Id Trinity | TRINITY_DN47299_c0_g2_i11 |
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Name Transcript | Ll_transcript_385116 |
Sequence | CTTTAACCAAGCTGCGTCTGCAAGTAGATAAACAAACTACTTATTATGCTCATTGCTCCACCGATCATTTCAGGGAGTAGTAGTAATAATAATAATAATG ACGAATGGTGTTATCTTCACTCTCACAATTACTCTCTGAGTTTAAATTCACAATTTGTTTTCACTCTCTCTTCTATCCCTCTTGAGCTTGTGGTCTTGGT GTGAAAAACTAAACCCTACCTACACTCTCATCTTTTAAACTTCATCTTCTCCATTGCATTGCACCAGATCTGTAACCGTTAACCAACAACTCAAACCTAT GCATCATTAGTTTCTTCTCAACCATGTCCAATTCTGATCCCAAGCCAATGCATCCTTCTTCGTGGGCCAAGAAGACCGGTTTCAAGCCCAAATTCTCCGG TGAGACCAATGCCTCCGATTCCGGTCAGATAGCGCTTCCAACCAACACTACTCAACCTGACACTAACCTTGATCTCGAATCGGGTCGGGTTCGGAGTCAG ACACTACCTGATGCAAACGGTAACGGTAATGGTGTCGGAGCTGCTCAGGGAGAGAAGGTTCTGGTGAAGAAGCGTAGGGAGTCCGATGGCGCGCCGAAGA ATTCTGTTCCGAGTACCAATGGCCAGGCCAATGCTCCTCCTCCGGTGGACCAGCCGCTGCGGAGAGCTGCGAGGCATGAGGAAGTGGTGGATGATGATGA GTTTGTGCATAGGCAGTCGCATATGAAGTATGAGCTCAGAGATTCACCTGGTCTTGTTCCAATTGGTGTGTACGGTATCCAGCATTATTTTTCAATATTA GGTTCGTTGATTCTCATTCCGCTTGTCATAGTTCCTGCCATGGGAGGCACTCATGAGGAAACCTCTAAGGTGGTATCGACCGTGCTCTTTGTGTCTGGGG TAACTACTCTATTGCATATCACTTTCGGGTCCAGGTTGCCCTTGATACAAGGCCCTTCTTTTGTTTACCTGGCTCCTGCTTTGGCGATAATCAACTCCCC GGAGTTTCGAGGATTAAATGAAAATAAATTCAAGCTTATAATGAGGGAGCTGCAGGGGGCTATAATTATTGGTTCATCTTTTCAAGCTTTACTTGGATAT AGTGGTCTCATGTCGCTGTTTGTAAGGTTGATCAATCCTGTAGTTATATCCCCTACTATTGCTGCGGTTGGACTTTCATTTTACAGCTATGGTTTTCCAA TAGTCGGCACATGTCTTGAGATTGGTGCAATACAGATATTAGTGGTTATTGTTTGTTCTCTCTATTTTCGTAAGATATCTGTTCTTGGACATCGTATATT TCTTATATATGCGGTTCCTTTGGGTCTGGCAATTACGTGGGCATTTGCTTTCATGATGACTGAAGCAGGAGTCTACAGCTACAAAGGATGTGACATAAAT GCACCTGCCTCAAATATGGTTTCAGAACACTGCAGAAAACATTATTCAAGGATGAAGCATTGTCGGGTTGATACTTCTCAGGCATTGAAATCCTCCCCAT GGTTCAGATTTCCTTATCTGCTCCAATGGGGTACTCCTATCTTTCACTGGAAAATGGCTCTTGTAATGTGTGTGGTTTCCCTAATCTCATCCGTGGATTC GGTTAGCTTCTTTTCTTTTCCTGTTTTGATTCCTGGACTGTATTTATTAATCTTGACTGAAAATATGTTGATGATTTAACTTGTTTTAACCATCTATTGG CCCCTATTACCATCTTTATAATGTACTAGCAATCTTGTTTGTCTATGGCTATTCATTTATTACATATGATACATGCCTTGATGGAAATTATGATTTGGAC CTATCGAAGTGATATATATTTCATAAAAATGATGATTTGGGTGCTGAGAAAACTTGCATTTAGTATTCACTTAAAGATCATTTGTCACTTCAGTTTAACT GCAAGCTTTCTCCATGAATGGAGAAAACTTGAGAATGAAGAGCCTGGAGGCTTTCATATAGTTTATCAGATCCAAACTTGAAAACAATGGTTGCCATCTT TTCATGTTGTTTTTTACATGATCAAGTTCTTTTTTCTTCTTCTGTGTTCGTTTTAAGTCTAGGTGGGGTTATTGGCACTCTAAATTGCCTATTCACACTC TTCATTAACCAACCACATTTTTAGTTTTTTAATTTACAAATTTGTGACTGGTTAATAACAAGTGTGAATAAGTATTTGGGAGTGCCAATAGCCCCATCCT TTAAGTAGATACCATGTATAAGGCACACTAATGTAGTATTGGTTTGGTTTTATCTCATCTTAGAAAATGACTGGATCAATACAATTATTTTATAATTACA TTTTTTAATCTTAGTGCTGCTAATAGCAACTATTTGATTTCCATAGAATAGTATGTACTGATCTATTAGAGATTAACAATATACTATCTCAAAATTGAAA TGATATTTTCCTTGTATTTTCCTCTGCATCACTGGACCATGCTGTGGATAAGGGATACTCGTGTGCACTTTTAACTTTGTAGGTCGGCTCATACCATGCA TCTTCATTATTAGTAGCATCCAGACCTCCAACTCCTGGAGTTCTTAGCCGAGGAGTTGGTTTGGAAGGTCTTTCTAGTGTCTTAGCTGGTATCTGGGGAA CTGGAACTGGATGCACAACTTTGACTGAAAATGTCCACACAATTGCTGTGACAAAAATGGGAAGCCGCAAAGCTGTTCAACTGGGTGCATGCTTTCTAAT TGCGCTGTCTCTCGTGGGTGGGTCTCTATACCTTTCTGTACATGAATCTACCTTTACTAATTTATCCTATTATGATTAATGGTGAATAACCATGGAAGAG AAGTACATAATATGAGACATTGGATATTTATTCTTAAGTAGCCTTATATGGATATCTAAAACTTCCTTCCAACGTCACGATTTTTCTCTCTCTGAAAAGC AGTTCATGATAGCAATAATACAAATGACATGTCATTGTTTGGAACTTACATTTCTAGGTCATGCAGCTACTTCCCTACGGAATATTTATTATTATTTGCA ACTTTTTGTGAACTGAGGTGTCTAACTATTAACTACTTTTGGGGAAGCTTTTATGACTCAAATTTACGGTTTTTGTTAGGATAAGGAGGCTACAGTTCAA AGTCCCATGGCAATGACATTTCAAGGGCGCACCTTATTTTTAGTTTCTATTTTTGGGGGTGCCTTATCTTTGCTCCTAATATATTATTTCAAATTTTGTA TCATACTTAATAATTAAATAACGGCTGGCTACTGTCTCATCTGAACTGGAAAATTAGAGTGATATCTTTTCCAAGAGATGGAAGTATGGAACCTATCCTA CCTTTAGTTTCTCTGTTGTAGTCATAATGCCTGAATGCAGTATAGTTGCTATGATTGCATAAAATTTCATCCTAAGACAAACAATGTCTATGGTGAAGTG GTATGTAGAATGTATATATACTCTTCCAGTTTCCCCATCAACGGCTGCATTGCAACTCCAATAAGGTGTTGATCTCTTATTTGATTTTTAGCATGATGAT TGGGTTGGAGGGTGTTAAAGCTTCAATTAGAAGTGCCGGGCTTAACATGTGGATTTGACTACTCAACCAGAAAAAAGGTTAACCATTTTGGTCTTGATTG ACCAAGTTTATAAGGCGCTTATCTTCTCATCTCTCAGTGAGGAATTTCTACCAACACTATCCCACACCACACTCAAACGTGCACCATACAAAATGTGTTC TGATTTCTCTTTTTCTTTTTGGAACTTGATAATTCATCGGATAATTAGGATATGCAATTGTTTCCTAGTTTCTGGATTGCTCTCTACTTCTGTGATGTAC TTTTAAAAATTTCTAATCTGTCTTTTGTAGAATATTTTTATTGCATATATGTCCATGGTTAATTTGCTTAGACCTTATAATATAACAGGTAAGGTTGGAG GGTTCATTGCTTCAATTCCTGATGTCATGGTTGCTGGTCTTCTCTGCTTTATGTGGGCAATGCTCACCGCATTGGGCTTGTCAAATCTACGCTATAGTGA GGCTGGAAGCTCTCGCAACATCATCATTGTTGGGTTATCATTGTTTCTCTCTCTCTCTATACCCGCCTACTTTCAACAATACGGTGTTTCTCCGAATTCG AACTTGTCAGTACCAAGTTATTTTCAGCCCTACATTGTGGCCTCTCATGGGCCTATGCACAGCAAATATGGAGGGTTGAACTATGTAGTGAATACAATTT TTTCACTAAACATGGTGATAGCTTTTCTTGTGGCTATTGTGTTGGATAATACTGTCCCTGGCAGTAAGCAGGAACGTGGAGTATATGTTTGGTCTGAACC TGAGGTTGCTAGAATGGAGCCTGCTGTTGCTAAAGATTATGAGTTGCCGTTGAGAGTGGGTCGGATTTTCAGATGGGTGAAATGGGTTGGCATGTGAAAG GACGGTTTCATATATATTGTTGAGCTCAATGATGAATTGTAGTAGGTCATATTACAAAGTAAATTTTGGGTACAATGAAGATCCAGAGGGGTCTATTTGT TTTGTAAATTAGGTTAACCATGTATGTAGTTTTGATTCATTCAAAATCACCAGGTGGAGTTTTTTCTTCTTTGCTTTACTGCGGACTTTGACAAATCATC CTGGTTATGTATATATACATTATTATATTTGAAGTTTTTTCTTTTGCAGATTTATCCATCTTCATCAGTAGAGTCATTGGACCCTGCTACTCCTTTATCT AACTGTCCAGTTTGATTTTTTGGGTAGTTCAGGGATCAAATAAGAGGGATGGTTCAATTTTTGTTTTTGAC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_151505; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_385116
Blastp | Nucleobase-ascorbate transporter 12 from Arabidopsis with 65.62% of identity |
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Blastx | Nucleobase-ascorbate transporter 12 from Arabidopsis with 64.52% of identity |
Eggnog | permease(COG2233) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT2G27810) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019448812.1) |
Pfam | Permease family (PF00860.19) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |