Id Trinity | TRINITY_DN47526_c0_g1_i7 |
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Name Transcript | Ll_transcript_526831 |
Sequence | GTTCAAAACAGAAGTAGCAATAATGTCATGAATCCAATTTATCCAAAGAACCAACCTTTCACTTTCACTACTTCACACGATAAATCATAATCAGCATGAT TCATCTTCTCTCTCAATCATCGATTCAACTTCTCTCTTTTTCCCAAAAGGTTTGAGATCAGAAAAAAACATATATAATTATATCACCCACTCTAAGTTAT GTACTTGATCTGTATCTGCAATTCAGCATTTGTTTAGGGTTAGGGTTTCAGCATCGGTAGGGTTTCTCGGATTTTTTCTAAAATTCCTTTTGGGATTAGT GAAATTCGAGGAAAAGGGTGTTTTGGGTTTGTGTTTGATTAGTCAATTAGCGATGCAATTTAGACGGCACGAAGAAGAGCATGTTCCTGCTGCACTGTCT CCTTCAAAGTTGCGATCTCAGCACCGGTTCGGACCGGGTCCTGAGCCGAACCAGATGAATCGCCGCAATGGTTTGGATCCAGTACAGCAGAGGAATTTAA GTCCACGGAAAATGGATGAAGTAAGAAGGGGGTGTGATGGGTTTGAAAAGAGGGATTTTGATTGGCAATTGGGTGGCCGTAGGAGCGGTAGGTTCCGGCA GCAATTACCTGTGGATGAAGAATTTAGAAAAAAGTCACATTTGGGATTGAGACCAAGATATGAGGTGGCAAATTCCATGGATTATGTTGTTGATGATGAA CATTTGAATGTGAAGCACAGTTATGTTAATAGAGAGAAGGATTTGATTGAAAACAGGTTAGGTTGTGGAGTGGATATGATGGATCATAAGTATGTGATCC GTGAAGATGAAGCGAGAGGTTCATATAGCTCAATTCCAGATATGGGTGTAAATGTAACATCACGATATGAAGAAACTGGTGGGCACTTGCCTCGGCCGCC AAGGGGTATTCCCATGGGGAGATTTGACCATGAAAGATTACAGCACCCAGAATCTCTACCTATGGATAAAATACCCATCACTGAACCCCACAATGAGGCA GAAAAAATAATATTTTATGACAGAGATGGCTCGTACGCGACAATATCCCCCTCATACACAAAGGATTTTGCAGGAACTTCTCACTCGATGGAGAGGGATT ATGGAGGCTCCTCTGTAGAAATGTCAAGGAGTCATTTTCGATGCTCGCATGGTGATGACATATATTTACCTACACCTTATGATCTGTCAAAGAGCGGCAC AGAATTTGCAGAACCTGTAGGGTTTAGCGAACACGGGCAAATGCCACTTGAAGACACTACTAGAGATCCTGAAATTAGGCATAGAAATATGATGTGTCAC CAAGGATGTGAGTTTGGTCCTACCAGGACTGAGCATCAGGATTATCTTAATAATTCTAAAATACCGGTAAGAGCGTCACAGGATGAGGGTGTATATCAGT ATGATGATTTACCAAGAAGGATGGCTCCTCATGGTCGATTAGACTATAATCATTCTCCAATGGAATATGATGATAAAGAGTTGTGCAGAGCTTATACCTC ATATCCAGATTTAGATATAACTGGTAAGAGTGAAGATTCATATGGCAATCAAAGAAAGGGTGTTATACGTGACTACCCTGTATTACGGAAGCCAAAGTAT TTCGACTATCATGACATGAGAAAAACACCAATGGTATCAACACCCGATGAGGCGTATTTGCATTCTGGATATAGTCATCTTGAAGGTGGTAAGAGAATGC CACAAGATTATGAAATTTCATATCTGCGTGCACCTGAGGCTGACCGATCATCAAATTTGAGATCACATTATGAATCTAGAAGAGATGGAGGGCCAAGACT TCAGCAAGAAAGGTTTCAAAGTTCATCTTTCTCTAAACATAATTCAGAAACCTACAGACAAGATGCAAGAATGCAGGAAACGAAACAGGATATTGGCATT CATGACCATTCAGGTAGGTTTATGAAAAGAAAATACCATGCTAATGAAGATATAGATGTCCTTGATTCTAGAGCAATAAAATCAAGTAAATGGGATGCAA CTGAACAATTTCAAGATGTATATGAAAATGAAGAGTGGGTAGATGACGAAGATACGAATATGTTTTATTCAACTCGCGATATTGGATTCAGCCATAAAAC ATACGGGAAGTATAAGAGGGAATGCAATGAACTGCAGAGTGAAGAAGATTTTCCATCAGATGAGTGGATGTTACCTCAAGATTCTGTGGGACATCTACAA AAACATTCATTTCGGTTTCAGAAGTATCCAAATCATAATATAAAGCATCATTTAAAACCTAGTTCTTCAAGCTGGTATAAGCCCCAACACTTCTCTAAAA GAAATGTGATTCATAAACAACCAAAAGTTTGGAAAAAGCATCACGGTTACCATGAGAATAAGCATACATCTAATGATGAATCATCTGAAGATTGGGTAAT TGCCACAGAATCTGAGCCACCTGAGGGTTCTGAGGAGTTTAAACGAATGGTACATGAGGCTTTCTTAATATACTCCAAGAATTTGAATCTGAGCTCGTCT CTCCAAAAAAGGTATCAGGAACAAGGAAAAGCTGGTAGTTTGTACTGCATCGTATGTGGCAGAAGGTCTGTTTTCTTTTCTACGATGCTCTTTTATTATA TGGAGCACTTCTGTTCACATATTAAATCAGGAGCTCCGTAGTTTTTAACTTACTGGTGGGGTCTGGTACGTGTGCTATTATTATTATTATTGGGATCACA TTGTAGGTTCTTATAACTTTGAAAGTGTAAAGAAGTTGGTAAGTGTACTTGCTGTACTGTATTAAGATGGACGGCTTGAAGGATTGATAGCACCATTCCC GTGATAACATGTGCTCTATTAGTCTTGGGATCATCTTTTTGGTTCTCACAACTTTGGAATTATAATAAGGTGGCATGTGTAATTGTTGAACCATATTAAG GTGGATGCATTGAAGGATTGATAGCATCACTTCCATGCCAGTAGGATCAAATACATGGTAAACTGTTCTGCGGATGAACACGAGTCAGCTAGCAGAAGTG ATATCTATGCTCTCAAGTGTTGGTGAAAATTGCATTTAAATTTGCTGCTATGCTGCATGGTTTTGAACTTGGATTAGGATTGTTTTTGCTAGAGCTGGCA TCTTACTGTATTTTCAAACAAATGTGGATGCTTTTTTAAATGTGAATGTCTTGTTAGATAATTACTTGAGCCTTTAGATGCATATGAAATTCAAGACTAA TTATATTTAGGAAAGACAGATAGATTTGGAAAAGTTTAGGTGGCTTCTAATGTCAGAGTGTAAATGGATTTGGAATTATTGAGAATACTGATAGTGGTAC TGTGGTAGTTTGAAGTTGCCTAGACCTTTTAAAATTCCTAAGATTGATTTTCCAGTTACAAGTATGGCTGTAAGTTTGGGTTTTAGATTTATAGAGGAAG AGGGTAATGGCTTCAGGTGTCAAGTGATATCTAGGACTAATCTGAATATAGAATTGTGTTTTTATTTATTTATTTTGTAAGCATTGATCTAGTAACTTCA ACTAAATCAATCAGTTTTTTCTTTTTTCATTATATACTTCCCTGTTTAAGAGAATTTATGTTTCATGATTGACAAAACCAAGTTTCTAAACTTAGGTTCT CCTAGGAATTTAAGTTTTATGATTGACAAAATGCAAGTGGACATGCTCCTCGTGCCTTTCGCAAACAGATTAGGAAGTGCATCAGAAGGCTAATCATATA TGCTCCTATACTTCATTGATGCATAAAAAATGATGGTTTTGACGCTATTTCTGATAACTGTTGGATAATATACTATTCTAAACATGTTATTTATCTTTTT TCTGATTGACTTCAGTTATTTATCTTGAAGATGACCTCAAAATTTCATTTTATTACTCCTTGCCATTTTTTACCTTAGCTTCGGACTTGAACTCTGTCAG TTACATTGTAGTGAAGATAGTGGTTTTTTATCTTTTTAAGTTTCTTCTTTACTTTTTAAAGATAGACAAGATTTTATATAATGTACCACTTAACAGCAAG TTTCATATTTTTTCAGATGAAATTACTATACGTCGTATAACTCATAACATTTTTATTTGTACTATTTATGTTTCTTTATGGTACAGCTCTTCGAAGGAGT TCATGGACACTCAATGCTTAGTAACTCATGCTTTTATGACCCATAAGGCTGGCCTGAGAGCAAAGCACATGGGTCTTCACAAAGCAGTTTGTGTTATGAT GGGTTGGGATACTATTATTCCTCAAGATACAGTAACTTGGGTTCCCCGGGTCTTGCCCCATGCAGAAGCTTTGGCTCAAAAGGATGATCTGATTATCTGG ACTCCTACTGTCATCATCCATAACATATCAATGCATGATGACAATCCACAAAACTGGAAGGTTGTAAGCACGGAAACAATTGAAGCTTTCGTAAGAGGTT AGTGTGTTTGGATGTTGTTTATGTGTAGCTGGTATAGGTAGAACATTGTTGGCAAATACACACAGGTTTGAAAGTCAACTTTGTTATAAGAAGATGTAAG CATGGCAACTTTCACGAAACATCTCTCTCGAAAACTTCAGTTGTGAGGTGGAAGTACATAAATAGTTTTATAAGTCAGACATGCAAGCTTGTGCAAAGGC CCATTGGACATGAACATGTATAATGCACACACGCTCTCCCTTATGTTGAAATTTAACTTTAATTAGATGAATAGGGACGGCAACAATCAAATCTAGACTA CTTGCTCAGACACTAATTTTTTGTCATGAACCATCTCTCCTAAAATGTTAAGCTGTTAGGTGAAGATATATGAATGGTTTTTATATATCTAAAACAATTA AGGATTTCCTTGGGATGAATTTTTGTTTCGATGTTGTGATATGGTGCC BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_153359; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_526831
Blastp | - |
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Blastx | - |
Eggnog | - |
Kegg | - |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019428430.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | - |