Ll_transcript_475466

• Id Trinity: TRINITY_DN47448_c1_g1_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_475466
• Sequence: CAGTCTTGTTGTTTTATAACACAAGTTTTTATTTTTGATTTTGAAAAAAATTGTCAGAATTGGCGAGTGGCGAAGTCTTCTTCACTCTGTTTGTTCTCTT CGCTGTTCCATTTCTGTGACTTCATCCATGGCTCCTTCGATGAGGATCATTTTCGGACTCCTCACTTTTGTCACCATCGGAATGATCATTGGTGCTCTTT CACAACTTGCATTCATACGAAAATTGGAAGATTCTTATGGCACCGAGACTCTGCCATTTAGAAGATTGCGTGGACTTGAGAGTAATGGATACATTCAGTT CCCTAGAGGTATTAATATCTGGAATAACGACAAGGAAGCAGAAATCTTACGCCTTGGATATGTCAAACCTGAAGTGCTTAGCTGGTCTCCACGGATTATT TTACTGCATAACTTCCTGAGCATAGAGGAATGTGATTATCTCAGGGCTATAGCCCTCCCTCGCCTGAAAATTTCAACTGTGGTGGATACAAAAACTGGAA AGGGAGTTAAAAGTGATGTCAGGACAAGCTCTGGTATGTTTTTGTCTGTTGCAGAGAGAAAATATGCAATGGTACAGGTAAGTTATCAGGTTTATTTTTC CCCAAGTCTTTTGTCTCCCATCTTTGTTGTCAAGCCTGTTCTAAAGTGGTCTTTGTCTGATACACACTAAAACTCTGTTAACATATGACTTTACTGAAAA TTATGGGATAGAATTCAATGAGTCCAACGGAGCTCAGCTCCTTGCAACAGAGGTATGCATCTGAAAATATAGATAAAACTGCAACACGGACCACAGGGAA ACAGTAAACAACTGAGAGAAAAAGAAATTCTGGAATGGTCACTAGAGATAGAGAGCTCTCCTCCCACAGGTCAAGGCTTTCCCATTCTAATTCTAAATTC TTCAGATACTCTGTCCCCTTCCAGCTCCTCCCATATATCATTCCCCCATCAATGCACTCATGATTCTCCATTTCTGTGCCCCGATTCCCCTATAGTATGT TACTCATTTTCCCCTCCTCTCCATCTGACTCCCTTTATCATATTCAACTCTTTGTCCCTAACTTCTCCTTCTCTCATATACCAATAAGGCCTTTACTGTT ATTAGGCCATCTTTTAGCTTCTCTCCTGTCCTTCTATACACATAGGTAAGTGGCCCATCAGCATAGAGCCAGACCAGCTCCTGCACTCCTTCCGGACCCT TGTTCGGTGGTTATGAGTGACCACTTTTGTTTTTAAACTCTGTTTAAGTTTCACACATAGGGTTTGAATGCTTCTCAATCATGAATAGGGCACTGTTCAC AGTTAATTCATAAATCTGATCATCTACAAATGGAAAGCATTACAATTGAATTAACCATTTTATCCTACAAGAACTAGCAATTGAGTCCTAGTTCTACAAC GATTGAGATCCAACAATTCCATAAACAAAACTTGGGAGTTAGAAGAAAGCTCAATAATACATTGGTGCAAACCAAAATTCAGTAAATGTGATTCAGTAAC CTTGTTGAGTTAGGGTAAATAGCAACTTATTAAGGCTAGTAACCCTAAATAGTAATCTTGTCAGATAAAACAGCAAGCCCAAGGTAAAATGTCTGCCTTT GGACCTTTGGATGCTCCATTCAACATTTCACATTTTTTATTTTTTTAATTCTTATACTAACACAGATGGAAATAGTACAATAATTAGACAAAAATAGTAC TTATTACATCCATTTAACCAATGATAACTTATAAAACATTGCTTTTGTCTTTTAATTTGAGGTTTTTATTTTATATGTTGTTTTCGTGTCTTATAATTTT TAAAACTTGTCGTAACCTCGTGCCACTATTGTGTCATATCCATGTCCCAAAATAAAACTAAAGCAAAACACCTTAGATGATTTGATAGCAACATGTATGC TTTGACTCGAGTGGGACCTTGATCGATTAGTAATATTGAATTTATTTTTGTATATTCTTTTATGCTCCTTCGTCCTTTTATAAAATTGTTTTTCTTATGT ATAAATGTAGGAAGAGTACAAAAAACATATTTTATTGGCGATCATTAAGTGTACACTCTGCTAAAAACATGCTCACCTTTGTTAACTAGGCAATTGAAAA AAGAATTTCTGTCTATGCTCAAGTACCAATTGAAAATGGAGAGCTTATACAAATCTTGAGGTGAGGATATGACTTGTTTTCTTTACATTATATCTGAACA AGAAAGACGGGTTTTGCTAGTTTCAAGCGTAACATCTGCAGCAGCACAGGTATGAGAAGAATCAATTTTACAAACCTCATCATGACTATTTTTCTGATAC TGTAAGTTGTACCCCTCTCTTTGCAATTTTTACTGTTATACTAAGCATAAGAATTGGTTGAAGTGGCTCCTTTGCAACCCTTTGTGCCTTCTTTTCTGGT ACAGTTCAACTTGAAGCGTGGTGGGCAGCGAGTAGCTACAATGCTTATATATTTAACTGACAATGTTGAGGGTGGAGAAACATATTTCCCCATGGCTGGT TCTGGTGATTGTAGCTGTGGTGGGAAAATTTTCAAAGGTCTATCTGTGAAACCAACTAAAGGAAATGCAGTGCTTTTCTGGAGTATGGGACTGAATGGAG CGTCAGATCCGAGAAGCGTGCATGGGTCATGTGAGGTACTCTCTGGGGAGAAGTGGTCAGCTACAAAGTGGATGAGGGAGGGAGTTCACAATTGATTTAA GATCTAACCATATCCCCAACCTAAAGTATAAATTTTCGCCTCAGATTTGTCCTTATAAATATATAGTCATGATTATGAATAGTTATTGGTAATATTTGGT AGCAGTAACCTTTAATCAATAAACTATTATAATTTGATAGCTATTGCCATGGTTTTATCTAAGTATAAGTATATATGTATATATGTATGTTCGTGTGTAT GAGAAAGAGGTTTGCTAACATGGGTTACCTTGTTTTTAGTTAGGAATATGTTAACAGGGTACCATAAAAGTTGAACAACCTTTAATGTTATGTTGAAATG GGTAACAGGGATATTGTAGTAAATTGCTATTTTGAAAATTAAAAATAAAATTTTAT
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152704;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_475466

FPKM

• PAB: 1.2
• PNAB: 0.8
• PS1: 0.8
• PS2: 1.2
• PS3: 2
• PW1: 0.5
• PW2: 0.9
• PW3: 0.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_475466

• Blastp: Prolyl 4-hydroxylase 1 from Arabidopsis with 65.56% of identity
• Blastx: Prolyl 4-hydroxylase 1 from Arabidopsis with 65.56% of identity
• Eggnog: prolyl 4-hydroxylase(ENOG410XS5J)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT2G43080)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019452515.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;