Id Trinity | TRINITY_DN47362_c0_g1_i5 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_499752 |
Sequence | AAAAAATAGTATTACTTTGCATTGTAAGAGAATATATGAAATTGGTATAAGGGAATTTTAGTAGTAATGTCTTCACAAGAAATAAGTGGTCCGAAAAGAA ACGACAGTCGTTTAATCTTGCTTTCTCTCTGCGCCATTTGTGGTGTGTGTAACTCCTCATGCTATGATTCTTGATTCTTTATACCAAACTTTTCTTCTTA GGTTATCGCAATTTCAATCCTTCTTCTCTCAATTTATTTACTTCACAGATTCAACTGTTTCTTATTTCACTGCTACTGCACCCAACAAATTGAATTCAAC CACTGGTAAATTCTTTTCATTCTATCGTTCTCTTCATTTAGGGTTTTTAGGTTCTGATTCTCGAATTGAATTTTGTTTCCTCTTTATTTTTGAAATTTGA TTTCTATGTTGATGTTTTAGCTTGTTTGTGGACATTGGCGATTGCTCAAGAAATTTATCACTGCCTAAATTTATGTGAATTTCTCTTTTCATGGTTTTTT TGTTTGTTATTGTAATTACAATAGTATGTTTTTTAATTTATGAATAAATTTGTTTACGAGAAGATTATATGGAGTGTAAATTTAGCAAGAGGTAGATAAA TCCTACTATGAAAGTAAATATTGGAGATTATACCATACTACAAGTTAATAAATTTAAGTATCTTGGGTCAATCCATAAAATATGACGAAAATTGATGGAG ATGTAAACAATAAAATTCAAGGAGGGTGAATGAAATGATGGGATGCATCAAGTGTCATATGTGATATAAAAGTTCTACTCAAACATAAAGGAGATTTTTA CCGCACAACTCTAATATACAAAATGTTATATTATATTGAACATTGGGCAATAACAGGTTAATAAGAGATTAAACTCAATGTAGCATATTTGAAAACTGTT GCACCGAATGAGTGAAGTAGTGAAAATACTAAACAAGATAGTATTATGAATAATGCATTAAGTAGAAATTTTGAGTTTCTCCTATTGTAGAAAACAGGGG TGAGCAGGACCCGTCCGACCCGCTTACCCATTTAACATCAATATCGGGCCCAAATATGGTTGGATTTCATTAGGTTTAAGACTGAGTTAAAAAATTAGAC CTGATCAATATTTAAGATTGAGTAAAAGGCAAACATGAACTGACTCAACCAGTCCTATGTTCACTCATTCATCATATTCGTATGTGCCTATTCAATTGTA TATAAAATAATGACATCTTTTTGGCCCAAAATATCATTGGTTCTCTAATTTTTCATCATTTATACATGTGCGTAAATGATTAACAAAATATATACATATA CATAATTTCATATATCAAATTATGTATCCAGAAGAATAAGTTGTATTGAGAAAACTTTATCTAAAATGGGTATGCATTATATTTAATCGAGTCTAGGATA AGGTATGAGTTTAAAAGATGGACTGACCAACATTTGGGTTTGGGTTAGTCTTTGTGTCTAGGGCTGAGTTCGGGTTCAAAAAAATAACCCAACCAACATT TAGATGTTAATGCTTTCTCAATGGACATGATTATGATAGAACATTATGGCATTGTTGTTGGTTGGTAATTTTAAGATTCTGTCTTTTGGACTTTAAGATG TTGTTGTAAACTATATCATCAATCTTGCTTCTGGTTGCTACTTGCACATGGAATGTAGGGTTTAACCTACAAAAGCCAGTTCTTGTTATCACTTTGTGCT ACAGGGATATTGAAATGTTGTTTCCTGTTGTCTGATAATGTCTTTGCTCTCTTTTGATCTGGGCAATACTTTATATATATTGGGATTGTTATGATGCTTG TGATAGCGACATTATAGATATGCCCCAACTCTAACTACCATTGTGTACTCACTGCTTGGTAGATACTTGAGGTGCGTTCCTTTCAGGTGTGTTCCTGTGT GTGTGTGTGAATTTTTCGTTCTTGGGAAATCTGTTTTATTGAGAGGAGAATTATGAATATGATACACCGAATTTGCTTGTTTGATTACGACATGCAACGT AAGTAAGTTCATGTTGGGGGATACAAGCCCTATGCAAATATGGAAATGTGTGGAAACTTGTATAATAGTTAGTTCATTTGGTGTGCCTCTCCTAGGCATT