Id Trinity | TRINITY_DN47616_c1_g3_i1 |
---|---|
Name Transcript | Ll_transcript_360093 |
Sequence | CTCTATCTCTACCCAACTATCTAGACACCCACTATCTTTCTCTTTTTCTATTGCACTTTTTTCTCTCTCTTGCCCTTTACTTACCACGTCCATCTTTCCT CTATCGGAGGCTCTATGCGCATAGCGCACCCATACATCACAATATGCTTCCCAACTCACGCTTACACCTTCTTCCCTTACCCGGTGCACGTTAGTACCCA TCACTATCCCAATTAAGTAATTGCAACTTACCCAGCTAAAAGCTGAGGTTACAAATACTTAACCTCGCCGATTCCCGTGACTGAAAAAAATGATCAAATC CTTTCTTGGAAGGCACTGCTAACGTGCGCTATCATCTAAACGCAGTCGTTTAATGATCTCTTCGTATCGTTCATCGTTTTTTGCTATGGAGAGCAACGTG AATTGAACAAAGGGTTTAATCGGTTTTGAATTCGGTGAAGCAACAATCGTTTTCCTAATTGAGATTGTGGAAACACATATTCTATAGAAGTTCTATAGTG TTACGGTTTTTTTAGGTTTTGGTTTATTATTTTTTCTCTTAGAGTGAGTAAAATGGATCCTGAGGAGGTTAATTTGAATAGAGAAAATGGAAAAAGTAGT GATGGATTCGTTGATAGAAGTAAAGTAAGGATTTTATTGTGTGACAACGATTCCAAAAGTTCACAAGAGGTTTTTACTCTTCTTCTCGGATGTTCTTATC AGGGTATGAATAACTATGAACTTTTTCCTTTATGATTGTTGATTTATGTGTGCGTAATCTTAATTGTTCTACATATTGCTATGGTAAATGAGTCATATAT GAGTTATGATTATTATGATTGTTTTACTTATGTGTTGTGCCAAAGATATTTAATTTGAATTTTGTGCTAGAAAAGGTTACTGGATCCAGGCATGCTTTGG TTGTGAATTTTATGCTGTCCAGTTTTTTTAGAGTAACCATATGAAAAGATGCTAGAATCTCGGTTTAGATGATTTCAAATGTGTAGAGATTGGAGAAGAC CTGTAAAAATTGTAGGTGAAACCAATAGCCAATAGCAAGAGGGAGAAGTAAACAAAGAAAAAAATTATAGATGAAACCATTCGATCGATTTAGATGTCAA GGGTTTGTCACATGATATGATATTAGGACAAGTTTGATACATATAGTTGGCCCCACCTAATGTGAAAAGGCTTGGTTGTTGTTGTTAGGTAGTAACCTTT GTGTGTATGTTGGCAACAATGTAAAATGAAGATTAGTCAAACTTAAATTGCATCAAGCAAAATTGCTGTATCTTCTTGTAGTTGAGTTATGTTTTACAAC AATTGTTGTGGTTCACAGTCATTCCTTTCGGAACTCAAATTTTGTTCTCCGTCCTGGTATTTAATTTCCATGAAGGAAACATAAGACCAAGAGAAATAGT TGCCACTTGCACGGGAGTTACTTGGTGCAACTTTCAGATACATTAACTTTCTAGATTCCCCCAAGGTGATTTTGGTTTCAGGGTCTAAGTCTTTTCTTTA GATCAGTACTATCAACACATGGAGAATGTTTTTCTATCAGTGAAAATGACTTGAAGTGATGATTTTATTGAATGCTTTCTGATTTATACTGCGTGGATGC ATTTGGCTCCTCCGATTTAGAGCTTATGCATCTTATAGCATGCTCCCAGATATTATATGTGAACTCTTGATTTTCTTTTGTTGCCTCACAGTTACTGCCG TAAGGTCAGCTAGGCAGGTAATTGATGCACTGAATGCAGAGGGGCAACATATAGATATCATACTTGCTGAACTTGACCTTCCAATGAAGAAAGGTATGAA GATGTTAAAGTACATTACACGGGACAAAGAATTGCGCAGAATTCCTGTCATAATGATGTCCGCACAAGATGAGGTATCCACTGTTGTTAAATGCTTGAGA CTTGGAGCAGCAGACTATCTAGTAAAGCCTTTGCGCACTAATGAACTATTAAATTTGTGGACACACATGTGGAGAAGGAGGCGCATGCTTGGACTTGTAG AGAAGAACATCTTGAATTATGATTTTGATCTGGTTGCGTCAGACCCTAGTGATGCCAATACGAACAGTACCACCTTGTTCTCTGATGACACAGATGACAA GTCCAAAAGAAGCACCAATCCAGAGACAGGAATGTCAACCCAACAAGAGCTAGAGGTGAAGCTAAAAAACATTATTTAACTAATGAAAGAATGTTAGTAA GCAATGGGTTCAACAAGCTCTCAAATCAACGAGCTTGTGGACCATGGTAAACTTTGAAATTAATTTAATCTATAAAGAGATGATGTCTTTTTAAATCAAT TTTCAGCTGATTTTGTAAATCATCCTACCTTTTAGAATATAAACTTGGTCAATGACACGCTTCCAAGTTTTATAATTGCCTTCCATGTAAAGGTCATATC AGGCGTGATGCTACAATAGAGATTCAATTATAGAACCAATAAATCATTTTTAGTAGAATTTGTTGATTACTGAGTATCTTAGAAGTTTTTACAGTATCCT TGATGATCCTCTTAGGATTTATTTCCTATTTATATTCCCTATTTTTTATTCAATTAGGACTAAGATTCTGCTATTCATAATAGGACTATTGGAGTTTGCC TTTTGTTTCCCAACACGTCACTCACATTATTTCCTTAGTTCACAGTTGTCTCTCTTTTTCGTATTAATCACACTTTTTTGAGTCTTCATTCTCTCCTTTT CTCCTTTCTTACCAAAAACCCTCCAATTCAACATGCTATCAGAGTGATACTATCCTCCATCACCTATACTGTCATCGTTCCACTGTCGAGTTCACAAAAG TTTGGAACTTTGATTAGCCATCTCTTGTAGCGTTGTGTCTCCGACATACTCTGTCTCCTCAGGCACAAGCACCATCCGATCACTTTCTTGCGAGATATTC AGCCAGCAATTGCACCATCAAACTTGTCTTTTACCAATTTGTCACTTTCAACACCTTGTCGGTTGGCCACATGTCGTCCTTCCTGTCATGCCTACTCGGC ACATTTGACGAAATTTCTGCCCTCCATTTGTTGCGCAGAAGTCATCTTTTTCTACTCTACCCAGTCTGTCCTCACCTTGTCCAGTTGCACCAGGTTGTTG TGTTCCCTTGCTCAAAGGGTTTCAAGTGTATTGGGGTTTTTGTTTTTTGCCATTATACTCCCACAGCTGTTTCACCCCCTTGACAGGCACCTTGGCTTTG ATTGGAACTATTGGGCTGTTTTTGCCATGTTTAATGCTCAAACCTGCTTTGGCTTCTTAGTTTGGCTCTTCACCAATGCTAGTTCAGCATGGAGGGGGAG AATATTTGTCTGAAATTATTCTTCAATTTTGATATTTATCTCAACTTATTCTTCAATTTTGATATTTGTCACATCATTCTTTTACCTCTGGTGGATCATA ACAATGCCATCTCTTCCCACTAATGATTTTTTTTACCTCCAGCAGTGCTTAAAGGGATGCAATGGGTGTAGATGTGTCATCAGTCATACTTTTTTTCACC AGTTACTGGTGTTTAAGATATGAACACAAATATTGTTATATCACTACTAATAAGTTTAGATCTGAGATGCTATAATCACATTTTATGTGATCTTTTATGT ATTTAATTTAACTTTTCAGTCTAATATTGCCATTGCTGCTGCTGTTGTTGAGGAGCCACCAGATGCTCATGCATCAGAGTGTCGGCCTGATGTGCCTAGA ATTAGTGATCTCCGAACAGGACATTTTTCATCTGGTCCAAAGAAGAGTGAACTAAAGATTGGGCAGTCATCAGCCTTCTTCACTTATGTTAAAGCATCCG TGTCAAAGAGCAACTTTGAAGGAATTGTTCATGTTGGCAACAATGCTGCTATACGGATGAGGGTCGAAGATGCACACCAACCATGTGCTCAACAGCGGGT TAATGACCTTCAAACACTTGCAAATGGAGAGACCTGTGAAAGTCAATCACAAGATGACTTTCCCAGCAGCAATAGTTTTCCTGATTCTTTCTCTATAGAG AGGTCTTGTACTCCACCTGCGTCTATGGAAGTTTCGCCACAAAATGACCCCAAGGAACAAAATCTGCCTCCAGGTATGGTGCATCCAAGAAATGGAACTC ATGGTTCTGAGATTGATGTTTCTACCATGGCTACCCAACATGCTTATCCATATTATATATCTGGAGGTTTTAATCATGTTATGATGCCTTCATCAGCACA AATGTATCAAAAGAATATTCAGGACATGCAGAATCATGCTTGTTCAGCTATGATTGCTCAATATAATCGTCTTCCTCAAGGTCCTCCTCATGCAATGGGG ATGACGTCCTACCCATATTACCCGATGAATCCATACTTACAACCTGGTCAGATTCCTACATCTCATCCATGGCCATCTTTTGGAGGTTCAAGCTCATCTG AAGTAAAATTAAGTATAGGTGATAGGAGAGAAGCAGCATTGCTGAAGTTTAGACAGAAAAGGAAAGAGCGTTGCTTTGATAAGAAAATCAGATATGTTAA TCGGAAACGACTTGCTGAGCGTCGGCCTCGTGTGAAGGGACAGTTTGTCAGAAAGTTAAATGGCACTAATGTGGATCTTAATGGACAGCCTGCTTCCATC GACTATGACGAAAATGTTGACGAGGAAGATGACCAGGGAGCAAGAGATTCCTCTCCCGAGGACACTTGAGCATGTCAAAGGACACAATTTAGGTATTGTT TCTTTGGGTGCTTGTGGCGCTTATCTCCAACATAACTATAATGAGTGGTTTATATTTTCACATATGAGCTATACTACCCATGCTATATTCTTAATTGAAA ATAACACCACAAGCACCTAGAAAACGTTATGATGACAATGGAGCCGTATGTCCCAAATTTTGTACTACTCCATGTACTCAATGTTTTTCATTGGTTGAAA AATAAATCATGAATTAAATATATATTAACTTTATATTTTCTGACCAATAAAAATGAAGGGGTATATGAAGTGATATAAATTTTGGGACATAAGATGTGTT CCCGATAACAAAAGGATGAAGTGGCACTAGATTCCTTCCTCCACTAATATCTGCCTATCAAGGATATGCTTCTGTCCCTTGCTTTAATTGAAACTTGTTG CCTTAGCATTAGTTGATGAGAGCATGCATCCTCATTATTTGGACTTAAAACAATTTCTTGCCCAGTCACTTTATGACTTAGTCAAATGATCCTTGTTAAT GAGCTCCTTTAGAAGAAATCGTTCTGATTATGCCCAAAGCGGTTGAAAGTATCACTGTTTTATTGAAACTTTTAGAAGCTGTGCATGCATATGTTTATGG AGAAAAGGCAAGATACCTTGAATTTGTCCTGAGAAATGGGTTATTATTATTCTGAGATTTTAACATCAAACAAAATTTCACTAAAAA BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_154073; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_360093
Blastp | Two-component response regulator-like APRR1 from Arabidopsis with 48.95% of identity |
---|---|
Blastx | Two-component response regulator-like APRR1 from Arabidopsis with 79.75% of identity |
Eggnog | Transcription factor(COG5641) |
Kegg | Link to kegg annotations (AT5G61380) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019417277.1) |
Pfam | CCT motif (PF06203.13) |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |