACTAAATCAAGGTTTCATCTTCCCCTTGGTACTCGTCTCAAATCC TTGTGATACACTGCTCTCAAATTCTCTCTCTTGCAGCACTAGTTTCCTCAAATTGTGTTGTGGCGCACTTCTGTTTATAACTGAAGCATATTGTAGGTTT CAATTCAAAACAAATCTGGCATCTCGTTTTGCCGGCTCCACTTATGTTTCTCCCTACAATTTTTCTTGATACCAAATTTATACGGCTGCATCTTGGTGTG ATAATATAAACAAATATAGTCATTATAATTATCATTAAGCTTCACATGTGACATGTGACCTATTTGAGTTTGACCCCATATCAAGTATACAAATTTAAAC CTGCACTTTATCATAAAAGATTAATAAGTCATCCATTTATATCAGTGCCAGACCTGCATTGATAGGTCTGGGGACACATGCCCCCACTGATTTTGAAAAG AAAAAAATTAGAAATATATATCCATTTTTGTTCTTGTTTTAACAATTTCAAGAAACTTGTCCACATTGCATGTTAGAGTGAAAGAACAAACAGTTTCAAA TATATTTTTATGTGCATTTATAATCTTTGTCTCCACATCCTGATACTGTATTTATAATGATATTATGAATCTGAAGATATGTTGTATACGAAGTGATAAC CTAATACCCATAATTATACCTATATTAGTAAAATACTGATGTAGTACAACTTGCATATGCCTCGTCCCTCAATTTTGGACGGCTAATCTATAAGGTTCCT ACAACAGTAAGGATCCTGATAGTCTAACAATTACAGTTCCCACAAAGGTTAAGGCTCTGTATGGACTGTGGTACTAGATAAAATCAATACCTTTGATCTA TTTGCATATTTGTAGCAATACTGTTGATCTGTTTATGTATTTGTAGTAATACCATCGGTCTGTTTATGTACTTGTAGCTTATGAGCCTCACTGGGCTATT TCTGTTGATTTTTATGTTAGGTTTTTTTATTTCAGAGATCAATATTCGTCCTTTTATCTTTTTGCACTCTGAAGTTGCTTGGTAGGTGGTAGCTTGGTAG CTAACATTTTTATGGTTGCCTTGGGAGGATTTATTATTCTCCTTTTCTGTATGCCCCTTCTATCTTCTAACAGATTCTTTTGTTATCACAGAAAAATACT GTGCAAGTTCATATTTATTGATAATCATGTGCTAAATTACCTTAATATTTAATTTGTTTTTTCAGTTCTGATCATGTTCTTCAAACTCCCTTTCAAGGTT GGGTTATGGCAATTGTGAGTTGTCAACATTTGTGGTTCTCTCACATTGGAAATATAAAGTAGTGTAGTCTAAAGTTATGGCTTGAAAATGATCATGAGCT TTTCCTTTTCAGGTCATGGCACTCTTGAGTGGTTTTGCAGGGGTATATACAGAGGCTATTATTAAAAAGCGTCCTTCACGAGACATTAATGTTCAGAACT TTTGGTTGTATATCTTCGGCATGGGCTTCAATGCTGTTGCAATACTAGTTCAAGATTTTGATGCAGTGATGAACAAGGGATTCTTCCATGGATATTCATT TGTTACTGTTCTCATGATTTTCAATCACGCACTCAGGTAACATACGTAGATAGAATTTCATGAATGCTGGGAGTTTTCCCTCTTCATTTCTTCATATGTC TTTGCTTCTGTCTATGTTTCTATCATTATCTCTATCAAAGTTTCACAACATAGAAAGACATGGGAACACTCTGACCAAGTGAATAAAAGCAAACCTCCCA TTATTTTATTATCTGGAATTTTGACTTTTTGTATTGTGAATTAATATTTGTTTTCGTGGTTGGTTCATTTTTTAGTGGGATTGCTGTATCAATGGTAATG AAGTATGCTGACAATATTGTGAAGGTGTATTCTACTTCGGTGGCAATGATTCTTACAGCAATTGTTTCGGTGTTCCTTTTTGGCTTCCATCTCTCCCTTG CCTTCTTCCTTGGCACAATGTAAGCTGCTGTTTATTATATCATGAATGTACTTCACATCTTCTATTGTTGTATTTTTCTTCCTTTTTTTACTATCC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_150304; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_309052
Blastp | - |
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Blastx | CMP-sialic acid transporter 2 from Oryza sativa with 91.89% of identity |
Eggnog | membrane(COG0697) |
Kegg | Link to kegg annotations (4343687) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460204.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |