| Id Trinity | TRINITY_DN47609_c3_g3_i3 |
|---|---|
| Name Transcript | Ll_transcript_361139 |
| Sequence | CCTTCTTCTTGTTCAGAGCCATGTAAGCCAACATAATTATTTTAATTCTTGTTTCTTCTCTATCTCTCTTATTTACATACATTTTCTAATAACTTCAAAA CTCAGCTTTAGTTACTTTACTCTGCTTGCTCTAAGTTCACTTGACAATGTTTTCAAGAGGAAATGATTTGTTCGTTTCAAATTGAACTTAATGTTGAGTT AGATGTCATGTTCATGTTTAACTTAATAATCTGGGTTGTTATGGTAAGAAATAAAAAAATAAAAAAGTCAGGAATGATGTTGAACGGTTGAAGTAGTGCA TGACTATAAGATAAGATACTAGTCGACTAGTATTTTTTTGTTCTGCCACCTATTTTCCCCTGGCAAGCTTTTTGTATTTTAGTTTTCTTGAAACTACTGT AGATTGTGGCAAACATGAATTGTATTGATATGAATTATTTTATTATTAAAAAATATTTTGAATTAGATGTAACTTGATGTAGTTTGATGCGAATAAAGAT CCTCTCCATTAGGATGGAGAGGCAAATGTATATTTTTATACTTGTTTGTAATGATAAAATTGTAACTTTATTGTAATTAAAGAGATAGATGTGTCATTAA ATATTGCATTTTCATTTTGTCTTTTTAAGCACTTGTTTTTTCATTAATGGAGAGGATCCTAACTCGTTTGATGCATCCAAAATATGGTCAAATATGGTTG TGTTGCAATTCAATAAAACAACACTATTATAATTTAGTATCATATAGCAACTGTGTTGAATGCAATTACTGCCACCACAATATTACAATTGTATTAGGAT TATCGACCATATTAACATTACTAAATTTGAATAAACTCAACTAGTTTCAGAATATTATTATATAATATGTATAGATATGGGAACCATTAATTGTGCTTAG TATAATAATTCATCTTAGTTTTGGGTAACAATTTCCTTTAAATATGAATCACAATAATAGTTGTGCTTTTTATTATCCTTAATTAATGTTGGCTGTATTT GAATAAAACGTCTACATGTTTTTTTAGCATTATAAAGTATTCCTTTTTATTATATATATTTATAGTTTATTTTTTGAAATTTGTATCTTACATTTTTATT CATTATAACTTTTGTTTTCTCCATGCAGATACTAGATAGAGCTGTAAATGTAGGACAAAAACCACATTAATTGTTGTTCGAGTGTTTTTTAAAATATTTC ATTTTTTCTAATGGGGAGGGATCAAGTTTCTTCAAGAGTAAATCTAATGGTGTATATCTATTCATTAATTCAAACCATTGGATTTCCAAGAAATTGATAG CTAAGATGAAGAATAAGCATAAAAGAGTTACTCTTGAACTAACTTGATCCATACCATTTTCTAATTAGTCTCCTTATCAGAGTTAACATGAAGGCTAAAC TACATTTTTAGTAAAATACAAGGATAATTATTAAACGAGTGAGATTAATTTACTTAAAAAGAAAATTTAAAATACTTACTCTTCATTTTAGTCATCAATT ATAGAAAAATCTAATTGTTTGAATTAGGAAGTAGAGCTAAACCATTGGATTTCGAATAAATTGAAGGCTAAGACGAGGAGTAAGTCATTTAGACACTAAA TTGATCCCTCATTATTAAAAAGTATAGATTAAAGCCAAAATGAGTTATAAATATATGACTATAATCAAATTCAATCCATTATTATATAGGATGCCCTAAT ATCATACTAATCTTTTCAGGCTGAGATTGTTGTGACTACTAATGAGGCTCCAGCTCCATCCCCTCACCATAGCAGAAGCGGTACCCATTTTCCCATGCAT GGCATCACTGAAGGTAGTCTTCAACCACAAGGTATTAAAGATGAAAATGTTTTAACCATAAAATTTGACACATAACTAGGACATGCTTAATGGATAGCTA ATTTACCTCTCCTAGGACAACCTTTTTCACTACTCATATGTACAAGTATCACACATGGTCAAAATATTGGCTAATGAACATCTCTTTTTAAACTGTGTGT TTATCCCTTAAGAAATATCGCTCCTAGGAATTAAACATGTGTTCATTTAGTCTTTTGGGATTTAATGGAGTCTTATACTTCTAGGTCAGCACATTATTGA TTTACCAAGGTATTGTTTTGTGTGTTTGATTAAAAGAACTCGTGTGAATTTAGGGTAGGGATAAGTAATTTATCATTTTGGTCCTTCCATTTATCACTTA TTTGGTTCTTCGAACAAAAATTGGATATTCATGTTGGTGCCTATATTGAATACTGAGTTAAAAAGGATTTATTTGCTCATCTAAATAGCTTTGCCCAAAA ATAAAAGCATGAGGGATATTTTTAAAATGGGATGGTTAAACAGCCAGATTTTGACACATCAGATGGCATCTTTCTGATTTATACATACAATATATATATT CTACGTACAATGCTGTTGATTTCCATATCAGCTCACATTCACATTAAAATATAATGTATTAAATCCACTCGTAAAAACATTTCCTCTTTAAGAAATATGT AGTAAACGGATAAATAACGCAAAGAATATTTTAAATTACCGACAGCATCACTAGATGTGGTGCATTACCCTATAATTATGATTATGATTACCTCTATATT CACATTACATTGACCATAATATTATGGTTGTAGTTACATTACATTTTGTTATAATTATATTGTGATATTGAATTAAAATGATTTGGTCCTAGTAGATCAC GACTAAGTTTTATTAAATCCAATTAGAAGCATGTTAGACCAAATTAACTTCAAAAATATTTTTTATTCATGAAAAATATTGCAATCTGCAACGTGATACC CATATGGTTGAAATTGCAATGCAAATGTAATAACTCTGTAATTTAAAAAACAACTGATACGACATTGGATTAGAAGTAAATCGATGAAGTTGAGTCAGTG ATGGAGTCAGATCCAATATCTTGATTGGACTTAAAAAAAAATGCAATATTACATTTTTGTTATAAAGATTTGTATATAGTCAATTTATCATTTACTATTT ATTTGAATTAATTTTTTTTAAAGTCAATGATGATTAAAATTAAATAAATAATGTGATGACAATTTATAAAACTCATATTAATACTTAAAAAAATTTAAAT AATGTTGATTAAATTGCAGAATGCAGTCCACGTTGTGCAGACAGATGCTCTAACACACAGTACAGAAAGCCATGCTTGTTCTTTTGCCAAAAGTGTTGTG CCAAATGCTTGTGTGTGCCTCCTGGAACTTATGGCAACAAGCAAGTCTGCCCATGTTACAATAACTGGAAGACCAAAGAGGGAGGGCCGAAATGCCCCTG AATGTTTAAGCTTTTTTCTATCAAGTCTTAAGCTAAATGCATTCCTTCACACCTATTTCATGGATAAACATTACATAATTCATTCTTGTCTTTTTTAAGT TGCACGGCACATATTAAGAAATGGAATACATAATTATAATTGTAATAAGTATATGTAATAGTTCCCGACTTATCGTTTATCTCTTTAATAATGACTATTT CTCTTGATTATTAACTAAGTAAGGATTGTAAGAATATTATTAATATTATCTTGGTTTTATAAATAGATGAATAAAGAGGAAAAAATCTCTTTCTCTAAAA CGAGGGATATTAGTGTTGGACTGGACAGTCCGTTTGGCCCGACCATCATCCTGCATAGTAAGCAGCCTTGTCTCACCCTTAAAACCAAATACTTTTTTAA GCTACTTCTGACTGTTCAAAATCCAATTAAATCATATTACTATCTCCAACAAATTTCATATTCCTATCATGGAAGAACTATCGGATGAACTAGAAGG BLAST |
| Tissue | pods |
| Gene name | LI_gene_154031; |
| Additional information | - |
| PAB | abscising pods |
| PNAB | non-abscising pods |
| PS1 | seeds stages 1-3 |
| PS2 | seeds stages 4-6 |
| PS3 | seeds stages 7-8 |
| PW1 | pods wall stages 1-3 |
| PW2 | pods wall stages 4-6 |
| PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_361139
| Blastp | - |
|---|---|
| Blastx | Gibberellin-regulated protein 6 from Arabidopsis with 81.67% of identity |
| Eggnog | Gibberellin-regulated protein(ENOG410YQ6U) |
| Kegg | Link to kegg annotations (AT1G74670) |
| CantataDB | - |
| Mirbase | - |
| Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019426980.1) |
| Pfam | - |
| Rfam | - |
| GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |