Id Trinity | TRINITY_DN47296_c2_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_384732 |
Sequence | CTTCCGACAACGCATTTAAGAAAAGCTAGTTTGAAAACTAAAAGATCAAATTTAAGAGCAAATATATATTCAGTAACAGTATATTTACATTATTCCTTCA TTGGACTATAACATAATTAGCAACAAGTAGTCGTAAAACATTAATAAAGAATGGGAAAATAAAGTGCAAATCCAGTCAGCAGAGCTCGTGCAAGACATAA AGTTGCAAGATTGGGTTTATAAAATATGAAAAATACAGTGATGAATAGGAAAGCATCCTTAAAAAGTAATTATTTACATAAATGTTGTCTCTTCATAATT TTTTATATTCCTATTAGTATTCTCAACCTCCCTCAATGACCCAATCCCATTTCACTGTATAAGTGTAAAGAGATCGTGGAGTGTTGTGTGTCAAGCACTG ATACGTTCCCACCACTTGTCCTCATTCCCCTTTTAATCTATTCTCCACTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCCACCTTCATTTCTATTTCACCAGCATTTTC ATTACTCACTCTTTCAAACCCTAAAATGGCCTCTCACCAAAACGGCGACGTTTCTTCCCACGTTCCCAAAAAGCCAAAACTCTCCTCTTTCATCACCGAC TCAGAAATTCTATCCGAATTCTCTCACCACGACCCCTCCGTCGCGAGAATCAACAACGGCAGCTTCGGCTGCTGCCCCGCCTCCGTCATCTCCGCCCAGC ACCACTGGCAGCTCAAAAATCTCCGTCAACCGGATCACTTCTACGTTAACCACCTCAAACAAGGTATCCTTAATTCCAGAACCATAATCAAGAACCTCGT CAACGCTGAACACCTTGACGAGATCGCTATCGTTGATAACGCCTCCACCGCCACCACCATCGTACTTCAACAAACCGCGTGGTCCTTCCACGAAGGAAGG TTCCAGAAAGGTGACGTTGTCGTCGTTCTTCACTACGCGTATGGTGCGGTTAAGAAATCCATTGAGGCCTACGTGGCACGCGCTGGAGGTAAAGTCATCG AGGTGCAGCTTCCTTTTCCGGTGAAATCGAACGATGAGATTATAACGGAATTTAGAACTGCTTTAGAGAGAGGGAAGAGTAATGGTAATAGGGTTAGGTT AGCGGTTATTGATCATGTGACTTCGATGCCTAGTGTTGTGATTCCTGTGAAGGAGTTGGTTAAGATTTGTAGAGAGGAAGGGGTGGATCAGGTTTTTATT GATGCAGCTCATGCTATTGGGTGTATTGATGTTGATATGCAAGAAATTGGGGCTGATTTCTACACTAGCAATTTGCATAAGTGGTTGTTTTGTCCACCTT CGATTGCGTTTTTATACACTCGCAGGTCGTTGAAGTGTAAAGATTTGCACCATCCTGTTGTATCTCATGAGTATGGGAAGGGTTTGGCTTCAGAGAGTGC TTGGATTGGGAATAGGGATTATAGCTCGCAACTGGTGGTTCCAACGGTTTTGGAATTTGTTAATAGGTTTGAAGGTGGGATTGAAGGGATTAAGAAGAGG AACCATGATGCTGCCTTTGAGATGGGTGAAATGTTGGCTGCGGCATGGGGGACTCATCTTGGGAGTCCAAAGGAGATGTGTGCAAGTATGGTGATGGTGG GTTTGCCTGCTTGTTTGGGGATTAGTAGTGATTCTGATGCTATGAAGTTGAGGACTCATTTGAGGGATGCTTTTGGAATTGAAGTTCCGATATATTTTCG ACCACCGAGAGATGGGGAAGTTGGACTTCTAACTGGGTATGCTAGAATTTCTCATCAAGTTTACAACAGAATTGATGACTATTCCAAGTTCAGGGATGCA GTTAATCAACTCGTGACCAATGGGTTTACCTGTGCCCTTCTTTCTGCTTAAACTGGTATGCTCCCAGATCCTTTGAACCATAAATAAATTTCGTAGTATT TTCAATTATCAATTTTGTGATAGACCTACAATTAAACACATAAACAGTGGGAGCCGGTGTGGGTGGAGTAAGGAAAAGGGCAGGAATTACGGCAAGTGGG GGTGAGGCAAATGAATAGGTAGTTAGAGTAGGAAATAAATAGGGAAATGAAGGGGCTGATGGAAATTATGCTGGAACATGGAGGGTTTGTGTTGGCTGAG GCCATAGGGCAGAGACAGCATCTGTAGCTCAAATCTTCTTTCTTTCTCTTCTACTTACAACTTTGTTTTTCTATCATTGTAATTGGAGCTTGATCATCCT GATCCTGGATTGAACTCTCCTTGACATTCCTTGTTACATTACTTATAGCTTCTTTTCGTAAAACTTTGTTTCCTTAATAAGTTTATATTCAAACACAAAG GGATAAGAAAACACAATATACAAGATAGCTAACAAAGGTTATGATATTTGACTTGATCTATGATCCGAAAGGATAGAAAAAGCAACATGAATTTCTCTCG GGTATATCTTTCTCGTAATACACCTCTTCATCTTCCTCAAGCTTTGTAGAATACAGCATTTAATTATTTAAATTCTCTGTTCCCATTCCCTTTTCAACGG GAGCACTTCTTCTGTCCTACAGTGTGTCACTCCATGAGCCACTTCCTGTGGTAAAATATAACGAAGTTAAAAGTGTAATGATTAAGTGTTTTTTGACCAA TTACAACAAGTGGTACATGGAGTGACACATTTTTTGGGATAGATGTTGTGCTCCCCTTTTTGACTATCAATATTAGTTTCTATCAGTTTGCATTGGATAT ATGACAAATTGACAATGTTGAGGCTGGTTACTGTGCCATTACGTGGTGCTCACTGCCCAGTCTGTTAAAAACTTAAATACTAATACTAAGTATTGGGCGT TGAAATCTCTGGGTCATAGTCTTTGGACTCATCTTCAAATTTGTTGGTTACAAAATGTTTAGGCAGGTAGTGTAGCATCATGAGACCTGAGCTATAGTAT GGTCCTAGCATTCTTTTTTCGTACACATGCACCTGTACCTCAAACTTGGGATCACATGCTTTAGTGACCTTATCCTGATACATGATTTAGTGACCTGAAC ATGATATATCCCATGAGATTTTGGATAAGGAATCCCAACGCCTTATCATTTCGTTAGAAGGAAGCTCATGCATTTAGGATAGTTCTCACTTTTAAGTGCT TATTCTAGTTATGTCTTTATCTTCCATTATCCTATCAGATTATTTGCTATTTTCTAATTGTGGGTAGACTTATTTATATAGCATAAGTCTCGTGTAGTGT TTATTTCTAGTAGATACACAAACTCATCCTATATGAATATATGACTGGGAGTAATTTAAAAATAGCAAGATGATAAGATAGCGAAAGATAAAGGTATGAC TACTTAAGAGAACTAAAATATATATAACTTCTTAAGAGATAACATAATTATCATAAGGACAATAGATACAGATGACAAGGCATCTGGCTTCCTTATCCTA GATCTTATGGGATATACCAGGACCTCTTCCACTCGGACTAACATGCACTAACTTTTTTTGGTTCCAAAAAAATTCTATCACTGCAATATTGCACCATCAT TATAGTGCTTCATTGATATAGTTGAACTTTGCTGCTAGACCACAAATAAGCAGCATATATTCTCAGCATTTTCATAAATGGTTGAAAATTTGCATGCTCA AAGGAGAAGTTCTGTTCAATTTCATTTGAAGCGGTGTACACTTTTTATTTATTTTGAATTACTTGTTTCGACTATAATCTTTTTCATCATTTACCCTACC TTGACGTAAACTGTCTGTCTTACTTTAACTTTTGAGTAGTGGATTTTGCCATCTCTCCTCCCTCCCAACGAAAATGACACAAACAGTAAAACTATTATGT TTGAACTATCTGAATTGTTTTCTTTGTATCCCTTTATTGCTAGACTCATACTGATCATCTTGGTCATGCCCACTCTATATTTTCTTGACTGATAATACTT GGGATCTCTTCTTTTAAAATCTTCTTCAACTTAACATGGAGAATCTTATTCTATAACTCAATAACTGTATACTGAAAACAGTGCTCAAGTAAAATTCTTG TCATGGGAGCAATTAACATCAAGGTAAGTTAATATTCCATTTCCTTGAAATAGCTAGCTTTAACCTCTGAATTAAAAAAGAATTGTAGTCATAAATTGCA AAGTGTTACTGAAATAGTTAGCGGGAACATAAATGGTATTACTATTCGTGCAGAAAGATTACATTTTAGTCATAATCATAAACTTCATTCTAGTCTTGTA CTCTTGTTATAAAGAAAATTCTGCCACTCTATATGATATTATTGTTTATTTGCAGACAAGATGTGTCAAAGAAGGCTTATTACATGAATAACAGCAATGG TTCTGTGGTTGCCTAATGCTTGACTAGTTATGATGGTTTTGGTACCATGGACTCTGTTTTTGTAGAGAAACTGCCAAAATTGCAGAGTTGATTTCAGCTT GAAGTTGTTGACTTCTATTTTGAGATCCATGGAATTATCCTTGTAAATATAATTGTGATTTCTCTGACGGTTGCATGCTTTCAATCTTCCTTGTCTATGT AGTTAAACTTGACAGCTTTACCATAGCCATCATGATGAGGTCGTGTCAAAATGTTTGTTACTTCTAAAAAACCTTGATGATAATTTAACATTTCACTCTC AGTTGTTCGTGTATAGTGTTGTGACTCGTTAACTTTGATATGGAGAAGGATGCTGGTGTTTTGAGTGGGGTTCATGTATTAAACTACTACCAAATAGGAC TTTACTTTTTTACGGAGATAACATATAGTTTCCTTGGTGTAGCACATTAACAATAGTTTTCCACGCAAAATCGATATGTGAAAGTGTCTGATATGGAAAA TGTTATGTAAAATATTTGTTGATAAATGATGGGAAAATAATGTATCTGTTTTTTTTACTTTCTGAATTCATGTGTTCCCTATTATTATGAAAATAAATAG TATGC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_151490; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_384732
Blastp | Probable L-cysteine desulfhydrase, chloroplastic from Arabidopsis with 69.46% of identity |
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Blastx | Probable L-cysteine desulfhydrase, chloroplastic from Arabidopsis with 69.46% of identity |
Eggnog | cysteine desulfurase(COG0520) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G26600) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428448.1) |
Pfam | Aminotransferase class-V (PF00266.18) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |