Ll_transcript_476648

• Id Trinity: TRINITY_DN47480_c0_g1_i8
• Name Transcript: Ll_transcript_476648
• Sequence: AAAAAATGGTGGTGGTGTGAGAAAGGCTCTACTTAGATTATATGGTGATGGTGTTGAGATATTGTTCAATAGAGAAGAAGAGATTAGGATATTTGAATGT ATTTCAAAGCATGGTCAGGGACCACGCCTTCTTGCTCGTTTCACCTCTGGTCGAGTTGAGGAGTTTCTTCATGCTAGAGTATGTCATTTTCTTCTTCTTC TTTTCTGTTTCTTATTTATTCGAACTATTGGATTTCTAACGAATCGATTACTAGGATAAAAAGTAAGTCTTTTAAACTCACTATTCGAGTAACTTGATCA CTCCCTTTATTTATTTAATTTTTCTATCAATAAGTTATTGGTGTAGCAGCAAAAAGTATTGCATGTTTGATTCCATATACATTAACAACTTAACTCAAGA ATAGTGTTATATTATGGTTTTCTTAACATGATGACGAGAAATTAAAAATGGAGATAAAACATCAAAATTTTATTAAAAAGCTAAGAAGTAAAGCATTGAA GAAGCTATAATTTTTTTTATTTTATTCCTTTTTTATCCTCTTATCCTTACTCTTAATAAGAAAGTTGGCAATAACTAGAAGGGGCCAATTTGAGAACGTT TATAATAATGACCGGTGTCATAGAAAAAGTATATGTAAAAGTATTTTACATTATTATTTATTGTATCACTATTTATTTTCAATTATTGTTAATTGAAAAA AATGTAATTCAAATAAAAGATGAATAATACACTGGTAAATTTTTATATCATACATATTACAATCATGTCAGAAAGTACAAACTCTGTGTATGTTTATTTT TAGCCTTTAGTGCCAAAATCAGATTTGGTATTTGGTAAGACAAGTAAAGCGTTTGACTGTGCACAAAACATTTAGGAACTATAAGGTTAGCTCAATCGAA GTTTTAATAATTTATGTAAAAAAATTACATTATCACTGGGAAAGTTTGTCTTTATATAAAGTTATTGTCTATGTTTAATTTTTTTAATGATATGTGAATA TATGGAATGGATAGATAAAAAAGACCGTTTACGTCTGATTGTGATAAAATTAAGTTCATAAAAATGGCTACAATGATTATTGGAATTGAAGTTTGAGCTA GGGAGAATATATGCTCAATTTGAAAGTTAATTAGAATTTTCTTCTCTTAATTACTTTATTATTATATAGTCAAGGTATTTTCTTCATTCTTGATGCTCCC TTTTTCTTACTTTATTCCCTTCATACTTTGGAGCAATGGAGGGTTAACATTTCTTGTTAGTTATTTTTATTCTTTGGTCTTCTTGTTGTTTATAATTAAT TGATTAGGAAAAATCTTTAAGATATTCAACTGAATGGTGTTGAGTCATTGGAATAAGATCAGGTGCAAAGTGTTTCTTTTTAGCACCTTTTCCCAGTAAT GATATTTCTTCTGTTATTAATAAAGAAATTCAATGGTTTGAATTAATAAATAGATCTTAAACCATTAGATTTTCAAAAAAATGATAGCTAAGATAAAGAG TAATTCTTTTAGATCTAATATTCGAATAACTTGATCTCAACCCTAAAATAAATTGCATGAGTCCTAGAAAAGCAAAGATGATGAATTAGATAAACAATTT TATTTACATTCACATTATGATGATTTTTTTCTTGTCCATTGTAGACTCTATCAGCAGTTGACCTTCGTGACCCAGAAATATCTGCATTGATAGCTTCTAA GATGAGAGAGTTCCATAGACTTAACATGCCTGGTCCAAAAAAGGTTCAGCTGTGGCAGAGAATGAGGTAACTATAGATTATTAAGTCAATGTTAGAAACA TTTTTATTGATATGCAAAATATTAAATGCTCTCACAATGTTGTTTTACTAGGAATTGGCTTAGTGAATCAAAAACTATATGCTTCCCAAAGGATATAAAA AATTTCGGGTTGGAGAACCTAGATGAGGAAATAAATATGCTGGAGAAGTTGTTATCTGAAGGATATGAAGATATTGGCTTTTGTCACAATGACCTACAAT ATGGTAACATAATGATGGATGAAGAGACAAGATCAATAACTCTTATTGTAAGTGGTTTTTCTATAGTGTGGATTGTGGTTATATATTCTTTGCCTTGTGG TTGCATCTTTTTAATTTGTATGGCAAATGATACAGGACTATGAATATGCCAGTTACAATCCTCTTGCATATGACCTTGCAAATCATTTCTGTGAAATGGT GGCTGATTATCACAGTGACACACCTCACATTCTTGACTACACTAAATATCCTGGTAAGGGTTTTTCGATTCCAGTGACTATTGTGTTTTTTATTTTACTT TATGTCTATTGAGACCACTCTGCATTGCTAACATACAAATTTGTATTATGGTATACCAGAACTTGAGGAGCGTCAAAGGTTTATCCGTATCTATCTCACT TCTGAAGGTTAGACCACTGACCTATTATGATGTCAAAATCGTGTTATAAAAGTTGAAATCATACCATAAAATATAACACATCTTAACTTACTAAATGTTC TCTTCTTTTTTTTGTCAATTCGTTGTACACAGGCAAGAAACCCAGCAATGCTAGAGTGGAACAGTTAGTGAATGCTGCAGAGAAGTACACTCTTGCAAAC CACCTATTTTGGGGCTTGTGGGGACTTATTTCTGTAAGTTAATTTCAATTTTCCATGGTTATTCAAACATGGTTACTTGTGTCAGAAGAACTCTAAGAAA GCTTATGTTCTTGTAAGGGAAATGTTGATGATGTTTTGAATGCAAATGCAGAGTTATGTCAATAAAATAGACTTCGACTACAAGGAGTATGCAAAGCAGA GATTTCAACAGTACTGGATAAGGAAGCCTACTTTATTGAACTCACCAAGCATAGTTTCCCAAGATGATGAAATTGTGAATGATTCTCTGCCATCCTTCAA GTGATTGCTGCTGGTCATGTCTTAGTGAAGTTCAGCTTAGTATATGTATTTCTAATTTATAATAACGTCTAAATGTGTGCATGATGATATGCAGCATCAA TCATGTTTGTAAATAATATAATCATCAACAATGTGTGATGAGATTTTGGCAAGTTTTTCTAAAACTTGCTTATCAACCTCTCTCTTGCAGCCATTTGACT AAACTTGCCTATCATATAGCATTCTCTTACATTTTCTCCCTCTTCATCAGTCTCAAACTAATGGTTAATCAGCATATGATATAGTAGTTTAAAAGGAAAG GCTGGAAGAAAAGAAAAGAAAAGAAATGATGTTCCAGAATAAAAACCATTTTGGAAAAAATTCACTGAGATGATTTGTATCTAATACCTTTGTTTATAAC TTTTACTGTTTTCTGACTGCACCCTCTCCACCAACTTGACTCATA
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_152982;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_476648

FPKM

• PAB: 3.2
• PNAB: 0.2
• PS1: 1.9
• PS2: 0
• PS3: 0
• PW1: 6.2
• PW2: 6.3
• PW3: 1.8

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_476648

• Blastp: Probable choline kinase 2 from Arabidopsis with 60.61% of identity
• Blastx: Probable choline kinase 3 from Arabidopsis with 83.72% of identity
• Eggnog: Ethanolamine kinase(COG0510)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT1G74320)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_017412339.1)
• Pfam: Choline/ethanolamine kinase (PF01633.19)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;