CACTGTTCCCAAACTCTTCTTCTCTGTATCTTATCTGAATTTGTATTATTAACTAGCTCAGGCCTTTTGTTAATTTGGTACTGCGAAGGTCTCATTTAAT ACATGGAATTACTTTCTTGCATAATCAGACTGGGAATGGAATGACCCTTCCTGTTCTGCAGTTTAATTTTCTCAGTAATAGAATTGCATTTTTATTTTTT AATACAATACATGACATTATGCTTTTATGTTTGGTACATAGAATCAATTCATATCAAAATACAAGCATAAATCTGACTACTGAAGATAAATAGGGAATGA GGAAATAAAACAAAATTTAATTTGTTGTAGCCATCAGAAATGTCTATTCTCATGTCTCTTGAACGGAATAGGAATTTGTCTTTAGAAACTTGAGGCATGG AATCAAAGTCCTTCCTACCAAACCTTGTGATCCTTCTCTAATGGAATAGTAGTACTAGTAAGGACTGAATGACAACGTTACATACCAAAATTGTTTATGT TTTTTAGAGTTAGGCCAGTGATTGACATGAGTGAACCTCTTAAGGGAAAAACTTTATTTATTAAAGTTGCACTTCTGCTGAAAATAATGATCAACTTTGC TGGAAATTGGGGCTTGGAAAATTATGATATAATTGTAATTGATTTATATGATGCTTACCAGGTTTCTTACCGATGAAGATGTCCATTAAAAGCGAACAGG GTTGCAATTTCATACTGGTGTAGTGTCTTGTTGAAGAACATTCCACTGTGTCCATGGCTGCTGATCAGAGGAGAAAGCGATTAAATGGCGCGACCATTAT TGGTTATGGTCACAGAGAGCAAAACAGGAATAAAAGAAAGAACTTGGGATCTGCTCAAAATGATTTAAGCATGAAATCTCACATTGCTATTGAGTGGGAT GCTAATCAGAAAAGGGTTGTTTCCAAGCCAGAGCAGATTGGCATCAGTTGGAGGCATATGAAACCATTTGTCAATTTTGTCTCTGAAGATCACAATGTCT TGGCAGACGTGTTTACCATACCTGAAGAAATTTTTGATTTGGACAATTTAACTGAAGTGCTTTCATATGAGGTTTGGAAGACTCATCTATCAGAAAATGA AAAAAGCCTTCTTATGCATTTTCTACCCAGTGCCTTTGAGCCACATCAATCTGTAGAAGAATTACTTTCTGGGAATAAATTTCACTTTGGCAACCCCTTC TTGAAATGGCAAAATCTCTTTCTTTGTATTTCTAGACACATAATCTGCTGTGCTTAGCATTTCATCTATCCATGCATGTAAACATATGCAACATAAAGTT TCTAATTTTGGATGACTGATTGGATTTTAGTTATCGGTTAAATACTAAGCTGGTTAGCTTTATTATTAGTTCCTGGGTTGAGTTGACCATCTTTACCAAT TTTCAGGTATAAATTCTGTTTTGCGGACTTTTTGAAATTCGAAATTCAGTCTAAGTTTCATCATCTTACATGATAATAGTCCGTATGATAGAATAAGGTG AAGGTTAGGATGAGATATAAAGGATCAGGCCTTCAAAATTGTATGGATCACACAGTTACCTCAAGTAACTTCCCTGTCACACTCCGTTACCTAACTGCTG ACGTAGCAGTTTAAGTGTTGTAGTTGGGAAGAAGATATAAGAAAGGGAAGCAAGAGAGAAGAGAGGGTAAAGAAAGTGTAGAAGTAACTCGGTGGGAGAC AAATAGGCACTCTCGAACTTGATTGCCATAATTTGTATTCAGTTTTCAGGTGTTTTTCTTTTGTTTTATCTTTCCATCATCCCCTTTGCTCTTAATATTA CCGTGACATGACATCAGTGAGGGGACTTTTGTGTGTAATTCTGGTCTAATTTTATCTCAGAATATTGATTCACTTTTCTAGAATCTTCCTTTTGCTTCAT AGAAAATTTCTCAATTTTGTAACTTGAAGAGGGATTTCGTTGAATGTGAAGAGGGATTTAGTTGTAATATTTTTCACTGTTCATTGTTTCTACTTAAATT TTGTGGATTCGTTTATTTGGCTACCATTTCAATGATCATCTGGGTTATATGATTTTTTTTTTTGCTCAATTCTGTTGGTGATGACACCTTTTTTCAATCT GCAAAATATCCTTCTTGCTTGCCAAAAAACAATCCTTGTTTCCTTGTAATGTTGGGAAGTATTTCTAAGACATTGAATGAAATTTGTCTAGTTTGGTGAT CATTCACTAAATCTTCTCCTTTGTGAAGTCAAAATTATCCTTTAATATTTATATATATATGCAGGGGTGCTTCACTTTGTCTAGGTGATCTTCATCCAGA TGTGATCATTGACCGGGAGCAGCATCTGAAGTCTGAGAAGAGAGCATACTACTCACAGTTACATAATTATCACAAGGGAATGATTGGATTTCTAACTAGG TTGAAGAAAAGGTGGCAAAGCAGCAAATATCCAGAAAAGGAAATTGCACATAAGATGTGGAGGTTGACACTTGGAAAATTTTCTATTTATTGCAATCTGC ATATATGGCACACCCGCACAAACAACTAAATTGGGAGAGCATATTCTGCTATAAATTTTTGTATGAAAACTTCTTGACCATGTGCAAGCAGGGGAGAACA CATGGCTTATGTCCTAGACATCCTTCATATATTAACTTTCTGAACAGTTAGATATGTCATATTGGTTTACAACTGAGATAAGGAAATCCTGGAAATCTTT TCACAGATGTATCTGATGAAATGAGACTTCCCCCTTAAGTTTTCTGTATGACTACTATTTTCATCAGTAGTTAGCGAGTCTGATAATGTTCATTTATCTA TTTTTATGTGGTTTTGATCCCTGATTGGAATTTTAGGTTGTAATTGTTAATGTCATAATTTTGTTGGATTTGAGCAGGTCAAGGAATGATGTAGAGAAAA TAATGCCATCAAGTGTGAATGGGTCTAGACTTTATGATCATGATGGTAATCTTACACTGACATCTGGGTCTTGTTCCTGGGATGCAGAGGATAGAGCATG TAGCAGTGACAACCAAATTTCTTCACTGAGAAAGGACGATAAACTTCAAAGAAGGGTGCTCGAAAAAGGCCTTGTTAAAGGAAAATCTACAAATTTGATA TATTCTTCAGATGATATTCTTAATGTGGGAGAAAGGCCCAACAAAGGAGACAAACTACCCAAGCATAACATTCATTCTAGTGAAGGTGACAAATACATGT CATGTATCAAGATTAGTAAGCAGCAGCATGAACTTGTTAAAAATATGAAGCAGTTGGGTAAAAGCATCCAATCTAGGTCTCTTAACCGTGTTTTGGGTAA CCTTGATAACATTCATGTGCAACCATATGAAGTATTTGTCAAAGAAGAACAGAAGAAGTTGCATGAGCATTGGTTGAAATTGGTGAACAAAGACCTCCCT GTGGCATATGCAAACTGGACACAGAGACAGATACAAAGACATGAAGTGAGAAATTCATTGGTAGCAGAGATGAAGGAAAAATCAAATCCACTCCTGGAGG AAGAGGATAATGTGGACTCAGGGAGCGATCTTCGGGATCAGGATGAGGATAACATGAGCTCAGGGAGCGATCTTCAGGATCAGGATAATGTTAACTCGAG GAGCAAACTTCAGGATCAGACTGAGGATAACATGAGCTCAGGGAATGAGCTTCAGGATAAGGATGATGACAATATGAGCTCAGGGAACGACTTTCCGGAT CAGGAGGAGGATAATGTCAGCTCAGGGGGAGAGCTTCAGGATGAGGATAATGTGAACTCGGGGAGCAAACTTCAGGATCAGGATGAGGATAACATGAGCT CAGGGAACGAGCTTCAGGATGAGGACGAGGATAATGTAAATTCTGGGAGCAAACTTCAGGATCCGGATGAGGATAACATGAGCTCAGGGAACGAGCTTCA GGATCAGGTGGAGGATACAGGTGTAAAGAATCCGTCCAACTCAAATGATGATGAAGATTCAATTGTTAGGTCCCCAGAGAACCATTCCCCAAATAATTCT TATCTTAGAGATGAATTCTTCAACCCAATGAGTATGGGTCCCGATAAGAATATTATTTCATCAAAGCGAGCTGATGCTGCACTGAGTGAAGTCGAATATT CAAGGAATATAAACCCTGAGGATGTTTCTATTAATGAAAGGCCCATACATGATTCTTATCTTAGAGAAGAGAACTCAGTGAGTATGGGTTCAGAAAAGAA TGTTGCTTTATCTAAGCAAGCTGTTGCTTCACCGAATGTTGAGTATTCAAGGAATATGAATACTCAGAATGTTTCCATTAATGAAGGTTCCGCACATAAT