Id Trinity | TRINITY_DN47184_c2_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_311668 |
Sequence | TTTTCATATTAACGAGAAACCCCATTTTAGCCTCGTTTCCGAAGCGGAGGGATATACTAGGCTAGTAGAAGTGGTTAGGTTGCAGTGTTTCCGTTTGAAT CGAAGAATCAGAAGAGTGAAATGGGAACTCTAGGGAGAGTCATCTACACCGTTGGATTCTGGATTCGTGAAACTGGCCAAGCCGTTGATCGCCTTGGTTC TCGTCTTCAGGGCAGTTACTACTTCCAAGAACAACTGTCTCGGCATCGAACTCTGATGAATATATTTGATAAGGCTCCTACTGTTGATAAGGATGCATTT GTTGCACCAAGTGCTTCTGTCATTGGTGATGTTCACATTGGAAAAGGTTCTTCCATTTGGTATGGCTCTGTCTTGAGAGGTAATCAATTCATTACTCTTC TTCAATTATATGTCAATCGACTTTCGTATTTTCGTATCCGATGATTTCATTACTGCAATTTTGTTATAGTTGCATAATTCTATTTCCTTAGGTAGTGCTT GCCGACTTAAGTATCGATTTTGTCATAGAAAGGTCTCGTAAAATTAGTTAGAAGATTGACCAACTGTATTGCCAATAGAACCATGAACCTATACCATGTA ACTATGAATTTTATTTCGTTTTAATTTTGTTTGTGATAGTGTGAGTGTGTGACCCATAGTTAAATAATTCTCTCATTTATCTTTCATAATGCATGCCGAA TTCACCGTACTGTCTACCACGCATCGGGTTTGTCATGGAGGTCTCGTAAAATTAATGTAAAAAGTGATGAACTGTGTACTAGTACCTATACCGTGTACCA TGTAACTATGGTGTGACCTCTTTAGGCTTCACTTTGGTGCTCTCTGCAAGTAGGTCTTTTAGTGGAGTTCCTATGGTAGATATGGGCATGTTTTGTTGCA TGCCCCTTCTGCTTAGTTTTTAGGTGTTTCTTTTTCCTTGTTGTGAGGATGTCTTATCCTCTTGTAATAATTTTTATCAAAAAAGAAGTTGTCCAATAAA GCAGCCTTCTTTTATTTTCAAATGCAGTTTTCTTGGGATTTTGCAGTGATTGTTTGATGTAAATTGACTGAATTTTTTACCGAGTCTCTGTATTGTTGAT AATAATATACATGGCAATCATGTTTGAACTTCACTTTATGAATAGGTGATGTTAACAGCATTAGTGTTGGAAGTGGAACTAACATACAGGATAATTCCCT TGTTCATGTTGCAAAGTCAAATTTAAGTGGAAAGGTTTTGCCCACTATTATTGGGAATAATGTTACTATAGGTCATAGTGCTGTTATACATGGTTGTACT GTTGATGATGAGGCATTTGTTGGTATGGGCGCAACGCTACTTGACGGTGTTGTTGTTGAGAAAAATGCCATGGTGGCTGCTGGAGCACTTGTGAGACAGA ATACAAGGATTCCAAGTGGTGAGGTAAGTTTGTGGTTGTGCTGTTTGTTTGGCCTATCCAATTAATGAGATTTAGGATCCTGCTCATGTTTATCTGAGTA TCTTTGGGATTACCTAGTAACTACTCCCTGCAATAAGGGACATGCTCTTAATGTTTTGTCTGACAAATTGACCAATCATGAACCAATAATTTAATGCATT TTTCATCCATTACCTAATAACAATTTATAGTATGCAATATCCAACCATTTTTATTTATTATCATGATTCTGATTTGCAACAATTTTCTTTTATGATTTTT TACCATATTTTTGGGACACATGGAGTAATATTATTGTCATTGGGTTAGCATATTTCTAACGGTTACTACTTACTGCTAATCCTGTTGAGGGAAAGATGGT AAAATCGCACCTAATATGATTTGGACATGTGAGTAAAAGACTCGTAGAAGTCCAGTTAGAATGGTTGATTAGATGGAGGAGATAGCCCCATAATTAAATG GAGAGGAAGAGCAAGAAAAACATATATTAGAGCCATTATAAAAAGATCTAGACCTAAATGGATTTTTGGAAGGTTTGGTTTCTTACAGGACATGTGACTT GGTTTGATCCATGCATACGATCCCATATAGTTGGAGGGATTTGCTTCTTGTTATTGGTTGTTGTAATTTCTCATGAAATTTTAGGTTTTTCATTGTTACT TGGATCATTTATAATAATTATTGTGGAATAGAGATCTTATAATATGGATATGCCTTAAAAACATTCTCAAGAGTTGGTTTTTGTCAGTCTTTTATAATGC CTTCCATTGTGTTTTTTAATCTTATCCACCAGTCTTATGATATTTTGGTATCTAAGAGGTTTATGAAACATAAAGCCCTTATTCTTTCTTCAAGCTTTGT CACCTAATCTCAAGCCTGCTGCCAAGAGCACTTATGTTGTCCAAAAAAATGTGTTACTTACTGTGATTGATTGGAAAAAAATTTAACTTCAAAATTTATT AATTAAATATTTTTTTGACCAACTACAACATGTAATACGCTTTTTGGGACAACAGATGTGCTCCGATGGTGTCTGCCACTCTGGCAAAATTTTGTATCAG CACTATTACCCTATCACCATGGCGTGTACAAAAAAAACTACAAACCTAGTGTCTATTGTGCATTATAACTTTGGTTCTAAACCTTATTTGGACTAGACTC TAATCCATAATACCAGACCACATTTATTTAACTGTTATACAGAAACCTTTAAATTGACTCAGGTTAGGTACTTTTGTAGTATTTGATGATGTTAACCTTT ATGTTTGAGATTTAGACCCATTAAAAAAATGGTGTGGATTCTAGAGAGTAAACTTTAGAATCTGTAGATTGTAAAGCTGACGAGAAAATTAAGGGAGTGG ATTCGCACATCCATGCTTTACCCTTTAGTTGCTTATACTTTATATAAAAAAAATTAACAGTTTATTTTCTCATTAATGCATTTCACTGTCCCAAGTGTGC CACTTAATTTTGACTATCCAAACCCTATTGTGTATGTGATTTTAGTTCAAATGATAGTCTTTGTTCATAAAATATTTATCATCGGATGAAAACCTTTCCT TTGTCATGCTTTTATTGTTGCCTGGGCTAGATATTTAAGTTGTTGTGTATTAGTTAGGCTGCTTTTTTCAAATGTTTGCTATAATAATATTATAATCCAT GATTTATAATCACAACCTTTTTTTATAGGCACAAGCTTTTACACATTTTGCAGGTCTGGGCAGGAAATCCAGCGAAGTTCCTGAGAAAGCTCACTGATGA AGAGATAGCTTTCATCTCCCAATCAGCCATAAATTATACTAACCTTGCACAGGTCCATGCAGCTGAAAATTCAAAGTCTTATGATGAAATTGAGTTTGAG AAGGTTTTGCGGAAGAAGTTTGCATGTAAAGACGAGGAGTACGACTCTATGCTAGGTGTTGTTCGTGAAGTCCCACCAGAGCTTATCCTTCCTGATAATG TCCTACCTGGTAAAGCAGAAAAAGCTCTTCAAAAATGAGGGTCTTTAAAAGCAGTGTTTTGAATTCCAATCTTGAAATGGCTTTAAGGGATATTCTTGTT TTGTTCAAATTCATGGAAGGGGGGTTATTTTCATTCCCAATAATACCAGACATTTTCAAGGGTTAGAATTATGGCTCTTTCCTGGTTAAGGAAGCAATTG CTCAGTTAATATTTCAGTGTACCCATCTTCAGTGTTTGATGTATCAAATGCAAGTTATTTCACTAGTTTTATATGAACCATTTATTTTGAATCTTAATGG ATAATGATTGTTGCTTAAAATGTAAGTGCGTGACAGGGATTTGAAACTATTTAGAAAAAAGTGTATTGTCTAATGACTTAATAAAGATTATAGTGTGTAT GAAGTTTTCTGTGTTATTATTATTATGTAGCTTGATTAGCATAGAATAATAATGTTAAAAATGTTGTTCA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_150538; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_311668
Blastp | Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial from Arabidopsis with 84.09% of identity |
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Blastx | Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial from Arabidopsis with 81.9% of identity |
Eggnog | Transferase(COG0663) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G19580) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416688.1) |
Pfam | Bacterial transferase hexapeptide (six repeats) (PF00132.23) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |