Ll_transcript_477323

• Id Trinity: TRINITY_DN47461_c0_g6_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_477323
• Sequence: TTAACTCGCCGCCGCCGCCCACGGTGGCGCCAGCGGCGATGTTTGGCCATCATGGTCAGTATTTTTCTCAGAGGGGACCCCTTCAGTCCAGTAACACTCC TTCGATTCGTGCTTGGATAGAACCTAATTCCTTTGCTGTGGCGGCAACTGTCGCCGCCGTCTCTCACCCCCATTATCACCATCACTATCTCTCGCCGGCG ATCCACCAGGCTTCTGCCTCCGGATTTGCATCACCGTACGGTGGCTTCTCCGGCTTCCGCATACCAGCACGAATTCAGGGTGAAGAGGAACACGACGGCG TTTCAGACAAGCCGTCCTCTGCTTCCTCTGATTCTCGTCATTGATGGAAACACACAAAAATCTAAACTTTCTTTCTCCTTCAGGTGCTCCCTTCAAAACC CACTTCTTCAATTTTCAACTGTTTTTTATTAATTTTTATTGTGCAAATTTTCCTTTTTTAGGGTTCGCGATTTGCTTCCGATTCATAATGCGATGGATTT TCAGCTACAATTAGAATTCATTCATTGAAGAGTAACGTGAATGAGGAGTTGAGTTTGGATTTCAGATGCTTCCATTTCAATGGCCTAAAATATCGTGGGA ATGAAGAAAATCTGGGGTGAATTTTCAGGTTTTCCAATCGCATGGTTTGTTATGCTTTTTAATCTTATATTCTACCCATGTTTTTCAACCTTTGACTAGG ACTAAGAGTACTGTGTTGTGTTATGTTTGTTTCAGCTATGTTGGGTTTGTTATCTTTTCCATGTTACAATTTGTAGTAGATGTATCTTTGTACTTCCATT TCTGGTTCCTACTAGTGGTGTTTGGAAAAACTCGCAACACAAAATAACAGTGCTGGTTTGTTTAAGTTATCCTATATTTCCTACTTAGTTCAAACCCAAA TGCTGAATGAGGATTTATTTCCATGACTAAACGGGGCAAAACCAAAAAAGCCAAACATGGGAAATTTGCATCTTTGGATGAAAGCATCTTAACTTGTGTA TGCTTTTTGGTTCAAGATGGTTGTTGCTGTCTTTGTTTTAAATGGGGGAAAGAGGATATAGGCCCTTTTTCCCCGTTTGGAAATGCCAAATTGGTCACCA AGTTCTATCAAAGAATTGAAAGAGGGTTGGTTCACTTTGCATAAGAATTGATTGTTTTGTTTTGCTTGTTCCTTTTATTTACTGCTATCTAGTGCAGCCA TCCATCTTTCACTACCCCTTAGCTTCCCCATCCTGGAAAAACAATTGAAATTAAATCCGTAGTTCCATAACATCTATCTCTTTCATGCTTGGATTTTTGG AGATTTTGACCTATGTCATTGTCCATGAACAGTAGAAGCTGTTGACAAAAGAAACAGATAGTGTGAGAATTTATTCCCAGCATGGTAAAAAGGCAATTTC CTACATTCAGTATGGTTTGCTGCTTTTCATTTCTCATGTCATGTTTTTAGTTTTTCCTTAGCTGGTTTAGTAGCTATGATAGTGACTCAAAGGTTGATTA GGAATAAAAAAGTTATCATGATAAAGGAAGGAAAACAACACCAACTCCTCTTTAAATGCATAGTTTAATTCAGAAGAAAACTTCAGCTTCTTGTCTAAAG GCTTCTACCATTAAACTTTGAACTACATTTTACCTTTTAGTACAAAAATATCGAGTTCATTTTTGTTTGTTTTCAACCTTACAACAGTAGCATGATGTAT TGTGTTAAGTAGAATACATCTGCAGGGGAACCATGAAAAGGAAGGGGTGGTTGAGCACATAGAAGCTTAATTATGAAAGAGTTCACATCATGGATACGAA CAAGGATCTGATGTCCCAAATCATGTCTCTACGTCTATGAAAATATGTCATGTTAATTAAAAAATTAAATATTCATTATATTTTCTATTTTTCCTTCACT GTCATTGGTTTGTGATATGGTTTGAGCTATACTCTGGGACAACGGATCCTTGTTCCATGGATGCCACCAAAGTGTAGTACTTGTACATCTGTATGTGGTC CCTAGCCCTATATATCTCTCAGAGCCTCATAAAAATCCTTTGTAATGTCCTGCTGGCAATGCTCTCCAAGGGGATAGTGAAAGTAAATAACAAAAATAGT AGAAAACAACTTGGCCTATATTAAGAGAGTGGCAATTATATTTTGGTTGTAGGTGCTGCTAGTCGGTGGATAAATTAGATTACACCAAGAAGGTTAATGA GGACATCATACAAAAATAATTCAGGGTTACTATGTTAGAGGGTGACAAATATTTAATGAGTGTGATACCACAGAGAGTAGGGTCATTCTATTAAATTATC TACCTGAATTCATCCGTTGATATCATATATAGTTTAATGCTAAAGCAGCTGAATAATGTATCCCAAATCAGAAACCACAGATTCCAACATTGCAACTTGC AATTGGGTGTTTACCTTGCTTTTTTCAAGTTACCTTGAAATGCAGAGACTGTTGTTGTCAAGTTTAGACCATGCAGAAGTTGGAAATTTTTTTTAAATCA AATTACTACAGGAAGATCATAGTAAAAAAGTAAGTGTAATATACCTTAACCTCATGAAGCTTGGCCTCATGTTTTAACTGGTTTTCCAATTTCCTTTGCT TAATCCTGCTTTCTGCCATCATATCTTCAAGCTATTGTTGGAAATGCTGCTCGACTGTTCTTGAGTGTCATGCTTCTCGCGGCGCCCCCCGAGACTCATT ATGTTTTCAGCACTAGATGATTGCTCCTCTTCAGAAGAGTAACAGAAAATTCAGCAGTTCTGAATACACCAAATAATAAGAGTATTCTAGACAAGAAACA GAGAAGAGTATAACCTTTGCTTGTTTTCATTTATCCTCCTTAGATTTCTCCAGGTTCATTATCATCTTAATCTATCTATTGTGAAGCACGGATTCAATTA GTGTCCACATTTTAATCTATCTATTGTGAGCATTACCAAATAATGAGAATCTGCAGTAGCCAGAAAGAATCAAACAAAATAGTATTAAAGATTTATACAC AATTATTGTATCAACC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152819;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_477323

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.7
• PS1: 1.2
• PS2: 0.1
• PS3: 0.5
• PW1: 0.1
• PW2: 0.4
• PW3: 0.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_477323

• Blastp: Transcription factor TCP3 from Arabidopsis with 52.04% of identity
• Blastx: Transcription factor TCP3 from Arabidopsis with 48.15% of identity
• Eggnog: Transcription factor(ENOG410YG88)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G53230)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019413376.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;