CCTTATCTAAGAGATGAATCATTGAACACAGTGAGTACTATGGGTTCAGAAAAGAATATTGTTTCTTCAAGGAATATGAACACTCAGCATGTTTCTATCA ACGAAGGAGCATCTTTTGCTTCTGGCAGTGATGTCTGGCAAGCAGTTGAAATGCCACATGCATACTATGATTCTGCTGTGACCCATGAGTATACATCCAG TGGGTTATCACTGGCAAATCCTCAAGTCAATGGAGAGCAACAGACCCGCCTGACTGATATTCAACCTGATTTGGATCACCTAGAGACAGATAAAGAGTTG TTACACCAACAGTTCGGTGATGGAACCTTCAGCTCTTACCAAAATCAAGACCGAAGTAACATTTTCCAATCTCTCTTCAAGGGGGAGGGGATGTTGTCCT ATCATCCTGAACAAAAAAGAGATGAAGTAGACTTTAAGCCTTCAAACAATGTTATGATAGGGGATGAACAATTTTCCAGTCATTTTAAGGAGCCATTGCA AACATCACTGACATTGGACCAGGGGCATAGAAGAGCTAATGAGGTTTACTTGCCAGTAAACATGCCAGATAATATTTATTCTGATAGAGGGAGGTACTTA ATCCCCACCGCAGATCCACTGGCCTTCACACGACAACCGTTGCCTGTGGTAAGTATGACTGGTTGGTCTGCTAATACTGCTCACATAGCTGCACCTCCTC AATCTAACTTAAATAGCAGAGATTTTATTGATCATCATTGGTTTCCTGCTGACCATCATATTCGTGCTGGCTGGAATGGGTCTAATGACAGTAGTGCTTT GGGTCAGAGTCTTGGCACTCGACCAAACACTGATCCGAGCTTATTTAATATTTTATCACAGAGTGGCCATTTGCGTTCAGGTAACCCTTATGATTCAGTC AGAAACACTGATCAGTTTCTTGCGCCAAGAACATATGGAGAATTAGATGCAGCTATGCCCAGGCCCAATGCTGTAATACCACAGACTCCTCATGCACCAG GTTATTTCAGTGGGCATGAGGCACCTAGTGGTATGGTTCCCGATGATATGGCACGAATGAGCTTGCCGCATCAGAATTCTGCATTACATGATCAAATGGG AAAGTCATACTTGAGGTCATGGAACCAGCAATGAATGTTTTAGCCAGTGTGAGTCAGGGTGCAGAGCTCGACTGAAGATAGAAGAAATGCTCATATGCTG TGTAATAGTATTTAGGCAAAGACTCGATGAAGCTGGTGTTACATACCCCGAGAGAGATAGGTTTCTGTACATACCTATACCGAAGTCAACTCAATACCAT GTACATACCTAGATATTAGATGGGCAGGAAAATCAAAGGGGTAAGATGAGCTTCAAGAATTTCAGGTTGTTAGGCAAGTTATATATTTTATTTTTTATTT GATTTTGGAGACATAATTCAATAATTTTGGAAGTTAAGCAATGCAGGAGGCTGGTGCTCCTTTTGAAGTTATATTTATTTTGGTTCCTTTTCATAATTTC TTCATGTGCTAGTGATGCTGAAATAAATGGTCTTCTTTGGGCATATTTTGATTGTTCCAACCAAACTAAGTTATAGTAATTGGATATAACCCTGTGTAGT GTGTACTGTTGCCTGGGATATAATTGCCTAAATGGACAAAAGAATAAAATCTCTGTAGATGAGCATGGTTAGATGACAACTTTTGGGGTCAATTAGACAC CAAATCTCTTTTTACCAGTAGCTGTTCTTAAACTTTGTAGCTAATTCGTAAGTGATATATAAAGTGATACACTCTAATTCGTAAGTGATATATAAAGTGA TACACTCTAATTCGTAAGTGATATATAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_151998; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_499752
Blastp | Spore wall protein 2 from Encephalitozoon with 29.63% of identity |
---|---|
Blastx | Spore wall protein 2 from Encephalitozoon with 29.63% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019427429.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |