Ll_transcript_477330

• Id Trinity: TRINITY_DN47461_c0_g6_i2
• Name Transcript: Ll_transcript_477330
• Sequence: TTAACTCGCCGCCGCCGCCCACGGTGGCGCCAGCGGCGATGTTTGGCCATCATGGTCAGTATTTTTCTCAGAGGGGACCCCTTCAGTCCAGTAACACTCC TTCGATTCGTGCTTGGATAGAACCTAATTCCTTTGCTGTGGCGGCAACTGTCGCCGCCGTCTCTCACCCCCATTATCACCATCACTATCTCTCGCCGGCG ATCCACCAGGCTTCTGCCTCCGGATTTGCATCACCGTACGGTGGCTTCTCCGGCTTCCGCATACCAGCACGAATTCAGGGTGAAGAGGAACACGACGGCG TTTCAGACAAGCCGTCCTCTGCTTCCTCTGATTCTCGTCATTGATGGAAACACACAAAAATCTAAACTTTCTTTCTCCTTCAGGGTTCGCGATTTGCTTC CGATTCATAATGCGATGGATTTTCAGCTACAATTAGAATTCATTCATTGAAGAGTAACGTGAATGAGGAGTTGAGTTTGGATTTCAGATGCTTCCATTTC AATGGCCTAAAATATCGTGGGAATGAAGAAAATCTGGGGTGAATTTTCAGGTTTTCCAATCGCATGGTTTGTTATGCTTTTTAATCTTATATTCTACCCA TGTTTTTCAACCTTTGACTAGGACTAAGAGTACTGTGTTGTGTTATGTTTGTTTCAGCTATGTTGGGTTTGTTATCTTTTCCATGTTACAATTTGTAGTA GATGTATCTTTGTACTTCCATTTCTGGTTCCTACTAGTGGTGTTTGGAAAAACTCGCAACACAAAATAACAGTGCTGGTTTGTTTAAGTTATCCTATATT TCCTACTTAGTTCAAACCCAAATGCTGAATGAGGATTTATTTCCATGACTAAACGGGGCAAAACCAAAAAAGCCAAACATGGGAAATTTGCATCTTTGGA TGAAAGCATCTTAACTTGTGTATGCTTTTTGGTTCAAGATGGTTGTTGCTGTCTTTGTTTTAAATGGGGGAAAGAGGATATAGGCCCTTTTTCCCCGTTT GGAAATGCCAAATTGGTCACCAAGTTCTATCAAAGAATTGAAAGAGGGTTGGTTCACTTTGCATAAGAATTGATTGTTTTGTTTTGCTTGTTCCTTTTAT TTACTGCTATCTAGTGCAGCCATCCATCTTTCACTACCCCTTAGCTTCCCCATCCTGGAAAAACAATTGAAATTAAATCCGTAGTTCCATAACATCTATC TCTTTCATGCTTGGATTTTTGGAGATTTTGACCTATGTCATTGTCCATGAACAGTAGAAGCTGTTGACAAAAGAAACAGATAGTGTGAGAATTTATTCCC AGCATGGTAAAAAGGCAATTTCCTACATTCAGTATGGTTTGCTGCTTTTCATTTCTCATGTCATGTTTTTAGTTTTTCCTTAGCTGGTTTAGTAGCTATG ATAGTGACTCAAAGGTTGATTAGGAATAAAAAAGTTATCATGATAAAGGAAGGAAAACAACACCAACTCCTCTTTAAATGCATAGTTTAATTCAGAAGAA AACTTCAGCTTCTTGTCTAAAGGCTTCTACCATTAAACTTTGAACTACATTTTACCTTTTAGTACAAAAATATCGAGTTCATTTTTGTTTGTTTTCAACC TTACAACAGTAGCATGATGTATTGTGTTAAGTAGAATACATCTGCAGGGGAACCATGAAAAGGAAGGGGTGGTTGAGCACATAGAAGCTTAATTATGAAA GAGTTCACATCATGGATACGAACAAGGATCTGATGTCCCAAATCATGTCTCTACGTCTATGAAAATATGTCATGTTAATTAAAAAATTAAATATTCATTA TATTTTCTATTTTTCCTTCACTGTCATTGGTTTGTGATATGGTTTGAGCTATACTCTGGGACAACGGATCCTTGTTCCATGGATGCCACCAAAGTGTAGT ACTTGTACATCTGTATGTGGTCCCTAGCCCTATATATCTCTCAGAGCCTCATAAAAATCCTTTGTAATGTCCTGCTGGCAATGCTCTCCAAGGGGATAGT GAAAGTAAATAACAAAAATAGTAGAAAACAACTTGGCCTATATTAAGAGAGTGGCAATTATATTTTGGTTGTAGGTGCTGCTAGTCGGTGGATAAATTAG ATTACACCAAGAAGGTTAATGAGGACATCATACAAAAATAATTCAGGGTTACTATGTTAGAGGGTGACAAATATTTAATGAGTGTGATACCACAGAGAGT AGGGTCATTCTATTAAATTATCTACCTGAATTCATCCGTTGATATCATATATAGTTTAATGCTAAAGCAGCTGAATAATGTATCCCAAATCAGAAACCAC AGATTCCAACATTGCAACTTGCAATTGGGTGTTTACCTTGCTTTTTTCAAGTTACCTTGAAATGCAGAGACTGTTGTTGTCAAGTTTAGACCATGCAGAA GTTGGAAATTTTTTTTAAATCAAATTACTACAGGAAGATCATAGTAAAAAAGTAAGTGTAATATACCTTAACCTCATGAAGCTTGGCCTCATGTTTTAAC TGGTTTTCCAATTTCCTTTGCTTAATCCTGCTTTCTGCCATCATATCTTCAAGCTATTGTTGGAAATGCTGCTCGACTGTTCTTGAGTGTCATGCTTCTC GCGGCGCCCCCCGAGACTCATTATGTTTTCAGCACTAGATGATTGCTCCTCTTCAGAAGAGTAACAGAAAATTCAGCAGTTCTGAATACACCAAATAATA AGAGTATTCTAGACAAGAAACAGAGAAGAGTATAACCTTTGCTTGTTTTCATTTATCCTCCTTAGATTTCTCCAGGTTCATTATCATCTTAATCTATCTA TTGTGAAGCACGGATTCAATTAGTGTCCACATTTTAATCTATCTATTGTGAGCATTACCAAATAATGAGAATCTGCAGTAGCCAGAAAGAATCAAACAAA ATAGTATTAAAGATTTATACACAATTATTGTATCAACC
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152819;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_477330

FPKM

• PAB: 3.3
• PNAB: 7.6
• PS1: 12.6
• PS2: 1.7
• PS3: 2.2
• PW1: 1.8
• PW2: 2.1
• PW3: 2

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_477330

• Blastp: Transcription factor TCP3 from Arabidopsis with 52.04% of identity
• Blastx: Transcription factor TCP3 from Arabidopsis with 48.15% of identity
• Eggnog: Transcription factor(ENOG410YG88)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G53230)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019413376.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;