Ll_transcript_311185

• Id Trinity: TRINITY_DN47163_c0_g1_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_311185
• Sequence: ATTACCGCTATCTCATTTTTAACCCTTCAAATTTATTCAACTTCATCATCCCCACACTAAGAAATTTCTTCTCCACAATGGATTTATCGAAAACCGTTGA TCTTGCTCGAAATTTCGCAGTTATGGTTCGAGTTCGTGGCCCTGATCCAAAAGGCATGAAGATGAGAAGACACGCTTTTCATCAATACCGTTCTGGAGAA ACAACTCTTTCAGCTTCTGGGATGCTTGTGCCTGATACACTTTCTGATACCCAAAGTGCTAAGCTTCTATACGATGATAAATCTGATGGTAGGGTATTGG TTTTAACTGTTGCATCGCTTGTGGAACCCTTTTTGTCCCCTCAACATAGACACAATATTCCTCAGGATAGACCTAAGTTGATTCCTGGTGTTCGGATTGA TATTATGACCGAGAAAACCAACGAAAATTCCAGTCAAGGAACCCCTTCTTGGCTTGGGGCGCAGCTTTTGTCACTAGTTGACATTCCTGCTTCAGCCCTT TGTCTTCAGTCTCTAATTGAAGCATCTTCGGGCTCACCAGAGCATGAATGGGAGGTTGGTTGGTCTTTGGCATCAAACAGTAATGATAATAAACCTTCTA AAGATTTTTTTCGAACTCAGGTTAGCCCTGTTTTCCTTTATGAATGCACTCTCTCCCTTAGTTAAAAATTAGTTATAGTTTACAAAATTTGTATATTAAA AACATCCCAGTTCAATTATGAGATGGGAAGTATGATTCAAATGCCTTAAGAAAAGTGCACTTTGCATTCACAAATTTGATAATATGACTTGTATTTCACT GTGTCATGTTTGTCTAAATAAACTTGTTAGATCTGGAATTATATTGTAGCATGTCTGTCTGTCGCTTCTGGGAAAAGCACTCAATTAAAACACGTGGAAA GTTTTGCTCGTTGGTCTGCAAGCCTGAAAGCACCACAATCTGAGCTATTAATTTATTACATGGGATTAAGTAATGATGATAATCCTTCTATGTTTTTAGG TACTGGCTGAATTTTTTTGGAACATTCATCTCCACAGATGGATCACCCAGTTAAGATTAGTGGCTTATAAGAGTTGATCAATGTCTCTTGAGGCATCTTG TAAATTCTATTTGTATATGCTCAAAATTTAGCTTTTAACATTGTTGTGGGAAGGAAGCTGAAGCTGAGTTTCATAAAAATAGTTTGCACATTGCTTGCCA AAAGATGAAATTTTGGGGAAAAAGTGAGCATAGATGGCTAGTACTATCAAGTTTTGATCAGTCACAACTCAGGCCCTAGCTGTATTGCTTTCCTATATTT TTTCTCCTTCATAACCCCTCTAAAGTGCTTGGTAAATTATTTAAGTTTATATATTTTAATGTAGATTATGATAAATATGTCTAATAGACATAATGTTTTT GGATGAACATTAGCTTATATTAATCATGTAATTTTTTTAGATCTGACTAGATGTAATAATGTTTCACCTCAGTTGTTGTTCTGGATATATTTGTATATCT TTTGTAAAAAAATATTGATGCAACTGAAAATATTAATCTGTTCATTGATTAATGGAGTTGCACTTCATGTGAAAAATGGCTTATGTACACTTTTGGTACA CTTGGTAGAACTTATTAGAGTTTCATTTTTCTTCTTGTGTATAACCTGCTTTTGGGAATACATTCCTGTGATCATGATGCACAAAACTATAAAAGAAACT CAATCTTTTGCATAGAACATGATAAATCTTCTGTGAAATGCAGGGAAGATTGGAAGTGGGAGAATCTGGCAGTGCGAGTCTTGTGTGCAAATCATTGACT AGAATGGCCATTCTTAGTGTTTCCTTATCTCTCAAGGACGTGGTGGGTAGTACTGTATCTTCCATTAACAAAAGGGGTGATTCTCTTCTGGCAGTTGGAT CTCCTTTTGGGGTCCTGTCACCTACACACTTCTTTAACAGTATATCAGTAGGGCGCATTGCAAACTGCTATCCGCCATATTCATCAGATATATCATTGCT GATGGCTGACATACGCAGTCTTCCTGGAATGGAAGGTAGTCCAGTTTTCAGCGAGGATGCATGTCTTACTGGTATCATGATCAGACCATTGAGGCAGAAG ACAAGTGGGGCCGAAATCCAGCTGGTGATTCCATGGGATGCCATTGTGGGTGCTTCCAGTGGCTTGCTGCAGAAGTTGCCTCAGAACGAGCATTTAGATT