| Id Trinity | TRINITY_DN47205_c2_g3_i6 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_385392 |
| Sequence | CACACCTGCCTGGTCACTTAGGTATGATATTGTGTAAATTATTATGCATCCATCCTCATCATCCCTTTTAGTTACCCAGAATCCTTCCACATGAATAGGG GAATTCTAGGTAATTGTTCGAACAGAGTTTATTTGGTATGGTGCACTTAGATACTTGGGATATTAGCAAGTATTGACAATTAGATACTGTGTAATTGTCA AAAAATGTTCTTCCTAAACAATTCAGGGCTCCCTACTTCCCTTGGTATAAGCTCCACTTTGGTAAACATTGTTAACCTATGAAGCATTGATACTTGAATT TCCTTCACACATTTGTATCCAATTCCGATCTTCGATACTGCATTATACGTCAAATGAAAATTTGAAAAATAAATAAATAACTAGATATGTTTTCGATGCG TGATTACTAGCCTTCCGATACGTTTTGCAACATTGTCTCTTGATGAACCTAACATAGAAATTGTCCTCATTATACATGATAATCAGGGTAGAGATGAAAT TGATATACCTCTGTTGACAGTGCTAGGAAATAAGCAATGGTTTTTTATGATAATGATTTGCAATTTCTATTTTAGATCTCTTTATGTCTCTGAAGTATGT TCTTAGTTTAAATTTTGGAAGACATTAATGTGCAATTTTTATCTTATATTAAGTGATGTCTAATAAGTATATTTGTAGTTTGACTTTTGGATTTGCAATT ATATATTTATTATATTTTATGAATTTATATATGTGTGTGTGTGTGTTTCCCAAACTTATTGTATCCTGTATTTTTTAAGAATATTGTATCGATGTACTCA TATCAATATCAGCTCTTCATAGTCTTTAACTATTCAAATAATTAAAGGGTGTTGTTGGTAAAGTTTTGGTAGAATCAGAATTAAGTGAAATTACAATTTG GAAGTTTAATTGTACAGAGATTTGCTCTTACAAATTGATGCTTTTTGCCTTTGGAAAGGGTAAATAGGGCTGTTATAGACTTATAGGTGGTCAATGGTAG TAAATAGTATCCATTGCCAATAGAAATTGGGATTATTACGATAAAAGAAATTTGAGTGATATAAATGTGAATTACAATTCTTCGACTTTTATACGAGTCT ATTCACTTCTCTGCAAGTCCTAACTGTAGATTAATATGGATACTTCTCGCTCATTGTCTAGCAAATCCCCTTTAAGAAATGAAAAGGAATTGGGCACCCG TGTCATGGTTTTGTTTCCTTTATTTTTTTTGTTTTCGACTTTTCTACTCTTGAGGTTTCCTTGCCCCATGCTCTGGTAATACTTCTCTGCCACTTCTTTT TCTATGCAAAAAATTGGCTATAATCAAAGGTAACTGTGGGCTTGGCAGAAGGTTAGTGTTATGCTGGAACTGTAATTGCTACTTACAGCATGGAAATGTA GTCATGTAATACTTTGGTCCTTCCTTCAAATTATCCTTTGTTTGTTCCCTTTTACAACCTCATGGAATCATTAGAATTTTAAATGATACATGAAATATGT ATATTCATTCAAGAGCCCCAATCAAATTTTATAATCCAATGTTGCTGTCTAGCCTTCTTATGTATTACACATTAGTGAAGAAACATACATTTGGGTGATG GAGGAATTGTTATATAGGATAATCCTCTTAGTTTTTTGTAAAAATGGTTGAAAGGAAATTCGTTAGTTCAGAACTGATCACCAATTGAAAAGGTGATTGG TGAACATCATAAATCTTGTAATTCTCTGTTTATAGGTTGTTATTGTATGCAGGTGAGTACTTGGCTCTGACAGGGGAAAAACTCAATGGGGTAGAGATGG TTACCTGCGGGCTTGCTACACACTACACACTAACTGCAGTTTAGTTCTGTTAGACCCTGCACACTTATTTTATTTCAAATATAATGGACATCTGAGGTTC TAACATTCCAAGCCATTGCTTGTCTTGTCCCATAGCGGCTCCCGTTAATCGAAGAACAGCTGGGGAGATTGGTTACTGACGATCCGTCAGTCATTGAAAC CACTTTAGAGCAGTATGGTGACCTTGTTCACCCAGACAGCAGAAGCGTACTTCAAAGAATTGAAATTGTTGATAAATGCTTTGGCCTTGACACAGTTGAA GAGATTGTTGATGCTTTGGAAGTTGCGGCAAGTGAAACAAAAGATGCATGGTGCATTTCTACCTTAAATAGACTCAAAGAAGCTTGTCCATTGAGCTTGA AGGTTTCATTGAGATCTATACGAGAAGGTAGATTTCAGACCTTTGACCAGTGCTTGTCACGTGAGTACCGCATGACTTTACAAGGAATATCTAAGCAGAT ATCTGGTGACTATTGTGAGGGAGTAAGAGCACGTGTAATAGACAAGGACATGGCACCAAAGTGGGATCCTCCAACCCTGGAAAAGGTATCTCAGGATATG GTGGATCAGTACTTCTTACCTCTAAGTGAATTTGAACCTGATCTAGAGCTACCAACAAAAATTCGAGAAGCATTTTCCTAGTTTCCTTTTTTCTTTTGAA GTGTTTCCTGAAGTGGACAAATAGATATACAGCAATTGTATTTTGCAGGGCATTGGTGAAGGTTGTACTTAAAACATATATAGGTTGTACCAGCTTTGTG TTGTGTTGGTATTCACCAACAGATATATGCACATGAACAAAGTCTTGTTCTTCCTGAATTTCCATTAATTTATTTAATAAATGAGATGATCTCTATGGTA AAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_150730; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_385392
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 2, mitochondrial from Arabidopsis with 63.54% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019413106.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |