Ll_transcript_360788

• Id Trinity: TRINITY_DN47634_c2_g5_i1
• Name Transcript: Ll_transcript_360788
• Sequence: CTTTGACTATGGCGCACGAAACAATACGGTAACCTCGTCTTCAGTGTTTGCTGCCACGACACGCGTTTCACCCTCTTACCACTTTATCAATTATCAATAA ATAAATAAATAAATACTCTCTTCCACTTTCATTTTTCATTTCATTCAAACCCAATTCCTCTTTTTTCTAATGGGTCAATCACCCTCCACCGCTATTCCTT CGCCGGAACCCTATCTCCGACAATTTTCTTTCTCTTCCGACGACGATGGTTCCACCGGAGCACCACCCCGTGATTACACTGCCGATATTCCCGACGACTG TCTTGCCATGATTTTCCATTCACTAAGCTCCGTTGACCGGAAACGCTGCTCCGTCGTTTCCAAACGGTGGTTACGCGTTGACGGCGAAAGCCGTTATCGT CTCTCACTTCAAGCGAAAGGTGAACTCATAAACCGTGTTCCTTCCATTTTTACTCGGTTTTACTCGGTCACCAAGCTTGCGTTACGTTGCGACCGAAGAT CCACGAGCATAAACGACGACGCTTTGATCCTAATCTCGCTCTGGTGCAGTAACCTCACGCGCCTCAAGCTTCGCGGTTGTAGAGAGATCACAGAGGCTGG AATGTTAGGTTTAGCGAAAAATTGTAAGAATTTGAAGAAATTCTCTTGCGGTTCTTGCGTTTTCGGGGCGAAAGGCGTTTACGCGTTAATCGAACATTGC AATTCACTCGAAGAGCTTTCAATTATAAGGCTTCGTGGCGTTGATGATGACGCCGACACCGGAATTGTAGGTAACGGTGTTGTTTCGGTTCCCTCTTCGT TGAAATCGATTTGCCTGAAGGAGCTTGTTAATGGAAGAAGCTTGGAGCCACTTATAATTGGCGCGAAGAAGCTTTGTAGTTTGAAGTTGATTCGGTGTTT GGGGGATTGGGATATGATGCTTGAGGATATGGGGAAATTGAACCCTGGATTGGTTGAGATTCATCTTGAGAAGGTTCAGGTTAGTGACTTAGGTCTTAGA GGGATATCTAAGTGTTTGAAGTTGGAGACTCTACATGTTGTGAAAACTCCTGAATGCTCCGATTTAGGGATTATTGATGTGGCCGAAAAGTGTACGATGT TGAAGAAGCTTCACATTGATGGGTGGAGGACTAATAGGATTGGCAATGATGCATTGATCGCGGTCGCAAGAAATTGTCCTAATTTGTTAGAGCTTGTGTT GATTGCTATGTTTCCAACCGGTCTAGGGTTAGAGGCGGTTATTTCTAATTGTCGAAATTTGGAAAGGTTGGCTCTTTGTGGGATTGGAACAGTTGGTGAT GCTGAGATTGAGTACATTGCTACGAAATCTCTGGCGCTCAAGAAGATTTGTATTAAAGGGTGCCCTGTGTCTAATTCTGGGATTTTAGCTTTTGGTTTTG GTTGTCCCAATTTGGTTAAGCTTAAGGTTAGGAAATGCAGTAAAGTTAACGGCGAAGTTGTGGAGTGGCTGCGCAAAAAGAGGGGTCCTTTCGGGTTTAA TTTTGATTACAGTGAAGTTGAAAGTGAAGCTTTGGATGGAAGTGGTAGTGATGGTGGTGGAGTTGAAGAAAGTACAACAGTGTTTCCTCATGCAATAGTT ACCCAAGTAACAACCCTGGCTGATGATGCTGCAGCATCAAGTAGTAACAACAATAACAGTCGGTTTTCAATGTTGAGGACAAAGTTTGGATTTTTAGCTA GTTGGAATGTTGTGCCCTGTGCTTTTAGAAGATGGTCAAATAATGATAATATCTCTGGTGACAGCATTTGATAATCTTGAGTAAGGTTAAGAACGATAAG ATACATTCATTACCATTTTCATGATATGTTATAAGCGTCTTCGTGTGTGCAATTCCATGTTCCTTGAAGTGTTAGCTCACTTATTTTTTTTCCAGTATGG ATTGCTAGTTGCAGTAGTTATCATCTTAACTACATATGTAGCTAATTTACTTTCATTGATTGGCCCTATTCAAGTTATTTTTTATATTTGATATGCCGCT TTTATCTGTTTGCTGTTTTGTTTGGAAGTTGCATAGTTTAGCATGAGTGTTTAAATTTGTGATCTCATAAACACATAATATCACTACATATTCAAGAGGA AGAGAATGCCACTGCAAAATTTTCATCCATTTGAATTGTTTCATACTATTACTGTTAGATGATCAGTTAGGTTAATTAGTTTTCTGTTTTCTGTTACTGA AAGCTGTATGCTTGAGGTGTTCTACATATGTGTCAGATCAAACTATTCTACAGACCAAAATGTCACAATTTTAAAAATCATAACAATACAAACAGTTTCA GTGATGGCAAAGCTTTGCAATAAAGTATCACTTAAATAAGGAAACCCATAAGACAAGTAATTGAAGCTGTAAACTGTGCACTGAGTCAAAAGTTGCAACT TTAATTTGTAATCATGCAGTGAGGTTTGTCTACCTTTGCTGAAAATTTCCTAACCCCTATATACTAAAGTTTGTTAAGTTCCTCTGCAAAACTGTGATCA GTAACATCAGAAAATTCTCATTAATAATCCTATACACTTAATCATTTGTTTAGTTCCTATAACAGAAACCTTCAACTCTCTCCCTGCTATATCTTCTTTT TGCAGCATCATTTAATCCCCCATCGTTGTTCCATTTGTATCTGATGTATTACATGTTTCCAACAAATATTACAATTTGTAGGGAATCAATGGAGCAATTA ATGCAAACTGTTTCACCAGTTAATTTAACAAATTACATCTTATAAGATTAAATAGCATTAAGGAAGCAATTGTCTGTCTGCTGTTGCTTATAAAGTGAAG TCTTGTCTACTGTGGCAAACAAAGTTTGGTGGACCAACATGGTATTGATCTAGTGGTGTAAGACCCCACTAAATCCCTAGGATTACCAAAACGTCAAGG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_154217;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_360788

FPKM

• PAB: 62.7
• PNAB: 8.5
• PS1: 29.9
• PS2: 4.5
• PS3: 5.1
• PW1: 31.2
• PW2: 47.2
• PW3: 19.3

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_360788

• Blastp: F-box protein SKIP2 from Arabidopsis with 54.09% of identity
• Blastx: F-box protein SKIP2 from Arabidopsis with 54.09% of identity
• Eggnog: F-box and leucine-rich repeat protein(ENOG410XQ54)
• Kegg: Link to kegg annotations (AT5G67250)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019415486.1)
• Pfam: F-box domain (PF00646.32)
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;
  Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;