| Id Trinity | TRINITY_DN47272_c7_g4_i1 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_383795 |
| Sequence | GGCTACCTGTGGAATACCTGAAATAGCTTTTACAACTTTTGAGAACATGCTTTATGGAGAAGGTTTGCTCTCCTTATCTCTTTTTTTCTACACCTCTCTT CTTTTGCTTACGCTTATATTTGTTTACTCCCAATGATTTCGTTTACCATTTTCAGGTAAGCTCGGTTTCTATTCCTTTGATTTGTGTCAACTGTCTCTTC TTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTGTGTTTCTGCAGTGTTAAGCCTCTTTCTCCCTTATTACCTATATGTAAAGTTAATTAGCTTTAATTGGTTA CATAATAGATTTTATGAAGCCTGATACGGAGACTTACAATTGGGTTATTCAAGCATATACAAGAGCTGATTCTTATGACAGAGTACAAGATGTTGCTGAG TTACTTGGCATGATGATTGAACATCACAAGCGCATACAACCAAATGTGAAGACCCATGCGTAAGACAAGTCATTTCCTTTTGCAAAGTTTTACTATTGTA ACATATTGGATGTCAAGTTATTTGAAATTATTGCTTATTTAGCCTTGTAAAAAAGACCGTTTATCATTGCTATACTAACCTGAAGTTTGCAGCAAGACCT GCAACAAAACAGCAGATTGCAACAAAAAAGCTTTAATATATGAGTTTGTATGTAACATTATTAAAGAGAAAATGAGAGAATATAGAACTTCGGGGAGGAT GAGGTTCCTCCTAAACCAGAATGTAAAAATGAAAACAGTGAGCAAGGAGGCTAAGAAGTACTATAAAGCTGTCTGCACAACAGTTAAGAAATTTCCCTTA AAACAACAATGAGGGGAGTTCCCAAGAGAAGCCATAATCATGATTCTTTAACATTCAATATTATGGGCTAAGATGCCCCTGAAAAATATAGTCATTCCAC TTCAATCAAGTACATCAGAGAATCACAATAGCTGCACACTGCCACTAAATCACGATGTGCTTGGCCCAAAAAAGTAAAAATGGATGGAGCTGCAGGACTG TAAATTTAGAAGCTCAGGAGGTCAATCAGAATCCTGGTTTAATATATTGATTTTAGTGACACTTACTACTTCAACAATTCTAACTTTCACTAACAACAAA GTAATCTCCACTCACCCTTATGTTGACTATTTTGGGGATTATATGCTATTCAAATTTGAAATTTGTTCTCTATTTTCTGAAGGATCCAGGGATTATCAGG GAAGCTGAGTAATATGACTTGTAGTTTTGGGGACCAGATAGCATTCTATAAGCTGGTTTATTTAAATGAAAACGTTTTTTGTACCGGTGATGGATTTTGT ATATCTCACCATGACGTTTCCTATTGACCTGATTTGCCCCATACTTTTATGTAGGCTGTTAGTGGAGTGTTTTACCAAGTACTGTGTAGTACGAGAAGCT ATAAGGCATTTCCGTGCCCTTAAAAACTTCGAAGGGGGTACAAAAGTTCTACATAATGAAGGGAACTATGGAGATCCGCTTTCTCTGTATCTTCGGGCTT TATGCCGGGAAGGAAGGATTGTTGAAATGCTTGAGGCTTTAGAAGCCATGGCCAAAGATAACCAGACAATCCCTCCAAGGGCAATGCTTTTGAGCAGAAA ATACCGAACATTAGTGAGCTCATGGATTGAACCTTTACAAGAGGAGGCTGAACTTGGCTATGAGATTGATTACATTGCTAGGTAATAGGTATTGTTTCCT TTTCAACAACAGTTGCTATTTTGTATTTCATTATTTATTGTTTATTCTATTTATGTTTGCATATATGCTGATAATTTATCTTTGGTTAGGGAACCAAGTC CTAGATTGAAATTATTAAAATGGTTTGATTTGTTTGTGTATATTATATATAGTTTTTTTGCTGCACAAGAATTGTGTGCATAACAATACATGATATATTG CCTCTTGTAGTATGTTTCTATGGCTTTTATGTTTGCATGCAGCTCAATCTGTCCACCAGAGGTAACTTTAATTTCTGAAATCTCTGTAGTACTCAACACA TGAAAATAGGCAAACCAAAATATAAATAGTGGGTCTTAAACTCTTGTTATTTCCTAGTATGAAAATTTGCCTGCTTATTTTTAGTTTCCTTTCATTCTAT TTTAGTGCAGGCATGTGCTAGCAATGATGTAGTATGTATTAGCTAATGGGTTTCATGTTAAGTTGTTGATTCTTTTTTAAATGAATCAGGCATGTGCCAA GGATGACTTAATATATACAACAACAAAAGCCTTTTCCCACTAGGAGGATCAGCTACATCCTACATGGATTAAACAATGCCACTTTGTTTTATCAAAAACC AAATATTCTGATAGGTCATTTAGGTCTAAGTCCTTTCTAACAGTTTTCTTTAGTACAATTATTCTTAATGTAATCTTATATGCTCACTCATCCAACACAA TATTTTCATCTTTGCCTCACCTATCTTATGCTTTTGTTGGCAATTTATTTAATACATTTTATTATATTGATTCTTTTTATTAATGTGTTTATTCCTATTA ATTGAAACAGATATGTCGCAGAGGGTGGCCTTACCGGAGAGCGCAAGCGGTGGGTGCCTAGAAGAGGTAAAACACCTCTAGATCCTGATGCAGATGGATT TATATACTCAAACCCAATGGAGACTTCCTTCAAACAAAGATGTCTCGAGGAGTTGAAGTTGCACCATAGAAAGCTTTTGAAGAACTTGCAGAATGAAGGA CTTGCTGCTTTAGGGGATGGTGCATCTGAATCTGATTATATTAGAGTGCGGGAGAGGCTAAAAAAATTCATAAAGGGGCCTGAGCAGAATGCCTTAAAGC CCAAGGCTGCTAGTAAAATGCTTGTTTCTGAATTGAAGGAAGAACTAGAAGCACAAGGTTTACCTACTGATGGGACTAGAAATGTTCTTTACCAGCGTGT ACAGAAAGCAAGGAGAATAAATCGATCTCGTGGTCGGCCCCTTTGGGTTCCACCAGTGGAAGAGGAGGAGGAAGAGGTGGATGAAGAAGTGGATGCATTA ATTTCGCGTATAAAGCTGCAGGAAGGAAATACAGAGTTCTGGAAGCGTCGCTTTTTAGGAGAAGACATAACTAGCAATAATGGAAAGTCATTGGATGTTG GTAAATCAGAGTCCGATGAAGTTTCAGATGATGTCGATGCTGTGGAAGATGCTGCAAAAGGGGTTGAGGATGATGAGGCAGACGATGATGAGGACGATGA GGAAGTAGAACAGGTAGAAGAGGAAGTAGAACCGGTAGACAACCAAGATGTAGACAGGGTAAAGCAGAAGGAAGTTGAAGCTAAAAAGCCCCTTCAAATG ATTGGAGTTCAGTTGTTAAAAGATTCTAACCAACCCACCTCATCCAAAAAGTACAAAAAAACTTCTCGTCGATTGCTTGTTGAGGATGATGCTGATGATG ATTGGTTTCCTGATGACATATTTGAGGCATTCAAGGAACTGAGGAAGCGGAAAGTATTTGATGTATCAGATATGTATACCATAGCAGATGCTTGGGGATG GACGTGGGAGAGAGAACTGAAGAATAAACCTCCTCGTAGATGGTCACAGGAATGGGAAGTAGAGTTGGCAATCAAAGTTATGCAGAAGGTCATAGAATTG GGAGGGACACCCACTATAGGAGATTGTGCCATAATCATACGTGCAGCTATAAGGGCGCCTTTACCTTCAGCTTTCTTGACAATTTTGCAGATAACTCATG GTCTTGGTTATAAGTTTGGGAGACCCCTTTATGATGAGATCATTTCTCTATGCCTTGATCTTGGGGAACTAGATGCTGCTGTTGCAGTAGTTGCAGACTT GGAGACAACAGGGATCTTGGTTTCAGACGAGACCTTAGATAGGGTAATTTCAGCAAAACATAGGATTAACAATACCTCCAACGATAACATTATAGATGTA TGATTGTAAACTTTTACCTTCAAGTTGTGTGAGTAAAACTTGCATGGGCACATGAGCATAACTATTCCAAATCTTAAGGTAACTTTAGAATAATTATAGT AAATGCATTGTTGTTATTTAAGATTATTACTTTTAATGTTGGTTCCTCCTTTTAGGCATTGTACCCATACACGATTTAGGCATGTTGTACTTTATTGCAA AGGAAAAGATAACGCATGTTGTTTAGTATCATCAAAA BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_151300; |
| Additional information | details; |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_383795
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0000541) |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019452207.1) |
| Pfam | SAP domain (PF02037.26) |
| Rfam | - |
| GO | - |