| Id Trinity | TRINITY_DN47184_c2_g2_i14 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_311683 |
| Sequence | ACCGTTGGATTCTGGATTCGTGAAACTGGCCAAGCCGTTGATCGCCTTGGTTCTCGTCTTCAGGGCAGTTACTACTTCCAAGAACAACGTTAGTTTTAGA TCCAATTTCTATCTTCTTTTCAATTCCATTTCTTACATATCATTATTTTTTATTTCAATTTTACCGTTTTTTCCTTGGATCGGTGCTGTTGTTAAATTCG ATTTTAATTTCGAATGATTTATTATTATTATTATGTTTAGTGTCTCGGCATCGAACTCTGATGAATATATTTGATAAGGCTCCTACTGTTGATAAGGATG CATTTGTTGCACCAAGTGCTTCTGTCATTGGTGATGTTCACATTGGAAAAGGTTCTTCCATTTGGTATGGCTCTGTCTTGAGAGGTAATCAATTCATTAC TCTTCTTCAATTATATGTCAATCGACTTTCGTATTTTCGTATCCGATGATTTCATTACTGCAATTTTGTTATAGTTGCATAATTCTATTTCCTTAGGTAG TGCTTGCCGACTTAAGTATCGATTTTGTCATAGAAAGGTCTCGTAAAATTAGTTAGAAGATTGACCAACTGTATTGCCAATAGAACCATGAACCTATACC ATGTAACTATGAATTTTATTTCGTTTTAATTTTGTTTGTGATAGTGTGAGTGTGTGACCCATAGTTAAATAATTCTCTCATTTATCTTTCATAATGCATG CCGAATTCACCGTACTGTCTACCACGCATCGGGTTTGTCATGGAGGTCTCGTAAAATTAATGTAAAAAGTGATGAACTGTGTACTAGTACCTATACCGTG TACCATGTAACTATGGTGTGACCTCTTTAGGCTTCACTTTGGTGCTCTCTGCAAGTAGGTCTTTTAGTGGAGTTCCTATGGTAGATATGGGCATGTTTTG TTGCATGCCCCTTCTGCTTAGTTTTTAGGTGTTTCTTTTTCCTTGTTGTGAGGATGTCTTATCCTCTTGTAATAATTTTTATCAAAAAAGAAGTTGTCCA ATAAAGCAGCCTTCTTTTATTTTCAAATGCAGTTTTCTTGGGATTTTGCAGTGATTGTTTGATGTAAATTGACTGAATTTTTTACCGAGTCTCTGTATTG TTGATAATAATATACATGGCAATCATGTTTGAACTTCACTTTATGAATAGGTGATGTTAACAGCATTAGTGTTGGAAGTGGAACTAACATACAGGATAAT TCCCTTGTTCATGTTGCAAAGTCAAATTTAAGTGGAAAGGTTTTGCCCACTATTATTGGGAATAATGTTACTATAGGTCATAGTGCTGTTATACATGGTT GTACTGTTGATGATGAGGCATTTGTTGGTATGGGCGCAACGCTACTTGACGGTGTTGTTGTTGAGAAAAATGCCATGGTGGCTGCTGGAGCACTTGTGAG ACAGAATACAAGGATTCCAAGTGGTGAGGTAAGTTTGTGGTTGTGCTGTTTGTTTGGCCTATCCAATTAATGAGATTTAGGATCCTGCTCATGTTTATCT GAGTATCTTTGGGATTACCTAGTAACTACTCCCTGCAATAAGGGACATGCTCTTAATGTTTTGTCTGACAAATTGACCAATCATGAACCAATAATTTAAT GCATTTTTCATCCATTACCTAATAACAATTTATAGTATGCAATATCCAACCATTTTTATTTATTATCATGATTCTGATTTGCAACAATTTTCTTTTATGA TTTTTTACCATATTTTTGGGACACATGGAGTAATATTATTGTCATTGGGTTAGCATATTTCTAACGGTTACTACTTACTGCTAATCCTGTTGAGGGAAAG ATGGTAAAATCGCACCTAATATGATTTGGACATGTGAGTAAAAGACTCGTAGAAGTCCAGTTAGAATGGTTGATTAGATGGAGGAGATAGCCCCATAATT AAATGGAGAGGAAGAGCAAGAAAAACATATATTAGAGCCATTATAAAAAGATCTAGACCTAAATGGATTTTTGGAAGGTTTGGTTTCTTACAGGACATGT GACTTGGTTTGATCCATGCATACGATCCCATATAGTTGGAGGGATTTGCTTCTTGTTATTGGTTGTTGTAATTTCTCATGAAATTTTAGGTTTTTCATTG