Ll_transcript_385545

• Id Trinity: TRINITY_DN47247_c0_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_385545
• Sequence: CTCCCCTGGATTACAGTCAACAACACCTCACATGTTCTGCAAGACTCTGACTGCTTCTGATACCAGCACTCATGGAGGATTTTCTGTTCCTCGTCGAGCA GCTGAAGATTGCTTCCCTCCCCTGGATTACAGTCAACAAAGACCTTCACAAGAGCTTGTGGCGAAGGATCTGCATGGCCTAGAATGGAAGTTTCGACATA TATACCGGGGTCAGCCACGGAGGCATTTGCTCACAACTGGATGGAGCGCATTTGTGAACAAGAAGAAGCTTGTGTCTGGCGATGCTGTGTTATTTCTCAG AGGTGAGGATGGAGAGCTGAGATTGGGGATTCGTCGAGCAGCTCAGCTGAAGAGTGGTACCTTCGCAGTTCCCTCCAGTCAGCAATTGAATCCTAGCACT CTCATGGATGTCGTTAATGCCTTGTCTGCACGATGTGCCTTTAGCGTTTGCTATAATCCAAGGGTCAGTTCTTCAGAATTTATCATACCACTCCACAAAT TCTCAAAGAGTCTCGATTGTTCTTATTCAGTTGGAATGAGGTTCAGGTTGCGCTTTGAAACTGAAGATGCTGCGGAGCGAAGATTCACAGGATTAATAGC TGGAATTAGTGATGTGGATCCTGTTAGATGGCCTGGATCAAAATGGAGATGCCTACTGGTATATCTTGAGGCTCGCTCTGACATTCCGTAATAGTCATTG TATACATGCTGAAGTTTGTGTTATAAGACTGCTGTCTCTACGTGTTGTAACCTGTAATGCTTGATATATAAACCTTTATGATTACTTCTTAACCCGTTTT TATAGATATAACCTCTATATCCATCATGGGATTTGCAGCCACTGATTTTCTCGACATTGTAATATTCTACTGACCGCTGTTTTTTATGGTTACGAGTGAC ATGAATGTTAATTTGATGCATATCATGAACTTATTATAGATGAAGCACATTCCCTGGTTACTTGTTGAATATTGAAAAATTGGCTTTTGATGTAACCCGG TTGAAGCTTAGTACTAAAAACTGATTACTAATTCCGGAGTGTCATTGCTTTACTCCTCTTCTAACAGCTGCTATTTGCATGCTTCTCTTTTTGTAATTCA TAGTCCATCTTGGTATACTTCAATATTTCAGATCAATATTGGTTACTCATCTGAATTTGAAATTTCCGCTTAAGTTACATGTATAATATTGTTTGATTCA CCAACTCACTTGTCAAACTTTAAAAAATTGATTGTATATTCATAATGGTCACTGTTTCATGTTTGTAATGCCTTATCTAATTAGGAATTGTTAAGTGACA CCATTTCAATAAATAATATTTGTCGATTGTTAACGGTAGCCATAAGTCAACTCTCATGTGTACAGGTAAGGTGGGATGATGTAGAAGCTGCTAGGCACAA TAGGGTTTCCCCATGGGAAATTGAGCCATCTGGTTCTGCTTCCACTTCCAGTAATTTGATGGCAGCTGGTTTGAAGAGGAGCAGGATTGGATTGAGTTCA GCGAAGCTAGAATTTCCAGTTCCCAATGGGATTGGAGCCTCAGACTTTGGGGAATCATCAAGATTCCGGAAGGTCTTGCAAGGTCAAGAAATGTTTGGTA TTAATACTCCCTATGATGGTATTAGTGCTCAGAGTCCTGGGTTATCTGAGTTAGGGAGGTGTTATCCCGGTTCAAACTGTTCTGGGATTGCTGCAACAGG AAATAATGCCAGAATCCCACAAGTAACTTCTGATTTTCCCAGCAATGGCATAGGCTTCAGTGAATCTTTTCGATTGCAGAAGGTCTTGCAAGGTCAAGAA ATACTTCCAAGCCAACCCTATGGACGAGCCTTGTCTATGGAGGAGGCTCACGGAAATGGTCGCTTTGGACTCTTTGATGGTTATTATCAAATGCTTGGCT CCAGGAATGGATGGTCTCGTCAGATGCATGATAATTCCTCACATTTGCACGCTTCTGTTCCATCAGGGCAAGTGTCATCTCCATCATCTGTGTTAATGTT CCAGCAATCAGTAAATCCAGTTTTGAACACTGACTATAATAACATACACAATCAGGAGGGAAAAATCCGTTACCGTGGTTCATATGCTTCTGAAATGAAA GGTCGAACTTCTGCAACTTTCGCATCCGTTGAGCCTCTTTACTCCGGGCACGCTCAGGAAGCCACAAATTCTTTTGGTATGTTTAATCTGCATAGTCAAT TGGCCGGTTCTCGTTCACATGAATCAGTTTCAGCTCTCAGAGGCAGTCAAGAGATTGCTTCCTCATGTAAAAGTAGCTGCAGACTCTTTGGTTTTTCACT AACCGAGGACAGAAACATTGCAAGTAAAGAAGCTGACCCGTCTACAATCACTTGTCAATTGAATTCCGGGCCTCCCTTCGCTAGACATGTTGATGATGAG TTCCACCCTGGCCAGTCTCTCAGGAATAAGGCGGTTGTTGGAAGTAACTGCACCAAAGGTGTGTTGCAGTATTGAGTTGAGAATCATAGTGTGCTAGTAT GACACTGGTATGAGGCAGCAGAAACCAAAGTGTGCATACTTGCACTGCTTATGTATGTTCTTGTTTTTAATAGCTTTATGGATTTGAAGGAGGAAGCAAA TTTGGATAATTGTATTTTAAATTGGCTAATGACCACATTGAAGTGTTGTATTAATCTTTATATGCATATTCAGTGACCTATAAGAGATGCATACTCTGTA GTAAAAACTCTAAGGTATATCAATGGTATGCACTTTTATCTATTGAACTATGCCAGAATTGTGGTAGTTTTGTTGCAGATTTTGCTATAAACTTTTATTT ATGTCACGAAATGCATAACTGTTCAATAGTGAC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_151084;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_385545

FPKM

• PAB: 0.1
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.4
• PS2: 0.1
• PS3: 0.5
• PW1: 0.7
• PW2: 0.3
• PW3: 0.1

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_385545

• Blastp: Auxin response factor 2 from Oryza sativa with 32.11% of identity
• Blastx: Auxin response factor 3 from Arabidopsis with 71.56% of identity
• Eggnog: auxin response factor(ENOG410YC80)
• Kegg: Link to kegg annotations (4325895)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019440226.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;