Ll_transcript_476204

• Id Trinity: TRINITY_DN47457_c1_g1_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_476204
• Sequence: TATTAACCAGTTTTTCACCGGTGAGAGAATTTAATACACCAAATCTTTAACCCAAATAAAGGGAATTGATCACAACCTGCAACCTCCCCAGTCCCTTATT TTTATACTCAAATCATGCATTTCTTCCTGCACCAACCCCATTCGTCATAACAGAGATCAGTTGTCCCAAAAAACTATGTATCTTTGTCTCTATCCAATCA AGTTACCCTAAATAATATAATTATGCTTTTATGACTTTTCTATTTAATTAAATGACTCATTTTAATCGGTCTGGAACACCAAGAGGAGGAGGAGGACATA GATCTCCATTCATTGGCCCCCCCCTATACCTTCCCTCTCTTTCATCCCCACATATTATACCTCACTAGCTGCACTATTTTTTTTCATGCCCCAAACTACA CATGTATATATATAGCCTCATACATATAATCTTAATTCAGGCTATTATTATCCCAGTTTCTCAGAAAGGAAAGCTTTTCTGGTTTGAAGACAACCTGGTT TTTGAAGATTTGTGTGTGTTTGCTAGAACATAGTAAATAGTCATTGAATATGGCTGGTATCTTGTCTTTGGTAACAGGGAAGGCAGGGCCGAGTGGATTT GGATCAGCCTCAACTGCAGAACATGTTACTGATGGAATTGATGCCAGCAACCTCACTGCAATTATCACAGGAGGAGCAAGTGGCATTGGGTTAGAGACAG CACGGGTTCTGTGTCTTAGAAAAGCGCATGTCATTATAGCTGTGAGAAACATGGACTCTGCAAAGGAAGCTAAAAAGCTTATACTACAAGAAAATGAGTC TGCAAAAGTGGATATAATGAAGCTTGACCTATGTTCATTGAAGTCTGTTAGATCTTTTGTGGACAAATTCATTGCTCTTGATCTTCCTCTAAACATCTTA ATGTGGTTTCCTTAACATATCTTCATCTAATTCTAAATTTTGAGTTCATTTTATTTGAATTTATCTCGTTACGAACTTCAACTAATGTAGTATTTCTATA TGGTTTCAGAAACAATGCAGGAGTTATGTTCTGCCCTTTCCAGCTTTCACAGGATGGGATTGAGACTCAGTTTGCAACAAATCATCTTGGTCATTTCCAT TTGACAAACCTTCTACTTAACAAAATGAAACAAACTGCAAAAGCCACTGGAATTGAAGGAAGGATCGTAAATTTGTCATCAATTGCACACACCTATACTT ACGAAGAAGGCATTCGATTCGATGCCATTAATGATCAATTTGGTTATTCAGACAAGAAAGCTTATGGACAATCCAAATTAGCCAACATACTGCATGCAAA TGAGCTTTCTCGTCGCTTGAAGGAAGAAGGTGTGAACATCACAGCCAACTCGGTTCACCCAGGAGTGATAATGACACCTCTTATGAGACATTCCTCTTTA CTTATGAGTAAGTCAATTGCCACACAAGAAACAGATATATTTTAGATATTAAAAAAAGTAGTTGAATGTTCTTTTCTATATTTATTTTTCTAACAATCAT ACCATTTCAAGCAGATTTTCTGAAAATGTTTACTTTTTATATATGGAAGAATGTCCCACAGGTATATTCTCTTTCACTTGCTCCTAGCTTTATTATGGAA AAACAACACCCATAAATGATTTCACTCCCACAATTTTTATAAAAAATTTAGGCCCACATAATAAGATTGTATTTGCCTTTATTACTTTTCAAATTCATTG TATTAATTATTCCATTGCACACGTAAATTTCTTTAATATTTTGGGTTTTGCAATATAATGATTTTATTTTATTGTCACTGCATAATTAAGATAAGGGTAT TACATTAAATATATACAAGGTCTAAGGTTTAAATTAAAAAGGTGGTCCAAAAAATAATTATTATTTTTTGACTTAAATCCCACTGAGTAATTATAACTAA ACAAGAAAAGATAATGTATTTTAGTTCTCAACTATTTGTATGACATCCCTTTCTTCAAATTTTATACTCACTCTTATCAAGCATTCACAATTTGTTTGGA TCTTAATTTTTCTCAACTTTGGCATAGAAAATTTAAATAGTTATTTTTTTAATATAATACCTATGCATTATTAGTATAAGGATTTAGCTATATTGTAACT ATCTTTTAAAAGTCAATAATAACAAAACTTAAATGCTCGATAATCAGTGACACTGTACTCATATATTTTCAATACATCTATTTTTCTCAATTTTATATAT TAAGGAATGCCCTCAATTTTGTTTGATAAAATTGAGGGCCCTCACTTTTTTTCTCATGCTAGCACCAGCACAAAGGGTAACTATATTCGAGTACAAAATC ATGCAAAAGTTATTTTCTAATTTTGACCCACAGGGAGCTGCTACCACATGCTATGTTGCTCTCCACCCAAGCTTGAAAGGGGTAACTGGGAAGTATTTTT TGGATTGCAATGAATTTGAAGCAAGTTCATTTGCCAAAGACAAAATCTTAGCAAGTAAACTCTGGGATTTCAGCAACAATTTTATCAAATCACTATCTAA AGCTTGATTGCACCTATTGCTCTGGTGTTTTCCCAAACCACCCTTGTCTTGGTCATTAATTATTAATTGGTGTACCAAAAACTGGTTATGCGTCACTATA GTGATTAATAGTTATATCATATGTGTATGCCCAAACATTTTATTATTCCTAGTTATCATTGTCTTCTTGTCCCCTGTTATTAATTATTTTTCTTGGCAAA ATATCTCTGGGTATGTTTTATTTGCTGAATATATAGAGATCTCTTATGGATCAAACATTCATTTTTCTAAAAATCAAGAG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152761;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_476204

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.1
• PS1: 0
• PS2: 0
• PS3: 0.3
• PW1: 0
• PW2: 0
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_476204

• Blastp: Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic from Arabidopsis with 54.13% of identity
• Blastx: Short-chain dehydrogenase TIC 32, chloroplastic from Pisum with 66.67% of identity
• Eggnog: Dehydrogenase reductase(COG1028)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT4G23430)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019426534.1)
• Pfam: short chain dehydrogenase (PF00106.24)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;