| Id Trinity | TRINITY_DN47363_c0_g1_i27 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_501852 |
| Sequence | CTCTCTTCTCCTCCGATCGGTCCAGTTGACTTTTATGGCTACGATCGGACATAACAATCTCAATGCCAAATTGGTCTTTTTACTTTCCGATCCCTCTTTC CTTTTCTTCGATTCCTGTTTAGACTTATCATAACCTAATTATTTCATTTTCTTCTTCTCTAAATTTCAGGTTCTCCTTGGGGATATGGGTGCTGGAAAAT CCAGCCTCGTTTTGCGTTTTGTCAAGGGTCAATTCCTTGAATTCCAGGTTCTTTCACTCTCGAATCCTGTGATTACTTCTGTTTATTTCTCCTATTGTCA AATTCGTAATCCATAATTCTCCCCTAATATTCGGTGAATTACTTTGTTGCGTTTTCAATTGATGAAAATTTATATAGTTTTAAAATAAAGAAAATTGGAA GATGAGATAGGGAATAGTTGGTTTTAACTTTTTATACTTTGATGCTATTGAGCGAATCAAGCTATCTTGTTTCTAATAAATGCTTCTAAAACCTATGAAT TTGATTGTGAATATGGGATATTTTTAGTGAGACTAAATTGTTAACTTTAAAATGGGTAAATCCTTAAGTAATCTCAAGGGTTATTTATACTCTTAAAGGA CTACATTTGATTAAAATTTTCGCGACTTTGTTTGGGTCGATGTAAATTTAATCCAAGAGCATGCATGATTATGAAGTTCATGTGTCATGTTTTTAGTGGA CTGAGCATACCACTCTGATATATTACATGAGAATTTTTTCCTTAAAATGAGGAGTTGCTTTTCTGATTTGCCAAACATTCATTGAGTTCTGGTTTTACAC TAAATGCTTTGTTGACCAAATACAATAAAAATGAATAACATGTGTAACAGTTCACCTTGTATCTTGGTCCCATGGAACAAGTTAGGCATCAGAGTGATTA TCCTTAAAAGTATACTCCGGCAGGGAAAAAGAAGGCTGGGTCGGGTGGAAGATATATATAGAGAGAATTGCCTCTGTTTATGGTCCTCTGCAAGAATCGA CAATAGGGGCAGCATTCTTTTCACAGACATTGGCTGTAAATGATGCCACAGTGAAATTCGAGATTTGGGACACAGCTGGACAAGAAAGATACCATAGCTT GGCTCCCATGTACTACAGAGGCGCAGCTGCTGCTATCATTGTCTATGACATTACTAATTCGGATTCATTTACACGAGCTAAGAAGTGGGTCCAGGAACTT CAGAAGCAAGGTATTTGCTGATTGGTTCTAAATTTTTCTTAAGCTATTTTATAGTAAAGACAGAAATAAACTTTGTAGTGTGCAAAAGGAAAATCATACT ATTTATTAATCATTTATAAATTTCAGGATAAAAATTATTCCAAAGAAATTTTGTTCACCTATTCTGTAGTTTTTTGTGAAATTAGTTTTTATGTTTTATT TGAACTCTAAAATTATGTTATAATAGAATCATAGAGGAGATTAGACATGGTTGGACAAGACATGAAATGATATAAGGATGCTTATTTATTGCAACAGAGT GATAAACATTTAGCTAGATTCTAGGTTCTATTTTCTGAGACAGCCACCGGATTTGATTTTGTTAAATAATCTTCCTATGATATTTAATGTTTTATTATAA ATATTTTGCTATATTTTTTATACATATTACAAGAAAGATGTACCTCTAAGCAACCTTAGTTCTAGATAAAGAAGTAAGCAGTAGAACTTGTGTTGATAAT AATAAAACTAGGGGGTTTGCTCTAAAGTATTATTTCAAACCTTTTTGGTTTTCCCATCTCTAGTAAACTTGTTGTGGTGTTTTGCAGGGAACCCTAACAT GGTTGTGGCTCTTGCTGGTAACAAAGCCGACCTGGAAGATAAGAGGAAAGTGACAGCTGAAGTAAGTAACTTTTTTTTTCCAACTTTCAATTCCTTTAAT GATATTGTAGCTGCAGTTGTGTTGAATTGAATTAATGTACTATGTTTTTCTAATAAAAATTTAAAGGCAAAATATGGTTGAATTGTTACATACATTTGAT AATTTTTATGTTGCTGCCATTATTTTTGTGTTGTATCTGATGTGGACTTCATGTCTCTATATATCAAAATCTTATCCAACCATGACTAGCATCTTCAAAC TTCAAAAAGAATTGGTGCATTTGAGTTGTCAAATACTTGATTTCTCCGTGTAGCCAATTGATATTTACATTTAAACTTGTATAAAATATTTTTTACTGTC AAACATATTAGTATTTCTGTTAACAACTATCAGCGCCTCTGCTCTAAGTCAATTAATGTTAATGGTCGACAAACTCTTTTGATACCAGCTGAATTAATGC GTAATTGGTTTCACCTTGATCAAATCTGGTGGTGAAGTGCTTTCTAGTTTCTATTTCCCCACAGCGTTGATTTTCTCTCCTCTCTGACAAGTCTTAATTT CATCTCCTCTCTGACAAAGTCTTTTGGCGAATTAAAAAAATTAAATGAACTTAACTCGAATGGTTTATCTACAGCGACTCTTACATTAGCTTGTACATGC AATAACTGTACCTTGATAACTTTTCATTGTCCTAATTCTTAAAGTTCAATACAATGATACTCTAATCTGTAATTGGTTGCTAAAGCATGTTTGGGAGTGT TAATAGCCTCACCCTTCTTTGAATTACCTACTTATCAATTGTGATTCATGGGCAATGCAGGAAGCACGTGCATACGCTGAGGAAAATGGCCTGTTTTTCA TGGAGACCTCTGCCAAAACTGCAGCCAATGTTAATGATGTATTTCATGAAATAGCGAAGAGGTTGCCCAGGGCCCAACCAGCACAAAAACCAGCAGGGAT GGTTCTTGTTGACAGACCCGCTGATGGAGCCAGAGCTGCATCATGTTGTTCATAATTATTTATTCTATGTAGCCCCCTCTCTCTCATTTATGCACCCTTT TTCTAATGGTTAGTATAATTGTATCACTCTATGTACTGCACACTTTTGATAAACCTGTTATGTGGAACTCCATCAAGTTCATGGGCTGCCTTCATCATTA ATGCAAATTATAAAATAGAACTTGTGTTTGTAAAATATATATGTATCTCTCTTGGATTTGGTTCATAGCACCATATAAACTACATCATATGATCAATAAT CAATAATAACCACTCTTAATTTAACâBLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_152004; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_501852
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Ras-related protein RHN1 from Nicotiana with 93.33% of identity |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019460953.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |