Id Trinity | TRINITY_DN47410_c4_g2_i3 |
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Name Transcript | Ll_transcript_476937 |
Sequence | TGATTTTGCCCTCTAGTGTTTTATCATTTTCATGACTTGTGTGAATGTGATGCTGCCATGTCTGATTTAACATGATGAAAATAAGAAATCTTGTAAATTG CTGGAATCTTGGAGTACCTGTACAAAGACTTTCCTATCTGTGAATTCTGGGCTATTTAAATATTAATTAATTTGTAAAATTACCCAGTTACCAGCCAGAT TATAATTAGGTTAAGGCATATTTTACAGCAAGATCACATTGGTCACTGCTTCTTGGTTAAAACATGATAATTTCGAAGACAACTATGAATAATTTCACTA CATGTACAAAAGACTCACATCCATTCTTTTGCATTATATTCATTCTGCTTTTGCTGTTTATGTCTGATGTCTTATCCACCCACCTAGAACACCTTCTGTT TCATATAAAGTATTCCTATATAAAATTCTGTTATTACACACTCATACAGATCAAACATATCCTTTGTTGTCTTTTTTTATCTTTTATTTTAATTTAGAAA AAAAATTTCGTACCTTTTTCATATAGAAAAATAATTTCAGTAAGAAGGAAAGACCATTGCAAGATAAGATGATCAAAAGTCGTTTTTCTACCTTAATTTG TGTCCTGAAGATTAGATATGGCTATCTCGCTTCTGGAAGCAAGTAACACCTGCACTTCCTGGTTATGGGATATGTAATTTGACTAAATGCTACTTAACTC GAGCAATCTGCAAAGCGTTGTTCTAAAGTTAAGCTGCTGATCCACCTAAGTAGGATGTGACTTTATGTGCCAAATTATAAGTTCATAATAATAATGGCAG TTAATGTTTGCATGAATTGAAGTAGGCTATTTAATCTATTGCTGGTCCATTTCATAGCAGCTACTAGCTCCAATTATGCAGAAGACAACATCAATGCAAA ATCATACTGTTGATCCATATCTTACTAATTTCAGCAAAGATAATATCATCATGCAAGCTTTTCCTCATATAAAATTTGATTGAAAAGATATTAGTAATAA TACAACGGAAATAACCTACTAATAGGGAAAAAGGAAAATAAAATGTGATCTGTCTAGTATATATTCCCAAGGATAGGATGCATGTTTTCATGTTCAATGA TAACACCTTTTGACACTGGTTTGTAGGTTTAATATTTAAAGTGGCATGTCATAAAACTAATGATTAAGACATTAATCTATATTACCAGGCTTTATTTTTT GTGTATCTTCCAGTGCAAAATCATTTATAATGTAGAACCAATGACAAAGGAGTAAAATTACTTGAACTCATCATTTTCCTCAATAAATTTACAATCATTT TCAACTTATTTTTTATGCTCTGCATGTTTTATCTGTTTCAGTGTTTTCCTTTTAGCATGAAATTTTGAACTCATCAGAACCTGTTTCAACTTTCCTGTAA AACAGCTTTATTTATTGGGAAATTCCTCTGTAGAGTCACTATCAGGTGCAGAGTACTCAAAGTTGACATCGGTATGAGCGTCCTTTCATTGCTTAATCCT CTTCGATATAGTTCCACTCTCTGTTTGGGTTGAGAGTTCATTTTCCTACCTTATATCATACTTAAAGAATTCAGTAGGTTCTCTCATTTTGTTTGCTTTC TTCTGGCAAAGACATTTTCAGGTCAAATCAGTGATTGCTGAATTGAGGGAAAGATTTCAATCACATTCAATGAAATCATATCGATCTCGATTTCAGAGAA TATATGACTTGTTTATGAGCGACAATGCATCATCCTTCTTAGGGATTGAGCAATGGCAGCAGTTTCCTCATCTAGAGCAATGGCTTGGCCTTGCAGCTGA GGGGACTGTGGAGCTTGGGCATATAGTAGAGTCTCCTGTTATTCGTACTGCAACTTCAATTGTTCCTCTGGGATGGAATGATGGGCCTGGAGCAAAAAAT AGAGAACCTCTGAAAGTTGATATTACTGGTTTTGGCTTGCATCTCTGTACACTTGTTCATGCTCAAGTGAATGGTAACTGGTGTTCAACTACAGTTGAGT CCTTTCCCTCTGCACCAAACTATTCTTCAAATTATGGAATTCAGCCAGAGTTGCAGAACATGAGAATATTGGTTGGTGCTCCACTAAGAAGCCCACCAAA GCATCAAACTGTTTTAGACTCATCGATTCCTACTTTTACTTCTGTTGATTCCGAGACTGCTAGTAGTTCAGCACTTGTTGACAAGGATAAGTTCATCCGT CCTGAAAGTTTAAATAACTTTCTAATATTCTGCACTAGTGATTTTACAACTGTTTCCAGAGAGGTTCATGTCAGAACCCGTAGAGTACGATTAGTTGGGC TGCAGGGTGCTGGTAAAACCACTCTTTTAAAGGCAATCTTGAATAAATATAAACCAAATATTGCCATCAATGAGATTGTGGTTTCAGATGTTGATGTACA AGAAGGTATTGCTGATGGTTTGAGTTATTGTGACTCTGAAGGAATAAATATGCAGGAACTGAACATGGAAACCTCTCGCTTCAGGGATGAACTATGGCAT GGAATTCGAGATCTTAGTAGGAAGACAGATTTGATTATACTTGTTCATAACCTATCTCATAGCATACCTCGATATGGCGACTCAAATGGTTCTCAACAAA AGCCAGTCCTTTCACTTTTCTTGGATGAAGCTAAATCTCTTGGAATTCCTTGGGTTCTCGCAATAACGAACAAATTTTCAGTTAGTGCACACCATCAAAA CACAGCAATCGAAGCTGTCCTGAAAGCTTATCAAGCATCTCCCAGCTCAACCGAGGTTATAAATTCCTGTCCATATGTTATGCCTGGTTTTGCTGGGGCT ACTCAGTCATGGGATTCAACCAATGAAGATTCTTCTTATGCAAGGATGGGTGCTCAAAGGCTTTTATTGGCTCCTATTAACTTTGTTACAAGGCCTTTCC ATAAAAAGGAGATTATTCTTCCAGTAGAAGGTGTCAACTCTCTTTGTCAACAAATTCACCGTGTCCTTCGCAGTCAAGAGGAGTCTTCATTTCAGGAACT TACCAAAGATAGACTAATGATCGAGTTAGCGCGAGAACAAGCAATGTCAATCGATGCGAGTAAAGACGCCCAAGCTAAGGCAGTTTCGTTGAATTCTGCT GCTGTGGGTGCATCTGTTGGGGCTGGTCTTGGCATTGTCATGGCCATTGTAATGGGAGCAGCATCTGCCCTGAGGAAGCCCTAAGGATCCAATTCCTTTC TTATATTATTCGGGTCTGCTTGTAAGTTGAGTTTTGGAAGAGAAGAAAAAGAAGACGGAAACTTCAGAACCATGTCACAGATATATTTCATGGTTTCCAA CTTTCTCTCCCTTCTATTACCTTCCAAAAACCAACTCACGAAAAGACCTTTAGATTTGGGATTGTTTCTACCCTGTGCTGGAATATTCATTTTTGTAGAT AGAAGATTGGAGGAAGTTATCTGAGGGAAAAAAGTTGTTTTGCACTCATTAATTTATTGATTCAATTATTATTGGTCCTTAAAGTCCTATGTCTCAGGCA TTGTCATGCTTGATAGAAATGAAATTGATAGATAGTTGTTTTTGGTCCTAATGGCAGCTGGAAAAATCAGTTAGGGTTTGTAATTTGTTTGTGAGTCGAG TTTTGGAGTGAAATGAATGGAAATGGAAGATTTTGAACTCATTTCACAAGTGTATTTTATGGCTCTTAGGTCTTTTCTTTTCCTTCATTTTCCTTCAAAA CTCAATCCGCTAACAGATTCTAAGTG BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_152369; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_476937
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019465337.1) |
Pfam | ABC transporter (PF00005.26) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |