Ll_transcript_311186

• Id Trinity: TRINITY_DN47163_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_311186
• Sequence: ATTACCGCTATCTCATTTTTAACCCTTCAAATTTATTCAACTTCATCATCCCCACACTAAGAAATTTCTTCTCCACAATGGATTTATCGAAAACCGTTGA TCTTGCTCGAAATTTCGCAGTTATGGTTCGAGTTCGTGGCCCTGATCCAAAAGGCATGAAGATGAGAAGACACGCTTTTCATCAATACCGTTCTGGAGAA ACAACTCTTTCAGCTTCTGGGATGCTTGTGCCTGATACACTTTCTGATACCCAAAGTGCTAAGCTTCTATACGATGATAAATCTGATGGTAGGGTATTGG TTTTAACTGTTGCATCGCTTGTGGAACCCTTTTTGTCCCCTCAACATAGACACAATATTCCTCAGGATAGACCTAAGTTGATTCCTGGTGTTCGGATTGA TATTATGACCGAGAAAACCAACGAAAATTCCAGTCAAGGAACCCCTTCTTGGCTTGGGGCGCAGCTTTTGTCACTAGTAGGCATTTTAAACTCTTTTATG CTGTTCCTTATTATGCAGTCTTCTTAACAATTAATGATGTGTTGCACCTAATACTTTGTATCTAGTTATGAGACTCACTAATTATGGTACATGAATAGTT TAGTCTATTGTCATTTAATTCCTTCCATTTTCCCAAGATTGTTTATGAAATTTTCTCTTGTTTTCTTCTAAATGTTTGACTCAGCCGTTCATTTTCTAAA GACAGTGGTGAACTTTCAGCTGCATCATATGTTTTCCTCAATAATTTAGTCTTCGGGCTCATGTAATGGTCTCTAGCTAAACTTGATGGTTAATTACCAA AATTTGTGACATTTGTTTATCTACATGGCAAGACTTTTTTTTATAGGTTCATTTTTTAATATTTTTTCTACGAATTACTTGTTGCTTCAATGCTAATCAG ATTTTTGCATTACATAGGTTGACATTCCTGCTTCAGCCCTTTGTCTTCAGTCTCTAATTGAAGCATCTTCGGGCTCACCAGAGCATGAATGGGAGGTTGG TTGGTCTTTGGCATCAAACAGTAATGATAATAAACCTTCTAAAGATTTTTTTCGAACTCAGGTTAGCCCTGTTTTCCTTTATGAATGCACTCTCTCCCTT AGTTAAAAATTAGTTATAGTTTACAAAATTTGTATATTAAAAACATCCCAGTTCAATTATGAGATGGGAAGTATGATTCAAATGCCTTAAGAAAAGTGCA CTTTGCATTCACAAATTTGATAATATGACTTGTATTTCACTGTGTCATGTTTGTCTAAATAAACTTGTTAGATCTGGAATTATATTGTAGCATGTCTGTC TGTCGCTTCTGGGAAAAGCACTCAATTAAAACACGTGGAAAGTTTTGCTCGTTGGTCTGCAAGCCTGAAAGCACCACAATCTGAGCTATTAATTTATTAC ATGGGATTAAGTAATGATGATAATCCTTCTATGTTTTTAGGTACTGGCTGAATTTTTTTGGAACATTCATCTCCACAGATGGATCACCCAGTTAAGATTA GTGGCTTATAAGAGTTGATCAATGTCTCTTGAGGCATCTTGTAAATTCTATTTGTATATGCTCAAAATTTAGCTTTTAACATTGTTGTGGGAAGGAAGCT GAAGCTGAGTTTCATAAAAATAGTTTGCACATTGCTTGCCAAAAGATGAAATTTTGGGGAAAAAGTGAGCATAGATGGCTAGTACTATCAAGTTTTGATC AGTCACAACTCAGGCCCTAGCTGTATTGCTTTCCTATATTTTTTCTCCTTCATAACCCCTCTAAAGTGCTTGGTAAATTATTTAAGTTTATATATTTTAA TGTAGATTATGATAAATATGTCTAATAGACATAATGTTTTTGGATGAACATTAGCTTATATTAATCATGTAATTTTTTTAGATCTGACTAGATGTAATAA TGTTTCACCTCAGTTGTTGTTCTGGATATATTTGTATATCTTTTGTAAAAAAATATTGATGCAACTGAAAATATTAATCTGTTCATTGATTAATGGAGTT GCACTTCATGTGAAAAATGGCTTATGTACACTTTTGGTACACTTGGTAGAACTTATTAGAGTTTCATTTTTCTTCTTGTGTATAACCTGCTTTTGGGAAT ACATTCCTGTGATCATGATGCACAAAACTATAAAAGAAACTCAATCTTTTGCATAGAACATGATAAATCTTCTGTGAAATGCAGGGAAGATTGGAAGTGG GAGAATCTGGCAGTGCGAGTCTTGTGTGCAAATCATTGACTAGAATGGCCATTCTTAGTGTTTCCTTATCTCTCAAGGACGTGGTGGGTAGTACTGTATC TTCCATTAACAAAAGGGGTGATTCTCTTCTGGCAGTTGGATCTCCTTTTGGGGTCCTGTCACCTACACACTTCTTTAACAGGTATTACATTTCTGTTTGG ATAAAAGAAGAAAAATGGTTGTAGTAAACTTTCTTAATCCCCTGATGTAACATGTACTTCATCACTTTCTGTCGAACATTTTCCATGAGCTTTTGGGATC AACTATGTATTGAGTTCTAGAGGCAGCTATTTTGTTTTTAGTGCTGTTGTGGAGTGGATATCAATGTTTGAAACTTTGTATCATTCATTCCTTTGATTTG GTTGCTTGTTTGAATCAGTATATCAGTAGGGCGCATTGCAAACTGCTATCCGCCATATTCATCAGATATATCATTGCTGATGGCTGACATACGCAGTCTT CCTGGAATGGAAGGTAGTCCAGTTTTCAGCGAGGATGCATGTCTTACTGGTATCATGATCAGACCATTGAGGCAGAAGACAAGTGGGGCCGAAATCCAGC TGGTGATTCCATGGGATGCCATTGTGGGTGCTTCCAGTGGCTTGCTGCAGAAGTTGCCTCAGAACGAGCATTTAGATTTTAATGGCTCCTCACTATTACC AACTGAGAAAGCAATGGCTTCTATCTGTCTTGTTACGATTGGCGACGGTGTATGGGCATCTGGTGTTTTGCTCAACAGTCAAGGTCTCATACTTACAAAT GCCCATCTCTTGGAACCTTGGAGATTTGGGAAAACACATCTAAGTGGTGGAGGATATGGAACCAACTCAGAAAAATTTCCTTTCAAGTTGGAGGGAGCCA CAGATCTTAGGAATGGAATTGCGAGCATTCAAAAGAGTCAAACTTTGCCGTCGAAAGTGGGGACTGTTTATTCGTTCACTGCTGATACTTACAACAACTA TAGAAACATACGTGTACGTCTTGATCATGTTAATCCTTCGGTATGGTGTGGTGCTAGAGTAGTGTATATCTGTAAAGGACCATGGGATGTTGCCTTACTG CAGCTTGAATCTGTTCCCGAGAAGCTTTTGCCTGTTGAAATTAATTTTTCCAGGCCATCCACAGGATCAAAGACACATGTCATTGGCCATGGATTATTTG GCCCGAAATGTGGATTCTTCCCATCCGTTTGCTCTGGTGTGGTAGCAAAAGTGGTTGAAGCAAAGACTCCCCAATCTTATCAATCAATTCAACCTGAGCT CAAGTACATGCATGAGTTCTTCCCAGCAATGCTTGAAACAACAGCTGCTGTTCATCCTGGTGCTAGTGGTGGTGCTGTTATCAATTCGGACGGACACATG ATTGGCCTAGTAACAAGCAATGCAAGGCATGGTGGTGGAACGATAATACCGCATCTTAATTTTAGCATTCCGTCAGCAGCTCTGCTCCCCGTCTTCAAGT TCTCAAAAGACATGAAGAATTTCTCACTTTTACGGATTTTAGACGAACCGGATGAATACATTTCATCCGTATGGGCATTGATGCGACCATCGTCTCCCAA GGTCAATGGCATGCCTAACCTTCCTCAGTCTCTTGTAGACAATAAAAGCAAAGACGTCAAGGGCTCTCAGTTTGCCAAGTTTATTGCTGAAAGAAATGAT ATTTTCAAAATGCCTTCTAATATTGGAAAGAGTGGAGTGCTTACTAAGGAAGCTTTTCTTAGTAAGTTATAACCCATAATATTTTTGATTGGCATATTCT GCACTGGATTATACTGAACAGAAAATCAAGGAAATAAGTTCAAAGTTTCTAAAGAATCATGCTTGCAGTTCATTAGAATTTGAAGGTGATTATTCATCAA CACTAGTTATTTTATGTTATGCATTTTACCATGCAATTAACCATTGTTCACGGTTTGATTTGCATGAAAAGCCAAACTAAATCAAACTGGTTAACCTTTA TTTTCTTTTTCTTATTTGCACTTCAAGTTTTAGTTTGCATTTCTGCCCCTGAACATGGCTAAAGAGTATAATTCGGACGAACCTTGGTAAAAAGAATATC CAAGTAACTAGAGTAAGTAAATAATTTTCAGGTTTGATTTTATCTGCTTACATGGACTAATTTTATCATTTAATTGTCTGGTTATTTTCTTTATAAGGAA TTTTTTTTAATGAGAAATTGAGAATTGAGATCATGTAAAGTTCCAAATAGAAAAATGGTTGTTTACTGAAATGATTTTTATTTATTTTAAGATTGGAAGA GGAAAAAAATAATATTTAGTTTACTC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150332;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_311186

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.4
• PS2: 0.6
• PS3: 0.6
• PW1: 0.8
• PW2: 1.2
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_311186

• Blastp: Glyoxysomal processing protease, glyoxysomal from Arabidopsis with 54.57% of identity
• Blastx: Glyoxysomal processing protease, glyoxysomal from Arabidopsis with 54.47% of identity
• Eggnog: Serine protease(COG0265)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G28320)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019419712.1)
• Pfam: Trypsin (PF00089.25)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;