Id Trinity | TRINITY_DN47299_c0_g2_i1 |
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Name Transcript | Ll_transcript_385106 |
Sequence | AGCAGGTTTGAGGAGAAATAAAAAATAATAAAATTAAGAAACACGGTTTTATTAGCATCTCTACAGTTCTATCTTCAACTCTGTTCATTCTACTTCTCAC TCTAGACAACACTAACTCCACATTCAAACCCTATAATCTTTCCTTCATCTTTCAGATCTACAACTATAAATGTCTAATTCTGATCCCGAAAACAAGGCAA TGCCGCCTTCTTCATGGGCTAAGAAAACCGGCTTCAGGCCCAAATTCTCCGGCGACTCCGATTCCGGCCAAATAGTCTTGCCGCCAAAACAAACTACAGA TGCTGACGTGGATCTCGAAGCGGGTCGGGTTCGGGCACCGAATGTGACCAACGGTGTGACCCACCGCGACAAGGTTTCGTTTCTGCTTCCACTTCCACCT TCTAAGGATCAGGTAACGAAGAAACGAAGGGAACCTAGCTCTGATGGAGTAACTAAGAACCCTGTTTCTAGTACTAATGGCCAGGTTACGGTGCCGGCAC CGCCGCGGAGAACGACGAGGCCCGTGGAAGCGGTGGAGTCTCTGCCGCAAAGTGTTGATGATGATGGATTTGTGGCTCGGCATTCTCATATGAAGTATGA GCTCAGAGATTCACTTGGTTTTGTCCCCATTGGTGTATATGGTATTCAGCATTATGTTTCGATATTAGGTTCGTTGGTTCTCATTCCGCTTGTCATAGTT CCTGCCATGGGAGGTTCTTATGAAGATACTTCTATGGTGGTATCAACCGTGCTCTTCATTTCGGGAGTGACTACACTTTTGCATACTACTTTTGGGTCCA GGTTGCCTTTGGTTCAGGGTCCTTCTTTTGTTTATCTTGCTCCTGTTTTGGCCATTATCAACTCCCCGGAGTTTCAAGGATTAAACCAAAACAAATTCAA GCATACCATGAAGGAGCTGCAAGGGGCTATAATTATTGGATCAGCATTTCAAGCTTTACTTGGATATACTGGACTCATGTCACTTTTGGTAAGGTTGATC AATCCTGTGGTTGTATCCCCAACTATTGCTGCAGTTGGACTTTCATTTTTCAGTTACGGTTTTCCGATAGTTGGTACATGTCTTGAGATTGGTGCAGTAC AGATATTAGTGGTTATTGTTTTTTCACTTTATCTTCGTAAGATATCAGTTCTTGGACATCGCATATTTCTAATATATGCTGTTCCTTTGGGTCTGGCAAT TACATGGGCATTTGCTTTCTTGTTGACTGAAGCTGGAGCTTACAGCTACAAAGGGTGTGACATAAACATACCTGCCTCTGATATGTTATCAGAGCACTGC AGAAAACACGTTTCTAGGATGAAGCATTGTCGAATTGATACTTCTCATGCATTGAAATCATCCCCATGGTTTAGATTTCCTTATCCACTGCAGTGGGGTA CTCCTGTCTTCAATTGGAAAATGGCTATTGTGATGTGCACGGTTTCCTTAATATCATCAGTGGATTCGTTAGAAAATAAGCAGGTGGCCTGTTGCCATCT CAATAATGTGCAATGCAAGTGGTATCATATGTGAAAGGATGTTCTCCTTCTTGAACATGATAAGATGTGGTAAAAGTTAAGATTCGGAGCTACCAAAACC ATTTATGTTTAATTACATGATGGTTTGTATGCTGGGGAAAAAAGAAACTTGAATATGATATTTCACTTGACTATAAATGTCTTTTCATTTTAACTGCAAC CTTTGACAATGAAGGGTAAGAAACTTAAGAGCAAACAGCCTGGAGTTAGGCATTTAATTTATCAGACCTTTAGTTAAAAATAATGATTGCCAACTTGTCT TCCTACTTTCACCCAATCATATTATATTTTGTTTTCTTTTTTAGTAGATATACCAATTACAAGGAAGAGTGACAATGTATGCATTCTATCTCAGCTTAGG AAATCAGTGCATAGATATTTGGTGGTACTGATTGTGTGATTTCTAAAAAAATTTAACACATGCAAATAGCCACTTTGTGATTTTACTAGCATGGACTGAT CTATGAGAGAGTAACAGTATAATTGGTATCATATTTTCATGTACTTTTCTTATACGCAGGATTATGTAATTATTGAACTGTCTTGTTGATATTAATTTGT TTTAAACTTCGTAGATTGGCTCATACCATGCATCTTCATTATTAGTAGCATCCAGACCTCCAACTCCTGGAGTTCTTAGCCGAGGAGTTGGTTTGGAAGG TCTTTCTAGTGTCTTAGCTGGTATCTGGGGAACTGGAACTGGATGCACAACTTTGACTGAAAATGTCCACACAATTGCTGTGACAAAAATGGGAAGCCGC AAAGCTGTTCAACTGGGTGCATGCTTTCTAATTGCGCTGTCTCTCGTGGGTGGGTCTCTATACCTTTCTGTACATGAATCTACCTTTACTAATTTATCCT ATTATGATTAATGGTGAATAACCATGGAAGAGAAGTACATAATATGAGACATTGGATATTTATTCTTAAGTAGCCTTATATGGATATCTAAAACTTCCTT CCAACGTCACGATTTTTCTCTCTCTGAAAAGCAGTTCATGATAGCAATAATACAAATGACATGTCATTGTTTGGAACTTACATTTCTAGGTCATGCAGCT ACTTCCCTACGGAATATTTATTATTATTTGCAACTTTTTGTGAACTGAGGTGTCTAACTATTAACTACTTTTGGGGAAGCTTTTATGACTCAAATTTACG GTTTTTGTTAGGATAAGGAGGCTACAGTTCAAAGTCCCATGGCAATGACATTTCAAGGGCGCACCTTATTTTTAGTTTCTATTTTTGGGGGTGCCTTATC TTTGCTCCTAATATATTATTTCAAATTTTGTATCATACTTAATAATTAAATAACGGCTGGCTACTGTCTCATCTGAACTGGAAAATTAGAGTGATATCTT TTCCAAGAGATGGAAGTATGGAACCTATCCTACCTTTAGTTTCTCTGTTGTAGTCATAATGCCTGAATGCAGTATAGTTGCTATGATTGCATAAAATTTC ATCCTAAGACAAACAATGTCTATGGTGAAGTGGTATGTAGAATGTATATATACTCTTCCAGTTTCCCCATCAACGGCTGCATTGCAACTCCAATAAGGTG TTGATCTCTTATTTGATTTTTAGCATGATGATTGGGTTGGAGGGTGTTAAAGCTTCAATTAGAAGTGCCGGGCTTAACATGTGGATTTGACTACTCAACC AGAAAAAAGGTTAACCATTTTGGTCTTGATTGACCAAGTTTATAAGGCGCTTATCTTCTCATCTCTCAGTGAGGAATTTCTACCAACACTATCCCACACC ACACTCAAACGTGCACCATACAAAATGTGTTCTGATTTCTCTTTTTCTTTTTGGAACTTGATAATTCATCGGATAATTAGGATATGCAATTGTTTCCTAG TTTCTGGATTGCTCTCTACTTCTGTGATGTACTTTTAAAAATTTCTAATCTGTCTTTTGTAGAATATTTTTATTGCATATATGTCCATGGTTAATTTGCT TAGACCTTATAATATAACAGGTAAGGTTGGAGGGTTCATTGCTTCAATTCCTGATGTCATGGTTGCTGGTCTTCTCTGCTTTATGTGGGCAATGCTCACC GCATTGGGCTTGTCAAATCTACGCTATAGTGAGGCTGGAAGCTCTCGCAACATCATCATTGTTGGGTTATCATTGTTTCTCTCTCTCTCTATACCCGCCT ACTTTCAACAATACGGTGTTTCTCCGAATTCGAACTTGTCAGTACCAAGTTATTTTCAGCCCTACATTGTGGCCTCTCATGGGCCTATGCACAGCAAATA TGGAGGGTTGAACTATGTAGTGAATACAATTTTTTCACTAAACATGGTGATAGCTTTTCTTGTGGCTATTGTGTTGGATAATACTGTCCCTGGCAGTAAG CAGGAACGTGGAGTATATGTTTGGTCTGAACCTGAGGTTGCTAGAATGGAGCCTGCTGTTGCTAAAGATTATGAGTTGCCGTTGAGAGTGGGTCGGATTT TCAGATGGGTGAAATGGGTTGGCATGTGAAAGGACGGTTTCATATATATTGTTGAGCTCAATGATGAATTGTAGTAGGTCATATTACAAAGTAAATTTTG GGTACAATGAAGATCCAGAGGGGTCTATTTGTTTTGTAAATTAGGTTAACCATGTATGTAGTTTTGATTCATTCAAAATCACCAGGTGGAGTTTTTTCTT CTTTGCTTTACTGCGGACTTTGACAAATCATCCTGGTTATGTATATATACATTATTATATTTGAAGTTTTTTCTTTTGCAGATTTATCCATCTTCATCAG TAGAGTCATTGGACCCTGCTACTCCTTTATCTAACTGTCCAGTTTGATTTTTTGGGTAGTTCAGGGATCAAATAAGAGGGATGGTTCAATTTTTGTTTTT GAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_151505; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_385106
Blastp | Nucleobase-ascorbate transporter 12 from Arabidopsis with 67.78% of identity |
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Blastx | Nucleobase-ascorbate transporter 12 from Arabidopsis with 67.63% of identity |
Eggnog | permease(COG2233) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G27810) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019458402.1) |
Pfam | Permease family (PF00860.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |