Id Trinity | TRINITY_DN47654_c4_g1_i14 |
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Name Transcript | Ll_transcript_359233 |
Sequence | TGGGCACATTGCCTTATCACATATGACCTTGAAAAAGATTATCCAAATGTAATCAAGTGGTCAATCTCTACAAAATCACCCTGCCCCACCAATCATCATT TCATTTCATTTCACATCCTCTAACTTTGCAACAACACTACCCATCATCATTTTATCACTATCCTTATACTCATGGCCATTGCTCAAAAATGGCTCACACA CTTATCCAACACTAGACACAACAATCTCTTTGCTTCAAGGAAGCAACAACAACAACCCATGTGTTTCATCCAACACCATAGGCTTGTGTGCCATGGGTGC TACCTTTCAATGAATGGTTGCATAGAAGGACAAGACAAGGAAAAAAACCATGTTGGAACAATAGAAACAAGAACATTGGAACCAGTTACATCACTTGCAA TGGCTATGTATAACCTTAACAATGCAATTTCACAATTGAAAACAGAGCCACCATTTTATACCTCTTCAGGAATTGTAAGGTTGCAGGTTCCAATTGAAGA GAAGGTTGAGGCCATTGATTGGCTTCATTCTCAGAACCATCTTCTCCTTCCTCGTTGCTTCTTCTCTGGGAGGGAACAAAATGAAGATAACTTGGTCAGT GTTGCTGGTGTTGGTTCTGCTGTTTTCTTTTGCCATTCTCATCCCTTTTCTTATTGGGATTGGAGATCCATAAGGAGGTTTCTTTCTGAGAGATGTCCAT TAATCCGTGCATATGGAGCTATCCGTTTCAATGCAAAAGCTAAGGTCTCATCAGAGTGGCAGGCTTTTGGTTCTTTCTACTTCATGATTCCTCAGGTTGA GTTTAATGAGCTTGAAGGAGGATCAATGCTTACAACAACTATTGCATGGGATAATGCTCTTTCTAGGACATGGGAAAATGCAATCAATGCACTTGAAGCA ACATTTTGCAAGGTTTCTTCTTCCATTGTGAAGTCCCCTAAACAAGCTCCTCCAACATTAATATTAAGCAGCCATAACATTCCCAGCAGAGTAGATTGGC ATCTTTCTGTCAATAGAGCTTTGCAGATGATAAAACAAAATGATTCCTCACTAACCAAGGTTGTGCTAGCTCGTAGCACCAGAGTTGTGCCCACTGCTGA TATTGATCCTCTGAAGTGGTTAGCTTGCTTAAAGGATGAAGGTGCAAATGCTTACCAGTTTTTCCTTCAGCCTCCTAATGCACCTGCATTTATTGGAAAC ACAGTAAGTGTAGCATGTGTCTGACATCTGACTATAAAGTAGGATGATTTATATATTTAAATCTTTATTTAAATCTTTAGTTTGACACAATGGTAAAGTT GTTTGTCTCGTGACTGGAAATCACGGGCTCAAATCCTGGAAACAACTTCATTTGGAGGGTAAGACTGGGTATATTTAGCCTCCTGTACTGAACCATTCTT TTTATGCTATGTAGTGATATTGTGCTGAACATTCCACAGCAAGTGTTGAAGGAATAAATGTTACACAAATCATTTAAGTCACTTTCTGTTTCTAATTGTG CTTTATAAGTTTATGTTCATCAGCTGGATAACCCTTTCAACAACTGTTTTCTGAGTTTAATCAGCAATGATACATTTTCCATTTTAATTTTTTATGAACT TGATGAATAGCCAGAGCAACTATTTCACAGAAAATCTCTCCACATTACTAGTGAGGCTTTGGCTGGAACCCGTGCTAGAGGATTGTCACCTGCACTGGAT TGCCAAATTGAACTAGACTTACTTACCAGGTTTTACTTTTAGTGCCTGTCCAAAACTTTTGTTAAACACTTGCATCGATGATATTTGTTAAAATGGTAGG AGCCATGAATGAATTTTGATGAAACAAGAAAGAATGAGAAAATGAATGAATATTATTCTCATTGATGAATTGAATGAACTGATTACAAAGCTTAGGGGAA TACCTGTTTATATACAATAATATGTAACAACTAACTGAAATAACTACCCAATTAATCGATTAACTATAATGTTAACTACGATATTAATTGATTAAGTATT ATAGAATCTCACATATACTAATAATATTCAGTACTTATATTTATGTCTAGCTCCTCATATTTTGCTGTTAAAGATTTTGTCATATATTTACAGTCCAAAG GATGACAATGAGTTTACTATAGTGAGAGAAACCATAAGAAGAAAATTAGAGGCAGTATGCGAAAAGGTTGTAATCAAGCCAAAGAAAATGATAAGAAAGC TCCCCAGAATCCAACATTTATTTGCTCAACTAGCTGGCAGGTTAGAAAGGGAAGAAGATGAGTTTGAGATCATGTCATCTCTTCATCCAAGCCCAGCAGT GTGTGGGTATCCAACAGAAGAGGCACAACTTTTAATTGCAGAAACAGAAGTATTTGATAGAGGGATGTATGCTGGACCTGTTGGTTGGTTTGGAGGAGGA GAAAGTGAGTTTGCTGTTGGCATTAGGTCAGCATTGGTGGAAAAGGATCTAGGTGCATTGATATATGCTGGAACAGGAATAGTAGAAGGAAGCAATCCTT ACTTGGAATGGGATGAGCTAGAACTGAAGACATCTCAGGTAAGTTTTCGAGTCTCACCTACGACAAAAAGACTAACATACTAATAATTGCCGATAAAATA AAACTATATTTGTACAAAGGTTGACTACCTTAATGGATGTTGATATGTTACAGTTCACCAAGTTGGTCAAACTTGACTTGCCTCTCATCCAAAAAGTAGA TTGTAAGTAAGCTCCATCAAACTGATAAGGTTAGCACTTCTCATGTCAATTTATTGTCTTTTAATTACAAATGCAAGCAGAGCTTAAAATTGTTATTAAT TTTACATTTTTAGGTTGACAATATAGAAAAAGTTTATGAACAGTTTTAAAATATTTTTAAAACAATATTGATGGAGGAGACCGTTAGAAGTTATCACTAA ACAAAACAGTTAGGTTAGTCCGATTTGTAAAGATAGAGGGAGCCAAGAAAAACCATAAGTAAAATGTTTAAGAAAGATTTAGACATAAATGTTTTGTCAA TGAACATGATATATGATATCGTTCTATCCATATAATCGACTACCCCTAGAGAGGATCATGGTTTAGTTGTTGTTGATGCCTAGCTAGCAAAGATATGTTG GGGCATGGTGATTGATCGATTTTTCTATATCAATCTGCATTGAATTAAGAGGAACTTATATCGACTCCCATTAATGTATGACTTAAATATACTCACATTT CTTGTTTAAAAACATTAGATAATCTCATACAAGGTTGTTTAAAAACATTAAATAATCTCCAAGGGTTATATTGTCATTACACTTGCTCACCAATGTTTTC TATCATCACACTCATAGTCTTAAGGTTCATGTTAGTGGTAAAACTTACGTCTAGATTTTGCAAAAGTGACTCTACATAAATTGATTTATAGCAAAATTAT AGTTATTGTCACCCCTATGAACTATGTACCAATTCACGGTACTTTTGCGACTCGATTCATTACAGTTGGCAACTTGGTTCGAAGCCGTTAGAGAACCTAT CCATGGATGCTTCACGTACTCCAAACTCTAAAGATAGGTTTCACTATATTTAGAGCTTATTTATGGGTGGACCCATTTGAGCTTATTTATGTGGGTTGGC CTAGTTTATTTTTGTAGATGCACCACTTAGAACTTATTTTTATAGGTATTGGACTACTAAAGTTCTGAAATTAGATTTTTTGTCTCATTTTAATTTATAT TTAAAAGTTGAATTTAAATTGATTATACATAATAATAGTTGATTAACGTATGAACTTATTTGCATAACTTAATTTTAATGATTTTTTCTTATAATTAACC TCTAACTAACAGGTAAATAAAATATTAGAACGTCAACTAAAAAGTATCACGAAACCAACTAATATATTGGCTAAATATACCTCTAACATACTCTATATTT GAGAAGTAGCATATTGCGTGCCGCATATTCATAGCTGTACCATAAAGTACCAAAACCTTGGTGACTATCAGCAAAATGGGAGGGGATCAACTTACTCCAA GAATAAGTTTTTTTACGTTTACTCTTCATCTTAGCCATCAATTTATTGGAAATCCAATAGTTTAGATTTACTACTAATTCAAATCAT BLAST |
Tissue | pods |
Gene name | LI_gene_154401; |
Additional information | details; |
PAB | abscising pods |
PNAB | non-abscising pods |
PS1 | seeds stages 1-3 |
PS2 | seeds stages 4-6 |
PS3 | seeds stages 7-8 |
PW1 | pods wall stages 1-3 |
PW2 | pods wall stages 4-6 |
PW3 | pods wall stages 7-8 |
Annotations of Ll_transcript_359233
Blastp | Isochorismate synthase, chloroplastic from Catharanthus with 52.27% of identity |
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Blastx | Isochorismate synthase, chloroplastic from Catharanthus with 52.27% of identity |
Eggnog | - |
Kegg | Link to kegg annotations (CAA06837) |
CantataDB | - |
Mirbase | - |
Ncbi protein | Link to NCBI protein (XP_019464663.1) |
Pfam | - |
Rfam | - |
GO | Links to GO: General; Genes and gene products; Annotations; Ontology; |