TTAATGGCTCCTCACTATTACCAACTGAGAAAGCAATGGCTTCTATCTGTCTTGTTACGATTGGCGACGGTGTATGGGCATCTGGTGTTTTGCTCAACAG TCAAGGTCTCATACTTACAAATGCCCATCTCTTGGAACCTTGGAGATTTGGGAAAACACATCTAAGTGGTGGAGGATATGGAACCAACTCAGAAAAATTT CCTTTCAAGTTGGAGGGAGCCACAGATCTTAGGAATGGAATTGCGAGCATTCAAAAGAGTCAAACTTTGCCGTCGAAAGTGGGGACTGTTTATTCGTTCA CTGCTGATACTTACAACAACTATAGAAACATACGTGTACGTCTTGATCATGTTAATCCTTCGGTATGGTGTGGTGCTAGAGTAGTGTATATCTGTAAAGG ACCATGGGATGTTGCCTTACTGCAGCTTGAATCTGTTCCCGAGAAGCTTTTGCCTGTTGAAATTAATTTTTCCAGGCCATCCACAGGATCAAAGACACAT GTCATTGGCCATGGATTATTTGGCCCGAAATGTGGATTCTTCCCATCCGTTTGCTCTGGTGTGGTAGCAAAAGTGGTTGAAGCAAAGACTCCCCAATCTT ATCAATCAATTCAACCTGAGCTCAAGTACATGCATGAGTTCTTCCCAGCAATGCTTGAAACAACAGCTGCTGTTCATCCTGGTGCTAGTGGTGGTGCTGT TATCAATTCGGACGGACACATGATTGGCCTAGTAACAAGCAATGCAAGGCATGGTGGTGGAACGATAATACCGCATCTTAATTTTAGCATTCCGTCAGCA GCTCTGCTCCCCGTCTTCAAGTTCTCAAAAGACATGAAGAATTTCTCACTTTTACGGATTTTAGACGAACCGGATGAATACATTTCATCCGTATGGGCAT TGATGCGACCATCGTCTCCCAAGGTCAATGGCATGCCTAACCTTCCTCAGTCTCTTGTAGACAATAAAAGCAAAGACGTCAAGGGCTCTCAGTTTGCCAA GTTTATTGCTGAAAGAAATGATATTTTCAAAATGCCTTCTAATATTGGAAAGAGTGGAGTGCTTACTAAGGAAGCTTTTCTTAGTAAGTTATAACCCATA ATATTTTTGATTGGCATATTCTGCACTGGATTATACTGAACAGAAAATCAAGGAAATAAGTTCAAAGTTTCTAAAGAATCATGCTTGCAGTTCATTAGAA TTTGAAGGTGATTATTCATCAACACTAGTTATTTTATGTTATGCATTTTACCATGCAATTAACCATTGTTCACGGTTTGATTTGCATGAAAAGCCAAACT AAATCAAACTGGTTAACCTTTATTTTCTTTTTCTTATTTGCACTTCAAGTTTTAGTTTGCATTTCTGCCCCTGAACATGGCTAAAGAGTATAATTCGGAC GAACCTTGGTAAAAAGAATATCCAAGTAACTAGAGTAAGTAAATAATTTTCAGGTTTGATTTTATCTGCTTACATGGACTAATTTTATCATTTAATTGTC TGGTTATTTTCTTTATAAGGAATTTTTTTTAATGAGAAATTGAGAATTGAGATCATGTAAAGTTCCAAATAGAAAAATGGTTGTTTACTGAAATGATTTT TATTTATTTTAAGATTGGAAGAGGAAAAAAATAATATTTAGTTTACTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150332;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_311185

FPKM

• PAB: 2.2
• PNAB: 0.8
• PS1: 2
• PS2: 2.2
• PS3: 4.3
• PW1: 2.4
• PW2: 4.4
• PW3: 7.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_311185

• Blastp: Glyoxysomal processing protease, glyoxysomal from Arabidopsis with 53.66% of identity
• Blastx: Glyoxysomal processing protease, glyoxysomal from Arabidopsis with 53.66% of identity
• Eggnog: Serine protease(COG0265)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G28320)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019419712.1)
• Pfam: Trypsin (PF00089.25)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;