Ll_transcript_476623

• Id Trinity: TRINITY_DN47436_c5_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_476623
• Sequence: TAAGAATAAAATGATGTTTGCTACTGTGGAGAAAAAGTAAATATTTTCTTATTTCATAAGGAGTTATAATAAATTATAAAATAACACGTAGGAAGTTTTA TTGTACATGCTCTAAGTAAGTGTTGTGGTATATGGTATTTGGGTGGTGGAGGAAAAGACATGTGGAATGGTTAATCTGAGTGATATATCCAAAATCCAAT CCAATCCTAGGAGATATATGTATTATTATGTATGATGTAATGAAGGAGTGAGTTTGGAAATAATGCCCCTCTTCTCTGCAACTCTTGGCTTTTGTTCCAC TTCATTCTTCTTCCATTCTTCTACTCCTTCCACTTTCCCAAAATGCCCTTACAACTGTTCTGTCTCCAATTCTATCAATAATACAGATTCTGGAATCCTT CATCGCCCTCTTGTTACTCCTCTTGACCCCGACCACCTTGCTATTCGTCAGGCTCGGGTCTCTCTCTCTCTTTCTTTCTTGAATTGAATTGAATTATAAT AGCTATTTAATTGAATTATAATAATTATAATACTTATTTTGAATGAAGTAGAGATCATCAGATTGGAAGGCTGCAAATGCATATAAAGAGAGTTCAATAA TATACAATGGAAGGGTAGAAGAGTATAACACTGGAGGCTTATTGATTCGCTTTTTTACCATTTTGGGTTTCCTTCCTTTTCCTCAGTTCAGCCCATCCCA TGCTTCTAAAGAACCTCACAAAAGCATCCAAGACATTGCAAAAGCTTTGGTTGGTTCTATCTTATCCGTCAAGGTAATTGTGGCTGACGAGGATAACAGG AAATTGATCTTCTCTGAAAAGGAAGCTGCCTGGTCTAAATTCTCTGGACGGGTCAAGGTTGGAGACATTTTTGAAGCAAGAGTTGGCTCTGTTGAGGATT ATGGTGCTTTTGTTCATTTGCGCTTCCCCGATGGTCTTTATCGCCTTACTGGACTAGTACACATCTCAGAAGTGTCATGGGATCTAGTTCATGATGTAAG AGACATCTTAACAGAAGGTGATAAATTGAGGGTTAAAGTTATCAATGTTGATAGAGAAAAATCAAGGATTAAACTGTCAATTAAACAGTTAGAAGAAGAT CCACTTCTAGAAACTCTGGACAAAGTAATACCTCAGGATGATTCAGCATATTCTGATTCTTTGAGCGATGATGATAGCAGTGTTATTGAGCCTCTTCCAG GACTTGAGACAATCCTTGAAGAGCTACATAAGGAAGATGGTATATTTGATGCAAGAATCAGTCGTCAAGGGTTTGAAAAACGTGTTGTCTCACCAGACTT GCAGCTTTGGCTTTCCAATGCACCTCCTTCAAACCAAAGGTTTACTCTCCTTGCTAGAGCTGGAAGACAGGTGCAGGAGATCCACTTAACTACATCCCTT GATCAAGAAGGTATCAAAAGGGCATTACAAAGAGTATTGGAGCGTGTCCCCTGAATCTCACTCAGGAACAGTTCTTCCAGCTCCATAATATCTCAATGAT TTTGTACAGTTATCACACATTTAAAGTTCAGATATGACCCTGCATATTCCATTACATCAAATCATCGTGATTTAACTCTAAAAAAAAGTCCTTATAAGAA CACTCCATCAAATAACATTTGCTTGAATTCATTCATTCAAAACAAGTACTATTTTGAATAGATAATGAAGAATCAGCAACACAGGAAACATAAAAACTTA TTACATATTGTCCTGAAATGGGTGTTCCCTATCATGTCATATTCATAGATGATATTATTTTCCCTTTAGGATTCGTAATTGTTCATTCAAGCAAGTGTCG TTTTCAGGAATTAAATCATTGATCTTTTGGTTTTTTTGGGGTTTTACATGATTAGATTAATATTTTGTTAGTATATATATATAGATGATATTATCATTGA TTAACTTATTAAATAGTTCTTCAATTAATGCATCTTTCATTAGATGATGCACCATAGTTATTGAATGAATGAGGATCATTGATTTGGATAAACTTTTAAA TCAATGATTAGATTAGTATAGGTTATTCGATAGGCATGTTGAATGTTGTTTATATGGAATTAAGAAGTTTTAATATTCCTGTTTCTTTTTTTATAGCACC ATTTTGGATAATTTTATACTAATTAAGAGTTGTAAAAATATGTTTTAAATTTGTAAATGATTGTACCTAGTTTACAAAATTGTCATTATTTTTTTAAGTG TGATGCTTGAAAAAATAAACCTATTTCAATAATCTCTTTTCAGTGTTGTGATATGATTGAATAACAGTGTTCATTAATCATGATGAATTGGGTCCAATAT TAGTTTGATAGAAACTAGTACTTATTTTTCTTCCTTTTTGTAAAGTGCATCATGTGGCATATGAAAAAAGGTTTGTGGCCAAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152583;
• Additional information: -

Expression of Ll_transcript_476623

FPKM

• PAB: 1.9
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.2
• PS2: 0.3
• PS3: 0.5
• PW1: 0.4
• PW2: 0.8
• PW3: 0.7

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_476623

• Blastp: -
• Blastx: 30S ribosomal protein S1, chloroplastic from Spinacia with 27.22% of identity
• Eggnog: -
• Kegg: -
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019438287.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;