Id Trinity | TRINITY_DN47380_c0_g1_i6 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_500658 |
Sequence | AGAAGATAACATATATCACTTTTTACGAGTAGAAGGAGTGATATGAAAATTTAGTAGGAGACATACTCTTGTAATATATATTAATTTCTTTATGAATATG TCATTTTTTTCGCATAAAAAAAAGCAGAGGAGTTGATAATTGAGTATATGCAGCAGAGTGTAGGGCTGATTGTTAGATTTTGAAATTGAATTTTGTGATG CGAGTGATATGCATATCCAAATCCTCTTCTCTCCCATTATAAGCTATTAAGCAATTCCTATTTCACAGTGTTCATTAATTTAGGGTTTTATCAAAATGAG CACCGCTTCTCACCGTCACACCCTCCCTCCCTCCGCCGCTACCAACCTGGACACTCTCAACCGCATCCTCTCCGACCTCTGCACGCGTGCCAACCCCAAG GATGCTGCCTCTCCATCTCTCAAGAAGCACATAGAAGAGCAAGCCAGAGACCTCACCGGCGAGGCCTTTTCTCGTTTCATGGATCAGTTATATGATCGGA TCTCTTCTCTTCTCGAAAGCACCGATGTTAACGACAACTTCGGAGCCCTCAGGGCCATAGATGAACTCATCGACGTCTCCTTAGGGGAGAATGCTTCCAA GGTTTCCAAATTTTCAACTTATATCAGGAATGTCTTCGATGCCAAGCGTGATCCTGACGTTTTGCTCCATGCTAGTAAGGTTCTCGGTCACCTCGCTAGA GCCGGTGGTGCTATGACCGCTGATGAAGTTGAACGTCAGCTTCAAATTGCTCTTGACTGGCTTAGAGGGACTCGACTCGAGTATCGACGATTTGCTGCTG TCTTAATTTTGAAAGAAATGGCAGAAAATGCTTCAACTGTATTTAATGTCCACGTGCCAGAGTTCGTTGATGCTATTTGGGTTGCTTTGAGGGATCCGGC ATTGCCAGTTCGTGAGCGGGCTGTGGAGGCATTGCGTGCCTGCCTTCGTGTTATTGAAAAACGCGAGACACGCTGGCGTGTGCAGTGGTACTATCGAATG TTTGAGGCAACACAAGATGGATTGGGTAAAAATGCCCCAGTGCACAGCATACATGGTTCACTGCTTGCTGTTGGAGAGCTTCTGAGGAATACTGGTGAGT TCATGATGTCAAGATACCGAGAAGTCGCTGAAATTGTTCTCAGATACCTAGAGCACCGGGACCGTCTTGTTCGCCTGAGCATAACTTCATTGCTGCCTCG AATTGCACATTTCCTGCGTGACCGCTTTGTTACTAACTACTTAACAATGAAATTCCATGCAGATATGCATGAGTCATATTCTTTCTGTCTTGAAAGTGCC GCAAGATCGTGATAGTGGGTTCATTGCCCTTGGAGAGATGGCTGGAGCTCTGGATGGGGAACTCATCCATTATTTGCCGACAATAACTACCCACTTACGT GATGCGATTGCGCCACGTAGGAGTAAGCCTTCACTTGAGGCTTTGGCCTGTATTGGAAGTATTGCCAAAGCAATGGGGCCTGCCATGGAACCTCATGTAC GTGGGCTTCTGGATATTATGTTCTCTACTGGTCTTTCAACTGTACTCGTGGAAGCTCTTGAGCAAATATGTACCAGCATTCCATCTCTGCTGCCTACCAT ACAAGACCGCTTGCTCGATAGCATATCTATGGTTCTTTTGAAATCCCACTATCACCTGGGGAGGCTTGCGACAAGCATGGGCAGAGGAACAGCAATGAAT GCCTCTCAACAATTCTCAGAGCTTACTGGTTCTGCTCTTGTACAGCTTGCTTTGCAGACTCTTGCTCGTTTTAACTTCAAGGGCCATGACCTACTTGAGT TTGTTAGAGAATCAGTTGTTCTCTATTTGGATGATGAGGATGGAGCTACACGAAAAGATGCAGCTCTATGTTGTTGCAAAATAGTTTCTAATTCGTTCTC TGGTATATTGTGTGCACATTTTGGTTCTAGCCGTTTGAACCGACCAGGAGGAGGGAAGCGTCGTCGCCTTGTTGAGGAGCTTGTGGAGAAGATTCTCATT TCTGCTGTTGCAGATGCTGACGTTACTGTACGCCACTCTATCTTTACATCTCTCCATGGCGATAGAGGTTTTGATGAGTACTTGGCACAGGCTGACAATT TGAGTGCAGTATTTGCTGCTTTAAATGACGAGGACTTAGATGTTCGAGAGTATGCAATTTCTGTGGCTGGAAGGTTATCAGAGAAAAATCCCGCATATGT TCTTCCAGCTCTTCGTCGCCATCTTATACAGCTATTAACATACTTAGAGCAGAGTGCTGATATCAAATGCAAAGAAGAAAGTGCAAAATTACTTGGCTGT TTGATAAGGAATTGTGAACGGCTTATACTTCCATACATTGCTCCAGTACACAAGGCACTTGTGGCCAGACTTAATGATGTTAATGCCAATACTGGAATTG TTAGTGGAGTCCTTGTCACTGTGGGGGATCTAGCCAGAGTGGGTGGTTTTGCAATGAGGCAATACATTCCTGAACTCATGCCTTTAATAGTCGAAGCTTT GTTGGATGGAGCATCCGTCTCCAAACGTGAAGTGGCAGTTGCTACACTAGGTCAAGTTGTACAGAGTACTGGGTATGTTATAACTCCATATAACGAATAT CCGCAGTTACTTATCTTACTCTTAAAATTGCTGAATGGTGAACTAGTTTGGTCGACCAGGCGTGAAGTTCTGAAGGTTCTCGGGATTATGGGTGCTCTAG ATCCGCATATGCATAAAAGAAATCAAAAAGCTTTGCCAGGGCCTCATGGAGAAATTACTCGTCCTGCTAGTGATTCAAATCAACAAATTCAGACTATGGA TGAATTTCCCGCGGATCTGTGGCCTTCTTTTGCTTCATCAGATGACTATTATTCCACGGTTGCAATTAATTCTCTCATGCGTATATTGCGGGATCCTTCA CTTAATATTTACCACTTAAAAGTGATTGGGTCTCTCATGTTCATATTTAAGTCAATGGGGCTCGGCTGTGTTCCGTACTTGCCAAAGGTTTTGCCTGACC TCTTTCATACTGTTCGCGCCTGTGATGAAAATGTTAAGGACTTCATAACATGGAAGCTTGGAACTCTGGTGTCTATTGTGCGGCAGCACATTCGTAAATA TTTGCAAGACTTGCTTTCTCTAATATCCGAATTTTGGTCATCATTCACTCTTCCAGCACCAGATCGTCCTCACCTTGGCTATCCAGTTCTTCATCTGGTG GAACAACTTTGCTTGGCTCTTAATGACGAGTTTAGAACATATCTTCCAATTATTCTGCCGGGTTGTATTCAGGTTATTAGTGATGCAGAACGGTGCAACG ACTACACATATGTTCTTGATATTCTCCACACTCTTGAAGTGTTTGGTGGGACCTTGGATGAACATATGCATCTACTTCTTCCTGCTCTCATACGTTTGTT TAAAGTGGATGCTTCAGTTGACATAAGACGTGCTGCCATTAAAACTTTGACCCGATTAATTCCTCGTGTGCAGGTCACTGGTCACATATCCTCTCTTGTG CATCACTTGAAGCTAGTTTTGGATGGGAAAAATGATGAGCTCCGGAAGGATGCTGTTGATGCACTTTGCTGTCTGGCCCATGCTCTTGGCGAGGATTTCA CAATTTTTATTCCATCAATACACAAACTTCTACTGAAATATCGCTTGAGGCACAAGGAATTTGAGGAAATTGAAGGGCGTTTACAGAGACGTGAACCACT AATCCTTGGGACTACAGCTTCTCAAAGACTGAACCGAAGGGTTCCTGTTGAGGTCATTAGTGATCCTTTAAAAGATCCGGAGAATGATCCTAATGAAGAT GGATCTGATGCTCACAAAGTCAGAGGCCATCAGGTTAATGATGGTCGATTACGGACAGCTGGGGAGGCTTCTCAGCGAAGTACTAAGGAAGATTGGGCAG AATGGATGAGACATTTTAGCATTCAACTTCTAAAGGAATCTCCTTCTCCAGCCTTACGAACCTGTGCTAGGCTTGCACAATTACAGCCTTTTGTTGGGCG AGAATTGTTTGCAGCTGGATTTGTCAGCTGTTGGGCACAGCTGAATGAGACCAGCCAGAAACAGTTGGTTCGGAATCTAGAGATGGCCTTTTCATCACCG AATATTCCTCCCGAAATTTTGGCAACGCTTCTTAACTTGGCTGAGTTCATGGAACATGATGAGAAACCTCTTCCTATAGACATTCGCCTTCTTGGTGCTC TTGCTGAGAAGTGTCGTGCATTTGCAAAAGCCTTGCACTATAAAGAAATGGAATTTGAAGGAGCACGCTCTAAGAAGATGGATGCTAACCCAGTTGCTGT AGTTGAAGCTCTTATTCATATAAACAACCAATTGCACCAACATGAGGCTGCAGATGGAATATTGACCTATGCCCAACAGCATCTTGACTTTCAACTGAAG GAGTCATGGTATGAGAAACTGCAGAGGTGGGATGATGCCCTCATGGCTTATACTGCGAAGGCCTCTCAAGCAACAAGTCCACATCTTGTCTTGGATGCCA CTTTAGGTAGAATGAGATGCCTTGCTTCATTGGCTCGATGGGAGGAGTTGAATAACTTATGTAAGGAATATTGGACCCCAGCTGAACCAGCTGCCCGTCT TGAGATGGCATCAATGGCTGCAAATGCTGCTTGGAACATGGGTGAATGGGACCAGATGGCAGAATATGTGTCCCGATTAGATGATGGTGATGAAACAAAA CTTCGAGGCTTAGGCAATACCGCTTCTGGTGGCGATGGAAGTAGTAATGGTACTTTCTTCAGGGCTGTTCTGTTAGTTCGTATAGGAAAGTATGATGAAG CTCGTGAGTATGTTGAGAGAGCAAGAAAATGTCTGGCAACTGAGCTTGCTGCTCTGGTATTGGAGAGCTATGAACGTGCTTACAGCAATATGGTTCGTGT GCAGCAACTGTCAGAACTTGAAGAGGTGATTGATTACCGTACGCTTCCTATTGGAGATCGAGTTGCTGAAGAGCGTCGGGCTCTCATTCGAAATATGTGG ACTCAGCGTATACAAGGGGCCAAAAGCAATGTTGAGGTTTGGCAGTTACTTTTGGCTGTTAGAGCACTGGTGCTGCCTCCTGTGGAAGACATTGAAACTT GGCTAAAGTTTGCTTCTCTTTGCCGGAAAAATGGTCGCATTAGCCAAGCAAGATCTACTTTAGTTAAGCTTCTACAGTATGATCCTGAAATTTCTCCTGA AAATGTTCGATACCATGGTCCTCCCCAAGTAATGCTGGCATACTTGAAGTACCAATGGTCGCTTGGAGAGGATTCAAAGCGCAGAGAAGCATTTATTAGG TTGCAGGATTTAGCTATGGAGCTTTCAAGTGCGCCCAACATTCAACCAGTTACATCGTCTGGCTTCACAAATGGTTTGAATCCATGTGTTCCTCTCCTCG CTCGTGTTAATCTGATACTTGGATCCTGGCAGTGGTCACTTTCTCCTGGGCTGGATGACGAGTCCATAAAAGATATACTAGATGCATTTGCAAATGCTAC TCAGTATTCAAATAAATGGGCCAAAGCCTGGCATAAATGGGCATTATTCAATACTGCAGTGATGTCTCATTACACTTTGAGAGGTTTTCCAGACGTTGCA GCACAGTTTGTAGTTGCAGCTGTCACCGGATACTTTCACTCTATAGCATGTGCAGCAAATGCTAAAGGTGTTGACGGTAGTTTACAGGATATTCTTCGGC TTCTAACATTATGGTTCAACCATGGAGCTACAGCAGAAGTTCAAATGGCCCTAAAGAAAGGATTTTCCTTAGTTAATATCAATACTTGGCTAGTAGTTCT ACCTCAAATAATTGCAAGGATACACTCTAATAATCATGCTGTGAGAGAGTTGATACAATCACTTTTGGTTCGAATTGGGCAAAATCATCCACAGGCTCTT ATGTATCCTTTGCTTGTGGCCTGTAAATCAATAAGCAACTTACGCAAAGCTGCAGCTCAAGAGGTTGTTGACAAAGTTAGGCAGCGTAGTGGTGTCCTTG TGGATCAGGCACAACTTGTATCAAAAGAACTGATCAGGGTTGCTATTCTTTGGCATGAAACCTGGCATGAAGCACTAGAAGAAGCTAGCCGTTTGTATTT TGGTGAACATAACATTGAAGGGATGCTAAAGGTGTTGGAGCCATTGCATGAAATGCTTGAAGAAGGAGCAATGAGAAACAATGTTACCATAAAGGAGAGA ATATTTATTGAGGCTTACCGACAGGAGTTATTAGAGGCTTACGAGTGCTGCGTCAATTACAAGAGAACTGGGAAAGATGCTGAACTTACCCAGGCTTGGG ATATATACTATCATGTATTCAGAAAGATAGATAAGCAACTTCAAAGTCTTACAACTTTAGACTTGGAGTCTGTTTCTCCAGAATTGCTTGAATGCCGCAA TTTGGAGCTTGCTGTTCCTGGAACATACCGTGCTGATGCACCAGTGGTTACAATTGCATCATTTGCACGCCAGCTTGTTGTCATAACATCTAAGCAACGG CCTAGGAAGTTGACCATTCATGGGAGTGATGGTGATGATTATGCCTTCTTATTGAAGGGACATGAGGATTTACGCCAGGATGAACGAGTCATGCAGCTTT TTGGTTTGGTGAATACTCTGCTTGAGAATTCTAGGAAAACAGCAGAGAAGGATCTTTCTATTGAACGATATGCTGTGATTCCTTTATCTCCAAACAGTGG TTTAATTGAGTGGGTTCCAAATTGTGACACCTTGCATCATCTTATTCGAGAGTACCGAGATGCCAGAAAGATCACCTTGAATCAAGAACACAAATGTATG CTCAGTTTTGCTCCAGATTATGACCATTTGCCTCTTATAGCTAAAGTGGAGGTGTTTGAATTTGCTTTGGACAATACTGAAGGAAATGACCTAGCAAGGG TGCTTTGGTTGAAAAGTCGAACATCTGAGATTTGGCTAGAGAGGAGGACAAATTATACTAGGAGCTTGGCAGTTATGAGTATGGTTGGTTACCTTCTTGG CTTAGGTGATCGCCATCCGAGCAATCTTATGTTGCACCGGTTTAGCGGGAAGATTTTACACATAGATTTTGGAGACTGCTTTGAGGCATCAATGAACCGT GAGAAATTCCCAGAAAAGGTGCACTCAAGAATTGATTATTCGTAATGTTAAATGATTAGATTCTGGATATTATCTTGTTATCTTTTTATGCTATTATTCA GGTTCCTTTCCGCTTGACAAGAATGCTTGAGAAAGCCATGGAAGTTAGTGGTATCGAGGGCAACTTCCGTTCCACATGTGAAAATGTTATGCAAGTTTTG CGGACAAATAAAGATAGTGTTATGGCTATGATGGAGGCCTTTGTCCATGATCCTCTTATAAATTGGCGACTTTTTAACTTCAATGAAGTTCCACAAATGT CCATGCTTACTAGCAATCATGTAACTCCTGCTGTAAATACTGAAGAATCTGCCCAAAATAGAGAGCTTCCCCATCCTCAGCGCGGTGCTCGTGAAAGGGA GCTGCTTCAGGCTGTTAATCAACTTGGTGATGCTAATGAGGTGCTGAATGAGCGCGCTGTGGTTGTCATGGCTCGAATGAGTAATAAGCTTACAGGAAGG GATTTTTCGACGTCTTCAGTACCTAACAGCTCTCTTCAGCATGCAGTGGACCATAGCAGCTTAGTTTCTGGGGACACTCGTGAAGTTGATCATGCTTTAT CTGTGAAATTGCAAGTTCAAAAGTTAATTGGCCAGGCCACCTCACATGAAAATTTGTGCCAAAATTATGTTGGGTGGTGCCCTTTCTGGTAAAATCTCAA GGATAGCAATAAATTCATATGTATATAATGTGTACATATTGAAGACATACCGTGGATCGTAGATAGTCCTCTCACATCTCTATTTTATGTACGTTATATA CAGTCTTCAGCTTCTCAAAACTCTAGTGTGCTTGCTTGTTTGGTCCTTAATATTATACTTCAGATCACATTTCAACCGGATCTTTGTAAATACCATTAGT TCTTGTTAGCGCGTCCATGTAAATCTATTTACATTGTCTTGTACTTTGGTCATGAATAATATGAATTGAAAATGTGTAGTTGCTAATGAAGCCTCATTCT GATTTCTCCAAAATATATCACTTCTAAGTGACTTGAAATTCAAATATTATGATATTTAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_152123; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_500658
Blastp | Serine/threonine-protein kinase TOR from Arabidopsis with 81.86% of identity |
---|---|
Blastx | Serine/threonine-protein kinase TOR from Arabidopsis with 81.82% of identity |
Eggnog | phosphatidylinositol kinase activity(COG5032) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT1G50030) |
CantataDB | Link to cantataDB annotations (CNT0002730) |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019423211.1) |
Pfam | Domain of unknown function (DUF3385) (PF11865.7) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |