Ll_transcript_383592

• Id Trinity: TRINITY_DN47276_c3_g2_i6
• Name Transcript: Ll_transcript_383592
• Sequence: GGAGTTCTGTGCCATGGTTCACAAAATATATATCTACCCGAAGGAGGAGATTCAGAAAATGAGCCCTGGGACCCTGAGTTCAAAAAATGAAGATAATCAT TCAGCTAGCGTATGTGCAGAAGCAAAAGAAGTTAAAGATCAGCTGAATCCGAAGTTAAATTCAGAAAGTGGCTCAATGCCTGCTAACTACTAGATTCTCC TAGCTTCCAGGTAACTTTCTGCTTCCCATTGTACTTATAGCATTGGATTTAATGATATTTTTCCATGGCCGATGCTGTATATGAATTTTGATTCAAGTGT TGTAGAATTATCTCAATTCTCAAGTTGTAACATCTTGTTTTGATCTGCAGAGTTTATGTTCGAAAGTCGGGGTTTACTGTCGTGAAGCTATCCAGATGTA GAATATGACCATAAGATTAAGTGTAATTTTGAGTTTGACACTTCTACTGTTTTGAATCAGAGATTTTGGACGTAGCCTGGAATTATTGTTAGTATATGCT TGCATAGTTAATAGTGAATACTATAGAGTCCTAGTATGTAGCGGAGTTACATTGCCTAGTAGTAGTTGTACAAAGTTGTTTCCCTTGAACACATTAACGT ATAGAAGTGTAGTGTTATGGTTGGGATAATCCCTTTTTCATTTTTAATATATATCTCATTCTAAATCATAATTTGAGGTAAAAAATAGTGTGGATATCTA TTTCCAACATAAGTGTTGAAATGTTTGAAGGATGTTATGTTGTTTAGTGAAATGTATGTGGTCGGTCAATCCTTGGAATGGAACTAGTAGTGGTGTGGTC CTCGTGTTCTTTGATAACTGTGGTTCAATTACGTGATGAAGGTTCCTTGGAAGCTCCACTTTTTATGGTCAATGGTCTTTTTTAATATAATATTGCAGTC AACAATGGCACACAAATGGGTCACATTATTTTAGTGGTACACCTTTTCTAGCCTTAAGCTCATTGAATTCATAGTTTTTGATTTTATATCAATGTCGCTT TACTCTGGATCGTGGTTGGCTAAACCTTTATATTTGCTAATTTTAAGGATTATTATTAAGATTGTAATATTTTTGTACTGATAGTGTAAAGATTTATGTA TATTCACTATATTTTTTACTATGTTTTTTGAAGAATCAATAATAATTAAATATGAATTATGGACGATATAATAATATTTTATAAAACTTATATATTATTA GTGCATATATCTTTTTCTGATAATGCTTTGTAAACATAATTGTGCAGTTTGTGATGGTGATATTGAAGTCATCAGTGCCAATATCATTTGAGGGTAACAA AGAACCAGCAGCATATGGTGAGATAGTTTCAATGGGTGGCATTAACAAAGAAGTTAAGAGAAATCTCATTTCTACAATTGGCAAAATATTGCACTCTAAC CTATCCATCCCAAGAACTCGATTTTTCCTCAAAGTCTTTGATACAACTGCATTTAGCACTAACTCCAAAATCTAATGATTAACCGTATGGAAAATGATAT ATCATTCTACTGAACTTTCCTACAAATCTTCCTACCTACCAGCAAATGACATATGTTACAAATTAATATTTTATTTATTAACGATTGATTTATAAATGAT ATACGTCATTTTATTATAGGTAGAAAATTAGTATGAAAATTTCGTAGAATTATATAGCATTACTCTTATCAAATTGTCAGAGCTTAAGATTGTGCTTAAA TCTCTAATCATCAATTATTTGTGTTTTAATTTCATCAATTATGCATGCCCTACTTGTACTTTATTTTAATTTGAACCCAAAATAATATGTTTTACTTTCA TTTGATTATTTACGGAAAGTCAGGTTCACCAAGTATTCTATGTTTTATGTTTTTTTTGTCTCTCTCTTATTTCATGCATTACTTTCAACATGACAATAAC GTACCATTGCTGATAAAATTAATAAGTAGTAGTTTTCTGTAAGGAAAATAATTTAGAGCTTGAATAGTG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_151339;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_383592

FPKM

• PAB: 0.4
• PNAB: 0.3
• PS1: 0.8
• PS2: 0
• PS3: 0.2
• PW1: 1.2
• PW2: 1.6
• PW3: 0.6

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_383592

• Blastp: -
• Blastx: Auxin response factor 2A from Lycopersicon with 59.65% of identity
• Eggnog: auxin response factor(ENOG4110RNJ)
• Kegg: Link to kegg annotations (778240)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019412944.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;