Ll_transcript_385793

• Id Trinity: TRINITY_DN47216_c1_g2_i4
• Name Transcript: Ll_transcript_385793
• Sequence: TTTGTAACAATGTTTGGGACAGCAGATCCTGGTTTATATGATTTTGTGTAAAGTTGTATTAAGGAAAGTGTCTATATGTACTCGTGAGTTGTCTTATCCC TCTTTGATTCTCTCACACACACACATATAAGCATATCATCACACCAACCTCTTCACCATCAAGCTCCATGGCCGCCATAACCTTAAAGCCCTACTCTCTT CTCCGTCCTTCAAACCCTCTTCTCCATAAGCCACCATCCCCAACATTCTTGAGAACAGCTTTCTCACACTCCACAATAATGCTTAAATCCCGAAGAAGAA AGATCAACACTTTAACCGTTTGTGTCCTCATGGATGATCCAAAACAAGATGAGGAAGATCAGCAACAAGAAGAGCCTCAAGTTGTTGTTGTTTCTGAAAG AGTGACAGAAAAATTGGCTAGGAAAAAATCAGAGAGGTTCACTTATCTTGTTGCTGCTGTCATGTCTAGCTTTGGTATCACTTCACTGTCTATCTTAGCG GTTTATTATCGATTCTCATGGCAATTGGAGGGTGGAGAAATTCCTTGGCCTGAAATGTTTGGTACATTTGCTTTCTCAATGGGTGCTGCTGTGGGTATGG AGTTTTGGGCAAGATGGGCTCATAAGGCTCTTTGGCATGCCTCCTTATGGCACATGCATGAGGTATGCTAATGCAATTTGGTCATTCATTTTGATTAACC AAATTTGAGGGATTATATTTGTTAAAAAAATAGAGCGGTAAAAATTACATTTTTAAATTTCTGCAAGAAAACCTGTTTCCCCTTTTGATTTCCCAACTAA ATTGTGAGCAAAAAACATGAATTTGAAATTGTCACAGTCTCATCATCGACCAAGAGAAGGAGCATTCGAGCTTAATGATGTTTTTGCTATAATTAATGCT GTCCCTGCCATTGCTCTACTCTCCTATGGTTTTTTCCACAAGGGTCTGGTTCCTGGTCTATGTTTCGGTACCGGTCTTGGGATTACAGTGTTTGGGATGG CGTATATGTTTGTCCACGATGGATTGGTTCATAAGAGATTCCCTGTGGGTCCCATTGCCAACGTGCCCTATTTCAGAAGGGTTGCTGCTGCTCACCAAGT AATACAAAAAAAAATTAATATTCAATTTTTTTGTTTATTTACTTTTAGCTACAAAAAGTTAAAGAAAAATGTCCGTTGAGAGAATTATCCTCACATATAT TTGGATGTTCTCGGCTCGGATAAGATTGACTTAGTGCGAGGATACCGGGAAACCAAAAAAAAAGTTAAAGAAAAATGGGTTGTTTTAGTTTGTTTTTTGA ATAGGATCTCTTAACCTTAATTTTGTTGTCTGTATTCAGCTCCACCATTCAGACAAATTTGATGGGGTGCCATATGGGCTGTTTTTGGGACCAAAGGTAA CATTTTTTGTTCATTTAAATAGCTGTCATGTGTTGAATTTCTATTTCATTTTATTCAAGTTTTCATATACTCATTTTTGTGTTAATTTAATTTTTATTGA ATGAATTTTGGTGAGATTGGAACTTTAGAAGTTTCTCTTTTTTTGTTAACTCAGCATATTGTAGTGCTAATAATAATTAAGTATTGTTTGATAAAAAATG GTGCAGGAACTTGAAGAAGTGGAAGGACTAGAAGAGCTAGAGAAAGAGATAAGTAGGAGAATAAAATCACATAATGTTTCATGACAAATTAAGCTATTAC TGAAAAGCTGTTTGAAAGGAGTATGAGTGTAGAGAAACAATAATGATAATATTTGATTTTTGTTTTGCTTTTGTACATTATTCATTGATATTATGGTAGG ATATTACAAAATTATCACATACACACAAAAAGTTCAAAATATATAAATATGTGCAAGAAATAATTGGTGCCTTCAAGTAGGTAGTGTCAGTTTTTGGTTT GATACAGTGAATAGTGATACCCTTATGTGGGGCATGGAGCTAAACATGCCATGTACCAATCACTTAAGGGGCAAATTCAATGGTACCACTATTCTGTTGA CGAAGATCACCCGTCTCGAACGGTGTCCCATTTCCCGTCCCAAATCAATGAGAGTGCTACATTTTATAATTTTTTGTTTTTAAATTTTTTCTTTTATCTA TATGTAAATATGTGGACG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_150784;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_385793

FPKM

• PAB: 2.6
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.3
• PS2: 1.2
• PS3: 0.6
• PW1: 0.2
• PW2: 0.1
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_385793

• Blastp: Beta-carotene hydroxylase 2, chloroplastic from Capsicum with 59.38% of identity
• Blastx: Beta-carotene 3-hydroxylase, chloroplastic from Gentiana with 87.91% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: Link to kegg annotations (CAA70888)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019442123.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;