Ll_transcript_500394

• Id Trinity: TRINITY_DN47328_c1_g1_i14
• Name Transcript: Ll_transcript_500394
• Sequence: TCAGTGCAGCTTGAGGCATAGGCTTGATCATTGGACCAGCATTGGGAGGCTATTTGGCTCAGTCAGTAGAGAAATACCCACATATATTTTGAAGGGTTCA CTTCGGGATAAGTTTCCATACTTCTTGCACTGCTTTATGATATCATGTTTGGCGTTTATAGCAGCAATTGTGTGTATCTGGATTCCGGAAACACTTCACA ATCACAATGGCGGCATTGAGTCACTTCACAATCACAATGGCGGCATTGAGTCACTTCACAATCACAATGGAAGAGTTTAACATGCGAAGACAAGACCGTC CAAAAGAATGAATACCTACTTCTTAATTGGCCCTTAATGTCAGCTATTCTTACTTATAGTGTTTACGCACTTCATGATATTGCTTACCAAGAGGTTTTTT AATTATGGGCAGCCAGTCCTTGAAGGTTGGGCAGTTTAAACTACATACAACTGATGATGTTGGTAATGTTCTTTCAATATCAGGTACACCTTTAGCTTAC TCTATATATTACTATTAATGTTTGATTTGATACATGTTGCATTCCTAACTTTTCATATACGAAGATTGATCATTAATTTCTTGCATTTGCATGAGGCCAT ACAGTATCTCCCTGCAAGAAATTTCCTCTTAATCTGGTATCAATTGAGTCATTTCACTTATTTTTATTTTCAAGCTTTGAAAATTTATTTCAGACACATC TGGGTTATGAATCAAATTTTGCATAGTGACTGTGACTTCATATAAGCATAATTTGATGTAGCATGGGAGGGGGCTATATCTTTCCCTTCTAACATGCTGA AGAACTTAATTGTCACAAGGCAAGATCAAGCTTTCATATGGATTTGGGAAGTTAAATTCTTTGAACTTTGTTACCACTTACATGATACAGAATTAGTCCT TTCTATTAACAATTGCTATTATCAGGATATCATAATTATGACACAGACATTGGTAACAGGAAAAAGTAAATCCCAAGCAATGCAACTGGAGATGATGGTA ACTAGTTTTTTATGAACTGACTCCTAGAAAGAAAATGGGCATCTAATACTGATTCATGAGTCTGTGAAAGGTGAAATGAGTCTATTAAAGGTGAATGTAA TCATCAATCCGATATCTTTTGACCTTGCTAGCTCAAATTCGATGTTAGACTATTAATAGAATTCTTCTAATCTTGATATCTTTATTGGCATCAGGCTATT TGAATATTTAGCAAACAATTCTCCATTCACCACATTCAGTTTCCAAATGGGATTCACACGTAACTTAAAAGTTCTTATTTGTTGTTTAAGATGCAAGAAA TTGTGGAGACATCTTAAAACTTAATCCATTCCGTTTCCACTCACAGGGATGACTTAGTGATTGGTGCTGGTGCTAATGCTGGAGCCCTTCTTGTTGACGG GCTTCTTTTAGAATCTCCAAACAAGGACTTTGACTTTCTTAGAAGTACATCTTTCAATTTGCTGCAAGGCTGCAGAAACTTTAAAGCATGGACAAGAGCT TGATTGGATTTAATAATATACATAGATGTGATGTTTATTTGTATGCCTAAATTGTGTTGTAGGAGTATGTCCTGTGGTAGAACTTTGTTTGATCTTCAAG AAATAACCCTTTTTATGAGCTCGGGAGAGGACATCACATATGCCAGGTGTCTCGATTGCAATCATGGGTTGCATTGTGAATGGACCTGGGGAGATGGCTG ATGTTGACTTTGGTTATGTGGGAGGTGTTCCTGGAAATATTGACCTTTATTTGGGAAGACTGTGGTAAAGCCTGGGATTGCAATGGAGCATGCAACCAAT GCCTTGATCGAGCTCATAAAAGAGAATGGACGTTGGGTAGACCCTCCAACTGAAGAGTAAACTCTAATAAAAGCCAATGATCATAGTGGTTTAGTGTTCT GTTTTATTATATGTAATGTAAGTACTGATTTTTTTGCTCATGACAAAATTGGCATAGCAGAAATAAGGAATTTCATTTAAATTATGGTTTGATTGAGGAA CTCAGCAATTGCAATTTGCCTATAACAACCACAACGTATATGCTTTGCACATTGCACCTATCAGCAATAATACAGTGATATAAACATGATTTCCTGTAAC ATTGCCAATTTAGATGTTATGGCACTTAGCATCATGTCATGGTTAAGACATTAAGACTCATGAGGGTGATTGAAAAATGTGTTAGTGTAATTTAAGAATC TTATAAGCTATATTGTAAACCAAAAAAAAATAAAAGGAAAAAAGACAATAGCATGAGGAGATAGAAAAGGAGAAGTAAAGAATATAAGCACAGTATTGAA CAATTCTAGCTTTTGGCAAGAATTAGGTACCTAGCATTACTCTTCAGAACCAACATTTCTGCATCATCTTACTTTTGTTTGTACATTAAATGTTTATTTA TTATTTTACTTAGACTTTTGTTTATATTCCACATGTTCGGCTAGTGAATCATTCATTAGCCAACTTCCATTTCTTGTAGGCCAATACCCAACGACTTTAT TTATCAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_151740;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_500394

FPKM

• PAB: 0.3
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.7
• PS2: 0
• PS3: 2.5
• PW1: 0
• PW2: 0.6
• PW3: 2.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_500394

• Blastp: -
• Blastx: 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase (ferredoxin), chloroplastic from Oryza sativa with 40.72% of identity
• Eggnog: 4-hydroxy-3-methylbut-2-en-1-yl diphosphate synthase activity(COG0821)
• Kegg: Link to kegg annotations (4329911)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_006594344.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;