Ll_transcript_384732

Id TrinityTRINITY_DN47296_c2_g2_i3
Name TranscriptLl_transcript_384732
SequenceCTTCCGACAACGCATTTAAGAAAAGCTAGTTTGAAAACTAAAAGATCAAATTTAAGAGCAAATATATATTCAGTAACAGTATATTTACATTATTCCTTCA TTGGACTATAACATAATTAGCAACAAGTAGTCGTAAAACATTAATAAAGAATGGGAAAATAAAGTGCAAATCCAGTCAGCAGAGCTCGTGCAAGACATAA AGTTGCAAGATTGGGTTTATAAAATATGAAAAATACAGTGATGAATAGGAAAGCATCCTTAAAAAGTAATTATTTACATAAATGTTGTCTCTTCATAATT TTTTATATTCCTATTAGTATTCTCAACCTCCCTCAATGACCCAATCCCATTTCACTGTATAAGTGTAAAGAGATCGTGGAGTGTTGTGTGTCAAGCACTG ATACGTTCCCACCACTTGTCCTCATTCCCCTTTTAATCTATTCTCCACTCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCCACCTTCATTTCTATTTCACCAGCATTTTC ATTACTCACTCTTTCAAACCCTAAAATGGCCTCTCACCAAAACGGCGACGTTTCTTCCCACGTTCCCAAAAAGCCAAAACTCTCCTCTTTCATCACCGAC TCAGAAATTCTATCCGAATTCTCTCACCACGACCCCTCCGTCGCGAGAATCAACAACGGCAGCTTCGGCTGCTGCCCCGCCTCCGTCATCTCCGCCCAGC ACCACTGGCAGCTCAAAAATCTCCGTCAACCGGATCACTTCTACGTTAACCACCTCAAACAAGGTATCCTTAATTCCAGAACCATAATCAAGAACCTCGT CAACGCTGAACACCTTGACGAGATCGCTATCGTTGATAACGCCTCCACCGCCACCACCATCGTACTTCAACAAACCGCGTGGTCCTTCCACGAAGGAAGG TTCCAGAAAGGTGACGTTGTCGTCGTTCTTCACTACGCGTATGGTGCGGTTAAGAAATCCATTGAGGCCTACGTGGCACGCGCTGGAGGTAAAGTCATCG AGGTGCAGCTTCCTTTTCCGGTGAAATCGAACGATGAGATTATAACGGAATTTAGAACTGCTTTAGAGAGAGGGAAGAGTAATGGTAATAGGGTTAGGTT AGCGGTTATTGATCATGTGACTTCGATGCCTAGTGTTGTGATTCCTGTGAAGGAGTTGGTTAAGATTTGTAGAGAGGAAGGGGTGGATCAGGTTTTTATT GATGCAGCTCATGCTATTGGGTGTATTGATGTTGATATGCAAGAAATTGGGGCTGATTTCTACACTAGCAATTTGCATAAGTGGTTGTTTTGTCCACCTT CGATTGCGTTTTTATACACTCGCAGGTCGTTGAAGTGTAAAGATTTGCACCATCCTGTTGTATCTCATGAGTATGGGAAGGGTTTGGCTTCAGAGAGTGC TTGGATTGGGAATAGGGATTATAGCTCGCAACTGGTGGTTCCAACGGTTTTGGAATTTGTTAATAGGTTTGAAGGTGGGATTGAAGGGATTAAGAAGAGG AACCATGATGCTGCCTTTGAGATGGGTGAAATGTTGGCTGCGGCATGGGGGACTCATCTTGGGAGTCCAAAGGAGATGTGTGCAAGTATGGTGATGGTGG GTTTGCCTGCTTGTTTGGGGATTAGTAGTGATTCTGATGCTATGAAGTTGAGGACTCATTTGAGGGATGCTTTTGGAATTGAAGTTCCGATATATTTTCG ACCACCGAGAGATGGGGAAGTTGGACTTCTAACTGGGTATGCTAGAATTTCTCATCAAGTTTACAACAGAATTGATGACTATTCCAAGTTCAGGGATGCA GTTAATCAACTCGTGACCAATGGGTTTACCTGTGCCCTTCTTTCTGCTTAAACTGGTATGCTCCCAGATCCTTTGAACCATAAATAAATTTCGTAGTATT TTCAATTATCAATTTTGTGATAGACCTACAATTAAACACATAAACAGTGGGAGCCGGTGTGGGTGGAGTAAGGAAAAGGGCAGGAATTACGGCAAGTGGG GGTGAGGCAAATGAATAGGTAGTTAGAGTAGGAAATAAATAGGGAAATGAAGGGGCTGATGGAAATTATGCTGGAACATGGAGGGTTTGTGTTGGCTGAG GCCATAGGGCAGAGACAGCATCTGTAGCTCAAATCTTCTTTCTTTCTCTTCTACTTACAACTTTGTTTTTCTATCATTGTAATTGGAGCTTGATCATCCT GATCCTGGATTGAACTCTCCTTGACATTCCTTGTTACATTACTTATAGCTTCTTTTCGTAAAACTTTGTTTCCTTAATAAGTTTATATTCAAACACAAAG GGATAAGAAAACACAATATACAAGATAGCTAACAAAGGTTATGATATTTGACTTGATCTATGATCCGAAAGGATAGAAAAAGCAACATGAATTTCTCTCG GGTATATCTTTCTCGTAATACACCTCTTCATCTTCCTCAAGCTTTGTAGAATACAGCATTTAATTATTTAAATTCTCTGTTCCCATTCCCTTTTCAACGG GAGCACTTCTTCTGTCCTACAGTGTGTCACTCCATGAGCCACTTCCTGTGGTAAAATATAACGAAGTTAAAAGTGTAATGATTAAGTGTTTTTTGACCAA TTACAACAAGTGGTACATGGAGTGACACATTTTTTGGGATAGATGTTGTGCTCCCCTTTTTGACTATCAATATTAGTTTCTATCAGTTTGCATTGGATAT ATGACAAATTGACAATGTTGAGGCTGGTTACTGTGCCATTACGTGGTGCTCACTGCCCAGTCTGTTAAAAACTTAAATACTAATACTAAGTATTGGGCGT TGAAATCTCTGGGTCATAGTCTTTGGACTCATCTTCAAATTTGTTGGTTACAAAATGTTTAGGCAGGTAGTGTAGCATCATGAGACCTGAGCTATAGTAT GGTCCTAGCATTCTTTTTTCGTACACATGCACCTGTACCTCAAACTTGGGATCACATGCTTTAGTGACCTTATCCTGATACATGATTTAGTGACCTGAAC ATGATATATCCCATGAGATTTTGGATAAGGAATCCCAACGCCTTATCATTTCGTTAGAAGGAAGCTCATGCATTTAGGATAGTTCTCACTTTTAAGTGCT TATTCTAGTTATGTCTTTATCTTCCATTATCCTATCAGATTATTTGCTATTTTCTAATTGTGGGTAGACTTATTTATATAGCATAAGTCTCGTGTAGTGT TTATTTCTAGTAGATACACAAACTCATCCTATATGAATATATGACTGGGAGTAATTTAAAAATAGCAAGATGATAAGATAGCGAAAGATAAAGGTATGAC TACTTAAGAGAACTAAAATATATATAACTTCTTAAGAGATAACATAATTATCATAAGGACAATAGATACAGATGACAAGGCATCTGGCTTCCTTATCCTA GATCTTATGGGATATACCAGGACCTCTTCCACTCGGACTAACATGCACTAACTTTTTTTGGTTCCAAAAAAATTCTATCACTGCAATATTGCACCATCAT TATAGTGCTTCATTGATATAGTTGAACTTTGCTGCTAGACCACAAATAAGCAGCATATATTCTCAGCATTTTCATAAATGGTTGAAAATTTGCATGCTCA AAGGAGAAGTTCTGTTCAATTTCATTTGAAGCGGTGTACACTTTTTATTTATTTTGAATTACTTGTTTCGACTATAATCTTTTTCATCATTTACCCTACC TTGACGTAAACTGTCTGTCTTACTTTAACTTTTGAGTAGTGGATTTTGCCATCTCTCCTCCCTCCCAACGAAAATGACACAAACAGTAAAACTATTATGT TTGAACTATCTGAATTGTTTTCTTTGTATCCCTTTATTGCTAGACTCATACTGATCATCTTGGTCATGCCCACTCTATATTTTCTTGACTGATAATACTT GGGATCTCTTCTTTTAAAATCTTCTTCAACTTAACATGGAGAATCTTATTCTATAACTCAATAACTGTATACTGAAAACAGTGCTCAAGTAAAATTCTTG TCATGGGAGCAATTAACATCAAGGTAAGTTAATATTCCATTTCCTTGAAATAGCTAGCTTTAACCTCTGAATTAAAAAAGAATTGTAGTCATAAATTGCA AAGTGTTACTGAAATAGTTAGCGGGAACATAAATGGTATTACTATTCGTGCAGAAAGATTACATTTTAGTCATAATCATAAACTTCATTCTAGTCTTGTA CTCTTGTTATAAAGAAAATTCTGCCACTCTATATGATATTATTGTTTATTTGCAGACAAGATGTGTCAAAGAAGGCTTATTACATGAATAACAGCAATGG TTCTGTGGTTGCCTAATGCTTGACTAGTTATGATGGTTTTGGTACCATGGACTCTGTTTTTGTAGAGAAACTGCCAAAATTGCAGAGTTGATTTCAGCTT GAAGTTGTTGACTTCTATTTTGAGATCCATGGAATTATCCTTGTAAATATAATTGTGATTTCTCTGACGGTTGCATGCTTTCAATCTTCCTTGTCTATGT AGTTAAACTTGACAGCTTTACCATAGCCATCATGATGAGGTCGTGTCAAAATGTTTGTTACTTCTAAAAAACCTTGATGATAATTTAACATTTCACTCTC AGTTGTTCGTGTATAGTGTTGTGACTCGTTAACTTTGATATGGAGAAGGATGCTGGTGTTTTGAGTGGGGTTCATGTATTAAACTACTACCAAATAGGAC TTTACTTTTTTACGGAGATAACATATAGTTTCCTTGGTGTAGCACATTAACAATAGTTTTCCACGCAAAATCGATATGTGAAAGTGTCTGATATGGAAAA TGTTATGTAAAATATTTGTTGATAAATGATGGGAAAATAATGTATCTGTTTTTTTTACTTTCTGAATTCATGTGTTCCCTATTATTATGAAAATAAATAG TATGC BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_151490; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_384732

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_384732

BlastpProbable L-cysteine desulfhydrase, chloroplastic from Arabidopsis with 69.46% of identity
BlastxProbable L-cysteine desulfhydrase, chloroplastic from Arabidopsis with 69.46% of identity
Eggnogcysteine desulfurase(COG0520)
KeggLink to kegg annotations (AT5G26600)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019428448.1)
PfamAminotransferase class-V (PF00266.18)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;