Id Trinity | TRINITY_DN47184_c2_g2_i6 |
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Name Transcript | Ll_transcript_311671 |
Sequence | AACAAGTATTTTAGAAATGGGCCAAGTCTAACCGAAGAAGATTGAGTGAGCGAAGAGGGTAGCCCAGCCCATTTGGGCCCATTTGGAAAGGTCAGAAACC CCGTTTTACCCTCCATCTGAAGCGGGATATACAACCCGACCACTAGGTAGGAATCTGTGTGAGGTGGAATAGAGAAGAAGAAGAGAAGAAAGTAAGAATC GGAGAGAAATGGGAACTCTAGGGAGAGTAATATACACCGTTGGATTCTGGATTCGTGAGACTGGCCAGGCCGTTGATCGTCTTGGTTCTCGCCTTCAGGG AAACTATTACTTCCAAGAGCAGTTGTCTAGGCATCGAACTCTGATGAACATATTTGATAAGGCTCCTTCTGTTGATAAGGATGCATTTGTTGCGCCGAGT GCCTCGGTCATTGGTGATGTTCACATTGGAAGAGGCTCATCAATTTGGTATGGATCTGTCTTGAGAGGTAAGCAATTCCCCTTCATCGATTATGTGTGAA TGCCGAGTCTCTATATTGTTCGTAATGGTGTCTGAATTTCACTGTATGAATAGGTGATGTTAACAGCATTAGTGTTGGAAGTGGAACTAACATACAGGAT AATTCCCTTGTTCATGTTGCAAAGTCAAATTTAAGTGGAAAGGTTTTGCCCACTATTATTGGGAATAATGTTACTATAGGTCATAGTGCTGTTATACATG GTTGTACTGTTGATGATGAGGCATTTGTTGGTATGGGCGCAACGCTACTTGACGGTGTTGTTGTTGAGAAAAATGCCATGGTGGCTGCTGGAGCACTTGT GAGACAGAATACAAGGATTCCAAGTGGTGAGGTAAGTTTGTGGTTGTGCTGTTTGTTTGGCCTATCCAATTAATGAGATTTAGGATCCTGCTCATGTTTA TCTGAGTATCTTTGGGATTACCTAGTAACTACTCCCTGCAATAAGGGACATGCTCTTAATGTTTTGTCTGACAAATTGACCAATCATGAACCAATAATTT AATGCATTTTTCATCCATTACCTAATAACAATTTATAGTATGCAATATCCAACCATTTTTATTTATTATCATGATTCTGATTTGCAACAATTTTCTTTTA TGATTTTTTACCATATTTTTGGGACACATGGAGTAATATTATTGTCATTGGGTTAGCATATTTCTAACGGTTACTACTTACTGCTAATCCTGTTGAGGGA AAGATGGTAAAATCGCACCTAATATGATTTGGACATGTGAGTAAAAGACTCGTAGAAGTCCAGTTAGAATGGTTGATTAGATGGAGGAGATAGCCCCATA ATTAAATGGAGAGGAAGAGCAAGAAAAACATATATTAGAGCCATTATAAAAAGATCTAGACCTAAATGGATTTTTGGAAGGTTTGGTTTCTTACAGGACA TGTGACTTGGTTTGATCCATGCATACGATCCCATATAGTTGGAGGGATTTGCTTCTTGTTATTGGTTGTTGTAATTTCTCATGAAATTTTAGGTTTTTCA TTGTTACTTGGATCATTTATAATAATTATTGTGGAATAGAGATCTTATAATATGGATATGCCTTAAAAACATTCTCAAGAGTTGGTTTTTGTCAGTCTTT TATAATGCCTTCCATTGTGTTTTTTAATCTTATCCACCAGTCTTATGATATTTTGGTATCTAAGAGGTTTATGAAACATAAAGCCCTTATTCTTTCTTCA AGCTTTGTCACCTAATCTCAAGCCTGCTGCCAAGAGCACTTATGTTGTCCAAAAAAATGTGTTACTTACTGTGATTGATTGGAAAAAAATTTAACTTCAA AATTTATTAATTAAATATTTTTTTGACCAACTACAACATGTAATACGCTTTTTGGGACAACAGATGTGCTCCGATGGTGTCTGCCACTCTGGCAAAATTT TGTATCAGCACTATTACCCTATCACCATGGCGTGTACAAAAAAAACTACAAACCTAGTGTCTATTGTGCATTATAACTTTGGTTCTAAACCTTATTTGGA CTAGACTCTAATCCATAATACCAGACCACATTTATTTAACTGTTATACAGAAACCTTTAAATTGACTCAGGTTAGGTACTTTTGTAGTATTTGATGATGT TAACCTTTATGTTTGAGATTTAGACCCATTAAAAAAATGGTGTGGATTCTAGAGAGTAAACTTTAGAATCTGTAGATTGTAAAGCTGACGAGAAAATTAA GGGAGTGGATTCGCACATCCATGCTTTACCCTTTAGTTGCTTATACTTTATATAAAAAAAATTAACAGTTTATTTTCTCATTAATGCATTTCACTGTCCC AAGTGTGCCACTTAATTTTGACTATCCAAACCCTATTGTGTATGTGATTTTAGTTCAAATGATAGTCTTTGTTCATAAAATATTTATCATCGGATGAAAA CCTTTCCTTTGTCATGCTTTTATTGTTGCCTGGGCTAGATATTTAAGTTGTTGTGTATTAGTTAGGCTGCTTTTTTCAAATGTTTGCTATAATAATATTA TAATCCATGATTTATAATCACAACCTTTTTTTATAGGCACAAGCTTTTACACATTTTGCAGGTCTGGGCAGGAAATCCAGCGAAGTTCCTGAGAAAGCTC ACTGATGAAGAGATAGCTTTCATCTCCCAATCAGCCATAAATTATACTAACCTTGCACAGGTCCATGCAGCTGAAAATTCAAAGTCTTATGATGAAATTG AGTTTGAGAAGGTTTTGCGGAAGAAGTTTGCATGTAAAGACGAGGAGTACGACTCTATGCTAGGTGTTGTTCGTGAAGTCCCACCAGAGCTTATCCTTCC TGATAATGTCCTACCTGGTAAAGCAGAAAAAGCTCTTCAAAAATGAGGGTCTTTAAAAGCAGTGTTTTGAATTCCAATCTTGAAATGGCTTTAAGGGATA TTCTTGTTTTGTTCAAATTCATGGAAGGGGGGTTATTTTCATTCCCAATAATACCAGACATTTTCAAGGGTTAGAATTATGGCTCTTTCCTGGTTAAGGA AGCAATTGCTCAGTTAATATTTCAGTGTACCCATCTTCAGTGTTTGATGTATCAAATGCAAGTTATTTCACTAGTTTTATATGAACCATTTATTTTGAAT CTTAATGGATAATGATTGTTGCTTAAAATGTAAGTGCGTGACAGGGATTTGAAACTATTTAGAAAAAAGTGTATTGTCTAATGACTTAATAAAGATTATA GTGTGTATGAAGTTTTCTGTGTTATTATTATTATGTAGCTTGATTAGCATAGAATAATAATGTTAAAAATGTTGTTCA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_150538; |
Additional information | - |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_311671
Blastp | - |
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Blastx | Gamma carbonic anhydrase 1, mitochondrial from Arabidopsis with 89.36% of identity |
Eggnog | Transferase(COG0663) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G19580) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019416688.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |