Ll_transcript_500408

• Id Trinity: TRINITY_DN47328_c1_g1_i24
• Name Transcript: Ll_transcript_500408
• Sequence: AGCTATTGGATTATCAACCGTCAGTGCAGCTTGGGGCATAGGTTTAATCATTGGACCAGCATTGGGAGGCTATTTGGCTCAGCCAGTAGAGAAATACCCA CATGTATTTTCGAAGGGTTCATTTTGGGAAAAGTTTCCATACTCCTTGCCCTGCTTTATAATATCAGGTCTGGCATTTGTAGCAGCAATTGTGTGTATAT GGATTCCGGAAACACTTCACAATCACAATGGCGGCAATGAGTCTACAGATGACGATACCGAGGCTTTAGAAAATGGAAGTAGTGGAAGTTGCCAAGACAA GATAGTCCAAAAGAATGAAAACCTACTACGTAATTGGCCCTTAATGGCAGCTATTCTTATATATAGTATTTACGCGCTTCATGATATTGCTTACCAAGAG GTATCATTTCATGTTAATGAGGTTAAAAATGGTTTATGCATCTGATTTAACATAACATGTTTGGATTCCCCTGCTTCTTTATGTTCATCCATGCATCAAT AAGTGAAAAACATTATATTTTCTTTAGGTTTTCTCATTATGGGCAGTCACTCCTCGAAGGTTGGGGGGTTTAACCTTTACAACTGATGATGTTGGAAATG TTCTTTCAATATCAGGTACAAATCATTATTAATGTTTTGCACACGTGTTTCCTTCCTAACATTCCATAATTCCATCTACAAAGATGCACATTAATTTTAT ACATTTACCTGAGGCCATATTGGTAACTTCATGCAAGGAATTTCCTCTTACACTGGTATTAGCTTTAGTCCTTTCACTTATCTTGCATTTCCAAACTTAA GAAAAATAATTAACATATTTTGATAGATAGTAATGCTATTTTAGCTTTTCTTTACTGTCAAAGGAAAAAGGGAAAATAGATATATCAAATATTCTGTTTA ATTATTGACTTACTCTTTGTTGGTCAGGTTTTGCGCTCATCATCTATCAGATTTCTCTATACCCTTTTGTGGAAAAAGCTTTTGGATCGATTAGCCTTGC TCGTATCTCAGGGTTGTTATCTATACCACTTTTGCAAAGTTATCCTTTCATAGCAATGCTGTCCGGCTTAACGCTATTCATACTCATAAGCATTGCTGCT GTTCTGAAGAGTCTTCTGTCTGTAAGTACACCTCTTTCTTTATTTAACCATTCATGTCAAGGGATTCAAATGAGTTAACTTGGCTTCACTGATTCACTTA ACTGTTTACATGACAAATTTAACTAATGATATTTTTTTTATGGACTCAGATAACCATCATAACTGGTTTATTCCTTATCCAAAACAGAGTTGTGGTATCA TTTCATAGCCTTTTATTTCCTTCCATATGTAGAGATTACTTTTTGATGGAATTTGTAACAATGGGTTGTTTATTTGGAAAACAGGAGCAACACCAGAGAG GGGAAGCTAATGGAATTGCTATGACTTCTATGTCACTATTCAAAGCAATTGGCCCGGCCACCGGTGGTGCAATGTGAGTGCCCGTTTAATTTGCGAGCTT TTGTTTAATTTACCAGTCATAGTTCATAAATGTGAATGCAGATCTCTATGAAGATTTAATATTTCACATGGTACTTGCTCAAAGTTGCTATAAAACTAGC ATACTAGTTTACATTTTTATATATCTTTTGTTATATGGATTAATCTATTCATTTGTGTTGAAGCTTCATCCTATGTTCTTCTATTATAATATGTTCCTTT AAAACCTGATTCTCTGTATAGTAGAGTAGTTTATTTCATGTCAACATGTAATTGAAGGGCTGTCTCAATAGTAAAAAAGTTAACTGAAATTACTCTCCTC TGATCCATTTACAGTTGAATAATTTTCTATTATAGAAGTTTTAAACTAGCATGCAAACTTGTAAAGGAATTAATTTTGGTGGGATTTGATTGGTTTGAGA CATGATGACAGAAATATTTCGGGACAAAGGATCTCGATTCGGTTATTTGTGGGTTGGACTGAATGATGTGGTAGTATAAGCTATTTACAGTTACTGCTTT TTCACCCCTTTTATTTTCTAAACCCTCTATTTCCTGTAAAGTTTATAGAAAATTATGCTTCACTTTTCTTATTACCTTTGTGGTCAATGCAGATTAACTT GGTCACAGAAGCGGA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_151740;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_500408

FPKM

• PAB: 0
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.1
• PS2: 0.2
• PS3: 0.2
• PW1: 0.2
• PW2: 0.2
• PW3: 0.4

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_500408

• Blastp: Protein ZINC INDUCED FACILITATOR 1 from Arabidopsis with 44.91% of identity
• Blastx: Protein ZINC INDUCED FACILITATOR 1 from Arabidopsis with 42.98% of identity
• Eggnog: Major Facilitator superfamily(ENOG410XSE0)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G13740)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019447126.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;