| Id Trinity | TRINITY_DN47478_c5_g1_i7 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_476972 |
| Sequence | CGGCGGAAAGGAAAGTTTAGTGTTCATCCTAATCATTTAATCAACCACCTTCGAACTTAACCCCTCTCCTCCCAAAGGGTATGCATATAATATTTCTTTG TTAGATAATGTTTTATTCAAATAATAATTCTTGGTCGGCACATGTAACTTTCAACCTGTGCCACATATTCAATTTAATTTATAGGTCATTTTTTTATTCT GGATTTCAGAGGTTGTAGCTTTCCATGTTTTTTTCCTTTTATGATTATACGTTAGTATACGAGTTTCTCTTTGATCCGTGCTTTGTTTAGAAAACTGGGG TTGGTAAATCACCTAATATGGGTTTATCTAGTGCGATATTTGTCCCTGAGTTGTTTTTTATTTTCACTGTTTATTGCGTTTTTTCTTTTCATCTTTTGTT TTCAGGCGAAACAGATATTTGTGTTTCCGTATCTAGTTGCAAACTGTTAACAATTGGTTTCAATGTTTGAGCTGATGAATGAGATTGATTATTTTGCTTG ATCATGAGGACCATAACGAGTCGCTTTAGTCTTCTCTTTACACTATTTAGGTAAGCATCTGCATCTGAACTATGGGAGTCATCGGTTTTTAGTTATAAAG GAAGTCTTCTTTATGCTGGTTTTCTATAGCTAACCAAGTACTTCTTAGAAAATAAGCTGAGGATTAGGTGCTTCAAATTGCGGATCACATCACGTGATCA GACGACCACAATATTGTGTTTGCGATGACTGCAATCGCATCAAAATGTTATTGTGGTGTGATACCAATTCACAATGATTTGGCCGCACTGGGCCACAACA TAACCGCACCGGACTGCATTTTGGCTGCATCGGGCCCGATCAAATTGAAAAATGTGTTTTTAATCATAAAATAATTCATACCCCGTAATCCGCATCGCAA CAGTCACAATCGTGATCGCCACAACTGTGACTGCAATTGTGACCACAACCGCGACTTAAAACATGGCTGAGGATATTGTCTTCGTATGCTTTATAATTGA TCTTCATAAAGGTTTGTTTTGACTACTGATAGTTTCATCTTGACTGCAATTTGAGCCACAACAGTTGCAAGTTTTATAATTGCAAAGGCACCACAACTAT AATTTAAAACCATAAATCTACTAACAAACTGATGCAGTGATAAGTTAGTTTGATATCATCAATAGGCAAATGTTCCCGTCAGCATTTATCGATGTTCTTT TTGGATGCCTGGATTTTATATTCCCTATCAGACTGCTTTTAATTCAATTGATCAGCCTTTTGTCTTCAGTTTTAGTTGTGGAACGGCAAGTTATCATGAA CAGCAGGTTTTGGCTGGTATATCAATTCGCTTTTCTTGTTAGCTTGTGTGTTAGTCCAGAATCCTTGAAGGGGAGAGAGTGGATGTAAAAGATTTATTTT CATTTAATTTTAAAAGAATGTTGTCCTCTACTCCTATATGTGGGTATGTTTTTGAACCATCCTTCTTGTTAGTGACAGACCCATGAATGTTTAGGTAGTA GGGGCAAAGGCAATATACAAGTAGAAATATATAGGAGTGAAAATGACAAATGGCTTTCATGTGTAGTAAATAATTCCGATGTTGAGTGGGTGTGTGTCCC CAACATTACTACTTTGGGTCCGTCCCTGCTTCATATGCATTTTAGGGACAGAAGGCATGCCATATCCTTATGATTTACTGAAATGAAGTCGGGCTAGAAT GAGAATAATTGGTTAACAACTTATGACTTAGTGAAGTAATGACGCTGTTCTGACTTATTGCCGTTGTTACTGTTTCAGGCTAAATCATCCTTCACACTCA TTATTACTGTGTTCAGAAAAATAGGCTTGCCCTTCCTTCTTCAAAGAGGTCAATTTCATGGATGACAGTCCTCCAAGATTAAAGATTATTCCTGATCATT TTCAAGTTCCAGCATCAAGTATTGAATCTCCTGAGAACAAAACACCAACTATTACAGAACCTGGAACTGATCAATCTTCAAGTTCAAGGTTATGTAGGTC CTCCTTCCATTTGAGGACTCGGAGAAAATTAAGGAAGGCTTTCATGTTGAACTTGTTTACTCTCCGTGGGCTGCCGTGGGGGACTAGTACTGAAGGTTGA GCTAACAGCTGCAGAAGTAGAGTCACTTCAATCAGAAGTTGCTGATATAGAGGAGAGGGAAGCTCACTTGAAAGCTCAGTGAGTGAATTTGCAGTTTACT TAAAGTTACCATGCTTCTTGTGTTTGTCTAGCTCTCAGTGTACTAAAGTCAGCAATAAAAGAAACTAAGTTAGTAGTATGCATGCTAGCATTAGATTGGA AAACATGTGGGGAACTCTTGTTTGCCTTAAGAGACACCAATGTGTTTTCAGTAAATGACAATTGTTTTTCACACAGGTTGGAACACATTGATGAAGTTTT GCGATCAGCTCGTTTATCTGGCTATCTATCCATTCGAACTGTACTGACAGTCTAGCCCCTAAGTTTTGTTGCATTGGTCTGTGCCTCATTATTTTATTTA CCTGACACGTTTAACACTAATTTTCTTTTATCTTTCTCTTAGAGATGGGCCACACTACCAGGAGAACCTCCACCAATAGATGATATTGAAGTAGATGATT GGGTTCCTCGCTTTGTTGTTCTCCATGGAGCATGTATGTTCTTATATTTCTTGTGTACAGGTAATGTAGTTAGCTATGTTTCATATCTCTTCCTCCATTT ATTTTTCTTTTCCTACCAAGCTTAGATTGAATTTAAACTGTTGTAATATTCTTGTATTCAACAATAGAGCTAATCTGTGTTATGTGTTTCGTTCTTCTTG CACGCCTCTATTCATTGAATGTCTACTGACATGTCAGCAAACTGCTGAAGTTGTATTCTCCATTTTTATGAACCTGTACTTGTATTTGTTACAAAATGTT AATACTAGTGCTTGAATGCATTTAAGAAAATTAAATGACATGATGAAGATAAATAATTTTATGTTCTACATTCTACTAGTTGTACCTGATGTAAGCCACA AGAGGTTTTACTAAACATCTTCACACACATATATACTAACGAGTAACTCAATGCATGTTTGGATTGAGGGGGTGGAATGGGAATGAGGCAATCTCATTCG CATTCCCAAGGGAGTAAGTTTTCCTTCATTTTTAGCAATAGGTGTAAAAAAATAATACTTGGCCAATCCATTTGGCCTCATTTCTTGAACTCCAAAATAA ATTCAAGCCAATTTGTGTTTTTCAGCCCAAATTAGGCCTAGCCAAATCTATTTAACTTCAAAATTCAAGGAAAAAAATTATAGATTGAACTTTTGTTGGG ATCAGTTTTAGTATACCAGGCATAGAAGTGGAATGAAGTCATCTTTTCATTCATATCGATACTAAAGCAAACATAAGAATGAACAATTAAGCATCCATTC ATGACATTAGTTTTCTTTATGCATGACCAAATTTTTCCGTAGATAAATTGCATTTGTACCTTCTTCAATGTGGGTGAGTGAGACATGAAAGTATGAAACC TCCTAATCATCACAGACTTGTGCAACCTTTCAATTACTTTTTTAAATATATTCCTTGGATTATTGAAACATCACTTCTCTCTATTGACTAATTCTTTTTC CAATACTTGCTGTATGTTTGTGATTTGCTTTGAATCTAGCAAATCAACAGCTCATACTGAAACTTCATTAACCATAATGTTAAAGATTACTAGAGTGTTT GTTTGAAATTCTTCAGTGTGCCCTTTATGTCAAATCTTAAACAAAGCACATCCGAGCAACAAAGAACCTAACTCTTGATATCTTGGTTGAGGAGGCATCA TATCATGTTAAGAACTAATACTCCCACTCCCAAATTAAGCTATTTGGAAAATGCCTAAGTTTGTTCTATATTAATATCTTTAAAATTTTAAACTAAATTT TCACGTTTGGTTCAATCATATATATTTAATCTCAAGCTTTAGACGATGTGTTACATCTTCAAGGCATCTGTTATGAATGAGAACAATACTAATGACATAC AAAATAAAATAACAGAAAGAATGACAGATGGCACTACAGAAAATGATCAAGGACATGTGGCAATTGATCCTAAAATTGTGGAATTGAGGAGAAGCACAAG AGAAAGGAAACATAACAGAAAATATTCCCATGAATAGCATAAAAGAGAAAATCACCCATCAGATGGGGTGTGGAATATTTTAAGAACAATCCTCTTCTTT CCTCACTACTGTTTTCTGCTCACTGCTATTACCTACTCTGTACTGTTTTCTATTTCCTCCAAATGGTTATCAACCATACTTGTTAAATGTTCCAGTGGTG GATTCCTAAATTGTACTCACTCTTTACACAGTTTAGTGAATTATTTTCTGAATCTTGCTTGTGTACTTTTCTTTATTTTCACACACTGTTACAGCATCAT TGCATCAATGCTTGTTTACTGATAAAAAGGGTAAAGAAATTGCAGATTTAAGCCCTCAGGACTCAACACTTCTATCTGATATTGTTGAAGTTGGGAGATT ACCAAATATTAAGCGTGAAGAACATGAGATTCAATATGCCTTTTATATTTTAACTCGGCATGGATTACGATATGAGTGCTCAAGCAATTCTAAGATACAG GTGGATGCTTGGTTGTCAGCTTTGAAAACTGACTGCAAACTGGAATCTGATAAATCAGTTCCCAACGGTTCGATTGAGAAGTAACATAACTTACGCCCCG TTTGGTGAGTTTAAGTGGCTCCATATCTAAGCTACCTTGTAAATATGTCCCTAGTATTACGAAATGTTGTCAGTAATTGAATAAAGACTAATGATATATG TTACTTTTGGCTCATTCCAGAACTAGTTTGATCCATTAGGTTTTAAACCTTAAATTTTGGTGATATATAGCCTTTGTGTAAATTAGATTTGGGATCAAAC TGTTATGCTTAAAATCTGAGGGCTCATTCCTAAATAATGAATATTGTTGGCCTTAATTAAATTCAAT BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_152973; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_476972
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | - |
| Eggnog | - |
| Kegg | - |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019421637.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | - |