Ll_transcript_475890

Id TrinityTRINITY_DN47485_c0_g3_i2
Name TranscriptLl_transcript_475890
SequenceCTCATTCTAATTTTTTTAAATTCTCCTAAATTTCCTTCATTTGATTTCCATTTCAATTTAGAAGAGAACACTACTCTCTCTTTCTCTCAAAACACCGTTT TTTCCCTCTCTTCAATCGATGATGAAAATTGAAACTGATTTCTCTTTCGTTTCTTCATAGCCTTAGCCATTTCTCATTAAGATCCATTGGAGCATTTTTT TTAATTTTTTAATTTTTAATTCTTATTATCGGATTTGAACGCTGATCTTCAATTAATCCACTCGTAATTGGTGAGTCTTCGTTTCGAAATTGAATCCATT GATTTAGTTGATATGTTTGAACTGATTGTGACTGATCGCAAATGCAAAATAAAAAATTCGCACTTTATGTATGCGATTCATTCTTTGAATGTTATTTTAT GTTTAATTTTGATCTAAGATTATGTTCATATATTAATAATAATAATTAATGAACGATGAACCAGAAAGAAAATTTGCTTTCAGTGAATAGTTCAATATTT TGTTTATAATTTTAATATTTCTAGGTATAATTGCTTCGTATATTTCCTTTGACATGGTCAAATTTTCATTTGATATTCGATTATGAAGTGAATTCGGAGC CTTCATTTTTTATTTTGTATTTAAATTTCGTTTTTTTATAAAAAAATATGTTGACTTTACTTTTAATTTTTTATTCTCCGATCCTACTGTTGCTTACTTG TTTGGAATAATAATCATTCTCATATAGCTATTCCTTTCATTAAGTTATTAGGAATTATTCTGTTTCAAGGTTAATAATTCTGTTTGTGATTATTCTGTGT ATAACTCAGATCTATTCAATCGATAAGGCAAGTTCTTTTTCTGCTTGTATCTATGCTCTTACTCTTACATTTAGCTATTGCTGATTCTTGTGCCTGCATT TTTTTCGGGATTATTAAGCTTGGTTTTTTATCCAGTTCTATGTAATCGGTGAGTATTTTGCTGTTTTGAGCTTCTTCTGTAAAGTTTAAGAATCTCTTTA CAAGTTGAGTTTTGGAAGGAAAAGAGAATATCTCGGAGCCTTGAAATACACTTCTGAGATGTCTCTCAAACATTCATTTTCCCTTCCTTCCTCCGAAGGC CCACACAAATGGACCCTAAGCATTGTTTGTGTTGTTTAAGGTCACCATTTGTAGATATTTTTGTTATTAGTATTGTTGTTTACGTTCTTAATGATTAATT TTTTGGATGGTTGCTTGAACATGGTTTTTTTGTCTCATGTATATGGTGGTATTATTTCATTTTCTGTTTTGTAATAAGATGCCTGTTATCCATCTCGTTT GTAATTTACAGCTTCACCTGCACTTGATTGCTTTGTGAATTCTGTGCTAAATTGTTTAAATTGTTTTTGTTCTCAAGTCCATATGAGTATTTTATTCAAC TTTGATTTCTGTTGTTCACTTCCTGTGATTGATACCCTTTTGACCCTGATATTCGTTTTGATCTAATGTTAAAATCCAGGGGTAGTGGCTTCTTAATGGT TAATTTTGGAACTATGGATTCACCCGTTTTCTGTGGTGGATTTTTAACTACTATATCTGTTGTCAAGCTTTTCTTGTGGTTGCTTATTATGTTTCATTAT TATTCCCCAGCTAATTGAAGCATGTGCAGTGGTCCAGAGAAATCAAAATCACCATCTTCATCTGCCGCAGAAGGTTCAACTAACTTTGAAGACATGAAAA ATCTAACTGTTCATACTGAAGATTCCTTTTCCAGCTTACTTGAGCTTGCTTCTAACAATGATTTTGAAGATTTTAAGCTAGTCTTAGATAAGGATGCTTC TCTCGTTAATGAAGTTGGCCTATGGTATGTTCGTCAAAATGGCTCTAAACAAGTTGTTCTTGAGCATAGAACTCCTTTAATGGTTGCTGCTACCTATGGG AGCATGGATGTTGTAAAGCTTATACTCTCGTACCCAGAAGCTGATGTAAACTTCTCTTGCGGAGCAGATAAAAGCACTGCTCTTCATTGTGCTGCTTCAG GTGGGTCTGTTCATGCAGTTGGAGTTGTGAAACTTCTTATATCAGCTGGTGCTGATATCCGTTGTGTAGATGCTAATGGAAACCATCCTATAGATGTTAT AGTCGTTCCTTTTAAGCTTCAAGGCGTGAAATCAATTCTTGTTGAGCTTCTTTCAGATAGTGCATCTGATGGGTCTGTTGATGACTGCTTTATCCCACCT TCTGTTGGTTCATCAAGTCCTGTTTCAACTGCTCATTTATCATCACTTGAATATGGGTTGCCATCCTCTCCTTCAGGCTCACCACCTTCTCCTGTGGCCA CAAAGTTTATTGATACACCTGAGAAGAAGGAATATCCAACTGACCCATCACTCCCTGATATAAAAGACAGCATATATACAACAGATGAGTTTCGAATCTT CTCATTCAAGGTCCGTCCTTGTTCCCGTGCATACTCCCATGATTGGACTGAGTGCCCTTTTGTTCATCCTGGAGAGAATGCTCGCAGGAGAGACCCCAGA AAGTTCCATTACAGCTGTGTTCCATGCCCTGATTTTAGAAAAGGGGCTTGTAGACGTGGAGATATGTGTGAATATGCTCATGGTGTATTTGAAAGCTGGC TGCACCCAGCCCAGTATCGGACAAGGCTCTGCAAAGATGGTACTAGTTGCAATAGAAGGGTTTGTTTTTTCGCTCACGCAATAGAAGAGCTGCGTTCACT GTACGGATCCACAGGTTCAGCTGGCCATTCTCCTCGCTCACCTGCTTCTGCTCCTAATGTCATGGACATGGCTGCTGCAATGAGCCTTTTTCCTGGTTCG CCCTCATCTATGTCTTCCATGTCTCCATCCCCCTTTGCTCAGCCTATGTTTCCATCTCCAAATGGCATCTCTAATTCGTCTGCTGGTGGTTGGCCCCAGC CAAATGTGCCAGCTCTTCATTTACCAGGAAGCAATCTTCAATCTAGTCGCTTGAGATCTTCTTTTAATGCCCGTGACATGCCACGAGAAAACTTGAATAT GTTGCCAGATTTTGATGGGCAGCAGCACCTTTTCAATGACTTGAGCTGTTTCTCTCAGCATCATCCTGGTGTTGGTTCAATGAGTCGACCCGGTCGGGCT AAGACACTAACCCCATCTAATCTTGATGAGCTTTTCTGTTCTGATATTTCTTCATCTCCTCGATATTCTGACCCAGCAGCGGCCTCTGTATTTTCTCCTA CACACAAATCAGCTGTATTCAATCACTTTCAACAGCTTCAAAGTACATTAGCACCCATAAATACAAATCATTTGTCACCTAAAAATGTTGAGCATCATCT ATCACAAGCATCATTTGGTGTCTCTTCTCCTGGAAGGATGTCACCAAGAAGTATGGAATCAATTTCCCCGATGAGCTCTCGTTATTCAGCATTTGCTCAG CGTGAGAAACCTCAGCAACAGCTGTGGAGCCCTGGCTCAAGGGACCTTGGTGTTAACACTTCTGCTTCAGTTGTTGGGTCCCCTGTAAACTCATGGTCCA AATGGGGATCTCCTAATGGAAAAGCAGATTGGTCAGTAAATGGAAATGAGCTCGGTCCACCGTCTGGGCACGGAAATAATGGGGAGGGGCCTGATCTATC ATGGGTTCAATCTCTTGTCAAGGAATCTCCACCTGAAATGATAAAGGAGAACTTTGCAGGGTCTGGCCCTATGGCATCTGCTGCTGCGGGAATGAAAACC AATCCTCAAATTGAATCCATTGATCATTCTGTTATAGGTGCCTGGCTTGAGCAAGTGCAGCTGGATCAGTTTGTTGTCTAATTGACCCTTTACATGTTGT TGAGATAGGTATTTAATTTCATGTGGTACATATTCTTTTGGGAAAAAAATTAGGTCCTGTTAAGATACCAAAACAAGGAGTGATGGCTGCAAAGTTCCCA AAGGATATTCTGAATTTTTTGTTTTCATATTTGTCATTCATTATTTTTACTTGATCGACATAATTGTTCATTATTTACTTCAGCTTCAAGGGGACTAAAG ACTTGGATGTTGTTGTTTAGAGCCAAGGATGGCTCTGGACCGATAATCTAGTAAAAAAAGAAAATCATTTTTATGTAAGGTATTTTTCTTCCAAAAAAAT GGCCCTTTGCACTTATTTTATTTACCCCTTCCCCACCTATCCCCCTTTAAAATGAAAGCTAGATGGTTTATATTGAACAAAATCCCATAGTTCTATGTCT TCAAATTTCTTTGTCATACAGTTTGCATTGTAAGATTCTGTCAGGTAATTTGCTGTTTGAATATTTACTGCTGCCTGGTCATAAGATTCTCTATGGATTT CTGTTCTGCTGTTATAAATGGTGCTGTACTGGTTAGTTTCAAATTCAAGGCATTGATTATTTCTTTCTGCAACTTTGGAATTACCTATCTCTCTTGATAT TTTTCTTGTATACTTACACCTACTTGTACCAACACTGTTTTTAACATTTATTAATTCTTTGGCATAGACTGTACGGATTAGTATTAGACGAATCAGCATT TTTTATAACTAAATGAATTAGCATTTCATTGGCACACACTTTATAGTAATTTATGTAACTGAATCTATTTTGGTATGACACTTAATAAATGGATTTGTTT CTTTTTCAAATTAAAATAATCTTATTTGCAGCATATAAGCCCTTTTTATCTTACTGGTCAAAATAGGGGTACCTATATAATGTTAATGGTTTAGCCAATA TTAAAATATAGATAATAAATTCATAAATATTATTATTTACATTATATAACTTAATTAT BLAST
Tissuepods
Gene nameLI_gene_153038; 
Additional informationdetails; 

Expression of Ll_transcript_475890

Labels

PAB abscising pods
PNAB non-abscising pods
PS1 seeds stages 1-3
PS2 seeds stages 4-6
PS3 seeds stages 7-8
PW1 pods wall stages 1-3
PW2 pods wall stages 4-6
PW3 pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_475890
BlastpZinc finger CCCH domain-containing protein 30 from Arabidopsis with 56.99% of identity
BlastxZinc finger CCCH domain-containing protein 30 from Arabidopsis with 55.45% of identity
Eggnognucleic acid binding transcription factor activity(ENOG410Y7IC)
KeggLink to kegg annotations (AT2G41900)
CantataDB-
Mirbase-
Ncbi proteinLink to NCBI protein (XP_019443633.1)
PfamAnkyrin repeats (3 copies) (PF12796.6)
Rfam-
GOLinks to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;