TTACTTGGATCATTTATAATAATTATTGTGGAATAGAGATCTTATAATATGGATATGCCTTAAAAACATTCTCAAGAGTTGGTTTTTGTCAGTCTTTTAT AATGCCTTCCATTGTGTTTTTTAATCTTATCCACCAGTCTTATGATATTTTGGTATCTAAGAGGTTTATGAAACATAAAGCCCTTATTCTTTCTTCAAGC TTTGTCACCTAATCTCAAGCCTGCTGCCAAGAGCACTTATGTTGTCCAAAAAAATGTGTTACTTACTGTGATTGATTGGAAAAAAATTTAACTTCAAAAT TTATTAATTAAATATTTTTTTGACCAACTACAACATGTAATACGCTTTTTGGGACAACAGATGTGCTCCGATGGTGTCTGCCACTCTGGCAAAATTTTGT ATCAGCACTATTACCCTATCACCATGGCGTGTACAAAAAAAACTACAAACCTAGTGTCTATTGTGCATTATAACTTTGGTTCTAAACCTTATTTGGACTA GACTCTAATCCATAATACCAGACCACATTTATTTAACTGTTATACAGAAACCTTTAAATTGACTCAGGTTAGGTACTTTTGTAGTATTTGATGATGTTAA CCTTTATGTTTGAGATTTAGACCCATTAAAAAAATGGTGTGGATTCTAGAGAGTAAACTTTAGAATCTGTAGATTGTAAAGCTGACGAGAAAATTAAGGG AGTGGATTCGCACATCCATGCTTTACCCTTTAGTTGCTTATACTTTATATAAAAAAAATTAACAGTTTATTTTCTCATTAATGCATTTCACTGTCCCAAG TGTGCCACTTAATTTTGACTATCCAAACCCTATTGTGTATGTGATTTTAGTTCAAATGATAGTCTTTGTTCATAAAATATTTATCATCGGATGAAAACCT TTCCTTTGTCATGCTTTTATTGTTGCCTGGGCTAGATATTTAAGTTGTTGTGTATTAGTTAGGCTGCTTTTTTCAAATGTTTGCTATAATAATATTATAA TCCATGATTTATAATCACAACCTTTTTTTATAGGCACAAGCTTTTACACATTTTGCAGGTCTGGGCAGGAAATCCAGCGAAGTTCCTGAGAAAGCTCACT GATGAAGAGATAGCTTTCATCTCCCAATCAGCCATAAATTATACTAACCTTGCACAGGTCCATGCAGCTGAAAATTCAAAGTCTTATGATGAAATTGAGT TTGAGAAGGTTTTGCGGAAGAAGTTTGCATGTAAAGACGAGGAGTACGACTCTATGCTAGGTGTTGTTCGTGAAGTCCCACCAGAGCTTATCCTTCCTGA TAATGTCCTACCTGGTAAAGCAGAAAAAGCTCTTCAAAAATGAGGGTCTTTAAAAGCAGTGTTTTGAATTCCAATCTTGAAATGGCTTTAAGGGATATTC TTGTTTTGTTCAAATTCATGGAAGGGGGGTTATTTTCATTCCCAATAATACCAGACATTTTCAAGGGTTAGAATTATGGCTCTTTCCTGGTTAAGGAAGC AATTGCTCAGTTAATATTTCAGTGTACCCATCTTCAGTGTTTGATGTATCAAATGCAAGTTATTTCACTAGTTTTATATGAACCATTTATTTTGAATCTT AATGGATAATGATTGTTGCTTAAAATGTAAGTGCGTGACAGGGATTTGAAACTATTTAGAAAAAAGTGTATTGTCTAATGACTTAATAAAGATTATAGTG TGTATGAAGTTTTCTGTGTTATTATTATTATGTAGCTTGATTAGCATAGAATAATAATGTTAAAAATGTTGTTCA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_150538; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_311683
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial from Arabidopsis with 81.9% of identity |
| Eggnog | Transferase(COG0663) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G19580) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416688.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |