Ll_transcript_359624

• Id Trinity: TRINITY_DN47651_c4_g2_i15
• Name Transcript: Ll_transcript_359624
• Sequence: CATCTCACAAGTGTATTTCATGGCTCCCAAGCCTTCCTTCCCTTTCCCTTCCTTCCCCTCCAAAATCCAACTCCCAAACAAACCCTTAAGCTCTGTTTTG TAAAACTAAATTATAGATTTCAGGTTGTGGGTTATAGTTGGGAGATTGTATCGTGCATGTGAAGATAGTTGATAGCTTATAGCCATGCAGGGGGAAACTA GTTGTATAACTAACAAATCTGTTAAAAAACTTAAAAAAACATGTAATATTTTGTTAACGTAATATTATGATTAAATATTTTGTGTTGTATTTATTTATTT ATTATGAACCAATTAAATAATTATTATCCATGAATGAGTTGGATGCAATTGAATATTAATGACTTTATCCCCCATAATTTGAAGTGTTCTCAATCACTTG CAAGATTAAAAAAATATCATTTAGTTATTGCAAAAATGTCACAGCATATGTGAGGGTATTGTTATATTAAAAAATGGAGCGAAGCTACTTGAGGTAGCTA TCGAGCAGCTAGCTTTTAAAAGCTAAAATCTCCTTTTTCAAAAGTTATAATCTTGTTTAATTTATGGTTCACTAAGCAGCTCTTTAAACTTATTGATTGA GTCAATAAGCTATAATCTACCAACTAAGCTACAAACTCGTCGTGCCAAACACACACTTAATTGAATTTCTAATGATTGCCATGCATGTCAAACTCTTGCT GGATAGTTTATGTCTGTAATGTTGATGTTTCCAACTTTAGAGCACATGCTTGATTTTGGATGGCATGTTAATATTCTTTTTCAACAAAAGAATACTAACA AAAGTTTTCAGTCTAGTGGCTTCTGGCTCGCAATATAAACACTCCCAAATTAAATGGGATTACTGTCTAAACAATGGCACACTAAACATGGAAGTGAAGT GTTACACATAACTTTCAGAAATGAGTTAATTTATAGACCTACTACATTATTTAGCTGTTCATTATATGCCTTTTCTTATTGTAAATTCCCTCAAAGACTG TTTATATATCTTAAGTTTGTCTAACATGCTACTTTTTATGATGAAAATATTTGTACCTTGGAGCACATTCAGTCTACAGAGTTTTTCGAACATTGTAGAA ATTATTTATTACCGTCTTTCTAGAAATGTTACCTATACTGATTTCAGGCGCTGTTTTCATTTAATAGGGATTTAAAGTCAAGTTTTTCTTTTGTGTTGTT CAATATGTTAACACTTTTGTTACCGAAGCTTCAGTCAAGACCTTCAATACCTTTTTAACATAATAATAATGTAGTTGTCAGTGATATTTCCATACCAAGT TCTGGATGGGGAATAAGTCATTTAGGGTTTCTCACTTTTAGTCATGAGATGTTTTGATTGGTGACAGAGTGACAATCTTAGGTTATGCAGCTGTTTGTTC AGTAGTTGTAGCCCAGGTGATTCATTATACAACTCTGTATATATTTGTGCATTAGCCATTTAGCCTATTTTTTGTGGTCGCTGAGCATACAGGTCATAGA TGATGCAAGTTAATGTCAGACACTGAATTTCTGATCCAACTTTGTATTAAGAGAATGACAGACGTATAGGTAGCATAAAATTAAATATTACTTTATTGGA ATCTTATACTTAACTTGGTGAACATCTTTTGCAGAGCATCGCAACTGTCTGTATGTTCCTGGCTGGGAAGGTTGAAGAAACGCCTCGCCCACTAAAGGAT GTTATTCTGATTTCTTATGAAATCATTCACAAGAAGGACTCTGCTGCTGCACAGCGGATAAAACAGAAGGTGTTCTATAATTTTCTGTGCTTTCACTATT TCATTTCATACATTCTCGTTCTGGATTTTTCGGAAATCACATTGCTGCTAGGTTATAATGCTTGCTCAGACATGGATGGGGCCTCAATTTTGAATTCCTA TAAAATGTTTGGCTGGCTTGTAAATTATGATAACCATTTTTGTTTACATGTTTCATTACTACTTACTACCTAAATAGAATTGTTTGTCTGGAATTATATA ATTTATTTAACGTTCTTTCTCTGTACGATTGTACATGCCTGCCTCAATTGTCTGTATCTCTTCATGTTTTGGCCTCTCTTTCTCTTGTATGTAACATTAT TTTAAAATTTGTTCAAGAAAGGTCGTAATCATTGCAGGACGTATATGAGCAGCAGAAAGAGTTGATTTTATTTGGAGAGAGGGTCGTACTTGCCACTTTG GGTTTTGCCTTTAATATTCAACATCCTTATAAGCCCCTTGTTGAAGCCATAAAGAAGTTCAATGTCTCAAAAAATGCACTTGCACAAGTTG
• Tissue: pods
• Gene name: LI_gene_154385;
• Additional information: details;

Expression of Ll_transcript_359624

FPKM

• PAB: 0.2
• PNAB: 0.2
• PS1: 0.2
• PS2: 0.2
• PS3: 0.4
• PW1: 0.2
• PW2: 0.3
• PW3: 0

Labels

• PAB: abscising pods
• PNAB: non-abscising pods
• PS1: seeds stages 1-3
• PS2: seeds stages 4-6
• PS3: seeds stages 7-8
• PW1: pods wall stages 1-3
• PW2: pods wall stages 4-6
• PW3: pods wall stages 7-8

Annotations of Ll_transcript_359624

• Blastp: Cyclin-T1-3 from Oryza sativa with 90.48% of identity
• Blastx: Cyclin-T1-4 from Oryza sativa with 84% of identity
• Eggnog: NA(ENOG410ZAZC)
• Kegg: Link to kegg annotations (4349827)
• CantataDB: -
• Mirbase: -
• Ncbi protein: Link to NCBI protein (XP_019419549.1)
• Pfam: -
• Rfam: -
• GO: Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology;