Ll_transcript_311204

• Id Trinity: TRINITY_DN47163_c0_g1_i20
• Name Transcript: Ll_transcript_311204
• Sequence: ATTACCGCTATCTCATTTTTAACCCTTCAAATTTATTCAACTTCATCATCCCCACACTAAGAAATTTCTTCTCCACAATGGATTTATCGAAAACCGTTGA TCTTGCTCGAAATTTCGCAGTTATGGTTCGAGTTCGTGGCCCTGATCCAAAAGGCATGAAGATGAGAAGACACGCTTTTCATCAATACCGGTTTTGTTAC TTCTCCCACTCCATATTCATAATCTTGCTTCTCTTGTTTCAAAGTTTTAATTTTTCATTCATGGGTATGTTTAGTTCTGGAGAAACAACTCTTTCAGCTT CTGGGATGCTTGTGCCTGATACACTTTCTGATACCCAAAGTGCTAAGCTTCTATACGATGATAAATCTGATGGTAGGGTATTGGTTTTAACTGTTGCATC ACTTGTGGAACCCTTTTTGTCCCGTCAACATAGACACAATATTCCTCAGGATAGACCTAAGTTGATTCCTGGTGTTCGGATTGATATTATGACCGAGAAA ACCAACGAAAATTCCAGTCAAGGAACCCCTTCTTGGCTTGGGGCGCAGCTTTTGTCACTAGTAGGCATTTTAAACTCTTTTATGCTGTTCCTTATTATGC AGTCTTCTTAACAATTAATGATGTGTTGCACCTAATACTTTGTATCTAGTTATGAGACTCACTAATTATGGTACATGAATAGTTTAGTCTATTGTCATTT AATTCCTTCCATTTTCCCAAGATTGTTTATGAAATTTTCTCTTGTTTTCTTCTAAATGTTTGACTCAGCCGTTCATTTTCTAAAGACAGTGGTGAACTTT CAGCTGCATCATATGTTTTCCTCAATAATTTAGTCTTCGGGCTCATGTAATGGTCTCTAGCTAAACTTGATGGTTAATTACCAAAATTTGTGACATTTGT TTATCTACATGGCAAGACTTTTTTTTATAGGTTCATTTTTTAATATTTTTTCTACGAATTACTTGTTGCTTCAATGCTAATCAGATTTTTGCATTACATA GGTTGACATTCCTGCTTCAGCCCTTTGTCTTCAGTCTCTAATTGAAGCATCTTCGGGCTCACCAGAGCATGAATGGGAGGTTGGTTGGTCTTTGGCATCA AACAGTAATGATAATAAACCTTCTAAAGATTTTTTTCGAACTCAGGTTAGCCCTGTTTTCCTTTATGAATGCACTCTCTCCCTTAGTTAAAAATTAGTTA TAGTTTACAAAATTTGTATATTAAAAACATCCCAGTTCAATTATGAGATGGGAAGTATGATTCAAATGCCTTAAGAAAAGTGCACTTTGCATTCACAAAT TTGATAATATGACTTGTATTTCACTGTGTCATGTTTGTCTAAATAAACTTGTTAGATCTGGAATTATATTGTAGCATGTCTGTCTGTCGCTTCTGGGAAA AGCACTCAATTAAAACACGTGGAAAGTTTTGCTCGTTGGTCTGCAAGCCTGAAAGCACCACAATCTGAGCTATTAATTTATTACATGGGATTAAGTAATG ATGATAATCCTTCTATGTTTTTAGGTACTGGCTGAATTTTTTTGGAACATTCATCTCCACAGATGGATCACCCAGTTAAGATTAGTGGCTTATAAGAGTT GATCAATGTCTCTTGAGGCATCTTGTAAATTCTATTTGTATATGCTCAAAATTTAGCTTTTAACATTGTTGTGGGAAGGAAGCTGAAGCTGAGTTTCATA AAAATAGTTTGCACATTGCTTGCCAAAAGATGAAATTTTGGGGAAAAAGTGAGCATAGATGGCTAGTACTATCAAGTTTTGATCAGTCACAACTCAGGCC CTAGCTGTATTGCTTTCCTATATTTTTTCTCCTTCATAACCCCTCTAAAGTGCTTGGTAAATTATTTAAGTTTATATATTTTAATGTAGATTATGATAAA TATGTCTAATAGACATAATGTTTTTGGATGAACATTAGCTTATATTAATCATGTAATTTTTTTAGATCTGACTAGATGTAATAATGTTTCACCTCAGTTG TTGTTCTGGATATATTTGTATATCTTTTGTAAAAAAATATTGATGCAACTGAAAATATTAATCTGTTCATTGATTAATGGAGTTGCACTTCATGTGAAAA ATGGCTTATGTACACTTTTGGTACACTTGGTAGAACTTATTAGAGTTTCATTTTTCTTCTTGTGTATAACCTGCTTTTGGGAATACATTCCTGTGATCAT GATGCACAAAACTATAAAAGAAACTCAATCTTTTGCATAGAACATGATAAATCTTCTGTGAAATGCAGGGAAGATTGGAAGTGGGAGA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150332;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_311204

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0
• PS1: 0
• PS2: 0.2
• PS3: 0
• PW1: 0
• PW2: 0.2
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_311204

• Blastp: Glyoxysomal processing protease, glyoxysomal from Arabidopsis with 47.02% of identity
• Blastx: Glyoxysomal processing protease, glyoxysomal from Arabidopsis with 47.02% of identity
• Eggnog: Serine protease(COG0265)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G28320)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019419712.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;